基因總覽
ZYX 是蛋白質編碼基因，產物 zyxin 屬於 zyxin/ajuba 家族。zyxin 是黏附斑蛋白，與細胞黏附相關結構及肌動蛋白細胞骨架相聯。其序列包含一段較長的無序區，以及三個 LIM zinc-binding 結構域；這些結構特色構成 zyxin 的基本分子特徵。來源亦指出它與多種蛋白質有交互作用，並可能參與黏附刺激所引發的訊號傳遞與基因表現變化；此項功能描述標示為 By similarity。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000322764 ★ | 143,381,345–143,391,111 | 10 |
| ENST00000449630 | 143,381,295–143,382,925 | 4 |
| ENST00000869086 | 143,381,308–143,391,111 | 10 |
| ENST00000869087 | 143,381,308–143,391,111 | 10 |
| ENST00000869088 | 143,381,308–143,391,111 | 10 |
| ENST00000869089 | 143,381,308–143,391,111 | 8 |
| ENST00000869090 | 143,381,308–143,391,111 | 8 |
| ENST00000943399 | 143,381,308–143,391,111 | 11 |
| ENST00000999823 | 143,381,308–143,391,111 | 8 |
| ENST00000999824 | 143,381,308–143,391,108 | 8 |
| ENST00001014569 | 143,381,308–143,391,111 | 10 |
| ENST00001014571 | 143,381,308–143,391,106 | 10 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
zyxin 是黏附斑蛋白，與細胞黏附相關的結構及肌動蛋白豐富的構造形成有關。來源指出，zyxin 可結合 alpha-actinin 與 CRP protein，並有助於將 TES 及 ENA/VASP 家族成員定位至黏附斑。藉由這些作用，zyxin 與黏附斑周邊的肌動蛋白結構組織相連；來源並未進一步說明其促成結構形成的具體分子步驟。
zyxin 也可能是訊號傳遞路徑的組成部分，該路徑可介導由細胞黏附刺激所引起的基因表現變化。不過，這項描述標記為 By similarity，表示此功能屬於相似性推定，不能視為來源已明確證實的機制。資料未提供該訊號路徑的其他組成或其調控基因表現的詳細方式。
Promoter 與基因調控
>ZYX ENST00000322764 GRCh38 chr7:143380345-143381445 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAGCGCAGTCTCAGAATGCCCAAGAGCTCCACCGTCGCCCGGGGTCTCCACCAAGCGCAGTCTCAGAATG CCCAAGAGCCCCACCGTCGCCCGGGGTCTCCAAGAGGAGTGGGTCGTGGTGGGCGTTGAAGGGCCGTAAA AGACGAGCAGCCCGCGTCCGCGTCCGTCCTCCCGGGTCTCCAGTCCGCAGGCGGCCGCCGCCTCGGCCCC GCCCTCCCACCTCCATTCCCGGCCCCGCGGACCCGAACGGTCCCTCTCGCAACCGATCTGCTGGCTGGGG CGCTGGGGATGCGAATTCCTAGAAGCCTTAAGAGGCTGCCCAGCGTTGGAAGTTCGTATCCCCAAGAATG CTGGAGGTTCCGGCTCACACACCCCCTCCGGGCACAGAGTCAGCTGGGGGGTGCTGGGAGGGAGAACGCC CCGCTCCTCACCCCCCATCCCCGTGCACCCTGGAGCCCAGCTCCATACGTTCGGCCACCCCAGGCGGACT CGGGGTGGCCGGGTAGCGGGTGGTGGCAGGAGGGGACCGGGTAACGGCAGGCCCGAGAGGAGGTCGCTGG GCCGGGCCGGAGGCGCACAGGGGCTGCGTGGCTACCTCGGCGGCACCCGCCCCACCTCCGCCGGCTAAGC CCGGAGGGGGACGGTGAGTCAGATCTCGGGCACCCGCGGGTCGGGCGGGGAGGGGGAGGCAGGTCAGGAA ATGACATCAGAGGCCTGTGCTCAGGGAGTGGGGGTCTGAGCCGGGCTGGGGCGGCGGGGGCGGCAGTGAG TGGGGTGGGGGCGAGCGGACCTCGGCGGAGCCTCCGGCCTGAGGCAGGATCAGGGCCCCTTCCTGGGGGA GTTTCCTGCCTGGTCCGCCCTTCCCCGCTCTCCCCGCCCCCTCTCCGGGCCGCTCCTTGTATGGTCTGGG CGCCGCTCTCTCCCCGCCCCCTCTCTTCTCCCTCCCTCCTCCTTCCGTGTGTCCCTCCCCGCCCGGCTGG AGGCTGCTCCGGACCGGGACGCAGAGTCTGCGGACCCGGCGCCGAGGCGGCCACCCGAGACGCGGCGCGC ACGCTCCGGCCTGCGGTGAGGCGCGGGGAGCGGCAGGGCGGCCCCACGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZYX_3 ↗ | 7:143,380,809 | 正股 | 143,380,760–143,380,819 |
| ZYX_2 ↗ | 7:143,381,050 | 正股 | 143,381,001–143,381,060 |
| ZYX_1 ↗ | 7:143,381,347 | 正股 | 143,381,298–143,381,357 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_538PJSR · CTCF_binding_site · 143378800–143378821 · regulatory
ENSR7_944WKB · promoter · 143379911–143380411 · regulatory
ENSR7_B33G9P · enhancer · 143380412–143380955 · regulatory
