演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZP3ZP3-424

zona pellucida glycoprotein 3

ZP3 編碼 zona pellucida glycoprotein 3,是卵母細胞周圍透明帶的組成成分,對精子結合與透明帶基質形成不可或缺。

Homo sapiens7q11.23UniProt P21754
OFFICIAL SYMBOL
ZP3
CHROMOSOME
7
UNIPROT
P21754
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZP3 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 zona pellucida glycoprotein 3,屬於 ZP domain family 的 ZPC subfamily。其蛋白質是卵母細胞周圍透明帶的糖蛋白成分;透明帶為細胞外基質,包含 ZP1、ZP2、ZP3 與 ZP4 等三至四種糖蛋白。此產物的基本特性與所在結構,將其定位為透明帶基質的一部分。

Official symbol
ZP3
Gene name
zona pellucida glycoprotein 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13189
UniProt
P21754
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZP3-424ZP3-372ZPCZP3AZP3B

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q11.23
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegZP3pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr7:76,397,497–76,442,071
Gene span
44,575 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000394857 ★76,424,950–76,442,0698
ENST0000033651776,397,497–76,442,0719
ENST0000113527776,424,923–76,442,0718
ENST0000041624576,428,638–76,442,0717
ENST0000039486076,433,470–76,442,0635

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZP3 是卵母細胞周圍透明帶的組成糖蛋白。透明帶是由三至四種糖蛋白形成的細胞外基質,來源列出的成分包括 ZP1、ZP2、ZP3 與 ZP4。ZP3 對透明帶基質形成不可或缺,並參與精子與透明帶的結合。

透明帶也與精子頂體反應的誘發有關,並可防止受精後多精入卵。這些作用描述的是透明帶整體的功能;來源並未進一步說明 ZP3 如何分子性地誘發頂體反應或阻止多精入卵。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 76424950 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZP3 ENST00000394857 GRCh38 chr7:76423950-76425050 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGAATGAAGAACGCAGGGCCCCTTCTCCACCTCTCTTCACACAGCTGCCTCTGCCTGAACTGACCTACCC
CCCGGCCTCCCATAAAATAAGGCAGAGACCCATGAAATTCCTCCTGTCTCCTAATTGATACCGCCTCCTT
TTTCTCACACTTGGAATGAGCTCCTTATGTCTCAGATCTAATCCCCCTGACTCTTCAATCAAGGGCTTTC
TCCTGTGTCCCCCACAGACCTGGGACAGCTCCCTTGCCGGGCTGCGAGCTTCCTAAGGGCAGGGCCAGCA
GGGGATCGGAGGGAAGCTGTGATACATTGTGGTGCACCAGGCAGGCAGCACACTCTTTGCAAACTTTTAC
ATGAATACACATGGGGATTTACAAGCTAAAAACTTTCAAGTGGGCTGGGGCGGGCGCGGTGGCTCACACC
TGTCATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTGGAGGTCAGGACTTCAAGACCAGCCTGC
CCAACATAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGCGGTGGCGCATGCCTTCCT
GTAATCCCAGCTATTTGGGAGTCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGCTGAGAAGTGGAGGATGCAG
TGAAACGAGATCATACCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAACAAAACAAA
ACACAACAAAAACAAACAAACCACAAACACACACACACACAGCAAAAAAAAACTTTAATGTGGATACACG
TGGGGGATTTCCAAGCTAAAAACCAAATTCTGCTGTGGTCATGCTGGGGTGAAGGCTGAGAGTTTGCAGT
TCTAACAAGCTCCCAGGTGTTACTGATGCTTCTGGATGGAGACCACTTTATGCAACAAGGGCCCAGCTGG
CTAGGGAAGGGAGGCAGCTGAGAAGCTGAGAGCCCAGGTGGCAGCAGCCAGCATCCCACGGGTATAAGAT
GGCCAGAGGCGGCTGCCTGCTGCTCTGCAGGTACCATGGAGCTGAGCTATAGGCTCTTCATCTGCCTCCT
GCTCTGGGGTAGTACTGAGCTGTGCTACCCCCAACCCCTCTGGCTCTTGCA
ZP3 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZP3_1 ↗7:76,397,524正股76,397,475–76,397,534
ZP3_2 ↗7:76,400,549正股76,400,500–76,400,559

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_935BZM · enhancer · 76421019–76421502 · regulatory

ENSR7_C9KQC · enhancer · 76423130–76424344 · regulatory

ENSR7_935C2M · promoter · 76424644–76424960 · regulatory

ENSR7_935C3W · enhancer · 76428925–76429219 · regulatory

· motif · 76421651–76421660 · motif

· motif · 76423362–76423371 · motif

· motif · 76423362–76423371 · motif

· motif · 76424667–76424675 · motif

· motif · 76424801–76424810 · motif

· motif · 76424911–76424924 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:424 aa

1 aa424 aa結構域功能區域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 P21754 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zona pellucida glycoprotein 3 長 424 個胺基酸,屬於 ZP domain family 的 ZPC subfamily。蛋白質具有 1–22 位的訊號胜肽;23–387 位為細胞外區域,388–408 位為螺旋型跨膜區,409–424 位為細胞質區。其 ZP domain 位於 45–307 位,330–356 位則註記為無序區。

