基因總覽
zinc finger and SCAN domain containing 31(ZSCAN31)是蛋白質編碼基因,產物為 Zinc finger and SCAN domain-containing protein 31,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。此蛋白質長 406 個胺基酸,具有 SCAN box,並含有六個 C2H2 型鋅指。現有資料提供其家族歸屬與結構特徵,並指出它可能具有轉錄因子功能;相關功能仍以可能性描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000344279 ★ | 28,324,737–28,336,148 | 4 |
| ENST00000439158 | 28,324,695–28,336,134 | 4 |
| ENST00000396838 | 28,324,695–28,354,206 | 8 |
| ENST00000611469 | 28,324,695–28,336,375 | 4 |
| ENST00000414429 | 28,324,695–28,356,271 | 8 |
| ENST00000446474 | 28,324,695–28,336,134 | 3 |
| ENST00000881652 | 28,324,695–28,354,273 | 5 |
| ENST00000881653 | 28,324,695–28,354,273 | 4 |
| ENST00000881654 | 28,324,695–28,354,273 | 4 |
| ENST00000881655 | 28,324,695–28,354,206 | 7 |
| ENST00000881656 | 28,324,695–28,354,273 | 5 |
| ENST00000881657 | 28,324,695–28,354,273 | 4 |
顯示 12/41 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZSCAN31 產物可能具有轉錄因子功能。此項功能描述屬於推測性資訊,現有資料未進一步說明其調控的基因、作用方式或轉錄調控方向,因此不能據此判定特定的分子機制。
此外,ZSCAN31 可能參與多種胚胎器官的發育。資料未指出涉及哪些器官、發育階段或具體生物學過程,也未說明其參與方式;因此,這項描述僅支持其可能與多個胚胎器官的發育有關,不能延伸為已確認的發育作用或因果機制。
Promoter 與基因調控
>ZSCAN31 ENST00000344279 GRCh38 chr6:28336048-28337148 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCTGCTGAGTCTTGTTTTGCCCCATTAGTTTTCCTCTCTCTTCCACGCCACGAATTCAAACTAATACATA CATTTATTTCCTACATACGTACTTAGCATGTTCCAGAGGCTATTCTCATCGATTTACAAGCACTTATTTT ATTTTACTTCATTTCACATGCACGTCTGTTTTACGCAGTTACTTGTTTACACGCTCTTCTTCTAGACTTT GGGATTCCAGAAGACAGAGGTTTGAGTGTAAAACACAAAATAACAAAACCACAACAAAAACAACTCTGTA TTCTCGTCCCCACCATTACCATCTCTCCTTTGTGATGTCAAAGAGACCAGAGGAAGTGGACAGACTCGGG GAAGAATAGGTAAGTATTAGAGACAGAAAAAGTATGAAGTCCCTTCTGTGAGGACTAACAATAGTGATGC CATTTTACAACCTTGATGACTGTGTTCTCAAGAAACAAAGCAAATGTCAACCCCGTCCATAGCTTCAACA GAGCATAACAGCTCTAACCGCAACAGAGCCTAACGGCCCTAACCACATCTGTCCCCAGTTGGAAAGTGTC CAAACAGTTCCAACTAGCCAGCACTTCCCCAACCCCTCCCCAACAGAAACTTTATTATAAAAGCCTCAGC TTGTAAGCGATCAGGATCTCAGCCAGATTCCTAACTGGAACTCTTCGCAGGCTTTTCCTGTAAATAAACC TGTTTGGCCGTGGAATTGCCTCCTGTTACTCGCTCTCTACGTTTATATCTTCCTAACACCTTCCGGCTCT AATGTTTTGGGTCTCGATGACCATCTAACTCCTAAATGCTGGGGGCCGCTCCCCATAGAAATGCCTCGCC GGATTTCTCCGCCTCGCACCCAGTGGGACTGGGATTTTTGGCCCCGGGGTTTGCAATAAGGGAGTCACCA AGCAGCAGCCACCTCTGGAATTCCTAGAAAGGAAAGAGTTGCCTGGCTTCAGCCAGTGGGCTCAGAACGG CTGACGCATTTCCGGCCTTTGCGGTTGATCGGTCATTGGGGTGCTGCAGCCCCGCCACCTGTTCCGTAGC TTGCCGGTGCCCCGAAGGTGAGTCTTGGCCCCTTGTCGCGACCCGCCAGGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZSCAN31_2 ↗ | 6:28,336,148 | 負股 | 28,336,138–28,336,197 |
| ZSCAN31_1 ↗ | 6:28,354,204 | 負股 | 28,354,194–28,354,253 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_9F8MW · promoter · 28335172–28335672 · regulatory
