基因總覽
ZSCAN12(zinc finger and SCAN domain containing 12)是蛋白質編碼基因,產物為 Zinc finger and SCAN domain-containing protein 12,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其蛋白質包含 SCAN box 與多個 C2H2 型鋅指,構成辨識其家族特徵的結構組成。現有資料指出它可能參與轉錄調控,但未進一步說明具體調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000684592 ★ | 28,384,738–28,399,747 | 4 |
| ENST00000361028 | 28,378,821–28,399,808 | 5 |
| ENST00000396827 | 28,379,219–28,399,808 | 6 |
| ENST00001135653 | 28,384,738–28,399,808 | 4 |
| ENST00000947375 | 28,388,102–28,398,932 | 3 |
| ENST00001106211 | 28,392,171–28,399,808 | 3 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZSCAN12 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述帶有不確定性,僅支持其與轉錄調控相關的可能角色,並未界定它調控哪些基因、轉錄因子或細胞過程,也未說明調控方向或作用條件。
目前提供的資料沒有交代 ZSCAN12 如何影響轉錄、是否直接作用於 DNA,或是否透過其他分子介導其可能的調控作用。因此,不能據此判定其分子作用機制、調控範圍或對特定生物學過程的影響;可支持的功能結論限於「可能參與轉錄調控」。
Promoter 與基因調控
>ZSCAN12 ENST00000684592 GRCh38 chr6:28399647-28400747 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCTCTCTGTTAATACACTAAAATTATATGGGTATGTTCCAGTATCTGATAAGGTTGACCCTCACCATTTT TCTTTTTCATGGGTTTCCTGGCTATTCTTATTTCCCCACATGAATTTTATAATCAGTTTATCTAATTCCA GAACAATATTTGTTGATATTTTTGTTGGAATACTACAGTTGCATACGTATTTAGGGAGGACTGACCTCTT TGAGTCTTTCCAAGAACCTCATATCGCTTTCTGTTTGTTTAAATGTATACTTGGCCTTTTAGGAATGTTT TAAAGCTTTCCCCATAGAAGTTTTGTTCATTTCTTGTTAAGTTTATTCCTAGTTTCACTTTTTTGCTGCT CTTGTAAATATGGTCTTCTCTTCCATTATATCTCGTAACTCGTTATCATTGATTATTCACATATATGAAG GTCGTTGATTTTAGTGTGTTAACTTTATATCTTGCTATTTTACTAAATTATCCTTTTTTTATAGTTTTTC CATTGAACCGGGTTTTCTGACATATAATCATACATCAGCACATAAAAGAGAACATCAAAAGAATCGTGGA TGGCGAAAGAGCCGGCAGAAACCAGCCGGCTGGCCCTTGAGAAGTCTGTGTGGAAGAAGTCCCTTCGCCA CCGCTAAGCGCGGATTTGGGAAGGTCCCCCGGAGAACATCCCTTTGAGGCATCTCTAACCTCAGAGACAC AGAATCCCAAAGTGAATGGAGACGCAAGGGATTTCCCTGTCTTAAGATCAGTTCTACAAGCCTCGACCAC CCATCGGGTCGGGGGAAGTGTGGACAATGGCTGGGTAAAGAAGAGGAGAAGATAAACCCGTTCCATTTAC CAGCGGGCCTGAAAGCCATCAACCTTCCTCTCACGTAGACGCGCGGAAACACTACCGAGTTGAAAGCCCC TTTCGCTCCCTTCCTAGAGCGGCCGCGGAAGTGCGCCCCGCGCGGGCTGGTTCTTAGACCCCCCGTGGCC GCTTCCGGCCTTTGTGGGTCACTTTTGATGGGTTCCGGGTCCCAAAAGGGTTCGAGGCCTCTTGCCTTCG CTCCGTAGGAGGGAGTTCTCTTCTGGCCCTGGGGGCCGCAGGTGAGCGATG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZSCAN12_1 ↗ | 6:28,399,741 | 負股 | 28,399,731–28,399,790 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:611 aa
ZSCAN12 蛋白質長 611 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 SCAN box 位於第 46–128 位胺基酸,另有 12 個 C2H2 型鋅指,分布於第 274–603 位。資料亦標示第 154–175 位及第 198–264 位為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZSCAN12 定位於細胞核;未提供定位改變的條件、不同異構型之間的定位差異或細胞內動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 25 個夥伴
- BICD2Q8TD16-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CENPHQ9H3R5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM161AQ3B820 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMNAP02545 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MID2Q9UJV3-2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MTUS2Q5JR59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PGBD1Q96JS3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RACK1P63244 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCAND1P57086 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SPRED1Q7Z699 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRPK2P78362 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SSX2IPQ9Y2D8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TFIP11Q9UBB9 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- VLDLRP98155-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VPS26AO75436 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZKSCAN7Q9P0L1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF24P17028 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF397Q8NF99-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF446Q9NWS9-2 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- ZNF473Q8WTR7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF496Q96IT1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZSCAN21Q9Y5A6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZSCAN32Q9NX65 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ACTTTTGATGGGTTCCGGGTCCCAAAAGGGTTCGAGGCCT40CTTGCCTTCGCTCCGTAGGAGGGAGTTCTCTTCTGGCCCT80GGGGGCCGCAGGACTGTCCAGGAATACAGTTTCCAGGTGA120GATCTTACTTGAAACACCGGTAGTTCTAGCACAGCTAAAA160TGGCATCTACTTGGGCTATCCAGGCCCACATGGACCAGGA200TGAACCTTTGGAAGTAAAGATAGAGGAAGAGAAATATACC240ACCAGACAGGATTGGGACCTGCGTAAAAACAACACCCATA280GCAGAGAGGTCTTCCGTCAGTACTTCAGACAGTTCTGCTA320CCAGGAGACATCTGGTCCCCGTGAGGCTTTGAGCCGACTC360CGAGAACTTTGCCATCAGTGGCTGAGGCCAGAGACCCACA400CCAAAGAACAGATTCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTT440CCTGACCATCCTACCTGAGGAGCTCCAGGCCTGGGTGCAG480GAGCAGCATCCAGAGAGTGGGGAGGAGGTGGTGACTGTGC520TGGAGGATTTAGAGAGAGAACTGGATGAACCAGGAGAGCA560GGTCTCAGTCCACACTGGGGAACAGGAAATGTTCTTGCAG600GAGACGGTACGTCTACGAAAAGAAGGAGAACCCAGTATGT640CCCTCCAGTCCATGAAAGCCCAGCCAAAGTATGAATCTCC680AGAACTTGAATCCCAACAGGAGCAAGTTTTAGATGTTGAG720ACTGGAAATGAGTATGGGAATTTAAAGCAAGAAGTTTCTG760AAGAAATGGAACCACATGGGAAGACATCCAGTAAATTTGA800AAATGATATGTCCAAGTCTGCTAGGTGTGGAGAAACTCGT840GAACCTGAAGAAATAACAGAAGAGCCCTCTGCTTGCTCCA880GAGAAGATAAACAACCTACCTGTGATGAAAATGGAGTAAG920CCTGACTGAGAACTCTGACCATACTGAACATCAGAGAATC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。