基因總覽
ZW10 是蛋白質編碼基因,其產物為 779 個胺基酸的 ZW10 kinetochore protein,屬於 ZW10 family。這種蛋白質具有多個結合區域:胺基酸 2–317 區域與 RINT1 互作,胺基酸 2–81 區域與 ZWINT 互作。ZW10 的主要角色涵蓋有絲分裂檢查點,以及高基氏體與內質網之間的膜運輸調節;其在不同細胞週期階段的定位會改變。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000200135 ★ | 113,733,187–113,773,692 | 16 |
| ENST00000898960 | 113,733,183–113,773,753 | 15 |
| ENST00000898961 | 113,733,183–113,773,753 | 16 |
| ENST00000936157 | 113,733,183–113,773,753 | 16 |
| ENST00000946662 | 113,733,183–113,773,753 | 15 |
| ENST00001139094 | 113,733,183–113,773,753 | 16 |
| ENST00001111933 | 113,757,130–113,773,753 | 7 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZW10 是有絲分裂檢查點的重要成分,該檢查點可防止細胞過早退出有絲分裂。ZW10 有助於 dynein-dynactin 與 MAD1-MAD2 複合體組裝至動粒,使這些複合體能在動粒處參與相關檢查點功能。來源指出,ZW10 與紡錘體組裝機制有關的功能,被認為取決於它是否作為有絲分裂期 RZZ 複合體的一員;這項依賴關係屬於提出的模型,而非無條件確定的描述。
除了細胞分裂相關功能,ZW10 也參與調節高基氏體與內質網(ER)之間的膜運輸。這項功能被認為與間期 NRZ 複合體有關,而 NRZ 被認為可能參與 ER 上的 SNARE 組裝。因此,ZW10 的功能與細胞週期階段相連:有絲分裂期的作用涉及動粒及紡錘體相關機制,間期的作用則與細胞器間膜運輸及 SNARE 組裝相關。來源並未將這兩類功能描述為同一條作用路徑。
Promoter 與基因調控
>ZW10 ENST00000200135 GRCh38 chr11:113773592-113774692 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGGGAGGATGTGTGCTGGTTACTTGTAAACATTACATCATTTTATGTAAGAGACTTGAGCATCCACGGAT TTTGCTACTGGGGCAGGGGAGGTTTCTGGAACCAATCCCCCCATACCAAGGGAGGACTGTGTATGTTTAC TGCAGAAAAATAGAGAAAGCAAGGGCAGAGAAGAGAATAAATACCATAAATCCACCACCCATAGGATAAT TTGATGTCTGTCCTTTACATACATACTTACATACTTTTTGTTTTCTGACCAATGGTTATACACTTAAGTT TTTAAAAAGGAATCATAGTATACATAGAATATTGTGAACATCTTTCTGTATGCAATGCATTAAAATAATG AAACCATTTTTAAAAGCTTTTGACACATTTATATATTTATAATATGACAGAAAGTACTAAGTATCTTGTT CACACAGGACTAATATTATGTATATCTAAGTAATATAAATATGTAATGTAGGTAATGTAAATGTGTAATG TATCACGTAGATGTAATATATGTACATAGATGCAATTATAAGCAACCTTTTATTTATAATGAGGTGACGC CACTTCTTTACACAACTCTAGAGGGCGCCATTCGTAGATTCTGGTGCCACAGCGGCCCAATAAAAGTTGA GGAAAAAAGATCGAGATGGGCTCGTTGGCTCTTTCAGTTAGATAATTTTACAAGTAAGCCTTTTGAAGTT TAGAAAGGTTCAGTTAGACCTGGTTATTAAAAACGTTTAATTTCCTCCAGTGAAAAACGGGCGGGAAGCA ACGAACTTTGAAAACAACTAAGGAAGAAAACGCGTCTGCTTACAGTTTGCCAACTACGGGACACCGTGGA AATCCCATCTCGGGATTGGCGCGGTGCCTGCTGGGAGTTGTAGTGCGCCCCTCGCCTTCCGGGCGGCGGT CTGAGGCCCGCGAGACTCCGTTTCCCGGCAGGCCTCGCGTCAAGACGGCCGGCGGGACGGGAGCTGCGGC GCTGGCTACGAGAGTGACCCAGTCAGCGTTGGTTCCCGTCTTGGCCATGGCCTCGTTCGTGACAGAAGTT TTGGCACACTCCGGGAGGCTGGAAAAGGAGGATCTGGGGACCCGGATCAGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZW10_1 ↗ | 11:113,773,692 | 負股 | 113,773,682–113,773,741 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:779 aa
