演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZP2ZPA

zona pellucida glycoprotein 2

ZP2(zona pellucida glycoprotein 2)是 zona pellucida 的組成糖蛋白,可能作為次級精子受體,參與卵母細胞周圍細胞外基質的精子結合功能。

Homo sapiens16p12.3-p12.2UniProt Q05996
OFFICIAL SYMBOL
ZP2
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q05996
PDB / ALPHAFOLD
8RKE
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZP2 的正式名稱為 zona pellucida glycoprotein 2,是由 ZP2 基因編碼的蛋白質,屬於 ZP domain family 的 ZPA subfamily。其蛋白質產物長 745 個胺基酸,具有訊號序列、長段細胞外區域、單次穿膜區段及短細胞質區域。ZP2 是卵母細胞周圍 zona pellucida 的組成糖蛋白之一;此細胞外基質由 ZP1、ZP2、ZP3 與 ZP4 等三至四種糖蛋白構成。

Official symbol
ZP2
Gene name
zona pellucida glycoprotein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13188
UniProt
Q05996
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZPA

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p12.3-p12.2
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegZP2pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr16:21,197,450–21,214,510
Gene span
17,061 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000574091 ★21,197,450–21,211,57419
ENST0000057400221,197,450–21,214,51020

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZP2 是包圍卵母細胞的 zona pellucida 細胞外基質成分。這層基質參與精子與卵母細胞的結合,也與誘發頂體反應相關;受精後則有助於防止多精入卵。zona pellucida 由 ZP1、ZP2、ZP3 及 ZP4 等三至四種糖蛋白組成,ZP2 的功能是在這個由多種糖蛋白構成的基質中發揮。

現有資料指出,ZP2 可能作為次級精子受體。這項描述表示其可能參與精子辨識或結合,但來源並未進一步交代其作用機制或相關條件,因此不宜將其延伸解讀為唯一或主要的精子受體。資料也將精子結合、頂體反應及受精後防止多精入卵列為 zona pellucida 的功能,並未將這些作用逐一歸因於 ZP2 單獨執行。

因此,ZP2 的已述功能重點是作為卵母細胞周圍細胞外基質的組成成分,並可能參與精子結合。這些角色將 ZP2 放在受精相關的基質功能脈絡中;可用資料未提供更細部的分子機制或不同條件下的功能差異。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 21211574 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZP2 ENST00000574091 GRCh38 chr16:21211474-21212574 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGCCACCCTAAAATGGTAACAGAGAGCTTTATGTTTAATAGTTATAAAGTGACAGTAGCAGATTACAAAA
CAGTATTTAAACTTTCCTCCCAGTGTTTTAAAAAAATTGTGTGTGGTGTTTGTAGAAACATGTCTAAAGT
TACTCACCTAAATATTAGCAGTGGCACTATTATGAGTGACTTTTGCCTTTTCTCTGTATCCTTCTGAAAT
TGTATCTTTGCGGTAAGCTTAAGCTTTTACACTTGGGGGTCAACAAGGCTTCATTCATTTTTTTAAAGAC
ACTTCCTGTGCATTATCAGGGTAACTTCTGCAGTAGCCAGAAGACTAGATGTTACTTAAAAGGTTTTAGG
GTAGGTGCAATGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCACGTGGATCACCTAGGTCA
GGAGTTCGAGACCACCCTGACCAACACGGTGAAACCCAATCTTTACTCAAAATACAAAAATTAGCCAGGT
GTGGTGGCGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGG
CAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCACCAGTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACTGAATCTCA
AAAAAAAAAAAAAAATGTAGTGGTGTGAACAAGACTTGTTTTTTTCTCAATAAAGCCCATGATTCTCTTT
GGCTCTACATTGCAGTTGTAAATAATTTGCCCAAAAGATCCTAATTTCCCCCATAGTTATAGGGAAAACA
CCAATTCACTCACCTGGAGCTGATTTCAGCAAACTCTGATTTCATGCCTGGCCCACAGGGCAGCTGGCAG
AATACCCGGCGCAAGCTGTCAGGAATCAGAGGCCACTTCCTTCCCCAATCCTTCCGTTTCAGCTGGGAGA
ATGGGACAAGATTCAGGTGCCCCCAATGGGGAGAGGGTGTGGATGCGGCTGGCTTCCTGCTATAAAAACA
CAGAGCAGCCTACCCTCTACCTGGTTGATCTGGTAGTGTCTTCTGCTATGGCGTGCAGGCAGAGAGGAGG
CTCTTGGAGTCCCTCAGGCTGGTTCAATGCAGGCTGGAGGTGAGTAATTCT
ZP2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZP2_1 ↗16:21,211,575負股21,211,565–21,211,624

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 21207031–21207044 · motif

· motif · 21207031–21207044 · motif

· motif · 21208629–21208638 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:745 aa

1 aa745 aa結構域功能區域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q05996 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZP2 蛋白長 745 個胺基酸。其第 1–38 位為訊號序列,第 39–716 位為細胞外區域;第 717–736 位是螺旋型穿膜區段,第 737–745 位則位於細胞質側。ZP domain 位於第 371–637 位,另有兩段被註記為無序區,分別在第 469–491 位及第 673–708 位。

訊號胜肽1–38 aa
拓樸區域Extracellular39–716 aa
跨膜區Helical717–736 aa
拓樸區域Cytoplasmic737–745 aa
結構域ZP371–637 aa
功能區域Disordered469–491 aa
功能區域Disordered673–708 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8RKE…

