基因總覽
ZP2 的正式名稱為 zona pellucida glycoprotein 2,是由 ZP2 基因編碼的蛋白質,屬於 ZP domain family 的 ZPA subfamily。其蛋白質產物長 745 個胺基酸,具有訊號序列、長段細胞外區域、單次穿膜區段及短細胞質區域。ZP2 是卵母細胞周圍 zona pellucida 的組成糖蛋白之一;此細胞外基質由 ZP1、ZP2、ZP3 與 ZP4 等三至四種糖蛋白構成。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000574091 ★ | 21,197,450–21,211,574 | 19 |
| ENST00000574002 | 21,197,450–21,214,510 | 20 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZP2 是包圍卵母細胞的 zona pellucida 細胞外基質成分。這層基質參與精子與卵母細胞的結合,也與誘發頂體反應相關;受精後則有助於防止多精入卵。zona pellucida 由 ZP1、ZP2、ZP3 及 ZP4 等三至四種糖蛋白組成,ZP2 的功能是在這個由多種糖蛋白構成的基質中發揮。
現有資料指出,ZP2 可能作為次級精子受體。這項描述表示其可能參與精子辨識或結合,但來源並未進一步交代其作用機制或相關條件,因此不宜將其延伸解讀為唯一或主要的精子受體。資料也將精子結合、頂體反應及受精後防止多精入卵列為 zona pellucida 的功能,並未將這些作用逐一歸因於 ZP2 單獨執行。
因此,ZP2 的已述功能重點是作為卵母細胞周圍細胞外基質的組成成分,並可能參與精子結合。這些角色將 ZP2 放在受精相關的基質功能脈絡中;可用資料未提供更細部的分子機制或不同條件下的功能差異。
Promoter 與基因調控
>ZP2 ENST00000574091 GRCh38 chr16:21211474-21212574 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGCCACCCTAAAATGGTAACAGAGAGCTTTATGTTTAATAGTTATAAAGTGACAGTAGCAGATTACAAAA CAGTATTTAAACTTTCCTCCCAGTGTTTTAAAAAAATTGTGTGTGGTGTTTGTAGAAACATGTCTAAAGT TACTCACCTAAATATTAGCAGTGGCACTATTATGAGTGACTTTTGCCTTTTCTCTGTATCCTTCTGAAAT TGTATCTTTGCGGTAAGCTTAAGCTTTTACACTTGGGGGTCAACAAGGCTTCATTCATTTTTTTAAAGAC ACTTCCTGTGCATTATCAGGGTAACTTCTGCAGTAGCCAGAAGACTAGATGTTACTTAAAAGGTTTTAGG GTAGGTGCAATGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCACGTGGATCACCTAGGTCA GGAGTTCGAGACCACCCTGACCAACACGGTGAAACCCAATCTTTACTCAAAATACAAAAATTAGCCAGGT GTGGTGGCGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGG CAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCACCAGTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACTGAATCTCA AAAAAAAAAAAAAAATGTAGTGGTGTGAACAAGACTTGTTTTTTTCTCAATAAAGCCCATGATTCTCTTT GGCTCTACATTGCAGTTGTAAATAATTTGCCCAAAAGATCCTAATTTCCCCCATAGTTATAGGGAAAACA CCAATTCACTCACCTGGAGCTGATTTCAGCAAACTCTGATTTCATGCCTGGCCCACAGGGCAGCTGGCAG AATACCCGGCGCAAGCTGTCAGGAATCAGAGGCCACTTCCTTCCCCAATCCTTCCGTTTCAGCTGGGAGA ATGGGACAAGATTCAGGTGCCCCCAATGGGGAGAGGGTGTGGATGCGGCTGGCTTCCTGCTATAAAAACA CAGAGCAGCCTACCCTCTACCTGGTTGATCTGGTAGTGTCTTCTGCTATGGCGTGCAGGCAGAGAGGAGG CTCTTGGAGTCCCTCAGGCTGGTTCAATGCAGGCTGGAGGTGAGTAATTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZP2_1 ↗ | 16:21,211,575 | 負股 | 21,211,565–21,211,624 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 21207031–21207044 · motif
· motif · 21207031–21207044 · motif
· motif · 21208629–21208638 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:745 aa
ZP2 蛋白長 745 個胺基酸。其第 1–38 位為訊號序列,第 39–716 位為細胞外區域;第 717–736 位是螺旋型穿膜區段,第 737–745 位則位於細胞質側。ZP domain 位於第 371–637 位,另有兩段被註記為無序區,分別在第 469–491 位及第 673–708 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將加工後的 Zona pellucida sperm-binding protein 2 註記於 zona pellucida,也另列出細胞膜及單次穿膜第一型膜蛋白的定位特徵。 來源未說明這些定位描述之間的條件或變化,因此不推定其定位轉換的時序或機制。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Zona pellucida。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- ACRP10323 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- VDAC2P45880-3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ZP2 可在體外形成同源聚合物並組成長纖維。另有 By similarity 的資料描述,ZP2 與 ZP3 的聚合物形成長絲,並由 ZP1 同源二聚體交聯;此項組裝描述帶有相似性推論限制。另有研究記載 ZP2 與 ZP3 交互作用,但資料未說明該交互作用的具體形式。