ZW10 kinetochore protein 長 779 個胺基酸,屬於 ZW10 family。序列註解指出,胺基酸 2–317 的區域與 RINT1 互作,胺基酸 2–81 的區域與 ZWINT 互作;這些是標示出的互作區域,來源未提供其更細部的結構域分類。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZW10 的定位隨細胞週期改變:間期多數細胞中呈現於細胞質並呈彌散分布;前中期與動粒相關,至中期則在動粒及紡錘體可見,尤以紡錘體極為明顯。 早期後期可在分離中的動粒偵測到,晚期後期與末期則累積於紡錘體中區。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Chromosome, centromere, kinetochore;Lipid droplet。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- RINT1Q6NUQ1 · UniProt INTERACTION · 19 experiments
- ZWINTO95229 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
ZW10 是 RZZ 複合體的組成成分,該複合體由 KNTC1/ROD、ZW10 與 ZWILCH 組成;它也與 NBAS、ZW10、RINT1/TIP20L 組成 NRZ 複合體。ZW10 與 NBAS、KNTC1/ROD 的互作彼此互斥,與其分別加入兩種囊泡繫留複合體相符。NRZ 與 STX18、USE1L、BNIP1/SEC20L 及 SEC22B 等 SNARE 蛋白相關;ZW10 另可直接與結合 BNIP1/SEC20L 的 RINT1/TIP20L 互作。其他已報導的互作對象包括 C19orf25、ZWINT、ZFYVE1 與 RAB18;ZW10 與 RAB18 的互作在有 ZFYVE1 時增強。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZW10 是有絲分裂檢查點的重要成分,可防止細胞過早退出有絲分裂,並為 dynein-dynactin 與 MAD1-MAD2 複合體組裝至動粒所必需。它與紡錘體組裝機制相關的功能,被認為取決於其加入有絲分裂期 RZZ 複合體。此外,ZW10 參與調節高基氏體與內質網之間的膜運輸;此功能被認為取決於間期 NRZ 複合體,而 NRZ 被認為可能參與內質網上的 SNARE 組裝。 | 含實驗來源 | 證據與來源Essential component of the mitotic checkpoint, which prevents cells from prematurely exiting mitosis. Required for the assembly of the dynein-dynactin and MAD1-MAD2 complexes onto kinetochores. Its function related to the spindle assembly machinery is proposed to depend on its association in the mitotic RZZ complex. Involved in regulation of membrane traffic between the Golgi and the endoplasmic reticulum (ER); the function is proposed to depend on its association in the interphase NRZ complex which is believed to play a role in SNARE assembly at the ER PMID 11590237 ↗ · PMID 15029241 ↗ · PMID 15094189 ↗ · PMID 15485811 ↗ · PMID 15824131 ↗ |
| 交互作用 | ZW10 可與 NBAS 或 KNTC1/ROD 互作,兩種互作彼此互斥,與其分別參與不同囊泡繫留複合體相符。它是由 KNTC1/ROD、ZW10、ZWILCH 組成的 RZZ 複合體,以及由 NBAS、ZW10、RINT1/TIP20L 組成的 NRZ 複合體的成分。NRZ 與 STX18、USE1L、BNIP1/SEC20L、SEC22B 等 SNARE 相關;ZW10 也直接與結合 BNIP1/SEC20L 的 RINT1/TIP20L 互作。其他互作對象包括 C19orf25、ZWINT、ZFYVE1 與 RAB18;有 ZFYVE1 時,ZW10 與 RAB18 的互作增強。