基因總覽
ZNF84（zinc finger protein 84）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質長 738 個胺基酸，具有 N 端 KRAB domain，並在後段排列多個 C2H2-type zinc finger，呈現由不同功能區域構成的結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000539354 ★ | 133,037,509–133,063,299 | 5 |
| ENST00000917405 | 133,037,262–133,063,297 | 5 |
| ENST00000392319 | 133,037,277–133,063,298 | 5 |
| ENST00000543758 | 133,037,277–133,059,606 | 5 |
| ENST00000907399 | 133,037,277–133,061,480 | 5 |
| ENST00000907400 | 133,037,277–133,059,600 | 5 |
| ENST00000907401 | 133,037,277–133,059,599 | 5 |
| ENST00000907402 | 133,037,277–133,059,599 | 6 |
| ENST00000907403 | 133,037,277–133,059,599 | 5 |
| ENST00000907404 | 133,037,277–133,059,599 | 6 |
| ENST00000917406 | 133,037,277–133,063,296 | 5 |
| ENST00000917407 | 133,037,277–133,061,081 | 6 |
顯示 12/36 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料指出，ZNF84 的蛋白質產物可能參與轉錄調控；此描述表達的是可能性，並未進一步界定其調控方向、作用標的或具體機制。
轉錄調控涉及對基因轉錄活動的調節，但現有資料未說明 ZNF84 是促進或抑制轉錄，也未指出它作用於哪些基因或調控序列。因此，不能據此推定其對特定基因表現的影響，或將其功能延伸至特定細胞過程。
來源也未提供 ZNF84 參與轉錄調控的實驗條件、作用方式或生物學後果。其功能目前應限於「可能參與轉錄調控」這項概括性註記；KRAB 與 C2H2-type zinc finger 等結構特徵本身，不能單獨用來補足未提供的功能細節。
Promoter 與基因調控
>ZNF84 ENST00000539354 GRCh38 chr12:133036509-133037609 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTCTTCAAATTGTGGATAAAATTGGGTCAAATTTGGCCCATGTTGTCCTGGAGAATCATTTGTGTCACAA ATTATCAAATTTATTAGTATAGAGCGGATTTTCATTCAATTTCCTATGTGTCTATGGTTATTTCTCTTTT TTCATCTCTCTCCTCCATCTCCCCGGCCCCATCTTGCTGTCATAAGCATCGTGACTTACCTATAATTCTC CCTACGACTCCAGTTATGGATCAACTTTACTTTTTTCTGTTAATTCTTACCTTCTTTCCATAAATATATT TAAATTTTTTCTGGTTTCCTCAACTGAAGTCAAACCAATTGAGTATTGGTGGGCCGGGCGCGGTGGCTCA CGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATTGCCTGAGCTCAGGAGTTCGCGACCAGC CTGGGCAACACGGTGACTCCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGCGGCGGGCGCC TGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATGGCGTCAACCCGGGAGGCGGAGTTTGCAGTGA GCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACGCCGTCTCAAGAAAATATATATAT ATATTGGTGGATTCGGTTTCCCTTTATGTTTCTCAGAAAACCGTGTGAGCCCGTTTGGAGTCACTCCGTC TCCAAGCGACAGGCACTTCCGGACGCGGGGCACTGTGGGAAGTTGAGTTCGCGGGGCTCCTTCCTTCGCG CATGCGCACATGCACTCTTGGTAATGCTTGCAGGTGGCCCGTTCTTCCTCTTTGTCCTTCGCTGCCACGT GAGAGGGGAGTGTACGCGTGTGCGCGCGTGCGAGTGTGCGCGTGTGCAGTCCCCGACTCGTCCCGGCCCG TTCGGAGCCGCCCGGGAGCGCACAAAGGCCGACGGTTTGGGCGCGTGCGCGGGACACGGGGGACGGGCGG TGTCACGTGATCGCGAGGCCGCGGGCGCGCGGGCGCGACTCGGCGGCGGCGTCTTTTGTGAGTTCAGTGA GTTTATTGCGGGCCCGGCGCTGGGGGCTCCGGGAATGGCGGGGGAGGCGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF84_2 ↗ | 12:133,037,326 | 正股 | 133,037,277–133,037,336 |
| ZNF84_1 ↗ | 12:133,037,525 | 正股 | 133,037,476–133,037,535 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_BZDT9 · promoter · 133036901–133037590 · regulatory
