演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF79pT7

zinc finger protein 79

ZNF79(zinc finger protein 79)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族的蛋白質,具有 KRAB 區域與多個 C2H2-type zinc finger;其可能參與轉錄調控。

Homo sapiens9q33.3UniProt Q15937
OFFICIAL SYMBOL
ZNF79
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q15937
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF79 是由 ZNF79 基因編碼的蛋白質,正式名稱為 zinc finger protein 79,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列包含 KRAB 區域及一組連續排列的 C2H2-type zinc finger,呈現此家族的鋅指蛋白特徵。資料指出,ZNF79 可能參與轉錄調控,但目前提供的功能描述未進一步說明其調控對象或作用方式。蛋白質特徵註解另標示其 N 端有一段無序區域。這些資訊勾勒出 ZNF79 的基本家族歸屬與結構組成;具體分子作用仍應依現有證據範圍理解。

Official symbol
ZNF79
Gene name
zinc finger protein 79
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13153
UniProt
Q15937
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
pT7

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q33.3
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegZNF79pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:127,424,374–127,449,728
Gene span
25,355 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000342483 ★127,424,382–127,445,3725
ENST00000617266127,424,374–127,445,3713
ENST00000850855127,424,382–127,449,7283
ENST00000543471127,424,390–127,445,3566
ENST00000850856127,424,406–127,445,3605
ENST00000850857127,424,470–127,449,7285

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有功能註解指出,ZNF79 可能參與轉錄調控。這項描述使用「可能」表達其功能推論,並未提供可據以判定調控方向、作用標的或具體分子步驟的資料,因此不宜將其解讀為已確立的特定調控機制。

ZNF79 被歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,蛋白質序列具有 KRAB 區域及多個 C2H2-type zinc finger。這些結構註解提供了理解其家族特徵的背景,但現有來源沒有說明這些區域在 ZNF79 中如何作用,也未指出其是否直接辨識特定核酸序列、招募其他分子,或藉由何種方式影響轉錄。

因此,目前能支持的生物學功能說法限於:ZNF79 可能與轉錄調控有關。來源未提供其參與的細胞過程、調控基因、表現條件或功能後果,也沒有描述實驗系統與功能驗證結果。這些未明資訊不應由家族歸屬或結構特徵延伸推定;要界定 ZNF79 的轉錄調控角色,仍需有直接證據支持其作用對象與機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 127424382 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF79 ENST00000342483 GRCh38 chr9:127423382-127424482 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTTCTTACAAAACTGTAAGCCCCAAACTACAGCTGCCCAATATAGAGAAGGGCTAGCTCAAAGACATTTG
TGAGTGTGGCTTCTCCGATGGAGCCAATCCCATTAAGATTCATAGGAAGACCCACAAAATTAAGAAACTT
ACACTGGCAAAAATGCCACCGGCTGTGATTGAAAGGGAAAGAGACAAGACAAAATGAAAAGGAGCCTTAG
AATCCCCATACTCACTTATTTCCTGGGTAACCCAGTCCCCTCCCCTTAACGACAAAATGCCTATAAAAAG
GAGCTGATCATCGAAAAATTGCTTAAGAAGTAATTTCCAAAGGGCTCGAGGGAAAGTCCATTGAAACATC
CCCAGCCTGCAGCAGGGAAGCCCTTAAGGAACACAGGATTCAGGAATCTCCTCCCGCAGAAGTGCTGATC
AAACACTGCCCCTGAAATGACTGAAGCAGTTCCCGCCGGCCGATAGGTTTTTATACTTTGAGGGTCCCAG
GCCACCCACTCACGGCTGTCCTGTTCAGACTGAGGGACTTCTGATTTCCTTTAGTCTTCCCAAACTTTTA
GTACGGCTCAAGAGGACCCTGAGAGTGGCTGGTGATTGCCCTGAGTGGAAGGCCAACGAGGGACAGGCGT
ACCGTGCGCAGAGAGCTGCGGAGAGGAAACCAAGCGCCTAGCGCCAGCGAAGATCGGCGCCCCTGTAAGC
CCAGCATTCCCAGAATCCTTCGCGGCTAAATCTCTTCTTTTCCTCGAGGCTCCATTTCGTTGGATTCTGG
TGGACTTTAAAGACGTGTGCAACAAAAAAGCACGATGGATAATAGATTCCGGGAGCAAGCACAGGCGGAA
GCCTCTCTGGGAAGTACAATCCCTGAGCGTGTGTGTATCATAAACCGGGCTGCAGGAATGAAAAAGACTT
TGGCCAGAAACAGAGCCCCGCGGCGACTTCTGGGAAATGGAGTCCGGTGTGGCCGCCGCGGGGCATGTGC
GCATGACCGGAAGTGGCGCCAATCAGGCGCGTCCCTCTGGCGCTGGAGCCAGGACCTGGCGTTGGGCGGT
ACTTGGACAGCGGTTCTTGAGCTCTCGCGGTTGCCGGTAGATTGTTGCCAG
ZNF79 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF79_1 ↗9:127,424,440正股127,424,391–127,424,450

