基因總覽
ZNF76 是蛋白質編碼基因，產物為 zinc finger protein 76，屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。現有資料將其描述為轉錄因子，能參與 RNA polymerase II 與 RNA polymerase III 所轉錄基因的表現調節。其 DNA 辨識與基因調控相關特性，是理解此蛋白質基本角色的重點；更具體的辨識方式及其對不同轉錄反應的影響，見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000373953 ★ | 35,259,735–35,295,985 | 14 |
| ENST00000905434 | 35,258,996–35,295,985 | 14 |
| ENST00000469195 | 35,259,471–35,292,642 | 10 |
| ENST00000905435 | 35,259,510–35,295,985 | 12 |
| ENST00000905436 | 35,259,510–35,295,985 | 14 |
| ENST00000905437 | 35,259,510–35,295,985 | 13 |
| ENST00000905438 | 35,259,510–35,295,985 | 14 |
| ENST00000905439 | 35,259,510–35,295,985 | 14 |
| ENST00000905440 | 35,259,510–35,295,985 | 12 |
| ENST00000905441 | 35,259,510–35,295,985 | 13 |
| ENST00000934067 | 35,259,510–35,295,985 | 14 |
| ENST00000934068 | 35,259,510–35,295,985 | 13 |
顯示 12/51 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF76 是 DNA 結合型轉錄因子，參與 RNA polymerase II 與 RNA polymerase III 所轉錄基因的表現調節。它可辨識並結合 Staf-binding site（SBS）；這是一種出現在許多啟動子中的共識 DNA 結合基序。透過辨識這類位點，ZNF76 能調節不同 RNA polymerase 系統所負責的基因轉錄。
在 RNA polymerase II 與 III 轉錄的基因中，ZNF76 可促進小核 RNA（snRNA）的表現。資料亦指出它會調節 mRNA 的表現，因此其作用範圍不僅限於 snRNA。這些調節結果依基因與轉錄情境而異；來源未進一步界定各類標的基因或啟動子上的具體差異。
ZNF76 也可作為轉錄抑制因子，抑制 TATA-binding protein（TBP）的活性。這項作用提供了另一種調節轉錄的方式：除了辨識 DNA 位點並調控基因表現外，ZNF76 亦能透過抑制 TBP 活性降低轉錄活動。現有資料支持它同時具有促進 snRNA 表現及抑制 TBP 活性的功能，但未說明兩種作用是否發生於相同基因或相同條件下。
Promoter 與基因調控
>ZNF76 ENST00000373953 GRCh38 chr6:35258735-35259835 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCTCCTAAAAGGCAATCTTTACCAGTTCCTTCTCTAACGCCCCTCCTTTTTAATTTGATTTTTTACCGA AAGCTCGCTCCCTTTTAATTTTCCCTCAGGTTTCTGAAAATTTCCCAATCGCAGCCCCTCCCAGCAGGGA AATAGTAAAGGGGCTTGGTTTTTATGTTCAACCCAAAGCAAGCCTACAAAAGGGAGTAGTCGGTTTCGAG CCTGACGGTGGAGCTGACGCGGGAATGAGAGAGAACCTGAGAAGACCGCCAGGGCGCCCTCCCTGCGGAG GCGAGTCCCTCACCGCCCCTCTACATCGTCCTTTTCAATAAGGAGCTCTTAATACCTGCAACTGCTTCCT TCAAGGGGTGGCTGGAAGATCAGTAGGCAAGGCCTGCGGACTGCGCACCTTAAAGCGCTTCGGGACCGTA AGACAGTGAGTGCTGAGCGCGCGGCCGGGAAGAAGCCTGGAGGCTCTGAGCTCGGAGGACAGAGACCGAA GCCCCAGGGCCTGCGTCCCTCACAACCTGCGCCTCCTGTCCTCCCGCGCTACTCCCGAAGCGCACCTTCT CGCCCGCAGGCCGCAGAAGTGATGACGCAAAGCCCTCGGGGCCTCCGCCACCTCCTCACGCTTCTGCTGG ACCGAATCCTTGGAATGGACAGGTAGCGGTTCCCGATTGCTATAGCGACGACCCGGCTCCGAGCCGCGCC CAGGCCCTGACCCGGGCGTCGTGACGTCAGCACGCCTTCCCTGGGCGCTCAGCCTCGCTGGCCATGCGTC ACCCCGGCCTTGGTGGGGGCGGGGCTCCGAAGAGCTCGGTTCAGATCCCGGCCGCCTGGGCTCCAGGAGC CCCGGAACCAGGATAAGTTGGATGGCTGCCGCGGCGAAGCGGGGGGCGGGGTGGACCGTGCCCGGTATTT TCTATACGGGTTCCGGGGCCCGGTAGAGGCGCGCCAAGAGGAAAGGAAAGTGCGGCGGCCCTGGAACCTG GATATCGCGCGAGGCAAGCTGCGCGCGGGCGGGCGGGCTATGGCGCAGGCGGGTTGTGGGGCCGGCGCTG GTGGCGGGGCCCGGTGCATGGCGGTCTGTCGGCGGAGTCGCCCTCGGGGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF76_2 ↗ | 6:35,259,533 | 正股 | 35,259,484–35,259,543 |
| ZNF76_1 ↗ | 6:35,259,735 | 正股 | 35,259,686–35,259,745 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_B8ZX4 · enhancer · 35258378–35259374 · regulatory
ENSR6_9HZTF · promoter · 35259375–35259784 · regulatory
ENSR6_C5HGN · enhancer · 35259785–35261346 · regulatory
ENSR6_832ZRN · enhancer · 35262681–35262869 · regulatory
· motif · 35258701–35258713 · motif
· motif · 35259295–35259310 · motif
· motif · 35259399–35259414 · motif
· motif · 35259399–35259414 · motif
· motif · 35259449–35259462 · motif
· motif · 35259453–35259466 · motif
· motif · 35259453–35259466 · motif
· motif · 35259491–35259507 · motif
· motif · 35259498–35259506 · motif
· motif · 35259519–35259529 · motif
· motif · 35259616–35259626 · motif
· motif · 35259784–35259794 · motif
· motif · 35259800–35259810 · motif
· motif · 35259855–35259865 · motif
· motif · 35259985–35259995 · motif
· motif · 35260015–35260026 · motif
· motif · 35260018–35260033 · motif
· motif · 35260030–35260040 · motif
· motif · 35260032–35260045 · motif
· motif · 35260071–35260084 · motif
· motif · 35260078–35260093 · motif
· motif · 35260083–35260095 · motif
· motif · 35260083–35260098 · motif
· motif · 35260086–35260093 · motif
· motif · 35260087–35260102 · motif
