基因總覽
ZNRD2（zinc ribbon domain containing 2）是蛋白質編碼基因，產生的蛋白質名為 Ubiquitin ligase substrate adapter ZNRD2。來源描述其參與蛋白質複合體組裝的品質管制，並指出它每個次單元可結合一個鋅離子。資料亦記載 ZNRD2 與人類呼吸道合胞病毒 nucleoprotein N 的關係；其作用情境包括未組裝複合體次單元的處理，以及病毒感染時對病毒複製的限制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000309328 ★ | 65,570,477–65,571,888 | 4 |
| ENST00000526877 | 65,570,459–65,571,858 | 4 |
| ENST00000913761 | 65,570,459–65,571,773 | 4 |
| ENST00000913762 | 65,570,459–65,571,773 | 4 |
| ENST00000913763 | 65,570,459–65,571,766 | 4 |
| ENST00000985385 | 65,570,459–65,574,190 | 5 |
| ENST00000985386 | 65,570,459–65,574,190 | 5 |
| ENST00000985387 | 65,570,459–65,571,761 | 4 |
| ENST00001025473 | 65,570,459–65,574,190 | 4 |
| ENST00001081230 | 65,570,459–65,571,770 | 4 |
| ENST00001081231 | 65,570,459–65,571,769 | 4 |
| ENST00001081233 | 65,570,459–65,571,768 | 4 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNRD2 在蛋白質複合體組裝品質管制途徑中充當 ubiquitin ligase substrate adapter。此途徑促進未組裝的複合體次單元及不完整的組裝中間體經蛋白酶體清除；ZNRD2 將 E3 ubiquitin ligase HERC2 與尚未組裝的 chaperonin-containing TCP-1（CCT）複合體次單元連結，使這些未組裝成分成為降解標的。來源另將 ZNRD2 列於蛋白質修飾及蛋白質泛素化相關功能。
在微生物感染情境中，ZNRD2 可促進人類呼吸道合胞病毒（HRSV）核蛋白 N 寡聚化，並使其聚集為無功能聚集體，從而限制病毒複製。與 N 的交互作用也會使 ZNRD2 的蛋白質複合體組裝品質管制功能受損；因此，此病毒相關作用與其處理未組裝複合體次單元的功能彼此牽涉。
Promoter 與基因調控
>ZNRD2 ENST00000309328 GRCh38 chr11:65569477-65570577 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACTGTGAAAGTCCAAGTCCTAGCTGCTTTTCCACTGCCCTGGTGTACAACCTCAGGCCCTGCAGACTGCA CATCTGAGGACCCCTGCCTGCCCTGTCTGGCTTCTCTGAATCTAATAAGGGAGAAGATGCGTTTGAAAAA GAACACGGAAGAGGGAGAGAGAAAAAAAGCACCAAGGTCCATGTTCAGAGAGCCCTGGTAATTTTAACTT GCAACTCACCCAAGAAGAGCCTAATGGTCGCAAGAGTATGTAGGAAGGCCCCAACCCGACCCGGCCCAGC ACGCAGCACCCAAGGGCGGCTGGAAGCGCAATGCGCGTGCCCAGTACAGCGCTATTCAGTCTGCAGGCTT TTTGAGGATTTCAACTTCAAAGAACGGTCGGCTTCGGGGCGAACTTTGCTTCAGTTCCAGGCCTCGGGAG GCAGCGAGGAGACAGACTGGGACACCGAGCATGCAGAAGGGGAGTGGTCTTGAAATACGCGGAAAGGGAG AATGCACCCCTCCTGGCCAGCCTTGCCGGGCGAAGTGAGAAGTACTGAGGCCTGAGAAGGCTCCACGCGT GCGCAAAGGGCCGCTCGCTGTGATTACTGGGGTGGCGATGGTTGTGATGACGCCGCTGCCCCGCCTGCGC CGAAAGGGAAACCCCAGGGGAGGCGGAGGCCAGCGGGGATTTCTGAAGCCAAGTGGTCCCCTTCATCCAC GACGGACAGGAAGGGCGACCCCCTGAGGCCACTTCCAGGTCTTGCGACCGGAGGAGAGTTACCAAGGAGA CGCTCCTCCCGAGGCCTCGCGCGTCGGAAGCTTCTGTCCCCTGGATTCCGGTTGACGGACGCGTCCCCCG AGCAGGTTCTCGGTAGCAGCCGACACGCCCCACCCCGGGCACAGCGAGGTCTGAGGACCACGCTAAGGCG TCACGTCCGCCCTGATCCGCGGCAGCTATGGAACGGGCGGAGCCGCAGCGGAGGGCGCTCCGCTTTGACG TCACTTCCTGTGAGCCCGGCGGTGACAACGGCAACATGGCCCTGAACGGAGCTGGTGAGGACCTGGGCGG CAGGGGTTTGTGGCTGTGAGGTACGGGAGGCAGCCCACTCCGGCAAGACCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SSSCA1_1 ↗ | 11:65,570,122 | 正股 | 65,570,073–65,570,132 |
| SSSCA1_2 ↗ | 11:65,570,460 | 正股 | 65,570,411–65,570,470 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：199 aa
ZNRD2 蛋白質長 199 個胺基酸。第 42–59 位區域與 CCT 複合體次單元交互作用，第 79–83 位區域與 HERC2 交互作用；第 100–125 位被註記為無序區。第 173–194 位含有核輸出訊號基序。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNRD2 被定位於細胞質的胞質溶膠。 來源未提供定位隨條件變化或異構型之間差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
- ACTN2P35609 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCNHP51946 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CCT2P78371 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CCT3P49368 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CCT5P48643 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CCT7Q99832 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- HEL-S-100nV9HW96 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HEL-S-69V9HW37 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INCA1Q0VD86 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIAS2O75928-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF4P78317 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNAPC5O75971 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SUMO1P1G2XKQ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRAF3IP3Q9Y228 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBE2IQ7KZS0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZMYM5Q9UJ78-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ORFQ9Q2G4 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