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_BX9R7 · promoter · 127423884–127424480 · regulatory

ENSR9_BX9RB · enhancer · 127424481–127425288 · regulatory

ENSR9_534Z8BQ · CTCF_binding_site · 127425251–127425272 · regulatory

· motif · 127421263–127421276 · motif

· motif · 127421263–127421277 · motif

· motif · 127421298–127421312 · motif

· motif · 127421299–127421312 · motif

· motif · 127422076–127422089 · motif

· motif · 127422215–127422230 · motif

· motif · 127422220–127422232 · motif

· motif · 127422223–127422230 · motif

· motif · 127422223–127422238 · motif

· motif · 127422358–127422370 · motif

· motif · 127422978–127422989 · motif

· motif · 127423781–127423792 · motif

· motif · 127424290–127424301 · motif

· motif · 127424351–127424362 · motif

· motif · 127424365–127424376 · motif

· motif · 127424365–127424376 · motif

· motif · 127424367–127424376 · motif

· motif · 127424439–127424456 · motif

· motif · 127425253–127425269 · motif

· motif · 127425933–127425948 · motif

· motif · 127425933–127425948 · motif

· motif · 127426139–127426161 · motif

· motif · 127426139–127426161 · motif

· motif · 127426989–127427001 · motif

· motif · 127427505–127427517 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:498 aa

1 aa498 aa結構域功能區域鋅指
依 Q15937 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF79 蛋白質長 498 個胺基酸。其第 38–109 位為 KRAB 區域,第 193–495 位則包含 11 個依序排列的 C2H2-type zinc finger。另有註解將第 1–23 位標示為無序區域;ZNF79 歸屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。

結構域KRAB38–109 aa
鋅指C2H2-type 1193–215 aa
鋅指C2H2-type 2221–243 aa
鋅指C2H2-type 3249–271 aa
鋅指C2H2-type 4277–299 aa
鋅指C2H2-type 5305–327 aa
鋅指C2H2-type 6333–355 aa
鋅指C2H2-type 7361–383 aa
鋅指C2H2-type 8389–411 aa
鋅指C2H2-type 9417–439 aa
鋅指C2H2-type 10445–467 aa
鋅指C2H2-type 11473–495 aa
功能區域Disordered1–23 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q15937…

AlphaFold · Q15937

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF79 的定位註解為細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件、不同異構型間的差異或動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 8 個夥伴 · 最多顯示 50 個
pT7ZNF79FGF12KRT34KRTAP10-8KRTAP6-3MDFITRIM27YJU2BZBTB24
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF79 可能參與轉錄調控;此功能描述保留推測性,未進一步指出調控方向、作用標的或具體分子機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF79 的定位註解為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000342483 · 2,078 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AATCAGGCGCGTCCCTCTGGCGCTGGAGCCAGGACCTGGC40
41GTTGGGCGGTACTTGGACAGCGGTTCTTGAGCTCTCGCGG80
81TTGCCGGTAGATTGTTGCCAGTTGCCAGTTGCCAGTCGTT120
121TTTCGGAAAGCTGGCAGCGGCTTTTTCACCGGGTTCTGCT160
161TGAGGCCGAGCCAAAGAGTGGCTGTGACTCGGGAGACGGA200
201GTGGAACACCCGGCTGGGCAGGCCCGGACAGCTCCCGCGA240
241CCCAGCACCGCAGGATCAGACCGTGCCTCTGCGGGGAGAG280
281GCTGGAGAGGAAGAGTCCGGCCTGGGAGCCGTCAGAGCAG320
321CCCTGCAGAACGGGGTGGGGGCTGCTGTAGATAGACCCTT360
361ACGCCCAGAGAACTGCTGGGAGGCTGTGGCGCGAGGCGGG400
401ACTCAAATGCTGGAGGAAGGAGTACTGCCTTCCCCAGGCC440
441CTGCCCTTCCCCAAGAGGAAAACACAGGAGAGGAAGGAAT480
481GGCTGCTGGTCTCCTCACAGCTGGGCCCCGGGGATCCACA520
521TTCTTCAGCAGTGTGACGGTAGCTTTTGCACAGGAAAGGT560
561GGAGGTGCCTCGTGTCTACTCCACGGGACAGGTTCAAGGA600
601GGGGATACCAGGAAAGTCCAGGAGCCTTGTCCTACTAGGA640
641CTTCCAGTTTCCCAGCCTGGCATGAACTCCCAGTTGGAAC680
681AAAGGGAAGGCGCATGGATGCTGGAGGGCGAAGACCTGCG720
721AAGTCCCTCTCCAGGCTGGAAGATTATATCTGGATCACCA760
761CCAGAGCAAGCCCTTTCTGAAGCTTCATTCCAAGACCCAT800
801GTGTAGAGATGCCCCCTGGGGATTCAGACCACGGGACCAG840
841TGACCTTGAGAAGAGCTTCAATCTGAGACCAGTCCTCTCT880
881CCGCAACAGAGAGTGCCCGTGGAAGCGAGACCTCGCAAAT920
921GTGAGACACACACCGAGAGCTTCAAGAACTCGGAAATCCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。