演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF83FLJ11015

zinc finger protein 83

ZNF83(zinc finger protein 83)是 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族的蛋白質,可能參與轉錄調控,蛋白質序列含有多個 C2H2-type zinc finger。

Homo sapiens19q13.41UniProt P51522
OFFICIAL SYMBOL
ZNF83
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P51522
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF83 的正式名稱為 zinc finger protein 83,是一種蛋白質編碼基因,其產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。此蛋白質長 516 個胺基酸,序列中可辨識出 15 個 C2H2-type zinc finger,其中第一個被註記為退化型;N 端另有一段被預測為無序的區域。這些序列特徵構成其基本蛋白質架構。現有資料將其可能角色概括為參與轉錄調控,但未提供更具體的作用機制或調控對象。

Official symbol
ZNF83
Gene name
zinc finger protein 83
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13158
UniProt
P51522
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ11015HPF1ZNF816B

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.41
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF83pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:52,612,356–52,638,388
Gene span
26,033 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000301096 ★52,612,377–52,638,3553
ENST0000059759752,612,356–52,637,0862
ENST0000053693752,612,356–52,638,3854
ENST0000054587252,612,356–52,638,3853
ENST0000059716152,612,356–52,638,3855
ENST0000070619952,612,356–52,638,3855
ENST0000089977052,612,356–52,638,3856
ENST0000089977152,612,356–52,638,3857
ENST0000089977252,612,356–52,638,3854
ENST0000089977352,612,356–52,638,3855
ENST0000089977452,612,356–52,637,0863
ENST0000089977552,612,356–52,619,0353

顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有資料指出,ZNF83 可能參與轉錄調控。這項描述帶有可能性,支持其與轉錄調控相關的推測,但未進一步說明它促進或抑制轉錄,也沒有指出作用的基因、轉錄因子或其他分子對象。因此,不能據此判定其調控方向或特定靶標。

資料亦未提供 ZNF83 如何影響轉錄的分子步驟、參與哪些細胞生物學過程,或其功能對細胞與個體的具體意義。雖然蛋白質屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,且含多個 zinc finger,但現有功能描述沒有將這些結構特徵連結到特定 DNA 結合、辨識序列或調控機制;因此不宜由家族歸屬推定其具體作用方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 52638355 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF83 ENST00000301096 GRCh38 chr19:52638255-52639355 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATTACTTGAGGTCGGAAATTTGAGACCAACCTGACCAACAT
GGAGAAATCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCAGGGCATGGTGGCACATCCCTGTGATCCCAGCT
ACTTGGGAGATAGAGGCATGAGAATCGATTGAACCTGGGAGACAGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCT
GGTCAACTAGAGCAAAACTCCATCTCAAGAAACAAAAAAAGAAACTGATAGATCTCTTACACAAATACGC
TGGGACAACTAACTGGATATCCACGTGGAAAAGAATAATGTTGGATCCCTATGTAACATCATCAAAAATT
TTATTATAAAAAAGAAAAGAGAGAGAGAGACGAGGAAGGGAGCCCTGCGGGAGGGGGTGTTACTTTGTCG
CCCAGGCTGGCCTGAACTCCCAGGCTCGGCGATCCTCCCGCCGCTGCTTCCTGAATAGCTGGGACCTCAG
GCTCCCACTCCCGCGCCCATATCCCAGCTGTGTTTAAGCCGCAGGTGGTGACCTCACCCATCCTTGGCCT
GAGCACTCCATCCTGCATCTCAGGCAGTGGCCTGAGTCTCTAAAGCTGAGCACAGCGTGGACTCTCTCCC
AAGTGAATGGAGAATAGAAAGGGAGAGGATTTCTATTCGGTTCTGTGGGCTATCAGCATGAAATTGTACC
TTCCGCCCAGGCAGGGCTTTGCATTTCACATTCTAGTTTGCATCCCCGTTCCAGATAATTCCAGGGCTTT
TGAATCATGCCTCAGCCTTCCTGGCCGGTCTCGCCTCCAAAACCCGAAAAATGCCTCTGCGCTGGGAACG
ATGCTGAGAGACTCACAGGTCCCGCCCTGGCCCCGCCCACTGCTGGTTCTAAAGGGGAAAGTCTCTCGGC
TTCCCACCCCGCCCCTACCTCATCCAGGCCCCGCCCACCTCGCGGGCCCCGCCCAGACCTGGCTTCTGTA
CTGCGCGCGCACATGCGCGCAAACCCGGAAGCGGATTATGTGGAGTGAAAGTTACACCGTGGCGGTGAGT
TTCGCTCTTCTATTAAGTCTGCGCTTACCAGGTCCCCGGCGCTGCTGTACC
ZNF83 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF83_2 ↗19:52,630,753負股52,630,743–52,630,802

