演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF77pT1

zinc finger protein 77

ZNF77 是人類編碼蛋白質的基因,產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19p13.3UniProt Q15935
OFFICIAL SYMBOL
ZNF77
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q15935
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF77(zinc finger protein 77)是位於人類第 19 號染色體的蛋白質編碼基因。其產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,長 545 個胺基酸。蛋白質包含 N 端 KRAB 區域,以及排列於後段的 12 個 C2H2-type zinc finger。這些結構特色構成其家族與蛋白質組成的基本辨識;目前提供的功能註解則指出,它可能參與轉錄調控。

Official symbol
ZNF77
Gene name
zinc finger protein 77
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13150
UniProt
Q15935
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
pT1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.3
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF77pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:2,931,137–2,944,971
Gene span
13,835 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000314531 ★2,933,218–2,944,9714
ENST000011263252,931,137–2,944,9714
ENST000008632332,933,219–2,944,9714
ENST000009151622,933,221–2,944,9714
ENST000011035852,933,226–2,944,9713

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF77 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。此描述以「可能」表達功能推測,來源未進一步界定其調控方向、作用對象或具體分子機制,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的轉錄。

現有資料也未說明 ZNF77 在哪些生物學過程中發揮作用,或其轉錄調控可能帶來何種細胞層級的結果。雖然蛋白質具有 KRAB 區域及多個 C2H2-type zinc finger,但提供的功能敘述沒有將這些結構與特定作用方式連結;因此,不能由結構註解推演其 DNA 靶序列、調控夥伴或下游效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 2944971 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF77 ENST00000314531 GRCh38 chr19:2944871-2945971 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGTCACACCAGTCTGAGTGTCCCTGTAAAAGTATTTTTTGTTTAAGCCTGTGGTTTTTGTAGAGTCTTTT
TCGTTATTAAGCATATAAATGTGAGACCTCTCTCTTCATGACCTTACGTGGTTCTGTTTGTGGGAGGGCT
GCTTTTTTTTTTTTTGAGACTCAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTCCTGATCTTGGC
TCACTGCAATCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCGGAGTAGCTGGGATTACA
GGCGCCCGCCACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGAAGTGGTTTTCGCCATTTTGGTCAG
GCTGGACTTGAACTCCTGACCTCTGATGATCCGCCGGTCTCCGCCTCTCACGGTGCTGGGATTACCGGCG
TGAACCACCGCGCCCGGCCGAGAGTTTTAAGAACACAGGGAGCGCCTGGTGGGGTCCGGCCTCCTGGGGC
CTCGTCGTCTGGTCTCCAGATCTCCAGGTCTCTGGACCCCAGGCGTCCGCGCCCACGCGGGACAGCACGG
TGACGTCACGCACGCGGGTCCCGCCCCCACGCAGGACTCCGCCCCATGGGACTCCGTGCCCTTCCTCTCC
TCCCCGCACGAGGGGCCGCTCCGAGGGGAAACTGAGTCTGGAGTTGCCGTGCAGTCAGGGAGGAGGACGC
CGCGCCCTCCCTGGACTGGAGTGAGTTCTCCCAGATCCGCGGCTGCCCGGCTAGAGGGTCAGCCACGCGT
GTTCTCGACGAGCCCGTCACTGAGGAGAGAATTATCCAATCAGGACAGGCAGGGGCGGGGCCTAGGGAAC
TGTCCAATCAGAGACGTTAATCCGAAGCGGAGCCCTGCCCAATCAAGGGCGCTAGGGGGACGGACTGGAG
AATTCTCCAATCAGGGGTGCGGAGTCGACAGCACTGTCCAATCAGAGTCTCCACTTCCCGAGATCTGTCC
AATCAGACCCCGAGGACGGTAAGCCGAGTTCCCCTCTGCCTTGCGCGCTTCCCCGCCTACCCCGAGCGGC
TCAGGTGTCCTGTCGTGCTCACCTGCGCCGGTCGCTGGACCGCGGGGCGCT
ZNF77 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF77_1 ↗19:2,944,919負股2,944,909–2,944,968

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BKR2 · enhancer · 2944380–2944960 · regulatory

