演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZSCAN20KOX29

zinc finger and SCAN domain containing 20

ZSCAN20(zinc finger and SCAN domain containing 20)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens1p35.1UniProt P17040
OFFICIAL SYMBOL
ZSCAN20
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P17040
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZSCAN20(zinc finger and SCAN domain containing 20)是蛋白質編碼基因,產物為 Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20,歸屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其蛋白質具有 SCAN box 與多個 C2H2 型鋅指,並含有被註記為無序的區域。現有功能註記指出,這種蛋白質可能參與轉錄調控;但資料未進一步說明其作用方式或調控對象,因此不宜將此可能性延伸為特定的分子機制。

Official symbol
ZSCAN20
Gene name
zinc finger and SCAN domain containing 20
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13093
UniProt
P17040
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX29ZNF360ZNF31

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p35.1
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegZSCAN20pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:33,472,467–33,501,643
Gene span
29,177 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000684572 ★33,472,645–33,501,6438
ENST0000036132833,472,597–33,501,6438
ENST0000090385633,472,597–33,501,6438
ENST0000094883733,472,597–33,501,6436
ENST0000094883833,472,597–33,501,6436
ENST0000102569033,472,597–33,492,7746
ENST0000037341333,472,631–33,492,6364
ENST0000090385433,472,631–33,501,6438
ENST0000090385733,472,631–33,501,6436
ENST0000094883933,472,631–33,501,6437
ENST0000094884033,472,631–33,501,6438
ENST0000094884233,472,631–33,501,6435

顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZSCAN20 的功能註記指出,它可能參與轉錄調控。這項描述表示其可能與基因轉錄的調節有關,但目前提供的資料沒有交代它如何影響轉錄,也沒有指出受調控的基因、轉錄因子或其他分子對象。因此,能支持的功能範圍僅限於「可能參與轉錄調控」,不能據此判定它會促進或抑制轉錄,或推論其在特定細胞過程中的作用。

這項功能描述也沒有提供實驗系統、處理條件或功能讀出,無法進一步界定其參與轉錄調控的情境與證據限制。雖然 ZSCAN20 具有 SCAN box,並屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族,但現有資料並未說明這些結構特徵如何與轉錄調節相連,也未提供足以描述其分子作用方式的資訊。因此,對其生物學意義的說明應維持在可能參與轉錄調控的層次。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 33472645 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZSCAN20 ENST00000684572 GRCh38 chr1:33471645-33472745 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CATCCTTCATTTGAAAGTAAGAACTTTCAGACACAAGCAGCTTGACTTCAGAGACTTTTACCTAAATAGT
CTCATTTAACCTTCATAACACCCTGTGATGTAAGTTCTCTTACATTACTTGCATTTTATAGATGAAAATT
CCAAAGACAAAATAGATGGCAGTAATTTGTTCAAGGCCACACAGCTGCGAAGTAGTTGAGTTGGGATTTG
GATCCATGTCTGACTACAAAGCCCCCATTCTCAACACCACATTAGATTGTTCATGCCCCAAAGTATTCAC
AGTGGTACAGAGCACCCGCATTTATATGAGGATTATTTTGTAATAATGATTAACATTCTTCCAACACCTA
GGAAGTGCCAAGCTCTGTACTAACTGATTTACATAATAATAGCTAACAATCGCTGTGCATTATTAGGAGC
CAGGCCCTGAGCTAATCGTTTTAGGTGTATTATCTCATTGAAAGTTCACAAAACTCTGTGACATGGATGC
CATTACTACCCTCATTTTATGGTTGAAGAGAACGAGGTTCAGAATTCTTCCAAAGTCACACAGCTTAGCT
GTAAGCTGGAAATTAAAGCTACAACTGTCCAGTTCTCTCCTGCCTATCGGGCTGGTCACCTCTAGTCATT
CTCTCTTCTTATTTCTTATTGTGTCTGCTTTGATCTTTCAGGGTCTGAGGCTCTCACTTCGACCCCTCAG
TAGAACTGGGCCCCCTTCTGCTCGAGTGCCCTCCCATTGGGCGGTGCTGTTATCCGGAAGCCTATGGAAA
AGGCCAGGATCGCAACAGGTCCCGCCCCCATGTGTCGCGCCCGTTCCGATTTGTTCCAGTGCCAGGGTCC
GTTAGAAGATGACATATCTATTGGCTGAAGACGTCTGAAAGGCAGCAAACGGAGGGGGCCGCCCCCGGCG
CTCGCGCGGTTCCTTCTGGGAATTGTGGTCTCAGACGTTCCATTCCCAGGGTGGCGCCGCTCGGACTCCG
CGTCCCAGCATTCCCCGCACGAGCCCGGGAGCACTTCCGCCCTGTTGTGAAGTGGGTGTCTCGGTGGGTG
AGTCCGGGTGGCGGGGCGGGGGCAGCTGAGACGCAGGCTCTGGGCTGGAGA
ZSCAN20 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZSCAN20_1 ↗1:33,472,651正股33,472,602–33,472,661

