基因總覽
ZNF91 是蛋白質編碼基因,產物 zinc finger protein 91 屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其蛋白質具有 KRAB 區域及大量 C2H2 型鋅指,包含部分退化的鋅指。來源資料指出,ZNF91 是一種轉錄因子;其序列辨識與轉錄抑制角色,主要與 SVA 逆轉座子相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000300619 ★ | 23,357,696–23,395,471 | 4 |
| ENST00001128849 | 23,308,715–23,395,527 | 2 |
| ENST00001128850 | 23,308,715–23,395,527 | 5 |
| ENST00001128851 | 23,308,715–23,395,455 | 3 |
| ENST00001128852 | 23,308,715–23,395,527 | 3 |
| ENST00001116031 | 23,337,283–23,395,527 | 6 |
| ENST00001109971 | 23,337,833–23,395,527 | 4 |
| ENST00001116032 | 23,338,618–23,395,527 | 5 |
| ENST00001116033 | 23,338,621–23,395,527 | 5 |
| ENST00001128853 | 23,338,623–23,395,527 | 2 |
| ENST00000599743 | 23,338,749–23,395,527 | 4 |
| ENST00001133993 | 23,357,696–23,395,527 | 4 |
顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF91 是轉錄因子,具有抑制 SINE-VNTR-Alu(SVA)逆轉座子的特定功能。它能辨識並結合 SVA 序列,進而抑制這些序列的表現。
其抑制作用涉及招募含有 TRIM28/KAP1 的抑制複合體。來源支持 ZNF91 對 SVA 表現的抑制與序列辨識、複合體招募相連,但未提供更細的分子步驟或其他調控條件,因此不宜延伸推論其作用機制。
另有資料指出,ZNF91 可能結合 FCGR2B 基因的啟動子,並導致 FCGR2B 表現受到抑制;不過,此結果仍需要更多證據,才能確認是否在體內發生。這項可能作用與 SVA 抑制的證據程度不同,應保留其尚待驗證的限制。
Promoter 與基因調控
>ZNF91 ENST00000300619 GRCh38 chr19:23395371-23396471 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCGCTGGACTTCAGCCTGGGCCACAGAGCAAGACTCAGTCT CAAAAAAAAAAAATTAAAAAATTATAAGAGATCATAAAATATGTATAAAAATCTAGAGAGGTCAAAAAAA TTTTAATGTATTTTTATTTTTATTTTTTGCTGGGGTGCAGTGGCATGATCTCAACTCACTACAACCTCCG CCTCCCGGGTTCAGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCGGAGTAGCTGGGATTACAGACGTGTGCCACCAT GCTCAGCTAATTTTTATATTTTATTTTTCATTTTTTTGAAATGGAATTTCACTCTTATTGTTCAGTCTGG AATGTATTGGCGCGATCTAGGCTTACTGCAACCTTGGCCTCCCGGGTTCTAGCAATTCTCCTGCCTCAGC CTCCCGAGTAGTTGGGATTACAGGCACGCACCACCATGCTCAATAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGG GTTTCACCATGTTAGCCAGACTGGTCTCGGACTCCTGACCTCAGGAGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAA AGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCGGCTGAGAGACTTACAATGTTTTATCAAATTAGCTT TATTATTGATAATACACAATAAAGTAAAAGTTGATTTTCTCTGGAACAAAAATTTTATGTATTATTAATA TACATCAAATATTTTTGTTCACATTTTGAATACATTGAAAGAGAGCAAAGAAGAGAGAGGATTTTCCCAT GCTCTGAGGTGGGCCTGGCTGAGCTGAGGAAGCCCTGCCTGAAAAGGCTGCAGCCTACGCTGTCACTCTT TCTTCATTCAGCCCAGTGTCTGATCACATCTTCTGTCACTCAGGGCCTGAGAAGGCGGGGCCTTAAACGT TATCTAATCAGGGACGCTGGGCTGGGAACTGTCCAATCAGGCACAAAGCTGGAGCGGACAGGGCGGCTTC CGGGATGTGGCTGGGCCTTTGTCTCTCGCTGCCGCCGGAGTTTCCAGGTCTCGACTTCACTGCTCTGTGT CCTCTGCTCCAGGAGGCCCAGCCTGTGTGGCCCTGTGACCTGCAGGTATTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF91_1 ↗ | 19:23,395,471 | 負股 | 23,395,461–23,395,520 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_B6MCN · enhancer · 23394538–23395435 · regulatory
