基因總覽
ZRANB2（zinc finger RANBP2-type containing 2）是蛋白質編碼基因，產物屬於 ZRANB2 family。其蛋白質含有兩個 RanBP2-type zinc finger，並具有一段被註記為無序的區域；來源亦指出其中一段區域是核定位所需。這些基本特徵構成其蛋白質家族與序列區域的概況。ZRANB2 的主要角色與 RNA 剪接相關，具體作用方式見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370920 ★ | 71,063,291–71,081,035 | 10 |
| ENST00000929967 | 71,063,251–71,081,286 | 10 |
| ENST00000852038 | 71,063,291–71,081,286 | 10 |
| ENST00000852039 | 71,063,291–71,081,286 | 10 |
| ENST00000929968 | 71,063,291–71,081,286 | 10 |
| ENST00000929969 | 71,063,291–71,081,286 | 10 |
| ENST00000974997 | 71,063,291–71,081,286 | 11 |
| ENST00001080376 | 71,063,291–71,081,286 | 11 |
| ENST00001141695 | 71,063,291–71,081,286 | 10 |
| ENST00000852037 | 71,063,293–71,081,286 | 10 |
| ENST00001013173 | 71,063,293–71,081,286 | 11 |
| ENST00000975002 | 71,063,301–71,081,286 | 9 |
顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZRANB2 是參與剪接的因子，對 TRA2B/SFRS10 轉錄本的選擇性剪接有必要作用。此角色將它與 RNA 前驅物的剪接調控相連；來源明確描述的是 TRA2B/SFRS10 轉錄本，未提供其他轉錄本或生物學過程的功能細節。
在分子作用上，ZRANB2 可結合帶有共識序列 5'-AGGUAA-3' 的單股 RNA（ssRNA）。這項序列辨識特性提供了其參與剪接調控的具體依據，但來源未進一步說明結合位置、結合對剪接機器的直接影響，或其作用所需的其他條件。
ZRANB2 也可能干擾組成型 5' 剪接位點的選擇。這項描述帶有不確定性，應理解為可能的作用，而非已確立的必然結果；來源沒有指出干擾的方向、程度，或其與 TRA2B/SFRS10 選擇性剪接之間的具體因果關係。因此，目前可概述其功能為參與特定轉錄本的選擇性剪接，並具有特定 RNA 序列結合能力及可能影響組成型 5' 剪接位點選擇的作用。
Promoter 與基因調控
>ZRANB2 ENST00000370920 GRCh38 chr1:71080935-71082035 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TATGTCCAGCATAAGACCTACAGAGGTGGGAGACCAGCTTAATGCCAGTGCCCGTTGCTTCTTACAGGCT GGGGTGATTTATAGGCCTGGGTGGGAGTGGTCTGGGGGGCCATGGCCTGCTTCCTGGGAACATGTTGATA AGGTGTTCCCAGGACGAGGCGGCTCTGGCCCTTGTTCCAGTGGAATGTGGTACTTTCTCCCAGCAGAGTA TAAGAGGCAGCCTGTTTCTCACGCCCGAACCCCGTGGAATGTTTCACTTTGACTAAGGTCTGCAAAATGG CAGGGGGGCTTACAAAAATGGTGCAGTTTGGACTAACAACGTACATAAATTTTTAAAAAGCAAAAGAATA AATCCCAAATATGGGAAAGTGTTATCTGTGGAAGAAAGTAATGGGATGGTATCAGAAAAGACACTGGTAA TTTAAACAGTGTTGACAATGTCTCAGTTTTAAAATTACCAGCTGGTTCCCATGTATAAGTTGCTTACTTA TCTGTTACACCTATTTATGTATATATAAAAATAGGTTTCCAAACGACATCCCATGTGTATGAAATAACAG AATTTTTATGCCTTATTAAAATAATTTCTCTAAACACTTGAAGAGCCCGAGCCGCCTCTTACCCTAAACG AACCCCACGCCCCTGAATTGATCAGTCACTTCCGCCTCCACCTTTCCAGCTCCACCTAAGGAAGCGGAAG TACTTTACTCTTGGGTCCTCCCACCTGTAGGGGGCTCTCCGAGGCTTCTAGTGCCACGAAGGCCTCCTGC CTGGGTTGTCCTTATGGCGCCTGTGAGTTTAGTTCTAGAAAAGATATTTGTATTTTAACTTTTCCATCTA ACAAACAGTAGCACAGGCATCTTAGTCTGGACAACAACGTACAAGCTGAATTCCTGGCTAGTTCCCTCAT TATCAAACCCTGACACAGTAGTAGGCGCGAGTCAGGCAGTGTGGGGACAGCCCCGAGTTGCCGAAAGTCC CCGGCCCGTTTTCCTCCTGTGAAGACATAGCTGCGGGTGGCTGTGCTGGTGGCGTTCAAGATGTCGACCA AGAATTTCCGAGTCAGTGACGGGGACTGGATTTGCCCTGACAAAAAGTGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZRANB2_1 ↗ | 1:71,081,035 | 負股 | 71,081,025–71,081,084 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_BJ4TM · enhancer · 71080184–71081000 · regulatory
ENSR1_9337QG · promoter · 71081001–71081393 · regulatory
ENSR1_BJ4TR · enhancer · 71081394–71082059 · regulatory
· motif · 71076642–71076653 · motif
· motif · 71076643–71076654 · motif
· motif · 71079564–71079575 · motif
· motif · 71080282–71080291 · motif
· motif · 71080282–71080291 · motif
