演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF91HPF7

zinc finger protein 91

ZNF91(zinc finger protein 91)是轉錄因子,可辨識 SVA 序列並抑制其表現。

Homo sapiens19p12UniProt Q05481
OFFICIAL SYMBOL
ZNF91
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q05481
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF91 是蛋白質編碼基因,產物 zinc finger protein 91 屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其蛋白質具有 KRAB 區域及大量 C2H2 型鋅指,包含部分退化的鋅指。來源資料指出,ZNF91 是一種轉錄因子;其序列辨識與轉錄抑制角色,主要與 SVA 逆轉座子相關。

Official symbol
ZNF91
Gene name
zinc finger protein 91
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13166
UniProt
Q05481
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HPF7HTF10

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p12
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF91pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:23,304,991–23,395,527
Gene span
90,537 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000300619 ★23,357,696–23,395,4714
ENST0000112884923,308,715–23,395,5272
ENST0000112885023,308,715–23,395,5275
ENST0000112885123,308,715–23,395,4553
ENST0000112885223,308,715–23,395,5273
ENST0000111603123,337,283–23,395,5276
ENST0000110997123,337,833–23,395,5274
ENST0000111603223,338,618–23,395,5275
ENST0000111603323,338,621–23,395,5275
ENST0000112885323,338,623–23,395,5272
ENST0000059974323,338,749–23,395,5274
ENST0000113399323,357,696–23,395,5274

顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF91 是轉錄因子,具有抑制 SINE-VNTR-Alu(SVA)逆轉座子的特定功能。它能辨識並結合 SVA 序列,進而抑制這些序列的表現。

其抑制作用涉及招募含有 TRIM28/KAP1 的抑制複合體。來源支持 ZNF91 對 SVA 表現的抑制與序列辨識、複合體招募相連,但未提供更細的分子步驟或其他調控條件,因此不宜延伸推論其作用機制。

另有資料指出,ZNF91 可能結合 FCGR2B 基因的啟動子,並導致 FCGR2B 表現受到抑制;不過,此結果仍需要更多證據,才能確認是否在體內發生。這項可能作用與 SVA 抑制的證據程度不同,應保留其尚待驗證的限制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 23395471 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF91 ENST00000300619 GRCh38 chr19:23395371-23396471 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCGCTGGACTTCAGCCTGGGCCACAGAGCAAGACTCAGTCT
CAAAAAAAAAAAATTAAAAAATTATAAGAGATCATAAAATATGTATAAAAATCTAGAGAGGTCAAAAAAA
TTTTAATGTATTTTTATTTTTATTTTTTGCTGGGGTGCAGTGGCATGATCTCAACTCACTACAACCTCCG
CCTCCCGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCGGAGTAGCTGGGATTACAGACGTGTGCCACCAT
GCTCAGCTAATTTTTATATTTTATTTTTCATTTTTTTGAAATGGAATTTCACTCTTATTGTTCAGTCTGG
AATGTATTGGCGCGATCTAGGCTTACTGCAACCTTGGCCTCCCGGGTTCTAGCAATTCTCCTGCCTCAGC
CTCCCGAGTAGTTGGGATTACAGGCACGCACCACCATGCTCAATAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGG
GTTTCACCATGTTAGCCAGACTGGTCTCGGACTCCTGACCTCAGGAGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAA
AGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCGGCTGAGAGACTTACAATGTTTTATCAAATTAGCTT
TATTATTGATAATACACAATAAAGTAAAAGTTGATTTTCTCTGGAACAAAAATTTTATGTATTATTAATA
TACATCAAATATTTTTGTTCACATTTTGAATACATTGAAAGAGAGCAAAGAAGAGAGAGGATTTTCCCAT
GCTCTGAGGTGGGCCTGGCTGAGCTGAGGAAGCCCTGCCTGAAAAGGCTGCAGCCTACGCTGTCACTCTT
TCTTCATTCAGCCCAGTGTCTGATCACATCTTCTGTCACTCAGGGCCTGAGAAGGCGGGGCCTTAAACGT
TATCTAATCAGGGACGCTGGGCTGGGAACTGTCCAATCAGGCACAAAGCTGGAGCGGACAGGGCGGCTTC
CGGGATGTGGCTGGGCCTTTGTCTCTCGCTGCCGCCGGAGTTTCCAGGTCTCGACTTCACTGCTCTGTGT
CCTCTGCTCCAGGAGGCCCAGCCTGTGTGGCCCTGTGACCTGCAGGTATTG
ZNF91 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF91_1 ↗19:23,395,471負股23,395,461–23,395,520

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_B6MCN · enhancer · 23394538–23395435 · regulatory

ENSR19_9C9PK · promoter · 23395436–23395915 · regulatory

· motif · 23394648–23394659 · motif

· motif · 23395157–23395167 · motif

· motif · 23395486–23395497 · motif

· motif · 23395683–23395693 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1191 aa

1 aa1191 aa結構域鋅指
依 Q05481 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 91 長 1,191 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質具有位於第 13–84 個胺基酸的 KRAB 區域,以及 36 個註解的 C2H2 型鋅指;其中第 1、14 與 27 個鋅指標示為退化型。