疾病與遺傳關聯
ZP2 基因變異與常染色體隱性遺傳的不孕症 Oocyte/zygote/embryo maturation arrest 6(OZEMA6)相關。此疾病的描述包括卵母細胞受精失敗,並指出患者卵母細胞的 zona pellucida 異常薄、精子結合有缺陷;來源將此疾病歸因於影響該基因的變異。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZP2 是包圍卵母細胞的 zona pellucida 細胞外基質成分。此基質參與精子結合、誘發頂體反應,並防止受精後多精入卵;其組成包含 ZP1、ZP2、ZP3 與 ZP4 等三至四種糖蛋白。ZP2 可能作為次級精子受體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the zona pellucida, an extracellular matrix surrounding oocytes which mediates sperm binding, induction of the acrosome reaction and prevents post-fertilization polyspermy. The zona pellucida is composed of 3 to 4 glycoproteins, ZP1, ZP2, ZP3, and ZP4. ZP2 may act as a secondary sperm receptor PMID 29895852 ↗ |
| 交互作用 | ZP2 可在體外形成同源聚合物並組成長纖維。依相似性推論,ZP2 與 ZP3 聚合物可組成長絲,再由 ZP1 同源二聚體交聯;另有研究記載 ZP2 與 ZP3 交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Can form homopolymers that assemble into long fibers (in vitro). Polymers of ZP2 and ZP3 organized into long filaments cross-linked by ZP1 homodimers (By similarity). Interacts with ZP3 PMID 28886344 ↗ |
| 細胞定位 | 定位資料列出加工後的 Zona pellucida sperm-binding protein 2,並將其位置註記為 zona pellucida。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | 定位註記指出 ZP2 位於細胞膜,並將其描述為單次穿膜第一型膜蛋白。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | Oocyte/zygote/embryo maturation arrest 6(OZEMA6)是常染色體隱性遺傳的不孕症,特徵為卵母細胞受精失敗。患者卵母細胞的 zona pellucida 異常薄,且精子結合有缺陷;來源指出此病由影響該基因的變異造成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Oocyte/zygote/embryo maturation arrest 6 OZEMA6 An autosomal recessive infertility disorder characterized by oocyte fertilization failure, due to defective sperm-binding to an abnormally thin zona pellucida in patient oocytes. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618353 PMID 29895852 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTGGTTGATCTGGTAGTGTCTTCTGCTATGGCGTGCAGGC40AGAGAGGAGGCTCTTGGAGTCCCTCAGGCTGGTTCAATGC80AGGCTGGAGCACCTACAGGTCGATTTCTCTCTTCTTCGCC120CTTGTGACTTCAGGGAACTCCATAGATGTTTCTCAGTTGG160TAAATCCTGCCTTTCCAGGCACTGTCACTTGCGATGAAAG200GGAAATAACAGTGGAGTTCCCAAGCAGTCCTGGCACCAAG240AAATGGCATGCATCTGTGGTGGATCCTCTTGGTCTCGACA280TGCCGAACTGCACTTACATCCTGGACCCAGAAAAGCTCAC320CCTGAGGGCTACCTATGATAACTGTACCAGGAGAGTGCAT360GGTGGACACCAGATGACCATCAGAGTCATGAACAACAGTG400CTGCCTTAAGACACGGAGCTGTCATGTATCAGTTCTTCTG440TCCAGCTATGCAAGTAGAAGAGACCCAGGGGCTTTCAGCA480TCTACAATCTGCCAGAAGGATTTCATGTCTTTTTCCTTGC520CACGGGTCTTCTCTGGCTTGGCTGACGACAGTAAGGGGAC560CAAAGTTCAGATGGGATGGAGCATTGAGGTTGGTGATGGT600GCAAGAGCCAAAACTCTGACCCTGCCAGAGGCCATGAAGG640AAGGCTTCAGCCTCTTGATTGACAACCACAGGATGACCTT680CCATGTGCCATTCAATGCCACTGGAGTGACTCACTATGTG720CAAGGTAACAGTCATCTCTACATGGTGTCTCTGAAGCTTA760CATTTATATCTCCTGGACAGAAGGTGATCTTCTCTTCACA800AGCTATTTGTGCACCAGATCCTGTGACCTGCAATGCCACA840CACATGACTCTCACCATACCAGAGTTTCCTGGGAAGCTTA880AGTCTGTGAGCTTTGAAAACCAGAACATTGATGTGAGCCA920GCTGCATGACAATGGAATTGATCTAGAAGCAACAAATGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。