基因總覽
ZWINT 是一個蛋白質編碼基因,產物正式名稱為 ZW10 interacting kinetochore protein。此蛋白是外層動粒 KNL1 複合體的成員,也屬於由 KNL1、MIS12 與 NDC80 複合體構成的 KMN 網絡。動粒分為靠近著絲粒的內側部分,以及接觸紡錘體微管的外側部分;ZWINT 所在的外層結構參與兩者之間的連結。來源將其定位於染色體分離相關的動粒架構,並指出它與紡錘體組裝檢查點成分的停靠及微管—動粒互動有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000373944 ★ | 56,357,227–56,361,259 | 9 |
| ENST00000361148 | 56,356,736–56,361,392 | 9 |
| ENST00000899407 | 56,356,736–56,361,392 | 9 |
| ENST00000899412 | 56,356,736–56,361,392 | 9 |
| ENST00000920698 | 56,356,736–56,361,392 | 8 |
| ENST00000920699 | 56,356,736–56,361,392 | 9 |
| ENST00000920700 | 56,356,736–56,361,392 | 8 |
| ENST00000920701 | 56,356,736–56,361,392 | 9 |
| ENST00000920702 | 56,356,736–56,361,392 | 9 |
| ENST00000920703 | 56,356,736–56,361,392 | 9 |
| ENST00000920704 | 56,356,736–56,361,392 | 8 |
| ENST00000920705 | 56,356,736–56,361,392 | 9 |
顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZWINT 是外層動粒 KNL1 複合體的一員,參與建立微管與動粒之間的互動,也為紡錘體組裝檢查點成分提供停靠位置。動粒負責連接著絲粒 DNA 與紡錘體微管;其外層的 KMN 網絡由 KNL1、MIS12 和 NDC80 複合體組成,並與內層動粒相連。這些組成共同支持微管結合及檢查點蛋白的互動,使檢查點能在染色體尚未於紡錘體上完成雙向排列時延緩後期開始。
在有絲分裂前中期,ZWINT 可將 RZZ 複合體帶至動粒;來源亦指出它會招募 MAD2L1,但依相似性資料,ZWINT 並非 BUB1B 定位所必需。這些敘述涉及不同檢查點成分,不能據此推論 ZWINT 對所有相關蛋白的定位都有相同作用。
ZWINT 的作用也涵蓋減數分裂。依相似性資料,它對減數分裂第一次中期同源染色體的排列至關重要;另有研究指出,在減數分裂 I 中,ZWINT 是未附著動粒啟動紡錘體組裝檢查點所必需,藉此協助修正錯誤的動粒—微管連結。這些功能將其動粒角色連結至有絲分裂染色體排列,以及減數分裂時的檢查與校正。
Promoter 與基因調控
>ZWINT ENST00000373944 GRCh38 chr10:56361159-56362259 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCACTGTCACCAGGGCTGTAGTGCTGTGGCGCAATTTCGGCTAACTGCAACCTCAGCCTCCCTGGTTCAA GCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAATAGCTGGGATTACAAGCGCCCACCACCACGCCCAACTAATTTT TTTTGTACTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTA ATTCACCTGCCTCAGACTCACAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCGCGACCGGCCATGTCCTGG TATCTTTAAAAATCTTTTAGCTAGTTTCTTGAGACACATACTGCTCAGTACTCAGCTGAATGAATACCAA GTTCTCTCTCAGCAGTTATCTTTCTCCTGTACTCTGCAAAGAACATTACCTACCTTGGTCTCCCCAGAAT ATCTGTTCTATTTTGCCAACGCAGGCAATCGGCTGGGCTCTGCTTGAGTTCACTCTCCTGCATCGCATCT ATAAAATACTAATATCTTTGAAAGCAGCTCGCTTTTTGAGCGCAGATCATTTGCTTCCTGTATCTCCCGG ATCACTATTCTTTACTGATTCCCAGCGTCTTAGAAACAGCCCCACTGTTTTTCGGGGTTTTGTTTTTTTT TTTCTACAGCAGTAGTGAATATTTTAAATAAAGTGTCAATGCTGTAAGTTTCCCTTAAAACGCAAACTCA AGGAAATGCTTTCCCTTTTTCGAGTAGAGAAAGAACTTCCACAGGCGCGCGGTCGAGCTCAAGCCCACTT ATAGTCTCTGGCACCGCGTAAGGACTAGCGCGCAGGCGCAGAGCCCGTGCGCGCCTAGCCATAACCGCGC TTGCGCCAAGCAGCGAGGCCCGCCAACGAGCGAATCCGCGCCTGCCAATTAGAGCGCACAATGGTCCTTG ATGCCCGCCCACTAACCTCTGCAGCCAATCGCCTGCCCCGGCGCGAAGTCGACTGTGACTTCAAAGTAAT CTTAGGGATTGTGGGAAGGCAGCTGAACTCGGCGCCTGGAAAGATGGAGGCAGCGGAGACAGAGGCGGAA GCTGCAGCCCTAGAGTAAGTGTTTGCGGCTAAGTGGCAGCTGGGGCCGGGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZWINT_1 ↗ | 10:56,361,259 | 負股 | 56,361,249–56,361,308 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR10_83MQ2J · promoter · 56361249–56361474 · regulatory
ENSR10_BF727 · enhancer · 56361475–56362256 · regulatory
