基因總覽
ZNF79 是由 ZNF79 基因編碼的蛋白質,正式名稱為 zinc finger protein 79,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列包含 KRAB 區域及一組連續排列的 C2H2-type zinc finger,呈現此家族的鋅指蛋白特徵。資料指出,ZNF79 可能參與轉錄調控,但目前提供的功能描述未進一步說明其調控對象或作用方式。蛋白質特徵註解另標示其 N 端有一段無序區域。這些資訊勾勒出 ZNF79 的基本家族歸屬與結構組成;具體分子作用仍應依現有證據範圍理解。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000342483 ★ | 127,424,382–127,445,372 | 5 |
| ENST00000617266 | 127,424,374–127,445,371 | 3 |
| ENST00000850855 | 127,424,382–127,449,728 | 3 |
| ENST00000543471 | 127,424,390–127,445,356 | 6 |
| ENST00000850856 | 127,424,406–127,445,360 | 5 |
| ENST00000850857 | 127,424,470–127,449,728 | 5 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有功能註解指出,ZNF79 可能參與轉錄調控。這項描述使用「可能」表達其功能推論,並未提供可據以判定調控方向、作用標的或具體分子步驟的資料,因此不宜將其解讀為已確立的特定調控機制。
ZNF79 被歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,蛋白質序列具有 KRAB 區域及多個 C2H2-type zinc finger。這些結構註解提供了理解其家族特徵的背景,但現有來源沒有說明這些區域在 ZNF79 中如何作用,也未指出其是否直接辨識特定核酸序列、招募其他分子,或藉由何種方式影響轉錄。
因此,目前能支持的生物學功能說法限於:ZNF79 可能與轉錄調控有關。來源未提供其參與的細胞過程、調控基因、表現條件或功能後果,也沒有描述實驗系統與功能驗證結果。這些未明資訊不應由家族歸屬或結構特徵延伸推定;要界定 ZNF79 的轉錄調控角色,仍需有直接證據支持其作用對象與機制。
Promoter 與基因調控
>ZNF79 ENST00000342483 GRCh38 chr9:127423382-127424482 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTTCTTACAAAACTGTAAGCCCCAAACTACAGCTGCCCAATATAGAGAAGGGCTAGCTCAAAGACATTTG TGAGTGTGGCTTCTCCGATGGAGCCAATCCCATTAAGATTCATAGGAAGACCCACAAAATTAAGAAACTT ACACTGGCAAAAATGCCACCGGCTGTGATTGAAAGGGAAAGAGACAAGACAAAATGAAAAGGAGCCTTAG AATCCCCATACTCACTTATTTCCTGGGTAACCCAGTCCCCTCCCCTTAACGACAAAATGCCTATAAAAAG GAGCTGATCATCGAAAAATTGCTTAAGAAGTAATTTCCAAAGGGCTCGAGGGAAAGTCCATTGAAACATC CCCAGCCTGCAGCAGGGAAGCCCTTAAGGAACACAGGATTCAGGAATCTCCTCCCGCAGAAGTGCTGATC AAACACTGCCCCTGAAATGACTGAAGCAGTTCCCGCCGGCCGATAGGTTTTTATACTTTGAGGGTCCCAG GCCACCCACTCACGGCTGTCCTGTTCAGACTGAGGGACTTCTGATTTCCTTTAGTCTTCCCAAACTTTTA GTACGGCTCAAGAGGACCCTGAGAGTGGCTGGTGATTGCCCTGAGTGGAAGGCCAACGAGGGACAGGCGT ACCGTGCGCAGAGAGCTGCGGAGAGGAAACCAAGCGCCTAGCGCCAGCGAAGATCGGCGCCCCTGTAAGC CCAGCATTCCCAGAATCCTTCGCGGCTAAATCTCTTCTTTTCCTCGAGGCTCCATTTCGTTGGATTCTGG TGGACTTTAAAGACGTGTGCAACAAAAAAGCACGATGGATAATAGATTCCGGGAGCAAGCACAGGCGGAA GCCTCTCTGGGAAGTACAATCCCTGAGCGTGTGTGTATCATAAACCGGGCTGCAGGAATGAAAAAGACTT TGGCCAGAAACAGAGCCCCGCGGCGACTTCTGGGAAATGGAGTCCGGTGTGGCCGCCGCGGGGCATGTGC GCATGACCGGAAGTGGCGCCAATCAGGCGCGTCCCTCTGGCGCTGGAGCCAGGACCTGGCGTTGGGCGGT ACTTGGACAGCGGTTCTTGAGCTCTCGCGGTTGCCGGTAGATTGTTGCCAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF79_1 ↗ | 9:127,424,440 | 正股 | 127,424,391–127,424,450 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_BX9R7 · promoter · 127423884–127424480 · regulatory
ENSR9_BX9RB · enhancer · 127424481–127425288 · regulatory
ENSR9_534Z8BQ · CTCF_binding_site · 127425251–127425272 · regulatory
· motif · 127421263–127421276 · motif
· motif · 127421263–127421277 · motif