訊號胜肽1–22 aa
拓樸區域Extracellular23–387 aa
跨膜區Helical388–408 aa
拓樸區域Cytoplasmic409–424 aa
結構域ZP45–307 aa
功能區域Disordered330–356 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P21754…

AlphaFold · P21754

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Zona pellucida;Cell membrane

加工後的 ZP3 位於透明帶。 另有註記將其列為細胞膜上的單次跨膜第一型膜蛋白;這項膜定位與透明帶定位分別描述其膜相關形式與加工後蛋白所在位置。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Zona pellucida。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZP3-424ZP3ACRVDAC2CLDN11MALL
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZP3 與 ZP1、ZP2 有交互作用。另有相似性推論指出,ZP2 與 ZP3 的聚合物可排列成長絲,並由 ZP1 同源二聚體交聯;此組織方式屬於 By similarity 的描述。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

Oocyte/zygote/embryo maturation arrest 3(OZEMA3)是一種自體顯性不孕症,特徵包括卵母細胞異常、缺乏透明帶及卵母細胞退化。資料指出,影響 ZP3 所代表基因的變異會造成此疾病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZP3 是卵母細胞周圍透明帶的組成成分;透明帶為含三至四種糖蛋白的細胞外基質,包含 ZP1、ZP2、ZP3 與 ZP4。透明帶參與精子結合及頂體反應誘發,並防止受精後多精入卵;ZP3 對精子結合與透明帶基質形成不可或缺。資料庫紀錄
證據與來源

Component of the zona pellucida, an extracellular matrix surrounding oocytes which mediates sperm binding, induction of the acrosome reaction and prevents post-fertilization polyspermy. The zona pellucida is composed of 3 to 4 glycoproteins, ZP1, ZP2, ZP3, and ZP4. ZP3 is essential for sperm binding and zona matrix formation

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZP3 與 ZP1、ZP2 有交互作用。相似性推論指出,ZP2 與 ZP3 聚合物可組成長絲,並由 ZP1 同源二聚體交聯;長絲組織方式帶有 By similarity 的推論性質。含實驗來源
證據與來源

Polymers of ZP2 and ZP3 organized into long filaments cross-linked by ZP1 homodimers (By similarity). Interacts with ZP1 and ZP2

PMID 28886344 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位加工後的 ZP3 註記位於透明帶,並以精子結合蛋白描述其性質。含實驗來源
證據與來源

Processed zona pellucida sperm-binding protein 3; Zona pellucida

PMID 29895852 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZP3 被註記為細胞膜上的單次跨膜第一型膜蛋白。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type I membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Oocyte/zygote/embryo maturation arrest 3(OZEMA3)是自體顯性不孕症,患者可有缺乏透明帶的異常卵母細胞及卵母細胞退化;資料指出,影響 ZP3 所代表基因的變異會造成此疾病。含實驗來源
證據與來源

Oocyte/zygote/embryo maturation arrest 3 OZEMA3 An autosomal dominant infertility disorder characterized by abnormal oocytes that lack the zona pellucida, and oocytes degeneration. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617712

PMID 28886344 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000394857 · 1,303 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1TGCTCTGCAGGTACCATGGAGCTGAGCTATAGGCTCTTCA40
41TCTGCCTCCTGCTCTGGGGTAGTACTGAGCTGTGCTACCC80
81CCAACCCCTCTGGCTCTTGCAGGGTGGAGCCAGCCATCCT120
121GAGACGTCCGTACAGCCCGTACTGGTGGAGTGTCAGGAGG160
161CCACTCTGATGGTCATGGTCAGCAAAGACCTTTTTGGCAC200
201CGGGAAGCTCATCAGGGCTGCTGACCTCACCTTGGGCCCA240
241GAGGCCTGTGAGCCTCTGGTCTCCATGGACACAGAAGATG280
281TGGTCAGGTTTGAGGTTGGACTCCACGAGTGTGGCAACAG320
321CATGCAGGTAACTGACGATGCCCTGGTGTACAGCACCTTC360
361CTGCTCCATGACCCCCGCCCCGTGGGAAACCTGTCCATCG400
401TGAGGACTAACCGCGCAGAGATTCCCATCGAGTGCCGCTA440
441CCCCAGGCAGGGCAATGTGAGCAGCCAGGCCATCCTGCCC480
481ACCTGGTTGCCCTTCAGGACCACGGTGTTCTCAGAGGAGA520
521AGCTGACTTTCTCTCTGCGTCTGATGGAGGAGAACTGGAA560
561CGCTGAGAAGAGGTCCCCCACCTTCCACCTGGGAGATGCA600
601GCCCACCTCCAGGCAGAAATCCACACTGGCAGCCACGTGC640
641CACTGCGGTTGTTTGTGGACCACTGCGTGGCCACACCGAC680
681ACCAGACCAGAATGCCTCCCCTTATCACACCATCGTGGAC720
721TTCCATGGCTGTCTTGTCGACGGTCTCACTGATGCCTCTT760
761CTGCATTCAAAGTTCCTCGACCCGGGCCAGATACACTCCA800
801GTTCACAGTGGATGTCTTCCACTTTGCTAATGACTCCAGA840
841AACATGATATACATCACCTGCCACCTGAAGGTCACCCTAG880
881CTGAGCAGGACCCAGATGAACTCAACAAGGCCTGTTCCTT920
921CAGCAAGCCTTCCAACAGCTGGTTCCCAGTGGAAGGCTCG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。