演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZSCAN21DKFZp434L134

zinc finger and SCAN domain containing 21

ZSCAN21 是鋅指與 SCAN 結構域蛋白,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族;來源以相似性推定其具強轉錄活化能力,並參與精子生成及減數分裂前期 I 的進程。

Homo sapiens7q22.1UniProt Q9Y5A6
OFFICIAL SYMBOL
ZSCAN21
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q9Y5A6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZSCAN21(zinc finger and SCAN domain containing 21)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質全長 473 個胺基酸,具有位於 N 端區域的 SCAN box,以及多個 C2H2 型鋅指;序列中另有兩段被註記為無序區。這些結構註解勾勒出其蛋白質組成,但現有資料未提供各區域在細胞中的具體作用細節。功能資料則以相似性推定其具強轉錄活化能力,並與精子生成及精母細胞減數分裂前期 I 的進程相關。

Official symbol
ZSCAN21
Gene name
zinc finger and SCAN domain containing 21
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13104
UniProt
Q9Y5A6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DKFZp434L134NY-REN-21Zipro1ZNF38

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q22.1
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegZSCAN21pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr7:100,049,767–100,081,304
Gene span
31,538 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000292450 ★100,049,774–100,065,0404
ENST00000456748100,049,767–100,065,0385
ENST00000906174100,049,767–100,065,0405
ENST00000906175100,049,767–100,065,0374
ENST00000906176100,049,767–100,065,0375
ENST00000906177100,049,767–100,065,0365
ENST00000906178100,049,767–100,065,0375
ENST00000938146100,049,767–100,065,0435
ENST00000938147100,049,767–100,065,0405
ENST00000938148100,049,767–100,065,0375
ENST00000938149100,049,767–100,065,0355
ENST00001119301100,049,767–100,065,0454

顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZSCAN21 被描述為強效轉錄活化因子,但這項功能是依據相似性推定,並非此處列出的直接實驗結果。資料沒有說明它活化哪些基因、如何辨識或調控特定 DNA 序列,也未提供其轉錄活化作用的分子步驟,因此不能據此進一步指定目標或機制。

在生殖相關功能方面,資料指出 ZSCAN21 對精子生成具有重要作用,並將其與精母細胞減數分裂前期 I 的進程連結。原始註記將這些功能同樣標示為依相似性推定;因此,這些描述反映的是推論性功能註解,而非此資料中已呈現的直接驗證。資料也未交代其作用發生於精子生成的哪個具體階段,或如何影響減數分裂前期 I。

綜合而言,來源支持將 ZSCAN21 描述為可能參與轉錄活化,且對精子生成及精母細胞減數分裂前期 I 進程具有重要性;但各項功能的依據均帶有相似性推定的限制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 100049774 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZSCAN21 ENST00000292450 GRCh38 chr7:100048774-100049874 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACAACCTAGATCCCTCGCATGCACTGTCCACAATAGGGTTTGTGCTCCTGTAAGAATCTAATGCTATGGC
TGATCTGACAGGAGGCGGAGCTCAGGCAGTAATTAGAGCAATGGGGAGTGGCTGTAGATACAGGTGAAGC
TTTGCTCCTGCAGCTCACCTCCTGCAGTAACGGCCCAGTTCCTAACAGGCCATGGACTGGTATCTGTCTG
TGCCCCAAGGGTTGGGGACCCCTGCCTTAGTCATCCCAGACATTCCTTTCTATTGATTATAGGTCTTTAG
ACAATAACTTTCAGCCAGTTGCCCATTAGAAGATCCTTGAGTTCACCTATGACTTGGAACATCCCCGCTT
GGAATTGTCCTGCCTTTCCCACAGAACCAATGTTCATCTTACATGTCTTGATTGGTGTCTTATGTCTCCC
TAAATTGTATAAACCCAAGCTGTAGCCCGACCATCATAGGTACATGTTCTTAGGACCTCTTGAGACTGTA
CCTTGGGCCATTGGTCACTCATATTTGTCTCAAAATAAATGTCTTCAAATATTTTACAGTTTGATTGTTT
TCATCAACGAAGTATTAACTCAATCTCTGGCTTCACGGGCCAAGCACAGCGTTCCATGTCCATAAACCTG
GACCGAGGAGCTGGGCCCAAGGGTATCCAGTGACCTCGATCCAGGTTTATGGACAAGGAACCCTGTGCTT
ATCCCAAGGGTACTCAGGGACCTTGGGCTCTGAAGTCCACGAGGGTGACCGAGGTGGCTGCCTCAGCCCA
TGCCCTCCCTGCCCCAGGGCGTCGGGGTTGGGTGAGAGAACCGCCGCAGCCTTCATCTGGTCTGACCGTC
TTCGGTAAAAACAGAAAGAGTCCCTGGCTTTTCATTTTCGGGGTGGACTCAACTCCTCCCTGATGTCCCA
AGGGCCAGAGACACAGAGAGGACCTCCCGAATTTCTAGAGGGGCCGCTACGGCCCCGCACTACTTTTCCG
CGGGGGCGGGGCTATGACGCACTTCCGGGTGCGCGGTCCCGAGGTACGCGGTGCGGTCTCCCGGTACCCG
GAGCGGCTCTGATTCATGGTGAGCCTGCTGGTCGCGGGTTAGCGAGGCGGA
ZSCAN21 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZSCAN21_1 ↗7:100,049,774正股100,049,725–100,049,784