PDB · 8RKE

X-ray · 2.70 A · A/B/C=39-365

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Zona pellucida;Cell membrane

資料將加工後的 Zona pellucida sperm-binding protein 2 註記於 zona pellucida,也另列出細胞膜及單次穿膜第一型膜蛋白的定位特徵。 來源未說明這些定位描述之間的條件或變化,因此不推定其定位轉換的時序或機制。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Zona pellucida。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZPAZP2ACRVDAC2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZP2 可在體外形成同源聚合物並組成長纖維。另有 By similarity 的資料描述,ZP2 與 ZP3 的聚合物形成長絲,並由 ZP1 同源二聚體交聯;此項組裝描述帶有相似性推論限制。另有研究記載 ZP2 與 ZP3 交互作用,但資料未說明該交互作用的具體形式。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

ZP2 基因變異與常染色體隱性遺傳的不孕症 Oocyte/zygote/embryo maturation arrest 6(OZEMA6)相關。此疾病的描述包括卵母細胞受精失敗,並指出患者卵母細胞的 zona pellucida 異常薄、精子結合有缺陷;來源將此疾病歸因於影響該基因的變異。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZP2 是包圍卵母細胞的 zona pellucida 細胞外基質成分。此基質參與精子結合、誘發頂體反應,並防止受精後多精入卵;其組成包含 ZP1、ZP2、ZP3 與 ZP4 等三至四種糖蛋白。ZP2 可能作為次級精子受體。含實驗來源
證據與來源

Component of the zona pellucida, an extracellular matrix surrounding oocytes which mediates sperm binding, induction of the acrosome reaction and prevents post-fertilization polyspermy. The zona pellucida is composed of 3 to 4 glycoproteins, ZP1, ZP2, ZP3, and ZP4. ZP2 may act as a secondary sperm receptor

PMID 29895852 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZP2 可在體外形成同源聚合物並組成長纖維。依相似性推論,ZP2 與 ZP3 聚合物可組成長絲,再由 ZP1 同源二聚體交聯;另有研究記載 ZP2 與 ZP3 交互作用。含實驗來源
證據與來源

Can form homopolymers that assemble into long fibers (in vitro). Polymers of ZP2 and ZP3 organized into long filaments cross-linked by ZP1 homodimers (By similarity). Interacts with ZP3

PMID 28886344 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位定位資料列出加工後的 Zona pellucida sperm-binding protein 2,並將其位置註記為 zona pellucida。含實驗來源
證據與來源

Processed zona pellucida sperm-binding protein 2; Zona pellucida

PMID 29895852 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位定位註記指出 ZP2 位於細胞膜,並將其描述為單次穿膜第一型膜蛋白。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type I membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Oocyte/zygote/embryo maturation arrest 6(OZEMA6)是常染色體隱性遺傳的不孕症,特徵為卵母細胞受精失敗。患者卵母細胞的 zona pellucida 異常薄,且精子結合有缺陷;來源指出此病由影響該基因的變異造成。含實驗來源
證據與來源

Oocyte/zygote/embryo maturation arrest 6 OZEMA6 An autosomal recessive infertility disorder characterized by oocyte fertilization failure, due to defective sperm-binding to an abnormally thin zona pellucida in patient oocytes. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618353

PMID 29895852 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000574091 · 2,295 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTGGTTGATCTGGTAGTGTCTTCTGCTATGGCGTGCAGGC40
41AGAGAGGAGGCTCTTGGAGTCCCTCAGGCTGGTTCAATGC80
81AGGCTGGAGCACCTACAGGTCGATTTCTCTCTTCTTCGCC120
121CTTGTGACTTCAGGGAACTCCATAGATGTTTCTCAGTTGG160
161TAAATCCTGCCTTTCCAGGCACTGTCACTTGCGATGAAAG200
201GGAAATAACAGTGGAGTTCCCAAGCAGTCCTGGCACCAAG240
241AAATGGCATGCATCTGTGGTGGATCCTCTTGGTCTCGACA280
281TGCCGAACTGCACTTACATCCTGGACCCAGAAAAGCTCAC320
321CCTGAGGGCTACCTATGATAACTGTACCAGGAGAGTGCAT360
361GGTGGACACCAGATGACCATCAGAGTCATGAACAACAGTG400
401CTGCCTTAAGACACGGAGCTGTCATGTATCAGTTCTTCTG440
441TCCAGCTATGCAAGTAGAAGAGACCCAGGGGCTTTCAGCA480
481TCTACAATCTGCCAGAAGGATTTCATGTCTTTTTCCTTGC520
521CACGGGTCTTCTCTGGCTTGGCTGACGACAGTAAGGGGAC560
561CAAAGTTCAGATGGGATGGAGCATTGAGGTTGGTGATGGT600
601GCAAGAGCCAAAACTCTGACCCTGCCAGAGGCCATGAAGG640
641AAGGCTTCAGCCTCTTGATTGACAACCACAGGATGACCTT680
681CCATGTGCCATTCAATGCCACTGGAGTGACTCACTATGTG720
721CAAGGTAACAGTCATCTCTACATGGTGTCTCTGAAGCTTA760
761CATTTATATCTCCTGGACAGAAGGTGATCTTCTCTTCACA800
801AGCTATTTGTGCACCAGATCCTGTGACCTGCAATGCCACA840
841CACATGACTCTCACCATACCAGAGTTTCCTGGGAAGCTTA880
881AGTCTGTGAGCTTTGAAAACCAGAACATTGATGTGAGCCA920
921GCTGCATGACAATGGAATTGATCTAGAAGCAACAAATGGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。