基因總覽
ZSCAN9(zinc finger and SCAN domain containing 9)是人類的蛋白質編碼基因,產物為 Zinc finger and SCAN domain-containing protein 9,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。此蛋白質長 394 個胺基酸,含有 SCAN box 與多個 C2H2-type zinc finger,呈現由不同結構區域組成的特色。來源僅指出它可能參與轉錄調控,未提供更詳細的分子作用方式或生物學情境。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000252207 ★ | 28,225,275–28,233,487 | 4 |
| ENST00000531941 | 28,224,886–28,227,207 | 2 |
| ENST00000866168 | 28,225,240–28,233,487 | 4 |
| ENST00000919062 | 28,225,240–28,233,487 | 4 |
| ENST00001028702 | 28,225,240–28,229,265 | 2 |
| ENST00000531981 | 28,225,260–28,227,958 | 3 |
| ENST00000425468 | 28,225,260–28,233,487 | 5 |
| ENST00000531979 | 28,225,260–28,233,487 | 4 |
| ENST00000527436 | 28,225,260–28,229,230 | 3 |
| ENST00000919061 | 28,225,260–28,233,487 | 5 |
| ENST00000950585 | 28,225,260–28,233,487 | 5 |
| ENST00000950586 | 28,225,260–28,233,487 | 5 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZSCAN9 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控;此描述表示一項可能的功能角色,並未確認其調控方向、作用標的或具體機制。因此,目前可將它理解為可能與基因轉錄調節有關的蛋白質,但不能據此判定它會促進或抑制特定基因的表現。
現有資料沒有提供 ZSCAN9 參與哪些生物過程、在何種細胞或實驗條件下發揮作用,也未說明其轉錄調控是否直接發生,或是否需要其他分子協助。來源亦未指出其功能對細胞活動的具體影響。這些資訊不足以進一步描繪其作用路徑或生物學意義,故此處僅保留來源所支持的可能性,不將其延伸為已確立的機制或特定功能結果。
Promoter 與基因調控
>ZSCAN9 ENST00000252207 GRCh38 chr6:28224275-28225375 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGGAGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTAGAGACCAGCCTGGCCAACAAAGCGAGACCCTGGTCTCTACCCC CCTCCCCCAAAAAAAATGCTGGGCATGGTGGTATGTGACTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA GGATTGCTTGAGCCAGGAGTTGCAGTCTGCAGTGAGCTATGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGA CAAATTTATTTAATTGGTTTTGGTTTGATTTTGTATTATTATTACTAAAACTCCAGAAAACTTTTACAGC AAAAAAAAAAAACAACAAAAAACAAAAACAAGAAAGAAAGAAAAGGAAAGGAGGATGGGAGAAAGGCAGG AAGGGAGGGAGGAAGGTAGGAAAAGAGGAAGGGAGGGAGGAAAGAAGGCAAGCACGCAGGCAGATGCCTA AATAAAGAATACATAGGGGCCTGGACAAATAAATTGCTTTATGGACTGTTATGCACCCATACAATAAGTT AGACTTACATGATGAGTAAAGCTTTTTAGGATACATGAAGTGAAAACGTTAAAATAAGCGGGGGAGAAAA GGCTAAATATAAAATAATGCCATTGTGTGTGTGAGAGAGGATCACAATGATATACAAATTCCAGGCTAAC GGTGACAGTGGCTGCCTCGGGGAGTGGGACTAAGGAGGGGTAGGTGGGGTTTGACATTTTACTTTATTAA TTTTGGTATTGTCTGAGGGTTTTTAAACCATAAATAATGTATTAATTTTAAAAATGCTTTTAAAAATCAT CATTTTCAATAGTTAACGGTCTATGCTTCATCAACGTTTTCCGTTTAAAACCTGTGTGCGGCCCACACAC GTATGACATTCTGATTATGTGATTCACTGCTGAAAAAGAACTGGACGCCAGGAAATTGGGGGTTGAGTCC GAAGCAAGGTGAACGCCGGACATCGAGACATGGAATCCTAGACCGGCCCGGAAGTGCCTCTGCTCCGTCC GCCTTCGAGGAGAGGTCGGCATCTTTGTTCCCTGCCCGGCCATTGTTCGTGCCGCGCTTCTAGCAACGCC GGGCCGGTAACCCCCTCTCCCTCCTTGCGCGTTCCGGGTCTCGTGAGTTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZSCAN9_1 ↗ | 6:28,225,296 | 正股 | 28,225,247–28,225,306 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_B7L8H · promoter · 28224774–28225349 · regulatory
ENSR6_B7L8K · enhancer · 28225350–28226070 · regulatory
· motif · 28221942–28221953 · motif
· motif · 28221946–28221960 · motif
· motif · 28225229–28225240 · motif