· motif · 71080313–71080327 · motif
· motif · 71080577–71080586 · motif
· motif · 71080577–71080586 · motif
· motif · 71081334–71081343 · motif
· motif · 71081334–71081345 · motif
· motif · 71081334–71081345 · motif
· motif · 71081334–71081347 · motif
· motif · 71081368–71081379 · motif
· motif · 71081368–71081379 · motif
· motif · 71081370–71081379 · motif
· motif · 71081475–71081490 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：330 aa
ZRANB2 蛋白質長 330 個胺基酸，屬於 ZRANB2 family。第 9–40 與 65–94 位分別註記為 RanBP2-type 1 和 RanBP2-type 2 zinc finger；第 117–330 位被註記為無序區域。第 151–324 位則是核定位所需區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供其他定位、定位改變條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- AKAP17AQ02040 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ARRB1P49407 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ARRB2P32121 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- LRRK2Q5S007 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ZRANB2 與 SNRNP70 的 C-terminal half、AKAP17A 的 Arg/Ser-rich domain，以及 U2AF1 和 CLK1 有交互作用。來源未進一步說明這些關係是否代表直接結合，亦未指出它們共同組成特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZRANB2 是剪接因子，對 TRA2B/SFRS10 轉錄本的選擇性剪接有必要作用。它會結合帶有 5'-AGGUAA-3' 共識序列的單股 RNA，並可能干擾組成型 5' 剪接位點的選擇；此干擾作用具有不確定性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Splice factor required for alternative splicing of TRA2B/SFRS10 transcripts. Binds to ssRNA containing the consensus sequence 5'-AGGUAA-3'. May interfere with constitutive 5'-splice site selection PMID 11448987 ↗ · PMID 21256132 ↗ |
| 交互作用 | ZRANB2 與 SNRNP70 的 C-terminal half、AKAP17A 的 Arg/Ser-rich domain，以及 U2AF1 和 CLK1 有交互作用；來源未進一步界定這些交互作用的性質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with the C-terminal half of SNRNP70, the Arg/Ser-rich domain of AKAP17A as well as with U2AF1 and CLK1 PMID 11448987 ↗ · PMID 16982639 ↗ |
| 細胞定位 | ZRANB2 的細胞內定位為細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAAGACATAGCTGCGGGTGGCTGTGCTGGTGGCGTTCAAG40ATGTCGACCAAGAATTTCCGAGTCAGTGACGGGGACTGGA80TTTGCCCTGACAAAAAATGTGGAAATGTAAACTTTGCTAG120AAGAACCAGCTGTAATCGATGTGGTCGGGAGAAAACAACT160GAGGCCAAGATGATGAAAGCTGGGGGCACTGAAATAGGAA200AGACACTTGCAGAAAAGAGCCGAGGCCTATTTAGTGCTAA240TGACTGGCAATGTAAAACTTGCAGCAATGTGAATTGGGCC280AGAAGATCAGAGTGTAATATGTGTAATACTCCAAAGTATG320CTAAATTAGAAGAAAGAACAGGATATGGTGGTGGTTTTAA360TGAAAGAGAAAATGTTGAATATATAGAAAGAGAAGAATCT400GATGGTGAATATGATGAGTTTGGACGTAAAAAGAAAAAAT440ACAGAGGGAAAGCAGTTGGTCCTGCATCTATATTAAAGGA480AGTTGAAGATAAAGAATCAGAGGGAGAAGAAGAGGATGAG520GATGAAGATCTTTCTAAATATAAGTTAGATGAGGATGAGG560ATGAAGATGACGCTGATCTCTCAAAATATAATCTTGATGC600CAGTGAAGAAGAAGATAGTAATAAAAAGAAATCTAATAGA640CGAAGTCGCTCAAAGTCTCGATCTTCACATTCACGATCTT680CATCACGCTCATCCTCCCCCTCAAGTTCAAGGTCTAGGTC720CAGGTCCCGTTCAAGAAGTTCTTCCAGTTCGCAGTCAAGA760TCTCGTTCCAGTTCCAGAGAACGTTCGAGATCTCGTGGGT800CGAAATCAAGATCCAGCTCCAGGTCCCACAGGGGCTCTTC840TTCCCCACGAAAAAGATCTTATTCAAGTTCATCATCTTCT880CCTGAGAGGAACAGAAAGAGAAGTCGTTCTAGATCTTCTT920CATCTGGTGATCGCAAAAAAAGACGAACAAGATCACGGTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。