ZNRD2 可形成同源二聚體，並與 E3 ubiquitin-protein ligase HERC2 及未組裝的 CCT 複合體次單元交互作用。與 CCT1、CCT2、CCT3、CCT4、CCT5、CCT7 的交互作用證據最強，CCT6A 與 CCT8 的支持較弱。病毒感染時，ZNRD2 也與 HRSV nucleoprotein N 交互作用；此交互作用使 N 被隔離於無功能聚集體，限制病毒複製，同時損害 ZNRD2 的複合體組裝品質管制功能。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNRD2 在蛋白質複合體組裝品質管制途徑中作為 ubiquitin ligase substrate adapter，促進未組裝的複合體次單元及不完整組裝中間體經蛋白酶體清除；它並將 E3 ubiquitin ligase HERC2 連結至未組裝的 CCT 複合體次單元。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ubiquitin ligase substrate adapter that functions in the protein complex assembly quality control pathway that promotes the proteasomal elimination of unassembled protein complex subunits and incomplete sub-assemblies. As part of the protein complex assembly quality control pathway, links the E3 ubiquitin ligase HERC2 to unassembled chaperonin-containing TCP-1 complex (CCT) subunits PMID 37480851 ↗ · PMID 41566792 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染情境中，ZNRD2 促進人類呼吸道合胞病毒（HRSV）核蛋白 N 寡聚化，並使 N 被隔離於無功能聚集體中，因而限制病毒複製。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Restricts replication of human respiratory syncytial virus (HRSV) by promoting oligomerization of HRSV nucleoprotein N and sequestering it into non-functional aggregates PMID 41566792 ↗ |
| 分子活性 | ZNRD2 每個蛋白質次單元可結合一個鋅離子。 | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | ZNRD2 的功能註記包含蛋白質修飾，並特別列出蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | ZNRD2 可形成同源二聚體，並與 HERC2 及未組裝的 CCT 複合體次單元交互作用，促使後者降解。與 CCT1、CCT2、CCT3、CCT4、CCT5、CCT7 的交互作用證據最強；CCT6A 與 CCT8 的支持較弱。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts with E3 ubiquitin-protein ligase HERC2 and unassembled CCT complex subunits; the interaction targets the unassembled subunits for degradation. The interaction with CCT subunits is strongest for CCT1, CCT2, CCT3, CCT4, CCT5, and CCT7, and poorly supported for CCT6A and CCT8 PMID 32170109 ↗ · PMID 37480851 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染時，ZNRD2 與人類呼吸道合胞病毒（HRSV）核蛋白 N 交互作用。雙方交互作用使 N 被隔離於無功能聚集體，限制病毒複製；同時也損害 ZNRD2 在蛋白質複合體組裝品質管制途徑中的功能。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with human respiratory syncytial virus (HRSV) nucleoprotein N; the interaction reciprocally sequesters N into non-functional aggregates, restricting viral replication, and impairs ZNRD2's function in the protein complex assembly quality control pathway PMID 41566792 ↗ |
| 細胞定位 | ZNRD2 的定位註記為細胞質及胞質溶膠。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GGTGACAACGGCAACATGGCCCTGAACGGAGCTGAAGTCG40ACGACTTCTCCTGGGAGCCCCCGACTGAGGCGGAGACGAA80GGTGCTGCAGGCGCGACGGGAGCGGCAAGATCGCATCTCC120CGGCTCATGGGCGACTATCTGCTGCGCGGTTACCGCATGC160TGGGCGAGACGTGTGCGGACTGCGGGACGATCCTCCTCCA200AGACAAACAGCGGAAAATCTACTGCGTGGCTTGTCAGGAA240CTCGACTCAGACGTGGATAAAGATAATCCCGCTCTGAATG280CCCAGGCTGCCCTCTCCCAAGCTCGGGAGCACCAGCTGGC320CTCAGCCTCAGAGCTCCCCCTGGGCTCTCGACCTGCGCCC360CAGCCCCCAGTACCTCGTCCGGAGCACTGTGAGGGAGCTG400CAGCAGGACTCAAGGCAGCCCAGGGGCCACCTGCTCCTGC440TGTGCCTCCAAATACAGATGTCATGGCCTGCACACAGACA480GCCCTCTTGCAGAAGCTGACCTGGGCCTCTGCTGAACTGG520GCTCTAGCACCTCCCTGGAGACTAGCATCCAGCTGTGTGG560CCTTATCCGCGCATGTGCGGAGGCCCTGCGCAGCCTGCAG600CAGCTACAGCACTAAGAGAAGCCCCTGAGAAAAACCCTCT640AGAAAAACAGCTGTTCCTCTGTGTGGTTTGTTTTTTTCCT680GGTTCCAAGTGTGCATGCCAGCCCCAGCTCCACTCACCTT720TTTCCAGCTTTTGGCCTCTTCACCTCTCCACTCTGCTCTC760CTTGACGCC769cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。