基因總覽
ZNF98(zinc finger protein 98)是位於人類第 19 號染色體 19p12 區域的蛋白質編碼基因。其基因產物名稱為 zinc finger protein 98;目前提供的基本資料未進一步說明其轉錄本或蛋白質的其他性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000357774 ★ | 22,391,019–22,422,346 | 4 |
| ENST00001123263 | 22,391,019–22,422,354 | 2 |
| ENST00001136980 | 22,391,019–22,422,354 | 4 |
| ENST00000593657 | 22,392,721–22,422,357 | 4 |
| ENST00000601553 | 22,402,382–22,422,354 | 4 |
| ENST00000593802 | 22,403,434–22,532,485 | 3 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF98 可能參與轉錄調控。現有資料僅指出這項可能角色,未提供其調控方向、作用方式或受影響的基因與生物學過程,因此無法據此進一步界定其具體功能。
Promoter 與基因調控
>ZNF98 ENST00000357774 GRCh38 chr19:22422246-22423346 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCTTTTAAAAACCTCAGGTTAGTTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGCGAGGCCAA AGCGGGCGGATCACCTGGGAGTTCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTGGTCTCTAATAAAAATACAAAA AAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCATGACTGTAATTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATCACT GGAACCCGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCA AGACTCCATCTTAACACAAAACAAAAACTATCTCAGGCTGCCTGTTCAAAGGACCAGAGCCAGGAAGGTT ATAAAAGCCGAAATTCAGGCTAGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACCGAGGC GGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGTAGACCACCCTGACCAACATGGTGAAAACCCCGTCTCTACTAAA AATACAAAAATTAGCAGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATTTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGAAG AATCGCTTGAACCCGAGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGA CACAGCGAGATTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGCAGAAATTTAAAAATAATTGTTATTCTATTCTTTC CATGTGTGAGCAGCCGTATAGTATATTATTTACAAATACATGAGACCTTATATACAAGGTTTAAGGCAAA CACCCTCTGGGTGGGCTTAGCTCACCTCAGGGAGGAAGCCCTGCCTGAAAAGGGGGCACCTTCGGCTGTC AGTCTTTCTTCATTCAGCCCAGCATTTGGTCACATCTTCTGTCACTCAGGGCGTGAGGGCGAGGGATCTT AAACGTTAACAAGTCAGAGACGCTGGCCTGGGAACTGTCCAATCAGGCACGCGGTTGGAGCGGAAAGGGC GGCTTCCGGGATGTGGCGGGGTCTTTGTCTCTCGCTGCAGCCGGAGTTCCTGGTCTCGTCTTCGCCCTTC TGTGTCCTCTGCTCGTAGAGGCCCAGCCTCTGTGGCCCTGTGACCTGCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF98_1 ↗ | 19:22,422,346 | 負股 | 22,422,336–22,422,395 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9BW9T · enhancer · 22421891–22422335 · regulatory
ENSR19_8MRKX · promoter · 22422336–22422523 · regulatory
· motif · 22422026–22422036 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:572 aa
zinc finger protein 98 長 572 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 N 端第 13–84 位胺基酸區段註解為 KRAB domain;另有 13 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 182–540 位胺基酸範圍內。
蛋白質三維結構
細胞內定位
zinc finger protein 98 的細胞內定位註解為細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTCTTTGTCTCTCGCTGCAGCCGGAGTTCCTGGTCTCGTC40TTCGCCCTTCTGTGTCCTCTGCTCGTAGAGGCCCAGCCTC80TGTGGCCCTGTGACCTGCAGGTATTGGGAATCCACAGCTA120AGATGCCAGGACCCCTTGGAAGCCTAGAAATGGGAGTGTT160GACATTTAGGGATGTGGCCTTAGAATTCTCTCTGGAGGAG200TGGCAATGCCTGGACACCGCACAGCAGAATTTATATAGGA240ATGTGATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTTGTGGG280TATTGCTGCCTCTAAGCCAGACCTGATCACCTGTCTGGAG320CAAGGAAAAGAACCTTGGAATGTGAAGAGACATGAGATGG360TAACTGAACCCCCAGTTGTATATTCTTATTTTGCCCAAGA400CCTTTGGCCAAAGCAGGGCAAAAAAAATTATTTCCAAAAA440GTGATACTGAGAACATATAAAAAATGTGGACGTGAAAATT480TACAGTTAAGAAAATACTGTAAAAGCATGGATGAGTGTAA520GGTGCACAAAGAATGTTACAATGGACTTAACCAGTGTTTG560ACAACTACCCAGAACAAAATATTTCAATATGACAAATATG600TGAAAGTCTTTCATAAATTTTCAAATTCAAACAGACATAA640GATAGGACATACTGGAAAGAAATCTTTCAAGTGTAAAGAA680TGTGAAAAGTCATTTTGCATGCTTTCACACTTAGCTCAAC720ATAAAAGAATTCATAGTGGAGAGAAACCCTACAAATGTAA760AGAATGTGGGAAAGCCTATAATGAGGCCTCAAACCTTTCT800ACACATAAAAGAATTCATACTGGAAAGAAACCCTACAAAT840GCGAAGAGTGTGGAAAAGCCTTTAACCGGCTCTCACACCT880TACTACACATAAGATAATTCATACTGGAAAGAAACCCTAC920AAATGTGAGGAGTGTGGCAAAGCTTTTAACCAATCTGCAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。