ENSR7_944WKL · promoter · 143380956–143381355 · regulatory
ENSR7_944WKQ · promoter · 143381417–143381917 · regulatory
ENSR7_538PKB4 · CTCF_binding_site · 143381457–143381478 · regulatory
ENSR7_944WL2 · promoter · 143382329–143382829 · regulatory
ENSR7_538PKLD · CTCF_binding_site · 143383246–143383267 · regulatory
ENSR7_CJ866 · enhancer · 143383830–143385682 · regulatory
ENSR7_D9546 · enhancer · 143385904–143388126 · regulatory
· motif · 143378802–143378818 · motif
· motif · 143380497–143380511 · motif
· motif · 143381095–143381108 · motif
· motif · 143381217–143381230 · motif
· motif · 143381236–143381251 · motif
· motif · 143381267–143381280 · motif
· motif · 143381294–143381305 · motif
· motif · 143381329–143381345 · motif
· motif · 143381398–143381413 · motif
· motif · 143381459–143381475 · motif
· motif · 143381478–143381485 · motif
· motif · 143381683–143381692 · motif
· motif · 143382571–143382583 · motif
· motif · 143382574–143382581 · motif
· motif · 143382574–143382588 · motif
· motif · 143382574–143382589 · motif
· motif · 143382575–143382588 · motif
· motif · 143382578–143382590 · motif
· motif · 143382581–143382596 · motif
· motif · 143383248–143383264 · motif
· motif · 143386129–143386146 · motif
· motif · 143386138–143386146 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：572 aa
zyxin 長 572 個胺基酸。其第 23–351 位胺基酸區段註記為無序區；第 384–443、444–503 與 504–570 位分別為 LIM zinc-binding 1、LIM zinc-binding 2 及 LIM zinc-binding 3 結構域。蛋白質家族分類為 zyxin/ajuba 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
zyxin 與黏附斑附近的肌動蛋白細胞骨架相聯。 存在 HESX1 時，zyxin 會進入細胞核；來源未提供其他定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell junction, focal adhesion。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
- CASS4Q9NQ75-2 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ENAHQ8N8S7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EVLQ9UI08-2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IMP3Q9NV31 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- LAP3P28838 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LATS1O95835 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- LIN7AO14910 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NME5A0A0S2Z4M0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- OPRM1P35372 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PDLIM5Q96HC4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PHF21AQ96BD5 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- QRICH1Q2TAL8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RTN4IP1Q8WWV3 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TUFT1Q9NNX1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VASPP50552 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ZNF512BQ96KM6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- B2R9Y1B2R9Y1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