ENSR19_9C9PK · promoter · 23395436–23395915 · regulatory
· motif · 23394648–23394659 · motif
· motif · 23395157–23395167 · motif
· motif · 23395486–23395497 · motif
· motif · 23395683–23395693 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1191 aa
zinc finger protein 91 長 1,191 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質具有位於第 13–84 個胺基酸的 KRAB 區域,以及 36 個註解的 C2H2 型鋅指;其中第 1、14 與 27 個鋅指標示為退化型。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF91 是特定抑制 SVA 逆轉座子的轉錄因子,可辨識並結合 SVA 序列,並藉由招募含 TRIM28/KAP1 的抑制複合體降低其表現。它也可能結合 FCGR2B 啟動子並抑制其表現,但此作用是否在體內發生仍待更多證據確認。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor specifically required to repress SINE-VNTR-Alu (SVA) retrotransposons: recognizes and binds SVA sequences and represses their expression by recruiting a repressive complex containing TRIM28/KAP1. May also bind the promoter of the FCGR2B gene, leading to repress its expression; however, additional evidence is required to confirm this result in vivo PMID 25274305 ↗ · PMID 11470777 ↗ |
| 細胞定位 | ZNF91 定位於細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTCTCTCGCTGCCGCCGGAGTTTCCAGGTCTCGACTTCAC40TGCTCTGTGTCCTCTGCTCCAGGAGGCCCAGCCTGTGTGG80CCCTGTGACCTGCAGGTATTGGAGAGCCACAGCTAAGATG120CCAGGAACCCCTGGAAGCCTAGAAATGGGACTGTTGACAT160TTAGGGATGTGGCCATAGAATTCTCTCCGGAGGAGTGGCA200ATGTCTGGACACTGCACAGCAGAATTTATATAGGAATGTG240ATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGCCTTCCTGGGTATTG280CTCTCTCTAAGCCAGACCTGATTACTTATCTGGAGCAAGG320AAAAGAGCCCTGGAATATGAAGCAACATGAGATGGTGGAT360GAACCCACAGGTATATGTCCTCATTTTCCTCAAGACTTTT400GGCCAGAGCAGAGCATGGAAGATTCTTTTCAAAAAGTATT440ACTGAGAAAATATGAAAAATGTGGACATGAGAATTTACAG480TTAAGAAAAGGTTGTAAAAGTGTGGATGAGTGTAAGGTGC520ACAAAGAAGGTTATAATAAACTTAACCAGTGTCTCACAAC560TGCCCAGAGCAAAGTATTTCAATGTGGGAAATATTTGAAA600GTCTTCTATAAATTTTTAAATTCAAACAGACATACGATAA640GACATACTGGAAAGAAATGCTTCAAATGTAAAAAATGTGT680CAAGTCATTTTGCATCCGTTTACACAAAACCCAACATAAA720TGCGTTTATATTACAGAGAAGTCCTGTAAATGTAAAGAAT760GTGAAAAAACCTTTCATTGGTCCTCAACCCTTACTAATCA800TAAGGAAATTCATACTGAAGATAAACCCTACAAATGTGAA840GAATGTGGCAAAGCTTTTAAGCAGCTCTCAACCCTTACTA880CACATAAAATAATCTGTGCTAAAGAGAAAATCTACAAGTG920TGAAGAATGTGGCAAAGCATTTCTATGGTCCTCAACCCTA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。