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_93GP66 · enhancer · 100044740–100045019 · regulatory

ENSR7_5TJCGW · CTCF_binding_site · 100044907–100044928 · regulatory

ENSR7_93GP7H · promoter · 100049284–100049784 · regulatory

ENSR7_BPT4S · enhancer · 100049785–100050477 · regulatory

ENSR7_5TJDBW · CTCF_binding_site · 100049870–100049891 · regulatory

ENSR7_93GP8L · enhancer · 100053146–100053579 · regulatory

ENSR7_5TJDWZ · CTCF_binding_site · 100053343–100053364 · regulatory

ENSR7_5TJDXF · CTCF_binding_site · 100053444–100053465 · regulatory

· motif · 100044897–100044913 · motif

· motif · 100044909–100044925 · motif

· motif · 100049138–100049149 · motif

· motif · 100049473–100049486 · motif

· motif · 100049473–100049486 · motif

· motif · 100049571–100049582 · motif

· motif · 100049677–100049690 · motif

· motif · 100049773–100049782 · motif

· motif · 100049773–100049784 · motif

· motif · 100049773–100049784 · motif

· motif · 100049872–100049888 · motif

· motif · 100053345–100053361 · motif

· motif · 100053364–100053377 · motif

· motif · 100053446–100053462 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:473 aa

1 aa473 aa結構域功能區域鋅指
依 Q9Y5A6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZSCAN21 蛋白質長 473 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其 SCAN box 位於第 45–127 位胺基酸,另有七個 C2H2 型鋅指,分布於第 277–466 位區間。第 127–169 位及第 244–272 位胺基酸區段被註記為無序區。

結構域SCAN box45–127 aa
鋅指C2H2-type 1277–299 aa
鋅指C2H2-type 2305–327 aa
鋅指C2H2-type 3333–354 aa
鋅指C2H2-type 4360–382 aa
鋅指C2H2-type 5388–410 aa
鋅指C2H2-type 6416–438 aa
鋅指C2H2-type 7444–466 aa
功能區域Disordered127–169 aa
功能區域Disordered244–272 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9Y5A6…

AlphaFold · Q9Y5A6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 ZSCAN21 定位於細胞核。 此註記未提供定位改變的條件或動態,也未描述不同異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 25 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DKFZp434L134ZSCAN21CAVIN1CEP70CLK2DVL3GRAP2KRT40KRTAP10-5KRTAP10-7KRTAP10-8KRTAP10-9KRTAP12-3PICK1TRIM41ZKSCAN4ZKSCAN7ZNF213ZNF24ZNF396ZNF446ZNF483ZNF496ZNF837ZSCAN12ZSCAN22ZSCAN23
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 25 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZSCAN21 被描述為強效轉錄活化因子,但此功能是依相似性推定。它也被推定對精子生成具有重要作用,並為精母細胞減數分裂前期 I 進程所必需;這些功能描述同樣帶有相似性推定的限制。推論支持
證據與來源

Strong transcriptional activator (By similarity). Plays an important role in spermatogenesis; essential for the progression of meiotic prophase I in spermatocytes (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZSCAN21 的細胞內定位為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000292450 · 2,009 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTTCCGGGTGCGCGGTCCCGAGGTACGCGGTGCGGTCTC40
41CCGGTACCCGGAGCGGCTCTGATTCATGGTTTAACTTGTG80
81GCCCTAAAGAACTGGAAACCCAAAGGAACGAATATTCCTG120
121CCCCACAGAGTCCCATCTTTGGTGAGGCTGTTTCTGGAGT160
161TTACATGATGACCAAGGTACTAGGCATGGCCCCAGTTCTG200
201GGCCCTAGGCCTCCACAGGAGCAGGTGGGGCCTCTGATGG240
241TAAAAGTCGAGGAGAAAGAAGAGAAAGGCAAGTACCTTCC280
281TAGCCTGGAGATGTTCCGCCAGCGCTTCAGGCAGTTTGGG320
321TACCATGATACCCCTGGACCCCGAGAGGCCCTGAGCCAAC360
361TCCGGGTGCTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCCGAGATCCA400
401CACCAAGGAGCAGATCCTGGAGCTACTGGTGCTGGAGCAG440
441TTCCTGACCATCCTGCCCCAGGAGCTCCAGGCCTGGGTGC480
481AGGAGCATTGCCCGGAGAGCGCTGAAGAGGCTGTCACTCT520
521CCTCGAAGATCTGGAGCGGGAACTGGATGAGCCAGGACAC560
561CAGGTCTCAACTCCTCCAAACGAACAGAAACCGGTGTGGG600
601AGAAGATATCCTCCTCAGGAACTGCAAAGGAATCCCCGAG640
641CAGCATGCAGCCACAGCCCTTGGAGACCAGTCACAAATAC680
681GAGTCTTGGGGGCCCCTGTACATCCAAGAGTCTGGTGAGG720
721AGCAGGAGTTCGCTCAAGATCCAAGAAAGGTCCGAGATTG760
761CAGATTGAGTACCCAGCACGAGGAATCAGCAGATGAGCAG800
801AAAGGTTCTGAAGCAGAGGGGCTCAAAGGGGATATAATTT840
841CTGTGATTATCGCCAATAAACCTGAGGCCAGCTTAGAGAG880
881GCAGTGCGTAAACCTTGAAAATGAAAAAGGAACAAAACCC920
921CCTCTTCAAGAGGCAGGCTCCAAGAAAGGTAGAGAATCAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。