· motif · 127421298–127421312 · motif
· motif · 127421299–127421312 · motif
· motif · 127422076–127422089 · motif
· motif · 127422215–127422230 · motif
· motif · 127422220–127422232 · motif
· motif · 127422223–127422230 · motif
· motif · 127422223–127422238 · motif
· motif · 127422358–127422370 · motif
· motif · 127422978–127422989 · motif
· motif · 127423781–127423792 · motif
· motif · 127424290–127424301 · motif
· motif · 127424351–127424362 · motif
· motif · 127424365–127424376 · motif
· motif · 127424365–127424376 · motif
· motif · 127424367–127424376 · motif
· motif · 127424439–127424456 · motif
· motif · 127425253–127425269 · motif
· motif · 127425933–127425948 · motif
· motif · 127425933–127425948 · motif
· motif · 127426139–127426161 · motif
· motif · 127426139–127426161 · motif
· motif · 127426989–127427001 · motif
· motif · 127427505–127427517 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:498 aa
ZNF79 蛋白質長 498 個胺基酸。其第 38–109 位為 KRAB 區域,第 193–495 位則包含 11 個依序排列的 C2H2-type zinc finger。另有註解將第 1–23 位標示為無序區域;ZNF79 歸屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF79 的定位註解為細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件、不同異構型間的差異或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- FGF12P61328-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT34O76011 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP6-3Q3LI67 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDFIQ99750 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM27P14373 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YJU2BP13994 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZBTB24O43167 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AATCAGGCGCGTCCCTCTGGCGCTGGAGCCAGGACCTGGC40GTTGGGCGGTACTTGGACAGCGGTTCTTGAGCTCTCGCGG80TTGCCGGTAGATTGTTGCCAGTTGCCAGTTGCCAGTCGTT120TTTCGGAAAGCTGGCAGCGGCTTTTTCACCGGGTTCTGCT160TGAGGCCGAGCCAAAGAGTGGCTGTGACTCGGGAGACGGA200GTGGAACACCCGGCTGGGCAGGCCCGGACAGCTCCCGCGA240CCCAGCACCGCAGGATCAGACCGTGCCTCTGCGGGGAGAG280GCTGGAGAGGAAGAGTCCGGCCTGGGAGCCGTCAGAGCAG320CCCTGCAGAACGGGGTGGGGGCTGCTGTAGATAGACCCTT360ACGCCCAGAGAACTGCTGGGAGGCTGTGGCGCGAGGCGGG400ACTCAAATGCTGGAGGAAGGAGTACTGCCTTCCCCAGGCC440CTGCCCTTCCCCAAGAGGAAAACACAGGAGAGGAAGGAAT480GGCTGCTGGTCTCCTCACAGCTGGGCCCCGGGGATCCACA520TTCTTCAGCAGTGTGACGGTAGCTTTTGCACAGGAAAGGT560GGAGGTGCCTCGTGTCTACTCCACGGGACAGGTTCAAGGA600GGGGATACCAGGAAAGTCCAGGAGCCTTGTCCTACTAGGA640CTTCCAGTTTCCCAGCCTGGCATGAACTCCCAGTTGGAAC680AAAGGGAAGGCGCATGGATGCTGGAGGGCGAAGACCTGCG720AAGTCCCTCTCCAGGCTGGAAGATTATATCTGGATCACCA760CCAGAGCAAGCCCTTTCTGAAGCTTCATTCCAAGACCCAT800GTGTAGAGATGCCCCCTGGGGATTCAGACCACGGGACCAG840TGACCTTGAGAAGAGCTTCAATCTGAGACCAGTCCTCTCT880CCGCAACAGAGAGTGCCCGTGGAAGCGAGACCTCGCAAAT920GTGAGACACACACCGAGAGCTTCAAGAACTCGGAAATCCT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。