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BDG3F · enhancer · 52637317–52638338 · regulatory

ENSR19_BDG3J · promoter · 52638339–52638875 · regulatory

ENSR19_5GD9RM · CTCF_binding_site · 52638466–52638487 · regulatory

ENSR19_9QW5R · enhancer · 52640923–52641276 · regulatory

· motif · 52636418–52636426 · motif

· motif · 52637176–52637187 · motif

· motif · 52637858–52637869 · motif

· motif · 52638083–52638092 · motif

· motif · 52638343–52638352 · motif

· motif · 52638343–52638354 · motif

· motif · 52638343–52638354 · motif

· motif · 52638357–52638368 · motif

· motif · 52638357–52638368 · motif

· motif · 52638468–52638484 · motif

· motif · 52639974–52639987 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:516 aa

1 aa516 aa功能區域鋅指
依 P51522 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF83 蛋白質長 516 個胺基酸,含 15 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 93–507 個胺基酸區間;其中第一個標註為退化型,其餘為 C2H2-type。第 1–20 個胺基酸另被註記為無序區域。此蛋白質屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。

鋅指C2H2-type 1; degenerate93–115 aa
鋅指C2H2-type 2121–143 aa
鋅指C2H2-type 3149–171 aa
鋅指C2H2-type 4177–199 aa
鋅指C2H2-type 5205–227 aa
鋅指C2H2-type 6233–255 aa
鋅指C2H2-type 7261–283 aa
鋅指C2H2-type 8289–311 aa
鋅指C2H2-type 9317–339 aa
鋅指C2H2-type 10345–367 aa
鋅指C2H2-type 11373–395 aa
鋅指C2H2-type 12401–423 aa
鋅指C2H2-type 13429–451 aa
鋅指C2H2-type 14457–479 aa
鋅指C2H2-type 15485–507 aa
功能區域Disordered1–20 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P51522…

AlphaFold · P51522

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF83 的定位資料將其列於細胞核;資料未描述定位隨條件改變的情形,也未提供異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ11015ZNF83
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF83 可能參與轉錄調控;此描述保留可能性,未指出其調控方向、特定靶標或具體作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF83 的定位資料列出細胞核,未提供其他定位條件或動態資訊。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000301096 · 2,553 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAACCCGGAAGCGGATTATGTGGAGTGAAAGTTACACCGT40
41GGCGGATTGACTTCTAAGGACTCTTGGTACATGAGGAAGA80
81AACCCGGAAGGGGAAGAGGAAAGCAAAGGCGTCAGGAATG120
121GTTCTTCCTCAGGTATTTTTTCTAAATGTGAGATCAAGGA160
161ATTACCACCAAAAAAGGAGAGTAATACAGGAGAAATATTC200
201CAGACAGTAATGTTGGAAAGACATGAAAGCCACGACATAC240
241AAGATTTTTGCTTCAGAGAAACCCAGAAAAATGTACATGA280
281CTCTCAGTGTCTGTGGAAACATGATTGAAGACATTATAAG320
321CGAGTGCGTGTGACCTATAAGGAAAGTCTCATTGGTAGAA360
361GAGACATGCATGGGAGAAAGGATGATGCACAAAAGCAGCC400
401TGTTAAAAATCAGCTTGGATTAAACCCGCAGTCACATCTA440
441CCAGAACTGCAGCTATTTCAAGCTGAAGGGAAAATATATA480
481AATATGATCACATGGAAAAATCTGTCAACAGTAGTTCCTT520
521AGTTTCCCCACCCCAACGTATTTCTTCTACTGTCAAAACC560
561CACATTTCTCATACATATGAATGTAATTTTGTGGATTCAT600
601TATTCACACAAAAAGAGAAAGCAAATATTGGGACAGAACA640
641CTACAAATGTAGTGAGCGTGGCAAGGCCTTTCATCAAGGC680
681TTACATTTTACTATACATCAAATAATCCATACTAAAGAGA720
721CGCAATTTAAATGTGATATATGTGGCAAGATCTTCAATAA760
761AAAATCAAACCTTGCAAGTCATCAAAGAATTCATACTGGA800
801GAGAAGCCATATAAATGTAATGAATGTGGCAAGGTCTTCC840
841ATAATATGTCACACCTTGCACAGCATCGCAGGATTCATAC880
881TGGAGAGAAACCATATAAATGTAATGAATGTGGCAAGGTC920
921TTTAATCAAATTTCACACCTTGCACAACATCAAAGAATTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。