基因總覽
ZRSR2P1 的正式名稱為 ZRSR2 pseudogene 1,基因類型為假基因。現有資料未提供其 RNA 或蛋白質產物的特性,因此不宜將相關預測描述為已確認的產物性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000512790 ★ | 112,891,610–112,893,079 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
資料庫預測 ZRSR2P1 可能具有結合 pre-mRNA 3′剪接位點的活性,並可能透過剪接體參與 mRNA 剪接。資料亦預測其可能屬於 U2AF 複合體與剪接體複合體;這些內容均為預測,並非已確認的功能或複合體關係。
Promoter 與基因調控
>ZRSR2P1 ENST00000512790 GRCh38 chr5:112890610-112891710 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCAAGTGATCCACCCATCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCACCTGGCCTA AAATCTCACTCTAAAGATATATACAGATCTCTCAACCCAACAAAGAGGGATTCAAAGAGTTAATATAGTA TATAGAGAGTAACAGGATGGACTCAAAGAAACTAACTTCCAATCCTGGTTCTGCCATTTACTAGCTAAGC AAACCTTATACAAGTTACTTAATCACTTAAGTCTGGTTTTTCCTCTATAAAATAGGTATTAATTGAAAAT TTTAAAATTTACCCCTATAATTTTGTAAGAAAATAAAATTACTAAGCATAGCAAGGACTTTCTCTGACCC AAGAATACTGTGTTTTCTAACAACATCTATGAAACATTACTAACAGGAGAACATGTTAGCTTTCAGTAGG GGAAAGCAAATCCTAGAACCAAAAATATTTAAGCAAATATTTATTTTTATTTTTTATTTTTGAGACAGAG TCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACAGTCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGT TCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGCTACCAAGCCTGGCTAA TTTTTTTATTTTTAGTAGAGATGAGTTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAGG TGATCCGCCCATTTCGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGAGTGAGCCACCGCACCTGGCCATAAGTA AATATTTTAGAACTCTCCTTTTAGTACATGAAATGAAATTCAAATTTATGATATACTTAATTACAAAAAA AGTCTAACTGCAATATAAAGGAGAAACAAAATGAAAGTAATTTGTAATATATATAAGTATGCAAACAAAA CAATACTAGAAAACATAAAATATTCATAAGTAGAATCACTGACAGTGGCAGCTATGAACAAAATCTTCCA TATATTCCCATAGGTTAAGAATGTCTGAGGGGTCAGGCGGTGCTGGCAAGATGGCTGCACTTGAGAAGAT GACGTTTCCCAAGAAGATGACATTTCCAGAGAAACCAAGCCACAAAAAGTA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR5_85BLQP · enhancer · 112896581–112896786 · regulatory
· motif · 112896598–112896611 · motif
基因座與轉錄註解
ZRSR2P1 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000512790 ★ | transcribed_processed_pseudogene | 1,470 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
資料庫預測 ZRSR2P1 位於細胞核;此定位屬預測,來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的基因產物定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 資料庫預測 ZRSR2P1 可能具有結合 pre-mRNA 3′剪接位點的活性,並可能透過剪接體參與 mRNA 剪接;另預測其位於細胞核,且可能屬於 U2AF 複合體與剪接體複合體。這些均為預測性註釋。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to enable pre-mRNA 3'-splice site binding activity. Predicted to be involved in mRNA splicing, via spliceosome. Predicted to be located in nucleus. Predicted to be part of U2AF complex and spliceosomal complex. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | 資料庫預測 ZRSR2P1 位於細胞核;此項定位資訊為預測,並非已確認的定位結果。 | 推論支持 |
DNA 與 RNA 序列
ATGTCTGAGGGGTCAGGCGGTGCTGGCAAGATGGCTGCAC40TTGAGAAGATGACGTTTCCCAAGAAGATGACATTTCCAGA80GAAACCAAGCCACAAAAAGTACAGGGCCGCCCTGAAGAAG120GAGAAACGAAAGAAACGTCGGCAGGAACTTGCTCGACTGA160GAGACTCAGGACTCTCACAGGAGGAGGAAGAGGACACTTT200TATTGAAGAACAACAACTAGAAGAAGAGAAGCTATTGGAA240AGAGAGAGGGAAAGATTACATGAGGAGTGGTTGCTGAGGG280AGCAGAAGGCACAAGAAGAATTCAGAATAAAGAAGGAAAA320GGAAGAGGCGGCTAAAAAATGGCTAGAAGAACAAGAGAGA360AAGTTAAAGGAACAATGGAAAGAACAGCAGAGGAAAGAGA400GAGAAGAGGAGGAGCAGAAACAACAGGAGAAGAAAGAAAA440AGAGGAAGCTGTGCAGAAGATGCTGGATCAGGCTGAAAAT480GATTTAGAAAATAGTACCACATGGCAAAACCCAGAACCAC520CCGTGGATTTCAGAGTAATGGAGAAGGATCGAGCTAATTG560TCCCTTCTACAGTAAAACAGGAGCTTGCAGATTTGGAGAC600AGATGTTCACGTAAACATAATTTCCCAACATCTAGTCCTA640CCCTTCTTATTAAGAGCATGTTTACAACGTTTGGAATGGA680GCAGTGCAGGAGGGATGACTATGACCCTGACGCAAGCCTG720GAGTACAGCGAGGAAGAAACCTACCAACAGTTCCTAGATT760TCTATGAGGATGTGTTGCCCGAGTTCAAGAACGTGGGGAA800AGTGATTCAGTTCAAGGTCAGCTGCAATTTGGAACCTCAC840CTGAGGGGCAATGTATATGTTCAGTACCAGTCGGAAGAAG880AATGCCAAGCAGCCCTTTCTCTGTTTAACGGACGATGGTA920TGCAGGACGACAGCTGCAATGTGAATTCTGCCCAGTGACC960cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。