演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZSCAN26SRE-ZBP

zinc finger and SCAN domain containing 26

ZSCAN26 是蛋白質編碼基因,其產物具有 SCAN box 與多個 C2H2 型鋅指,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens6p22.1UniProt Q16670
OFFICIAL SYMBOL
ZSCAN26
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q16670
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZSCAN26(zinc finger and SCAN domain containing 26)是蛋白質編碼基因,產物為 Zinc finger and SCAN domain-containing protein 26。其蛋白質全長 478 個胺基酸,具有 SCAN box,並含有多個 C2H2 型鋅指區域;其中第一個鋅指被註記為退化型。序列中另有兩段被標示為無序區。現有資料將其功能描述為可能參與轉錄調控,但未提供更具體的調控標的或分子作用方式。

Official symbol
ZSCAN26
Gene name
zinc finger and SCAN domain containing 26
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12978
UniProt
Q16670
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SRE-ZBPZNF187

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p22.1
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegZSCAN26pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr6:28,267,045–28,278,224
Gene span
11,180 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000421553 ★28,267,143–28,278,2044
ENST0000031660628,267,045–28,278,2244
ENST0000062327628,267,045–28,278,2244
ENST0000093490128,267,045–28,278,2244
ENST0000095104328,267,045–28,278,2244
ENST0000095104628,267,045–28,278,2245
ENST0000103721828,267,045–28,278,2244
ENST0000112492628,267,045–28,278,2245
ENST0000112492728,267,045–28,278,2184
ENST0000112492828,267,045–28,278,0164
ENST0000113309628,267,045–28,278,2244
ENST0000061716828,267,143–28,272,7033

顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZSCAN26 的功能註記指出,它可能參與轉錄調控。這項描述帶有不確定性,僅支持其可能與轉錄調控有關,並未說明它是促進或抑制轉錄,也沒有指出受影響的基因、細胞類型或生物學過程。

現有資料未提供其如何作用於轉錄的細節,也未說明 SCAN box 或鋅指區域是否參與特定分子互作、DNA 辨識或其他調控步驟。因此,不能據此推定 ZSCAN26 的直接作用標的、調控方向或具體機制;其在細胞中的功能意義仍須限於「可能參與轉錄調控」這一層級。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 28267143 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZSCAN26 ENST00000421553 GRCh38 chr6:28266143-28267243 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAATTGGCTTAGGATAAATGGCCTCCAGCTGCATCCATG
TTGCTGCAAAGGACATGATCTCATTCTTTTAGCTGCATGATATTCCATGGTGTTATGTACCACATTTTCT
TTTTCCAGTCCACCACTGATGGGCATCTAGGTTGATTCCATGTTTCTGCTATTGTGAAAAGTGCTGTGAT
GAACATACACATGCATGGTCTTTATGGTAGAACAGTATATTCCTCTGGGTATATACCCAATAATGGAATT
GCTGGGTCAAATGAGAGCTCTGTTTTAAGTTCCTTAAGAAATTTCCAAATTGCTTTCCACAGTGGCAGAA
CTAATTTACATTCCCACTAGCAATGTATAAGCATTCAAAGAGTTTATCTTATTCAAAAACTATAAAAACC
CAGTTTGTGATACTGTGGGCAAGAGAGACTATTTCTGTTCTCTGTTGTAGAATTTATTTTGATAAAGTGA
TATCTGTTGCTTTTATTCCCCCTGAAACTTACATTGATTGCAAAGTGTTGTTGATTTATTTTCTCTCACA
GTAATAGCCCTAATTTCTTCTTACCTTAAACCTTTCAATCCAAACGTATGTCCATTGTTTAGTTTAATTT
TCGAAATACTTTGACAATTATTTTTGCCATTGTGTTTGATGAATTTCTAAATTGCGAAAAATGGCGAAGT
ATGTGTGTTTTATTTATGTGAGCAAAGTGAAAATGTTGGCTGTTTGTGATAACACTCAACGGAGCTGGCC
TGTTTTTACATGAATAAAATAAACATCCACTTTAAAATGAGAAAACAAAAACAAAAACAGAAACAAAAAA
AAAACCCCAACAATCTTAGCTCACAACGAAATGACCCTCCCAGCCGTCCTCAGCAGGCAGCACCCATGTT
AGTCTCCTTCTGCGATGCCTAAGCGGCAGCACCATCGAGCCAAGGTCCTCCAGCGTTCCTAGAGCGGAGA
AGAAAGCGCTCCGAAGAGCTAGAGCTGACACTCGGCGATGAGCTAAGACGCTGTTTCAGAGCGTTTGGGT
CCTCTGAGGCCCCTTGACCAGGTGAGCGGACCCTGGAGCTGGGCCCCGGGC
ZSCAN26 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZSCAN26_1 ↗6:28,267,143正股28,267,094–28,267,153
ZSCAN26_2 ↗6:28,277,204正股28,277,155–28,277,214