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with NBAS and KNTC1/ROD; the interactions are mutually exclusive and indicative for its association in two different vesicle tethering complexes. Component of the RZZ complex composed of KNTC1/ROD, ZW10 and ZWILCH. Component of the NRZ complex composed of NBAS, ZW10 and RINT1/TIP20L; NRZ associates with SNAREs STX18, USE1L, BNIP1/SEC20L and SEC22B (the assembly has been described as syntaxin 18 complex). Interacts directly with RINT1/TIP20L bound to BNIP1/SEC20L. Interacts with C19orf25 and ZWINT. Interacts with ZFYVE1. Interacts with RAB18 and this interaction is enhanced in the presence of ZFYVE1 PMID 12686595 ↗ · PMID 15029241 ↗ · PMID 15272311 ↗ · PMID 15485811 ↗ · PMID 15824131 ↗ · PMID 16732327 ↗ · PMID 20462495 ↗ · PMID 30970241 ↗ |
| 細胞定位 | ZW10 的細胞內定位會隨細胞週期改變。多數細胞在間期時,ZW10 彌散分布於細胞質;前中期與動粒相關,中期則在動粒及紡錘體可見,尤以紡錘體極較明顯。早期後期時可在分離中的動粒偵測到,到了晚期後期及末期則累積於紡錘體中區。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Endoplasmic reticulum membrane / Peripheral membrane protein; Chromosome, centromere, kinetochore; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle; Lipid droplet; Dynamic pattern of localization during the cell cycle. In most cells at interphase, present diffusely in the cytoplasm. In prometaphase, associated with the kinetochore. At metaphase, detected both at the kinetochores and, most prominently, at the spindle, particularly at the spindle poles. In very early anaphase, detected on segregating kinetochores. In late anaphase and telophase, accumulates at the spindle midzone PMID 15029241 ↗ · PMID 11590237 ↗ · PMID 15485811 ↗ · PMID 15824131 ↗ · PMID 30970241 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTCAGCGTTGGTTCCCGTCTTGGCCATGGCCTCGTTCGT40GACAGAAGTTTTGGCACACTCCGGGAGGCTGGAAAAGGAG80GATCTGGGGACCCGGATCAGCCGCCTGACCCGGCGGGTGG120AGGAGATCAAGGGTGAGGTGTGCAATATGATTAGCAAGAA160GTACAGTGAATTCCTGCCTAGCATGCAGAGCGCGCAGGGC200CTGATTACCCAGGTGGATAAGCTATCTGAAGACATTGACC240TGCTGAAATCCAGGATAGAGAGTGAGGTCCGCCGGGATCT280TCACGTATCAACCGGTGAATTTACAGACTTAAAGCAGCAG320TTGGAAAGAGACTCAGTTGTCCTAAGTTTGCTTAAACAGT360TGCAGGAGTTTTCCACTGCTATTGAAGAATATAATTGTGC400ATTAACAGAGAAGAAGTATGTCACTGGTGCTCAGCGTCTG440GAAGAGGCACAGAAATGCTTGAAGTTATTAAAATCCAGAA480AATGCTTTGATTTAAAAATATTGAAATCTCTCAGCATGGA520GCTCACAATACAGAAACAGAACATACTTTATCACCTTGGA560GAAGAGTGGCAGAAGCTGATTGTATGGAAGTTCCCACCAT600CAAAAGATACCAGCAGTTTGGAATCTTACCTACAAACTGA640ACTTCATTTATACACTGAACAATCGCACAAAGAGGAGAAG680ACCCCTATGCCACCCATCAGTTCTGTCCTCTTGGCATTTT720CTGTTCTTGGAGAACTACACAGCAAGCTTAAATCATTTGG760TCAGATGCTGCTGAAGTATATCCTTAGGCCGCTGGCATCT800TGCCCATCCCTTCATGCTGTGATAGAAAGCCAGCCTAACA840TAGTTATTATTCGTTTTGAATCTATAATGACTAACTTGGA880ATATCCATCACCATCTGAAGTTTTTACAAAGATCAGACTG920GTACTAGAAGTGCTCCAGAAACAGCTTCTAGATTTGCCAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。