基因總覽
ZSCAN26(zinc finger and SCAN domain containing 26)是蛋白質編碼基因,產物為 Zinc finger and SCAN domain-containing protein 26。其蛋白質全長 478 個胺基酸,具有 SCAN box,並含有多個 C2H2 型鋅指區域;其中第一個鋅指被註記為退化型。序列中另有兩段被標示為無序區。現有資料將其功能描述為可能參與轉錄調控,但未提供更具體的調控標的或分子作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000421553 ★ | 28,267,143–28,278,204 | 4 |
| ENST00000316606 | 28,267,045–28,278,224 | 4 |
| ENST00000623276 | 28,267,045–28,278,224 | 4 |
| ENST00000934901 | 28,267,045–28,278,224 | 4 |
| ENST00000951043 | 28,267,045–28,278,224 | 4 |
| ENST00000951046 | 28,267,045–28,278,224 | 5 |
| ENST00001037218 | 28,267,045–28,278,224 | 4 |
| ENST00001124926 | 28,267,045–28,278,224 | 5 |
| ENST00001124927 | 28,267,045–28,278,218 | 4 |
| ENST00001124928 | 28,267,045–28,278,016 | 4 |
| ENST00001133096 | 28,267,045–28,278,224 | 4 |
| ENST00000617168 | 28,267,143–28,272,703 | 3 |
顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZSCAN26 的功能註記指出,它可能參與轉錄調控。這項描述帶有不確定性,僅支持其可能與轉錄調控有關,並未說明它是促進或抑制轉錄,也沒有指出受影響的基因、細胞類型或生物學過程。
現有資料未提供其如何作用於轉錄的細節,也未說明 SCAN box 或鋅指區域是否參與特定分子互作、DNA 辨識或其他調控步驟。因此,不能據此推定 ZSCAN26 的直接作用標的、調控方向或具體機制;其在細胞中的功能意義仍須限於「可能參與轉錄調控」這一層級。
Promoter 與基因調控
>ZSCAN26 ENST00000421553 GRCh38 chr6:28266143-28267243 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAATTGGCTTAGGATAAATGGCCTCCAGCTGCATCCATG TTGCTGCAAAGGACATGATCTCATTCTTTTAGCTGCATGATATTCCATGGTGTTATGTACCACATTTTCT TTTTCCAGTCCACCACTGATGGGCATCTAGGTTGATTCCATGTTTCTGCTATTGTGAAAAGTGCTGTGAT GAACATACACATGCATGGTCTTTATGGTAGAACAGTATATTCCTCTGGGTATATACCCAATAATGGAATT GCTGGGTCAAATGAGAGCTCTGTTTTAAGTTCCTTAAGAAATTTCCAAATTGCTTTCCACAGTGGCAGAA CTAATTTACATTCCCACTAGCAATGTATAAGCATTCAAAGAGTTTATCTTATTCAAAAACTATAAAAACC CAGTTTGTGATACTGTGGGCAAGAGAGACTATTTCTGTTCTCTGTTGTAGAATTTATTTTGATAAAGTGA TATCTGTTGCTTTTATTCCCCCTGAAACTTACATTGATTGCAAAGTGTTGTTGATTTATTTTCTCTCACA GTAATAGCCCTAATTTCTTCTTACCTTAAACCTTTCAATCCAAACGTATGTCCATTGTTTAGTTTAATTT TCGAAATACTTTGACAATTATTTTTGCCATTGTGTTTGATGAATTTCTAAATTGCGAAAAATGGCGAAGT ATGTGTGTTTTATTTATGTGAGCAAAGTGAAAATGTTGGCTGTTTGTGATAACACTCAACGGAGCTGGCC TGTTTTTACATGAATAAAATAAACATCCACTTTAAAATGAGAAAACAAAAACAAAAACAGAAACAAAAAA AAAACCCCAACAATCTTAGCTCACAACGAAATGACCCTCCCAGCCGTCCTCAGCAGGCAGCACCCATGTT AGTCTCCTTCTGCGATGCCTAAGCGGCAGCACCATCGAGCCAAGGTCCTCCAGCGTTCCTAGAGCGGAGA AGAAAGCGCTCCGAAGAGCTAGAGCTGACACTCGGCGATGAGCTAAGACGCTGTTTCAGAGCGTTTGGGT CCTCTGAGGCCCCTTGACCAGGTGAGCGGACCCTGGAGCTGGGCCCCGGGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZSCAN26_1 ↗ | 6:28,267,143 | 正股 | 28,267,094–28,267,153 |
| ZSCAN26_2 ↗ | 6:28,277,204 | 正股 | 28,277,155–28,277,214 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_B7LGJ · promoter · 28266568–28267369 · regulatory
ENSR6_9F7X9 · enhancer · 28267370–28267771 · regulatory
ENSR6_9F7XT · enhancer · 28269462–28269836 · regulatory
· motif · 28266261–28266276 · motif