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_B7LGJ · promoter · 28266568–28267369 · regulatory

ENSR6_9F7X9 · enhancer · 28267370–28267771 · regulatory

ENSR6_9F7XT · enhancer · 28269462–28269836 · regulatory

· motif · 28266261–28266276 · motif

· motif · 28266831–28266841 · motif

· motif · 28266883–28266898 · motif

· motif · 28267239–28267252 · motif

· motif · 28267516–28267533 · motif

· motif · 28267518–28267533 · motif

· motif · 28267525–28267533 · motif

· motif · 28268000–28268012 · motif

· motif · 28269706–28269714 · motif

資料指出,血清刺激與 ZSCAN26 的調控有關;但未提供刺激條件、調控方向或具體變化內容,因此無法進一步判定其如何影響基因表現。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:478 aa

1 aa478 aa結構域功能區域鋅指
依 Q16670 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Zinc finger and SCAN domain-containing protein 26 長 478 個胺基酸。其 SCAN box 位於第 51–133 位胺基酸;鋅指區域包括第 231–253 位的退化型 C2H2-type 1,以及第 282–304、310–332、338–360、366–388、394–416、422–444 與 450–472 位的 C2H2 型鋅指。另有兩段無序區,分別位於第 159–181 位與第 200–226 位。

結構域SCAN box51–133 aa
鋅指C2H2-type 1; degenerate231–253 aa
鋅指C2H2-type 2282–304 aa
鋅指C2H2-type 3310–332 aa
鋅指C2H2-type 4338–360 aa
鋅指C2H2-type 5366–388 aa
鋅指C2H2-type 6394–416 aa
鋅指C2H2-type 7422–444 aa
鋅指C2H2-type 8450–472 aa
功能區域Disordered159–181 aa
功能區域Disordered200–226 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q16670…

AlphaFold · Q16670

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 16 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SRE-ZBPZSCAN26CCDC136CCNDBP1CDR2LFSD2GOLGA6L9GRNHSPB1KRTAP10-4KRTAP10-5KRTAP10-7KRTAP10-9KRTAP4-12MTUS2PDE4DIPTRIM41WFS1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 16 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZSCAN26 可能參與轉錄調控;此描述保留可能性,未指出調控方向、標的或具體作用機制。推論支持
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZSCAN26 蛋白質定位於細胞核。含實驗來源
證據與來源

Nucleus

PMID 1569959 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控血清刺激與 ZSCAN26 的調控有關;資料未進一步說明調控方向或變化內容。含實驗來源
證據與來源

By serum stimulation

PMID 1569959 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000421553 · 2,685 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGCTGACACTCGGCGATGAGCTAAGACGCTGTTTCAGA40
41GCGTTTGGGTCCTCTGAGGCCCCTTGACCAGGAGTGTCTC80
81TGAAGATACAGTCCAAAGAAAGTTCTCCAAAACAAGGAGA120
121ACAGTCTGAAGCTGGGGATGGCAACAGCATTGGTGAGTGC160
161CCATTCCCTGGCTCCCCTGAATCTGAAGAAGGAGGGGCTT200
201CGGGTAGTGAGGGAGGATCACTACTCTACTTGGGAACAGG240
241GATTCAAGCTGCAAGGAAACAGTAAAGGCCTTGGACAGGA280
281GCCATTGTGCAAACAATTCAGGCAGTTGCGTTATGAAGAG320
321ACCACAGGACCTCGAGAAGCACTAAGTCGGCTCCGGGAGC360
361TCTGTCAACAGTGGCTACAGCCCGAGACCCATACCAAGGA400
401GCAGATCCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTTCTGATC440
441ATCCTGCCTAAGGAGCTCCAGGCCCGGGTGCAGGAGCATC480
481ACCCAGAGAGCAGGGAGGACGTGGTTGTTGTTCTGGAGGA520
521TTTGCAGCTGGATCTTGGAGAAACAGGACAACAGGTGGAC560
561CCAGACCAGCCAAAGAAACAAAAAATACTTGTGGAGGAGA600
601TGGCCCCTCTGAAAGGAGTACAGGAACAGCAGGTTCGGCA640
641TGAGTGTGAAGTTACAAAGCCTGAGAAAGAGAAGGGTGAG680
681GAGACAAGGATTGAGAATGGGAAGCTTATTGTAGTAACAG720
721ACTCTTGTGGAAGAGTAGAGTCATCTGGGAAAATATCTGA760
761ACCCATGGAGGCTCATAATGAGGGCTCTAACTTGGAAAGG800
801CATCAGGCCAAGCCCAAAGAGAAGATTGAGTATAAATGCT840
841CAGAACGTGAGCAGAGATTCATCCAGCACTTGGACCTGAT880
881TGAACATGCGAGTACACACACGGGAAAGAAACTCTGCGAG920
921TCTGATGTGTGTCAGAGTTCCAGTCTTACAGGACATAAGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。