ENSR12_BZDTD · enhancer · 133037591–133038363 · regulatory
· motif · 133037222–133037231 · motif
· motif · 133037222–133037233 · motif
· motif · 133037222–133037233 · motif
· motif · 133037275–133037286 · motif
· motif · 133037275–133037286 · motif
· motif · 133037320–133037333 · motif
· motif · 133037342–133037351 · motif
· motif · 133037342–133037351 · motif
· motif · 133037361–133037372 · motif
· motif · 133037361–133037372 · motif
· motif · 133037363–133037374 · motif
· motif · 133037369–133037380 · motif
· motif · 133037369–133037380 · motif
· motif · 133037371–133037382 · motif
· motif · 133037385–133037396 · motif
· motif · 133037385–133037396 · motif
· motif · 133037458–133037469 · motif
· motif · 133037458–133037469 · motif
· motif · 133037490–133037499 · motif
· motif · 133037490–133037499 · motif
· motif · 133037514–133037525 · motif
· motif · 133037514–133037525 · motif
· motif · 133037591–133037601 · motif
· motif · 133038071–133038082 · motif
· motif · 133040589–133040600 · motif
· motif · 133040745–133040756 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：738 aa
ZNF84 蛋白質長 738 個胺基酸，N 端含 KRAB domain；其後有 19 個 C2H2-type zinc finger，依序分布於蛋白質序列的後段。資料將其歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
現有資料未提供定位變化的條件、不同異構型之間的差異或其他動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- HSF2BPO75031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO1P25800 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO3Q8TAP4-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPANXN2Q5MJ10 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM28Q13263 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCGGGCGCGCGGGCGCGACTCGGCGGCGGCGTCTTTTTCC40ACAGATCCTGGTCCCTACAAATAAGCCTGCTCATGTGAGA80TAAGAAAGGAGTTCCTGGAACCAGGAATTCATTCTCAGTG120TAGAAGACCTAGCTGAGACCTCACTCCACAGTTTTGGGGC160AGAAGCAGAAGAGACGCACAGTAGAACCGATCTCAGCCTT200GCTGATCATCTCGTACAGCAGCAGAAAATGACCATGTTAC240AGGAGTCATTCTCATTTGACGATTTATCTGTGGACTTCAC280CCAAAAGGAGTGGCAGCTACTGGATCCCTCTCAGAAGAAT320TTATACAAGGATGTGATGTTGGAGAACTATAGCAGCCTAG360TGTCACTGGGGTATGAAGTTATGAAACCAGATGTCATCTT400CAAATTGGAGCAAGGAGAAGAGCCGTGGGTAGGAGATGGA440GAAATTCCAAGTTCAGATTCTCCAGAAGTCTGGAAAGTAG480ATGGTAACATGATGTGGCACCAGGATAACCAAGACAAGCT520TAAAATTATAAAAAGAGGTCATGAATGTGATGCATTTGGA560AAAAATTTCAATCTGAACATGAACTTTGTTCCTTTAAGGA600AATCAAACAGTGAAGGTGACTTAGATGGATTGATTTTAAA640ACATCATTTAGATTTGCTTATTCCAAAAGGAGATTATGGA680AAAGCAGAATCAGATGACTTTAATGTGTTTGATAATTTTT720TTCTCCATTCCAAGCCTGAGGATACTGATACCTGGTTAAA760ATACTATGACTGTGATAAATATAAAGAGAGCTATAAAAAG800TCACAGATTATCATATATCATAGAAATCGTTTAGGGGAGA840AACTCTATGAATGCAGTGAATGTAGGAAGCGCTTCAGTAA880GAAACCAAGTCTCATTAAACATCAGAGCAGACATATAAGA920GACATAGCCTTTGGCTGTGGTAATTGTGGCAAAACCTTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。