· motif · 28225229–28225240 · motif
· motif · 28225231–28225240 · motif
· motif · 28225772–28225785 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:394 aa
ZSCAN9 蛋白長 394 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其第 52–134 位胺基酸區段註記為 SCAN box;第 254–276、282–304、310–332、338–360 與 366–388 位各有一個 C2H2-type zinc finger,共五個。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZSCAN9 蛋白定位於細胞核;未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 25 個夥伴
- AIRIMQ9NX04 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FBXO17Q96EF6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FHL2Q14192 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GEMP55040 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GFAPP14136 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTRA2O43464 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KAT5Q92993 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIF1BO60333-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO3Q8TAP4-4 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MAGEH1Q9H213 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NEFLP07196 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPIAP62937-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKCAP17252 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRPS1P60891 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SETDB1Q15047-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPRED1Q7Z699 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRPK2P78362 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YWHAGP61981 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF446Q9NWS9 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 2 筆來源紀錄
- ZSCAN22P10073 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZSCAN23Q3MJ62 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ATCTTTGTTCCCTGCCCGGCCATTGTTCGTGCCGCGCTTC40TAGCAACGCCGGGCCGGTAACCCCCTCTCCCTCCTTGCGC80GTTCCGGGTCTCGCAAGCGCCTCCAAGGTTTGTCTTGAAG120CATAGCTCCAGCTGGAGGGTACCTTTTAAGCTGTTCAAGG160TCAAGATGAATACAAACTCAAAGGAGGTTTTATCCCTGGG200TGTTCAAGTTCCCGAGGCATGGGAAGAACTTCTGACAATG240AAAGTGGAAGCAAAAAGTCACCTTCAATGGCAGGAATCCA280GACTGAAACGCAGTAATCCACTGGCAAGGGAAATCTTCCG320AAGGCACTTTCGACAGCTGTGCTACCAAGAGACCCCTGGA360CCAAGGGAGGCTCTTACTCGACTCCAGGAACTTTGCTACC400AGTGGTTGAGGCCACATGTGAGCACAAAGGAGCAGATTTT440GGATCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTTCTATCCATTCTGCCC480AAGGAGCTCCAGGGCTGGGTGAGGGAACACTGTCCAGAGA520GTGGAGAAGAGGCTGTGATTTTGCTGGAGGATCTGGAGAG560AGAGCTCGATGAACCACAACATGAGATGGTGGCCCACAGA600CACAGACAAGAAGTCCTCTGTAAAGAGATGGTGCCTCTAG640CAGAGCAGACACCACTGACCCTTCAGTCCCAGCCTAAGGA680GCCACAGCTCACATGTGACTCTGCTCAGAAGTGCCATTCT720ATTGGAGAGACAGATGAAGTAACCAAGACTGAGGACAGAG760AGTTGGTGCTAAGGAAAGACTGTCCTAAGATAGTGGAACC800ACATGGGAAAATGTTTAATGAGCAGACCTGGGAGGTATCA840CAGCAGGATCCCTCACATGGAGAAGTTGGTGAACATAAGG880ATAGGATAGAGAGGCAGTGGGGAAACCTCTTAGGAGAGGG920GCAACACAAATGTGATGAATGTGGGAAGAGCTTTACTCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。