· motif · 56357213–56357226 · motif
· motif · 56357213–56357226 · motif
· motif · 56360966–56360983 · motif
· motif · 56361207–56361218 · motif
· motif · 56361413–56361424 · motif
· motif · 56361413–56361424 · motif
· motif · 56361437–56361448 · motif
· motif · 56361450–56361461 · motif
· motif · 56361450–56361461 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:277 aa
ZWINT 蛋白長 277 個胺基酸。第 80–155 位胺基酸區域註記為與 NDC80 和 ZW10 互動;第 228–277 位則註記為無序區。來源未提供其他結構域描述。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZWINT 位於細胞核及染色體著絲粒的動粒。 其動粒定位出現在晚前期至後期;依相似性資料,這種定位也見於有絲分裂與減數分裂。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Chromosome, centromere, kinetochore。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 14 個夥伴
- BCAS2O75934 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BECN1Q14457 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- BFSP1Q12934-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCHCR1Q8TD31-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM90A1Q86YD7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLF11O14901 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT75O95678 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MSGN1A6NI15 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NDC80O14777 · UniProt INTERACTION · 17 experiments
- NUP54Q7Z3B4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NUP58Q9BVL2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PCOLCE2Q9UKZ9 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TSG101Q99816 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZW10O43264 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
ZWINT 與 KNL1 組成 KNL1 複合體,此組成關係標示為可能。它也屬於包含 KNL1、MIS12 與 NDC80 複合體的外層動粒 KMN 網絡;雙向排列的動粒約含 150 份該網絡。互動對象包括 MIS12 複合體亞基 MIS12、DSN1、PMF1,以及有絲分裂期間的 NDC80;來源亦記載它與 ZW10 和 CETN3 互動。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZWINT 是外層動粒 KNL1 複合體的成員,參與紡錘體組裝檢查點成分的停靠及微管—動粒互動。它可在有絲分裂前中期將 RZZ 複合體導向動粒,並招募 MAD2L1;依相似性資料,ZWINT 不影響 BUB1B 定位。另依相似性資料,它對減數分裂第一次中期同源染色體排列至關重要,並在減數分裂 I 未附著動粒的檢查點啟動及錯誤連結校正中發揮必要作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as a component of the outer kinetochore KNL1 complex that serves as a docking point for spindle assembly checkpoint components and mediates microtubule-kinetochore interactions. Kinetochores, consisting of a centromere-associated inner segment and a microtubule-contacting outer segment, play a crucial role in chromosome segregation by mediating the physical connection between centromeric DNA and spindle microtubules. The outer kinetochore is made up of the ten-subunit KMN network, comprising the MIS12, NDC80 and KNL1 complexes, and auxiliary microtubule-associated components; together they connect the outer kinetochore with the inner kinetochore, bind microtubules, and mediate interactions with mitotic checkpoint proteins that delay anaphase until chromosomes are bioriented on the spindle. Targets the