基因總覽
ZNF92 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 92,產物屬於 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質長 586 個胺基酸,具有 N 端 KRAB 結構域,並含有一串 C2H2 型鋅指區域。這些序列特徵構成其主要結構架構;其中部分鋅指區域被註記為退化型。現有資料將其可能角色概括為參與轉錄調控,但未提供更具體的作用機制或調控對象。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000328747 ★ | 65,373,855–65,401,136 | 4 |
| ENST00000357512 | 65,373,799–65,401,136 | 3 |
| ENST00001136267 | 65,373,799–65,401,136 | 4 |
| ENST00000431504 | 65,373,839–65,401,136 | 2 |
| ENST00000450302 | 65,373,881–65,401,136 | 3 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF92 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述具有推測性,表示目前資料僅支持其可能涉及調節轉錄,並未將此作用表述為已確立的功能。
現有資料沒有說明 ZNF92 如何影響轉錄,也未指出其調控的基因、作用方向、結合序列或參與的細胞過程。因此,不能據此判定它會促進或抑制特定基因的表現,也無法描述其是否透過直接結合 DNA 或其他分子來發揮作用。
雖然 ZNF92 的蛋白質具有 KRAB 結構域與多個 C2H2 型鋅指區域,但來源並未將這些結構特徵與特定轉錄調控機制相連結。現階段可支持的功能結論限於:ZNF92 可能參與轉錄調控;其具體分子作用方式與生物學影響仍未由所提供資料界定。
Promoter 與基因調控
>ZNF92 ENST00000328747 GRCh38 chr7:65372855-65373955 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATTGGCCATGTGTAGCTACTGGCTGCCTGGAATGTGGCTGGTCTGAATTGCAATGTGCTAGAAAGGTAAA ATAGAGTTAATTTCAAAGATTCAGTTCCAAATAAATATATATACTTTATTAATAATTACATATCACTCAC ATATTAGAATAAGGTTTTAGATATATTGGGTTAAATTGTTACAATCAATTTCACCTGTTTCTTGTTTCTT TTTAAAGTTTGGCTGCTAAAAAATGTACAATTCACGTGTCGCCCACATTTTATTTTAGAGGATTGCCTTC TTTTTAAAATTTCAGGCTGCCTGCTTAAAAAAACAGAAGTTGGCCGGGCTCTGTGGCTCACACCTGTAAT CCCAGCACTTTGGGAGACCGAGGCGGGCGGATCACAAGATCAAGAGATCAAGACCATCCTGGCCAACATG GTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTAGTCCCAGTT CCTCGGGAGGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGTTGAGCTCGTGC CACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCTAGACTCTGTCTCAAAAAACAAAAACCAAAAACAAAACAAAAC AACAAAACCAGAAGCCAGGAAGGTCATAAAATCTGAAAATTTTGAATAATTGGTATTATATTCTTTGCAT TTGTGAATAGACATATAATATACTATTTATAAATGCATATGGCCTTATTCACAAGGTTAAATGCAAATAC TGTCTGGGGTGGGCCTGACTCAGCTCAGGGAGGAAGCCCCGTCTGAAAAGGCTGCAGCTTAGGCTGTCAC TCTTCCTTCAGTCCAGCATCTGATCACATCTCCCGTCACTCAGGGCCCGAAGGGGCGGGGCCTTAAACGT TATCCAATCAGGAACGCTGGGCTGGGAACCATCCAATCAGGCACGCAACTGGAGCGGACAGCACAGCTTC CGGGATTTGGCGGGGCCTTTGTCTCTCGCTGCAGCCGGCGCTCCACGTCTAGTCTTCACTGCTCTGCGTC CTGTGCTGATAAAGGCTCGCCGCTGTGACCCTGTTACCTGCAAGAACTTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF92_1 ↗ | 7:65,373,881 | 正股 | 65,373,832–65,373,891 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_9XXKF · enhancer · 65371520–65371870 · regulatory
ENSR7_5KD68M · CTCF_binding_site · 65372314–65372335 · regulatory
ENSR7_9XXKZ · promoter · 65373491–65373891 · regulatory
ENSR7_BGZB4 · enhancer · 65373892–65374832 · regulatory
ENSR7_5KD6K6 · CTCF_binding_site · 65374152–65374173 · regulatory
· motif · 65371982–65371993 · motif
· motif · 65372316–65372332 · motif
· motif · 65372335–65372346 · motif
· motif · 65373461–65373481 · motif
· motif · 65373745–65373755 · motif
· motif · 65373829–65373838 · motif
· motif · 65373829–65373840 · motif
· motif · 65373829–65373840 · motif
· motif · 65374032–65374042 · motif
· motif · 65374154–65374170 · motif
· motif · 65374161–65374171 · motif
· motif · 65374274–65374285 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:586 aa
ZNF92 蛋白質長 586 個胺基酸,N 端第 4–75 位為 KRAB 結構域。序列另含 16 個 C2H2 型鋅指區域,分布於第 145–586 位;其中第 1、2、14、15 與 16 個鋅指被註記為退化型,其餘列為 C2H2 型鋅指。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZNF92 蛋白質定位於細胞核;未提供定位變化的條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTCTCTCGCTGCAGCCGGCGCTCCACGTCTAGTCTTCACT40GCTCTGCGTCCTGTGCTGATAAAGGCTCGCCGCTGTGACC80CTGTTACCTGCAAGAACTTGGAGGTTCACAGCTAAGACGC120CAGGACCCCCTGGAAGCCTAGAAATGGGACCACTGACATT160TAGGGATGTGAAAATAGAATTCTCTCTAGAGGAATGGCAA200TGCCTGGACACTGCGCAGCGGAATTTATATAGAGATGTGA240TGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTCCTTGGTATTGC280TGTCTCTAAGCCAGACCTGATCACCTGGCTGGAGCAAGGA320AAAGAGCCCTGGAATCTGAAGAGACATGAGATGGTAGACA360AAACCCCAGTTATGTGTTCTCATTTTGCCCAAGATGTTTG400GCCAGAGCACAGCATAAAAGATTCTTTCCAAAAAGTGATA440CTGAGAACATATGGAAAATATGGACATGAGAATTTACAGC480TAAGAAAAGACCATAAAAGTGTGGATGCATGTAAGGTGTA520CAAAGGAGGTTATAATGGACTTAACCAGTGTTTGACAACT560ACTGACAGCAAGATATTTCAGTGTGATAAATATGTGAAAG600TCTTTCATAAATTTCCAAATGTAAATAGAAATAAGATAAG640ACATACTGGAAAGAAACCTTTCAAATGTAAAAACCGTGGC680AAATCATTTTGCATGCTTTCACAATTAACTCAACATAAGA720AAATTCATACTAGAGAGTATTCTTACAAATGTGAAGAATG760TGGTAAAGCCTTTAACTGGTCCTCAACCCTTACTAAACAT800AAGATAATTCATACTGGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAG840AATGTGGCAAAGCTTTTAACCGGTCCTCAAATCTTACTAA880ACATAAAATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGT920GAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCGGTCCTCAACCCTTA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。