· motif · 28266831–28266841 · motif
· motif · 28266883–28266898 · motif
· motif · 28267239–28267252 · motif
· motif · 28267516–28267533 · motif
· motif · 28267518–28267533 · motif
· motif · 28267525–28267533 · motif
· motif · 28268000–28268012 · motif
· motif · 28269706–28269714 · motif
資料指出,血清刺激與 ZSCAN26 的調控有關;但未提供刺激條件、調控方向或具體變化內容,因此無法進一步判定其如何影響基因表現。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:478 aa
Zinc finger and SCAN domain-containing protein 26 長 478 個胺基酸。其 SCAN box 位於第 51–133 位胺基酸;鋅指區域包括第 231–253 位的退化型 C2H2-type 1,以及第 282–304、310–332、338–360、366–388、394–416、422–444 與 450–472 位的 C2H2 型鋅指。另有兩段無序區,分別位於第 159–181 位與第 200–226 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 16 個夥伴
- CCDC136Q96JN2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCNDBP1O95273 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDR2LQ86X02 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FSD2A1L4K1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSPB1P04792 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-4P60372 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-5P60370 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- KRTAP10-9P60411 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP4-12Q9BQ66 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- PDE4DIPQ5VU43 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZSCAN26 可能參與轉錄調控;此描述保留可能性,未指出調控方向、標的或具體作用機制。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | ZSCAN26 蛋白質定位於細胞核。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 血清刺激與 ZSCAN26 的調控有關;資料未進一步說明調控方向或變化內容。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGAGCTGACACTCGGCGATGAGCTAAGACGCTGTTTCAGA40GCGTTTGGGTCCTCTGAGGCCCCTTGACCAGGAGTGTCTC80TGAAGATACAGTCCAAAGAAAGTTCTCCAAAACAAGGAGA120ACAGTCTGAAGCTGGGGATGGCAACAGCATTGGTGAGTGC160CCATTCCCTGGCTCCCCTGAATCTGAAGAAGGAGGGGCTT200CGGGTAGTGAGGGAGGATCACTACTCTACTTGGGAACAGG240GATTCAAGCTGCAAGGAAACAGTAAAGGCCTTGGACAGGA280GCCATTGTGCAAACAATTCAGGCAGTTGCGTTATGAAGAG320ACCACAGGACCTCGAGAAGCACTAAGTCGGCTCCGGGAGC360TCTGTCAACAGTGGCTACAGCCCGAGACCCATACCAAGGA400GCAGATCCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTTCTGATC440ATCCTGCCTAAGGAGCTCCAGGCCCGGGTGCAGGAGCATC480ACCCAGAGAGCAGGGAGGACGTGGTTGTTGTTCTGGAGGA520TTTGCAGCTGGATCTTGGAGAAACAGGACAACAGGTGGAC560CCAGACCAGCCAAAGAAACAAAAAATACTTGTGGAGGAGA600TGGCCCCTCTGAAAGGAGTACAGGAACAGCAGGTTCGGCA640TGAGTGTGAAGTTACAAAGCCTGAGAAAGAGAAGGGTGAG680GAGACAAGGATTGAGAATGGGAAGCTTATTGTAGTAACAG720ACTCTTGTGGAAGAGTAGAGTCATCTGGGAAAATATCTGA760ACCCATGGAGGCTCATAATGAGGGCTCTAACTTGGAAAGG800CATCAGGCCAAGCCCAAAGAGAAGATTGAGTATAAATGCT840CAGAACGTGAGCAGAGATTCATCCAGCACTTGGACCTGAT880TGAACATGCGAGTACACACACGGGAAAGAAACTCTGCGAG920TCTGATGTGTGTCAGAGTTCCAGTCTTACAGGACATAAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。