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_B8MCF · enhancer · 33470334–33471145 · regulatory

ENSR1_59TK5Q · CTCF_binding_site · 33470653–33470674 · regulatory

ENSR1_B8MCM · promoter · 33471903–33472661 · regulatory

ENSR1_59TKG2 · CTCF_binding_site · 33472433–33472454 · regulatory

ENSR1_B8MCP · enhancer · 33472662–33473227 · regulatory

ENSR1_8ZKGK · enhancer · 33473982–33474182 · regulatory

· motif · 33470655–33470671 · motif

· motif · 33472395–33472406 · motif

· motif · 33472395–33472406 · motif

· motif · 33472433–33472443 · motif

· motif · 33472435–33472451 · motif

· motif · 33472568–33472585 · motif

· motif · 33472577–33472585 · motif

· motif · 33472656–33472665 · motif

· motif · 33472656–33472667 · motif

· motif · 33472656–33472667 · motif

· motif · 33472701–33472711 · motif

· motif · 33472706–33472716 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1043 aa

1 aa1043 aa結構域功能區域鋅指
依 P17040 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZSCAN20 蛋白長 1043 個胺基酸。其 SCAN box 位於第 51–133 位;另有 10 個 C2H2 型鋅指,分布於第 710–1037 位。資料亦將第 30–49、661–692 與 835–873 位註記為無序區域。

結構域SCAN box51–133 aa
鋅指C2H2-type 1710–732 aa
鋅指C2H2-type 2738–760 aa
鋅指C2H2-type 3766–788 aa
鋅指C2H2-type 4794–816 aa
鋅指C2H2-type 5875–897 aa
鋅指C2H2-type 6903–925 aa
鋅指C2H2-type 7931–953 aa
鋅指C2H2-type 8959–981 aa
鋅指C2H2-type 9987–1009 aa
鋅指C2H2-type 101015–1037 aa
功能區域Disordered30–49 aa
功能區域Disordered661–692 aa
功能區域Disordered835–873 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P17040…

AlphaFold · P17040

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZSCAN20 的定位註記為細胞核;資料未提供定位變化的條件、動態或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX29ZSCAN20SCAND1ZKSCAN4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZSCAN20 可能參與轉錄調控。這項註記僅指出其可能與轉錄調節有關,未提供具體作用機制、調控方向或目標,因此不能據此判定其促進或抑制轉錄。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZSCAN20 的定位註記為細胞核;此資料未描述其他定位位置或定位改變的條件。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000684572 · 9,456 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGCCCGGGAGCACTTCCGCCCTGTTGTGAAGTGGGTGTC40
41TCGGTGGAGCCTTGGGGAGCAGTCCCTTTTCTAGGAGCCT80
81CTTGAAGGACTCACCGTAGATGCAGGAAGACATTGGATGA120
121GGTCAGCATAGCTGAAGTGAGGTGTCTGGGTTAGACAATG160
161GCTATGGCCCTGGAATTGCAAGCCCAGGCATCTCCGCAGC200
201CAGAGCCTGAAGAACTCCTGATTGTGAAACTGGAAGAGGA240
241CTCTTGGGGATCAGAATCCAAACTCTGGGAGAAGGACCGT280
281GGCTCTGTCTCTGGCCCAGAGGCCTCCCGCCAGCGCTTCA320
321GGCAATTCCAATACAGGGATGCAGCTGGACCCCACGAGGC360
361CTTCAGCCAGCTCTGGGCTCTCTGCTGTCGTTGGCTGAGG400
401CCGGAGATCCGTCTCAAAGAGCAGATCCTGGAGCTGCTCG440
441TGCTGGAGCAGTTCCTGACTATCTTGCCTAGGGAGGTCCA480
481GACCTGGGTGCAGGCACGCCACCCTGAGAGTGGTGAGGAG520
521GCTGTGGCCTTGGTGGAGGATTGGCACCGAGAGACCAGGA560
561CTGCAGGACAGTCGGGACTGGAATTGCATACAGAAGAGAC600
601CAGGCCCTTAAAGACAGGGGAAGAAGCTCAGAGCTTCCAG640
641CTGCAGCCAGTGGATCCCTGGCCTGAGGGACAGTCCCAGA680
681AGAAGGGGGTGAAGAATACATGCCCTGACCTTCCCAATCA720
721CCTAAATGCCGAGGTGGCACCACAGCCTTTGAAAGAGAGT760
761GCTGTCCTCACTCCCCGAGTCCCTACTCTCCCAAAGATGG800
801GGAGCGTTGGAGATTGGGAGGTGACAGCTGAGTCCCAGGA840
841AGCCCTGGGCCCTGGCAAACATGCTGAGAAGGAGCTCTGT880
881AAAGACCCCCCAGGAGACGACTGTGGGAACAGCGTGTGCC920
921TGGGAGTTCCAGTTTCAAAACCAAGTAATACCTCCGAGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。