結構域KRAB13–84 aa
鋅指C2H2-type 1; degenerate154–176 aa
鋅指C2H2-type 2179–200 aa
鋅指C2H2-type 3208–232 aa
鋅指C2H2-type 4238–260 aa
鋅指C2H2-type 5266–288 aa
鋅指C2H2-type 6294–316 aa
鋅指C2H2-type 7322–344 aa
鋅指C2H2-type 8350–372 aa
鋅指C2H2-type 9378–400 aa
鋅指C2H2-type 10406–428 aa
鋅指C2H2-type 11434–456 aa
鋅指C2H2-type 12462–484 aa
鋅指C2H2-type 13490–512 aa
鋅指C2H2-type 14; degenerate518–540 aa
鋅指C2H2-type 15546–568 aa
鋅指C2H2-type 16574–596 aa
鋅指C2H2-type 17602–624 aa
鋅指C2H2-type 18630–652 aa
鋅指C2H2-type 19658–680 aa
鋅指C2H2-type 20686–708 aa
鋅指C2H2-type 21714–736 aa
鋅指C2H2-type 22742–764 aa
鋅指C2H2-type 23770–792 aa
鋅指C2H2-type 24798–820 aa
鋅指C2H2-type 25826–848 aa
鋅指C2H2-type 26854–876 aa
鋅指C2H2-type 27; degenerate885–904 aa
鋅指C2H2-type 28910–932 aa
鋅指C2H2-type 29938–960 aa
鋅指C2H2-type 30966–988 aa
鋅指C2H2-type 31994–1016 aa
鋅指C2H2-type 321022–1044 aa
鋅指C2H2-type 331050–1072 aa
鋅指C2H2-type 341078–1100 aa
鋅指C2H2-type 351106–1128 aa
鋅指C2H2-type 361134–1156 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q05481…

AlphaFold · Q05481

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HPF7ZNF91
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF91 是特定抑制 SVA 逆轉座子的轉錄因子,可辨識並結合 SVA 序列,並藉由招募含 TRIM28/KAP1 的抑制複合體降低其表現。它也可能結合 FCGR2B 啟動子並抑制其表現,但此作用是否在體內發生仍待更多證據確認。含實驗來源
證據與來源

Transcription factor specifically required to repress SINE-VNTR-Alu (SVA) retrotransposons: recognizes and binds SVA sequences and represses their expression by recruiting a repressive complex containing TRIM28/KAP1. May also bind the promoter of the FCGR2B gene, leading to repress its expression; however, additional evidence is required to confirm this result in vivo

PMID 25274305 ↗ · PMID 11470777 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF91 定位於細胞核。含實驗來源
證據與來源

Nucleus

PMID 23665872 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000300619 · 5,400 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTCTCTCGCTGCCGCCGGAGTTTCCAGGTCTCGACTTCAC40
41TGCTCTGTGTCCTCTGCTCCAGGAGGCCCAGCCTGTGTGG80
81CCCTGTGACCTGCAGGTATTGGAGAGCCACAGCTAAGATG120
121CCAGGAACCCCTGGAAGCCTAGAAATGGGACTGTTGACAT160
161TTAGGGATGTGGCCATAGAATTCTCTCCGGAGGAGTGGCA200
201ATGTCTGGACACTGCACAGCAGAATTTATATAGGAATGTG240
241ATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGCCTTCCTGGGTATTG280
281CTCTCTCTAAGCCAGACCTGATTACTTATCTGGAGCAAGG320
321AAAAGAGCCCTGGAATATGAAGCAACATGAGATGGTGGAT360
361GAACCCACAGGTATATGTCCTCATTTTCCTCAAGACTTTT400
401GGCCAGAGCAGAGCATGGAAGATTCTTTTCAAAAAGTATT440
441ACTGAGAAAATATGAAAAATGTGGACATGAGAATTTACAG480
481TTAAGAAAAGGTTGTAAAAGTGTGGATGAGTGTAAGGTGC520
521ACAAAGAAGGTTATAATAAACTTAACCAGTGTCTCACAAC560
561TGCCCAGAGCAAAGTATTTCAATGTGGGAAATATTTGAAA600
601GTCTTCTATAAATTTTTAAATTCAAACAGACATACGATAA640
641GACATACTGGAAAGAAATGCTTCAAATGTAAAAAATGTGT680
681CAAGTCATTTTGCATCCGTTTACACAAAACCCAACATAAA720
721TGCGTTTATATTACAGAGAAGTCCTGTAAATGTAAAGAAT760
761GTGAAAAAACCTTTCATTGGTCCTCAACCCTTACTAATCA800
801TAAGGAAATTCATACTGAAGATAAACCCTACAAATGTGAA840
841GAATGTGGCAAAGCTTTTAAGCAGCTCTCAACCCTTACTA880
881CACATAAAATAATCTGTGCTAAAGAGAAAATCTACAAGTG920
921TGAAGAATGTGGCAAAGCATTTCTATGGTCCTCAACCCTA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。