演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF98ZNF739

zinc finger protein 98

ZNF98 是蛋白質編碼基因,產物為 zinc finger protein 98;其功能可能涉及轉錄調控。

Homo sapiens19p12UniProt A6NK75
OFFICIAL SYMBOL
ZNF98
CHROMOSOME
19
UNIPROT
A6NK75
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF98(zinc finger protein 98)是位於人類第 19 號染色體 19p12 區域的蛋白質編碼基因。其基因產物名稱為 zinc finger protein 98;目前提供的基本資料未進一步說明其轉錄本或蛋白質的其他性質。

Official symbol
ZNF98
Gene name
zinc finger protein 98
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13174
UniProt
A6NK75
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZNF739F7175

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p12
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF98pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:22,391,019–22,532,485
Gene span
141,467 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000357774 ★22,391,019–22,422,3464
ENST0000112326322,391,019–22,422,3542
ENST0000113698022,391,019–22,422,3544
ENST0000059365722,392,721–22,422,3574
ENST0000060155322,402,382–22,422,3544
ENST0000059380222,403,434–22,532,4853

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF98 可能參與轉錄調控。現有資料僅指出這項可能角色,未提供其調控方向、作用方式或受影響的基因與生物學過程,因此無法據此進一步界定其具體功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 22422346 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF98 ENST00000357774 GRCh38 chr19:22422246-22423346 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCTTTTAAAAACCTCAGGTTAGTTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCAA
AGCGGGCGGATCACCTGGGAGTTCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTGGTCTCTAATAAAAATACAAAA
AAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCATGACTGTAATTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATCACT
GGAACCCGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCA
AGACTCCATCTTAACACAAAACAAAAACTATCTCAGGCTGCCTGTTCAAAGGACCAGAGCCAGGAAGGTT
ATAAAAGCCGAAATTCAGGCTAGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACCGAGGC
GGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGTAGACCACCCTGACCAACATGGTGAAAACCCCGTCTCTACTAAA
AATACAAAAATTAGCAGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATTTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGAAG
AATCGCTTGAACCCGAGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGA
CACAGCGAGATTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGCAGAAATTTAAAAATAATTGTTATTCTATTCTTTC
CATGTGTGAGCAGCCGTATAGTATATTATTTACAAATACATGAGACCTTATATACAAGGTTTAAGGCAAA
CACCCTCTGGGTGGGCTTAGCTCACCTCAGGGAGGAAGCCCTGCCTGAAAAGGGGGCACCTTCGGCTGTC
AGTCTTTCTTCATTCAGCCCAGCATTTGGTCACATCTTCTGTCACTCAGGGCGTGAGGGCGAGGGATCTT
AAACGTTAACAAGTCAGAGACGCTGGCCTGGGAACTGTCCAATCAGGCACGCGGTTGGAGCGGAAAGGGC
GGCTTCCGGGATGTGGCGGGGTCTTTGTCTCTCGCTGCAGCCGGAGTTCCTGGTCTCGTCTTCGCCCTTC
TGTGTCCTCTGCTCGTAGAGGCCCAGCCTCTGTGGCCCTGTGACCTGCAGG
ZNF98 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF98_1 ↗19:22,422,346負股22,422,336–22,422,395

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9BW9T · enhancer · 22421891–22422335 · regulatory

ENSR19_8MRKX · promoter · 22422336–22422523 · regulatory

· motif · 22422026–22422036 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:572 aa

1 aa572 aa結構域鋅指
依 A6NK75 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 98 長 572 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 N 端第 13–84 位胺基酸區段註解為 KRAB domain;另有 13 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 182–540 位胺基酸範圍內。

結構域KRAB13–84 aa
鋅指C2H2-type 1182–204 aa
鋅指C2H2-type 2210–232 aa
鋅指C2H2-type 3238–260 aa
鋅指C2H2-type 4266–288 aa
鋅指C2H2-type 5294–316 aa
鋅指C2H2-type 6322–344 aa
鋅指C2H2-type 7350–372 aa
鋅指C2H2-type 8378–400 aa
鋅指C2H2-type 9406–428 aa
鋅指C2H2-type 10434–456 aa
鋅指C2H2-type 11462–484 aa
鋅指C2H2-type 12490–512 aa
鋅指C2H2-type 13518–540 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · A6NK75…

AlphaFold · A6NK75

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

zinc finger protein 98 的細胞內定位註解為細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件、異構型差異或動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF739ZNF98
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF98 可能參與轉錄調控;此描述保留可能性,未指出調控的方向、具體機制、作用標的或所涉及的生物學過程。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位zinc finger protein 98 的定位註解為細胞核;此資料未說明定位是否會隨細胞條件改變,也未提供其他定位細節。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000357774 · 2,338 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTCTTTGTCTCTCGCTGCAGCCGGAGTTCCTGGTCTCGTC40
41TTCGCCCTTCTGTGTCCTCTGCTCGTAGAGGCCCAGCCTC80
81TGTGGCCCTGTGACCTGCAGGTATTGGGAATCCACAGCTA120
121AGATGCCAGGACCCCTTGGAAGCCTAGAAATGGGAGTGTT160
161GACATTTAGGGATGTGGCCTTAGAATTCTCTCTGGAGGAG200
201TGGCAATGCCTGGACACCGCACAGCAGAATTTATATAGGA240
241ATGTGATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTTGTGGG280
281TATTGCTGCCTCTAAGCCAGACCTGATCACCTGTCTGGAG320
321CAAGGAAAAGAACCTTGGAATGTGAAGAGACATGAGATGG360
361TAACTGAACCCCCAGTTGTATATTCTTATTTTGCCCAAGA400
401CCTTTGGCCAAAGCAGGGCAAAAAAAATTATTTCCAAAAA440
441GTGATACTGAGAACATATAAAAAATGTGGACGTGAAAATT480
481TACAGTTAAGAAAATACTGTAAAAGCATGGATGAGTGTAA520
521GGTGCACAAAGAATGTTACAATGGACTTAACCAGTGTTTG560
561ACAACTACCCAGAACAAAATATTTCAATATGACAAATATG600
601TGAAAGTCTTTCATAAATTTTCAAATTCAAACAGACATAA640
641GATAGGACATACTGGAAAGAAATCTTTCAAGTGTAAAGAA680
681TGTGAAAAGTCATTTTGCATGCTTTCACACTTAGCTCAAC720
721ATAAAAGAATTCATAGTGGAGAGAAACCCTACAAATGTAA760
761AGAATGTGGGAAAGCCTATAATGAGGCCTCAAACCTTTCT800
801ACACATAAAAGAATTCATACTGGAAAGAAACCCTACAAAT840
841GCGAAGAGTGTGGAAAAGCCTTTAACCGGCTCTCACACCT880
881TACTACACATAAGATAATTCATACTGGAAAGAAACCCTAC920
921AAATGTGAGGAGTGTGGCAAAGCTTTTAACCAATCTGCAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。