基因總覽
zinc finger X-linked duplicated A 是一種蛋白質編碼基因，其產物屬於 ZXD family。ZXDA 蛋白質長 799 個胺基酸，具有多個 C2H2-type zinc finger。已知它可與 CIITA 協同，參與促進 MHC class I 與 MHC class II 基因轉錄。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000358697 ★ | 57,905,430–57,910,458 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZXDA 與 CIITA 協同作用，促進 MHC class I 和 MHC class II 基因的轉錄。這項功能涉及兩類 MHC 基因的轉錄調控；現有資料未進一步說明協同作用的分子步驟或其發生條件。
Promoter 與基因調控
>ZXDA ENST00000358697 GRCh38 chrX:57910358-57911458 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGTGAGCAGGTACACCGGGGCGAGTGGACAAGATCGTCTGTGCACATTACTTGGCAGAGTCCATTGAGTG ACTGAGGGTTTAACCTTAACACATTTAACTGGAACTCCTGCCCAGAGAATGTGCTGGAGAATGCAGAATA AACTGAGCAATGCCCTCATTGTGCTATGAGAGTGGACATGAAGTTTATCATGGTACAACCGATCGTCGAA GGGCAAAGAGTTGGTTTAGGTTGTGCACTGTATAGGGAGAAGCCAGGGGCGGGTTGGGTTTTTTTCCAGA TTTCAGTATAAATTGTTTCATCCTCCAGACTTTGCATTTGTAGGCTGAAGAGTGCTAATCTGTTTTGGCC GCATCTCTCACTCATTCTAATCTCTGTTATCAGCAGACAAAAATTGAACTATGTGGCAAATTGTACCGAG CACTTTGCTCAAGACAATTGTGAGTATGGAAGTTGTCCCGCGCAGAGGTGGGAAGGGGAAGGGCAATTTC CGCAGAAATGCCAGCACTATGGTGGTTTAATGCTGACACAGAGACAGTTTTTTCTCTCAGGAATTGTCTT TCATCCATCAATCCAGCCAGGTAGCCAGCCAATAAACAAATTTTAACACACAAAAAGTATGAAGCAACAT GTCTAACACTGGGAGGGGCTGGCGTGTGTTTATTTGGGTATATACAATGAGTCACGGATTAAAATTGCTT TTACCAGATAGATACCTAGGTGTTCCACAGCATTATTGAACAAGATGTCGTCATTTCCCCATTACTTCAG AAGACCTCCTTAATTACTTATATTAATTGTAGAATATATTTATGCATACCAGGCTCTACCTCTGGGCTTT CTATTCCGTTCCAGAGACCCAGTACCAGAATATTTAAATCACTGTGGCGTTGAATACATTTTAATATCTG ATAGGGCCAGTTTCTGCGCATTGCACATTTTTTTTTCCCCTTTCAGGAACGTGTTCAGGCCCGCGGCAGG GGGCGGGATCGCGCCTCCTCCTCGGCTCTGGTTCCAGCCGAGCCTCTCGGACGCAGAGATGGAAATCCCG AAGCTGCTCCCGGCTCGCGGGACACTACAGGGCGGCGGCGGCGGCGGTATC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_9SZKH · enhancer · 57906836–57907124 · regulatory
ENSRX_5HLQMF · CTCF_binding_site · 57909682–57909703 · regulatory
ENSRX_5HLQPG · CTCF_binding_site · 57910122–57910143 · regulatory
ENSRX_5HLQQ7 · CTCF_binding_site · 57910278–57910302 · regulatory
ENSRX_5HLQQL · CTCF_binding_site · 57910371–57910392 · regulatory
ENSRX_9SZLK · promoter · 57910448–57910948 · regulatory
· motif · 57909684–57909700 · motif
· motif · 57910124–57910140 · motif
· motif · 57910148–57910159 · motif
· motif · 57910258–57910268 · motif
· motif · 57910280–57910296 · motif
· motif · 57910283–57910299 · motif
· motif · 57910373–57910389 · motif
· motif · 57910703–57910716 · motif
· motif · 57910703–57910716 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：799 aa
ZXDA 蛋白質長 799 個胺基酸，具有 10 個 C2H2-type zinc finger，分布於第 267–568 個胺基酸區段。第 267–573 位區域為與 ZXDC 互作所需；第 572–699 位區域則註解為轉錄活化所需。第 1–89 位另標示為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZXDA 的細胞內定位記錄為細胞核。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- CIITAP33076 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ZXDCQ2QGD7 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
ZXDA 可自我締合，並與 ZXDC 及 CIITA 互作。資料未進一步指定這些互作是否屬於特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZXDA 與 CIITA 協同作用，促進 MHC class I 與 MHC class II 基因的轉錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cooperates with CIITA to promote transcription of MHC class I and MHC class II genes PMID 17493635 ↗ |
| 交互作用 | ZXDA 可與自身締合，並與 ZXDC 和 CIITA 互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ZXDA 定位於細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
CTCGGCTCTGGTTCCAGCCGAGCCTCTCGGACGCAGAGAT40GGAAATCCCGAAGCTGCTCCCGGCTCGCGGGACACTACAG80GGCGGCGGCGGCGGCGGTATCCCCGCGGGTGGCGGCCGAG120TCCACCGAGGCCCTGACTCGCCGGCTGGCCAGGTCCCCAC160GCGCCGCCTCCTGCTGCCCCGGGGCCCCCAAGATGGCGGG200CCCGGGCGGCGGCGCGAGGAGGCCAGCACGGCATCACGGG240GCCCTGGCCCAAGCCTGTTCGCGCCGAGGCCCCATCAACC280TAGCGGCGGCGGCGACGACTTCTTCCTGGTGCTGCTTGAC320CCGGTGGGTGGCGACGTGGAGACCGCGGGCTCCGGTCAGG360CCGCAGGGCCTGTGTTGAGGGAGGAGGCCAAGGCGGGCCC400GGGGCTCCAGGGGGACGAGAGCGGCGCGAACCCCGCGGGC440TGCTCTGCGCAGGGCCCCCACTGCCTGTCCGCGGTTCCCA480CTCCGGCCCCGATCTCCGCCCCCGGCCCCGCCGCGGCCTT520CGCGGGCACAGTCACTATCCACAACCAGGACCTGCTGTTG560CGCTTTGAGAACGGCGTCCTCACCCTGGCCACGCCCCCAC600CACACGCCTGGGAGCCAGGGGCCGCTCCTGCCCAGCAGCC640CAGGTGTCTGATCGCCCCCCAAGCTGGGTTCCCGCAAGCC680GCGCACCCGGGTGACTGCCCAGAGCTGCGGTCCGACCTCC720TGCTAGCCGAGCCCGCAGAACCCGCGCCTGCTCCGGCGCC760CCAGGAGGAGGCGGAGGGCCTGGCCGCCGCCCTGGGCCCC800CGCGGACTGCTGGGCTCTGGTCCAGGCGTGGTGCTGTACC840TGTGCCCCGAGGCGCTGTGCGGGCAAACCTTCGCCAAGAA880GCACCAGCTGAAGATGCACCTGCTGACGCACAGCAGCAGC920CAGGGCCAGAGGCCCTTCAAATGCCCCCTGGGTGGCTGCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。