ENSR19_936K7 · promoter · 2944961–2945461 · regulatory

ENSR19_C9WD · enhancer · 2949569–2950655 · regulatory

· motif · 2945141–2945151 · motif

· motif · 2945190–2945206 · motif

· motif · 2945384–2945394 · motif

· motif · 2945401–2945414 · motif

· motif · 2945401–2945414 · motif

· motif · 2945597–2945609 · motif

· motif · 2945599–2945606 · motif

· motif · 2945599–2945614 · motif

· motif · 2946013–2946026 · motif

· motif · 2946013–2946026 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:545 aa

1 aa545 aa結構域鋅指
依 Q15935 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF77 蛋白質長 545 個胺基酸,含有位於第 4–99 位的 KRAB 區域。第 212–542 位之間註解有 12 個 C2H2-type zinc finger,分布於相鄰區段。此蛋白質歸屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。

結構域KRAB4–99 aa
鋅指C2H2-type 1212–234 aa
鋅指C2H2-type 2240–262 aa
鋅指C2H2-type 3268–290 aa
鋅指C2H2-type 4296–318 aa
鋅指C2H2-type 5324–346 aa
鋅指C2H2-type 6352–374 aa
鋅指C2H2-type 7380–402 aa
鋅指C2H2-type 8408–430 aa
鋅指C2H2-type 9436–458 aa
鋅指C2H2-type 10464–486 aa
鋅指C2H2-type 11492–514 aa
鋅指C2H2-type 12520–542 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q15935…

AlphaFold · Q15935

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF77 的定位註解為細胞核。 此資料未提供定位改變的條件、不同異構型之間的差異,或細胞核內更細部的位置資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
pT1ZNF77FTOMBD3L1METTL27NICN1PRDX3RSPO4RUSC1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF77 可能參與轉錄調控;此註解保留可能性,沒有指出調控方向、作用標的或具體機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF77 的定位註解為細胞核;此資料未提供更細部的核內位置或定位條件。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000314531 · 2,040 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAGCCGAGTTCCCCTCTGCCTTGCGCGCTTCCCCGCCTAC40
41CCCGAGCGGCTCAGGTGTCCTGTCGTGCTCACCTGCGCCG80
81GTCGCTGGACCGCGGGGCGCTAACCCTGGAGAGCCCAGGA120
121GCGGGCGGGACATGGACTGCGTGATCTTTGAGGAAGTGGC160
161TGTGAACTTCACCCCAGAAGAGTGGGCATTGCTGGATCAT200
201GCTCAGAGGAGCCTCTACAGAGATGTGATGCTGGAGACCT240
241GCAGGAACCTTGCCTCCTTGGATTGTTACATTTATGTTAG280
281AACCAGTGGATCAAGTTCTCAGAGGGACGTTTTTGGGAAT320
321GGAATATCCAATGATGAAGAGATTGTAAAGTTCACAGGAA360
361GTGATTCCTGGTCTATTTTTGGAGAAAATTGGAGATTTGA400
401TAACACTGGAGATCAGCACCAAATCCCACAGAGGCATCTG440
441AGAAGTCAGCTGGGGAGACTCTGTGAAAGTAATGAAGGTC480
481ATCAATGCGGAGAGACCTTGAGCCAGACTGCGAACCTTCT520
521TGTGCACAAGAGTTACCCTACCGAAGCTAAACCCTCTGAG560
561TGCACTAAGTGTGGCAAAGCCTTCGAGAATCGGCAGAGAT600
601CTCACACTGGACAGAGACCGTGTAAGGAATGTGGGCAAGC640
641CTGCAGCTGCCTCTCCTGCCAAAGCCCTCCTATGAAAACG680
681CAGACTGTAGAGAAACCCTGTAATTGCCAGGACTCAAGGA720
721CAGCATCTGTGACATACGTGAAAAGTCTCAGCAGTAAAAA760
761GTCTTATGAATGTCAGAAATGTGGAAAAGCTTTCATTTGT800
801CCCTCATCTTTCAGGGGACATGTGAATAGTCATCATGGGC840
841AGAAAACCCATGCATGTAAAGTATGTGGGAAGACCTTTAT880
881GTATTACTCCTACCTTACACGGCACGTAAGAACTCACACA920
921GGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGGAGTGTGGGAAAGCCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。