RZZ complex to the kinetochore at prometaphase. Recruits MAD2L1 to the kinetochore, but is not required for BUB1B localization (By similarity). In addition to orienting mitotic chromosomes, it is also essential for alignment of homologous chromosomes during meiotic metaphase I (By similarity). In meiosis I, required to activate the spindle assembly checkpoint at unattached kinetochores to correct erroneous kinetochore-microtubule attachments PMID 15094189 ↗ · PMID 15485811 ↗ · PMID 15824131 ↗ · PMID 16732327 ↗ · PMID 24530301 ↗ · PMID 27881301 ↗ · PMID 38459127 ↗ · PMID 38459128 ↗ |
| 交互作用 | ZWINT 與 KNL1 組成 KNL1 複合體,此組成關係標示為可能;它也屬於包含 KNL1、MIS12 和 NDC80 複合體的十亞基外層動粒 KMN 網絡,雙向排列的動粒約含 150 份網絡。ZWINT 與 MIS12 複合體亞基 MIS12、DSN1、PMF1,及有絲分裂期間的 NDC80 互動,也與 ZW10、CETN3 互動。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the KNL1 complex composed of KNL1 and ZWINT (Probable). Part of the ten-subunit outer kinetochore KMN network that includes the KNL1, MIS12 and NDC80 complexes; a bioriented kinetochore contains approximately 150 copies of the network. Interacts with the MIS12 complex subunits MIS12 DSN1, and PMF1. Interacts with the NDC80 complex subunit NDC80 during mitosis. Interacts with ZW10. Interacts with CETN3 PMID 15485811 ↗ · PMID 15502821 ↗ · PMID 15824131 ↗ · PMID 16732327 ↗ · PMID 24530301 ↗ · PMID 27881301 ↗ · PMID 38459127 ↗ · PMID 38459128 ↗ |
| 細胞定位 | ZWINT 定位於細胞核、染色體著絲粒及動粒;在有絲分裂中,從晚前期至後期可見其位於動粒。依相似性資料,ZWINT 在有絲分裂與減數分裂期間均定位於動粒。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Chromosome, centromere, kinetochore; Localizes to kinetochores from late prophase to anaphase. Localizes to kinetochores both during mitosis and meiosis (By similarity) PMID 38459128 ↗ · PMID 15485811 ↗ · PMID 15502821 ↗ · PMID 16732327 ↗ · PMID 27881301 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGCTGAACTCGGCGCCTGGAAAGATGGAGGCAGCGGAGAC40AGAGGCGGAAGCTGCAGCCCTAGAGGTCCTGGCTGAGGTG80GCAGGCATCTTGGAACCTGTAGGCCTGCAGGAGGAGGCAG120AACTGCCAGCCAAGATCCTGGTTGAGTTTGTGGTGGACTC160TCAGAAGAAAGACAAGCTGCTCTGCAGCCAGCTTCAGGTA200GCGGATTTCCTGCAGAACATCCTGGCTCAGGAGGACACTG240CTAAGGGTCTCGACCCCTTGGCTTCTGAAGACACGAGCCG280ACAGAAGGCAATTGCAGCTAAGGAACAATGGAAAGAGCTG320AAGGCCACCTACAGGGAGCACGTAGAGGCCATCAAAATTG360GCCTCACCAAGGCCCTGACTCAGATGGAGGAAGCCCAGAG400GAAACGGACACAACTCCGGGAAGCCTTTGAGCAGCTCCAG440GCCAAGAAACAAATGGCCATGGAGAAACGCAGAGCAGTCC480AGAACCAGTGGCAGCTACAACAGGAGAAGCATCTGCAGCA520TCTGGCGGAGGTTTCTGCAGAGGTGAGGGAGCGTAAGACA560GGGACTCAGCAGGAGCTTGACAGGGTGTTTCAGAAACTTG600GAAACCTGAAGCAGCAGGCAGAACAGGAGCGGGACAAGCT640GCAGAGGTATCAGACCTTCCTCCAGCTTCTGTATACCCTG680CAGGGTAAGCTGTTGTTCCCTGAGGCTGAGGCTGAGGCAG720AGAATCTTCCAGATGATAAACCCCAGCAGCCGACTCGACC760CCAGGAGCAGAGTACAGGAGACACCATGGGGAGAGACCCT800GGTGTGTCCTTCAAGGCTGTTGGTCTACAACCTGCTGGAG840ATGTAAATTTGCCATGACTTCCTGGAGGACAGCAGCATGG880AGAAAGATCCTAGAAAAGGCCTCTGACTTCCCTCACCTCC920CAACCATCATTACAGGAAAGACTGTGAACTCCTGAGTTCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。