zyxin 經由富含 Pro 的區域與 ENAH、EVL 及 VASP 的 EVH1 結構域交互作用，也與 TES 的第一個 LIM 結構域、NEBL 異構型 2 及 SYNPO2 交互作用。另有資料記載 zyxin 與 HPV6 的 E6 蛋白交互作用；與 HPV11、HPV16 或 HPV18 的 E6 蛋白則未觀察到顯著交互作用。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | zyxin 是黏附斑蛋白，可結合 alpha-actinin 與 CRP protein，並有助於將 TES 及 ENA/VASP 家族成員定位至黏附斑，且與肌動蛋白豐富結構的形成有關。它也可能參與介導黏附刺激所致基因表現變化的訊號傳遞路徑；此項描述為 By similarity。 | 推論支持 | 證據與來源Adhesion plaque protein. Binds alpha-actinin and the CRP protein. Important for targeting TES and ENA/VASP family members to focal adhesions and for the formation of actin-rich structures. May be a component of a signal transduction pathway that mediates adhesion-stimulated changes in gene expression (By similarity) |
| 交互作用 | zyxin 與 HPV6 的 E6 蛋白交互作用，但與 HPV11、HPV16 或 HPV18 的 E6 蛋白沒有顯著交互作用。zyxin 透過富含 Pro 的區域與 ENAH、EVL、VASP 的 EVH1 結構域交互作用，並與 TES 的第一個 LIM 結構域、NEBL 異構型 2 及 SYNPO2 交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with HPV type 6 protein E6. Does not interact significantly with E6 proteins from HPV types 11, 16, or 18. Interacts, via the Pro-rich regions, with the EVH1 domains of ENAH, EVL and VASP. Interacts with the first LIM domain of TES. Interacts with NEBL (isoform 2). Interacts with SYNPO2 PMID 10801818 ↗ · PMID 12695497 ↗ · PMID 16885336 ↗ · PMID 18158903 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染相關脈絡中，zyxin 與人類乳突病毒 HPV6 的 E6 蛋白交互作用；與 HPV11、HPV16 或 HPV18 的 E6 蛋白則沒有顯著交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with human papillomavirus type 6/HPV6 protein E6. Does not interact significantly with E6 proteins from HPV types 11, 16, or 18 PMID 11689660 ↗ |
| 細胞定位 | zyxin 可與黏附斑附近的肌動蛋白細胞骨架相聯；存在 HESX1 時，zyxin 會進入細胞核。來源列出細胞質、細胞骨架、細胞核及黏附斑等定位資訊，未描述異構型差異。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton; Nucleus; Cell junction, focal adhesion; Associates with the actin cytoskeleton near the adhesion plaques. Enters the nucleus in the presence of HESX1 |
核酸與蛋白質序列
GCAGAGTCTGCGGACCCGGCGCCGAGGCGGCCACCCGAGA40CGCGGCGCGCACGCTCCGGCCTGCGCAGCCCGGCCCGGCC80ATGGCGGCCCCCCGCCCGTCTCCCGCGATCTCCGTTTCGG120TCTCGGCTCCGGCTTTTTACGCCCCGCAGAAGAAGTTCGG160CCCTGTGGTGGCCCCAAAGCCCAAAGTGAATCCCTTCCGG200CCCGGGGACAGCGAGCCTCCCCCGGCACCCGGGGCCCAGC240GCGCACAGATGGGCCGGGTGGGCGAGATTCCCCCGCCGCC280CCCGGAAGACTTTCCCCTGCCTCCACCTCCCCTTGCTGGG320GATGGCGACGATGCAGAGGGTGCTCTGGGAGGTGCCTTCC360CGCCGCCCCCTCCCCCGATCGAGGAATCATTTCCCCCTGC400GCCTCTGGAGGAGGAGATCTTCCCTTCCCCGCCGCCTCCT440CCGGAGGAGGAGGGAGGGCCTGAGGCCCCCATACCGCCCC480CACCACAGCCCAGGGAGAAGGTGAGCAGTATTGATTTGGA520GATCGACTCTCTGTCCTCACTGCTGGATGACATGACCAAG560AATGATCCTTTCAAAGCCCGGGTGTCATCTGGATATGTGC600CCCCACCAGTGGCCACTCCATTCAGTTCCAAGTCCAGTAC640CAAGCCTGCAGCCGGGGGCACAGCACCCCTGCCTCCTTGG680AAGTCCCCTTCCAGCTCCCAGCCTCTGCCCCAGGTTCCGG720CTCCGGCTCAGAGCCAGACACAGTTCCATGTTCAGCCCCA760GCCCCAGCCCAAGCCTCAGGTCCAACTCCATGTCCAGTCC800CAGACCCAGCCTGTGTCTTTGGCTAACACCCAGCCCCGAG840GGCCCCCAGCCTCATCTCCGGCTCCAGCCCCTAAGTTTTC880TCCAGTGACTCCTAAGTTTACTCCTGTGGCTTCCAAGTTC920AGTCCTGGAGCCCCAGGTGGATCTGGGTCACAACCAAATC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。