ENSR6_9F8N3 · enhancer · 28335673–28336123 · regulatory
ENSR6_B7LSL · promoter · 28336124–28336865 · regulatory
· motif · 28333213–28333227 · motif
· motif · 28333213–28333227 · motif
· motif · 28334467–28334478 · motif
· motif · 28335369–28335375 · motif
· motif · 28335409–28335423 · motif
· motif · 28335409–28335423 · motif
· motif · 28335686–28335700 · motif
· motif · 28335686–28335700 · motif
· motif · 28335698–28335718 · motif
· motif · 28335880–28335895 · motif
· motif · 28335880–28335895 · motif
· motif · 28335923–28335933 · motif
· motif · 28335974–28335984 · motif
· motif · 28335974–28335987 · motif
· motif · 28335981–28335988 · motif
· motif · 28335983–28335999 · motif
· motif · 28335986–28335997 · motif
· motif · 28335986–28335997 · motif
· motif · 28336007–28336017 · motif
· motif · 28336110–28336120 · motif
· motif · 28336142–28336150 · motif
· motif · 28336142–28336157 · motif
· motif · 28336142–28336159 · motif
· motif · 28336611–28336628 · motif
· motif · 28336636–28336644 · motif
· motif · 28336636–28336651 · motif
· motif · 28336827–28336849 · motif
· motif · 28336827–28336849 · motif
· motif · 28336876–28336893 · motif
· motif · 28336885–28336893 · motif
· motif · 28337215–28337228 · motif
· motif · 28339954–28339965 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:406 aa
ZSCAN31 蛋白質長 406 個胺基酸,含一個位於第 39 至 121 個胺基酸的 SCAN box,以及六個 C2H2 型鋅指,分布於第 239 至 401 個胺基酸區段。其家族歸屬為 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZSCAN31 的細胞內定位為細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SPRED1Q7Z699 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCGGTTGATCGGTCATTGGGGTGCTGCAGCCCCGCCACCT40GTTCCGTAGCTTGCCGGTGCCCCGAAGGTGTCTTCTCCTA80AGGAAGATTAAATCAGAAAATTTTAAATCACAGTTATCCC120TTTACTTAAAGCCAGAGTAAGCCTTCCAAATTAACCCCAG160GAATGGCTTCAACAGAGGAACAGTACGATCTTAAGATTGT200GAAAGTGGAGGAAGACCCTATCTGGGACCAAGAAACCCAC240CTTCGAGGGAACAACTTTTCTGGCCAAGAAGCCTCCCGAC280AACTTTTTAGGCAGTTTTGTTACCAAGAGACTCCTGGTCC320CCGAGAAGCTCTGAGCCGGCTCCGAGAACTCTGTCATCAG360TGGCTAAGGCCAGAAATCCACACCAAAGAGCAAATCTTGG400AGCTGCTGGTGCTGGAGCAATTCCTGACTATCCTGCCTGA440GGAGCTCCAGGCCTGGGTGCGGGAGCACCATCCGGAGAGT480GGGGAGGAGGCTGTGGCTGTAGTTGAAGATCTGGAACAAG520AGCTTAGTGAGCCAGGGAACCAGGCTCCAGACCATGAACA560TGGACATTCTGAAGTGCTCTTGGAGGATGTGGAACATCTG600AAGGTCAAGCAGGAACCAACAGACATACAGCTTCAGCCTA640TGGTGACACAGCTCAGATATGAATCTTTTTGCCTCCACCA680ATTTCAAGAACAAGATGGTGAAAGTATACCTGAGAACCAG720GAGTTGGCATCAAAGCAAGAAATCTTAAAAGAAATGGAAC760ATTTGGGGGATAGCAAACTCCAAAGAGATGTATCTTTGGA800TTCTAAGTACAGAGAAACTTGTAAACGAGACAGCAAGGCA840GAAAAGCAGCAGGCACATTCCACTGGAGAGAGACGCCACA880GGTGCAATGAATGTGGGAAAAGCTTCACTAAGAGTTCAGT920ACTCATTGAGCACCAGAGAATCCACACTGGGGAGAAGCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。