· motif · 35260091–35260101 · motif
· motif · 35260096–35260106 · motif
· motif · 35260098–35260113 · motif
· motif · 35260100–35260115 · motif
· motif · 35260106–35260113 · motif
· motif · 35260106–35260121 · motif
· motif · 35260223–35260231 · motif
· motif · 35260229–35260241 · motif
· motif · 35260232–35260247 · motif
· motif · 35260262–35260269 · motif
· motif · 35260262–35260277 · motif
· motif · 35260263–35260276 · motif
· motif · 35260288–35260303 · motif
· motif · 35260339–35260350 · motif
· motif · 35260437–35260449 · motif
· motif · 35260544–35260566 · motif
· motif · 35260544–35260566 · motif
· motif · 35263855–35263867 · motif
· motif · 35263999–35264021 · motif
· motif · 35263999–35264021 · motif
· motif · 35264271–35264284 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：570 aa
zinc finger protein 76 長 570 個胺基酸，屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質含有七個 C2H2 型 zinc finger，分布於胺基酸 165–368；N 端另有三段約 12 個胺基酸的重複序列，位於 34–99。胺基酸 365–401 被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF76 位於細胞核，並定位於染色質及染色體。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間存在差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 81 個夥伴
- ACAT2Q9BWD1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ALOXE3Q9BYJ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ANKRD37Q7Z713 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ANTKMTQ9BQD7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATP5POP48047 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BLZF1Q9H2G9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BOLA2-SMG1P6A0A087WZT3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C10orf55Q5SWW7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C22orf15Q8WYQ4-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C3orf36Q3SXR2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEACAM6P40199 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP76Q8TAP6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CSN3P07498 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DISC1Q9NRI5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ENKD1Q9H0I2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EXOSC1Q9Y3B2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM228AQ86W67 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM90A1Q86YD7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FCRL4Q96PJ5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FHL2Q14192 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- FNDC8Q8TC99 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FSD2A1L4K1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRAPLQ8TC17 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IKZF3Q9UKT9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ZNF76 與 TATA-binding protein（TBP）有交互作用；來源將此關係描述為抑制 TBP 活性。資料未說明兩者是否組成特定複合體，因此不進一步推定其複合體狀態。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF76 是轉錄因子，可調節 RNA polymerase II 與 RNA polymerase III 轉錄的基因表現。它辨識並結合存在於許多啟動子中的 Staf-binding site（SBS），能促進兩種 RNA polymerase 所轉錄的小核 RNA（snRNA）表現，也調節 mRNA 表現；此外可作為 DNA 結合型轉錄抑制因子，抑制 TATA-binding protein（TBP）活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor that regulates expression of genes transcribed by both RNA polymerases II and III. Specifically recognizes and binds the Staf-binding site (SBS), a consensus DNA-binding motif present in many promoters. Able to activate expression of small nuclear RNA (snRNA) transcribed by RNA polymerases II and III. Also regulates expression of mRNAs and acts as a DNA-binding transcription repressor that inhibits the activity of the TATA-binding protein (TBP) PMID 10893243 ↗ · PMID 15280358 ↗ · PMID 16337145 ↗ · PMID 9705341 ↗ |
| 交互作用 | ZNF76 與 TATA-binding protein（TBP）有交互作用，並抑制 TBP 活性。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ZNF76 位於細胞核、染色體，並定位於染色質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCGCGCGGGCGGGCGGGCTATGGCGCAGGCGGGTTGTGGG40GCCGGCGCTGGTGGCGGGGCCCGGTGCATGGCGGTCTGTC80GGCGGAGTCGCCCTCGGGGGCTGTCAGATTTGTGACCCAG120AAGGAAATCTCTGACCTCAGCTGTGGCTCTTGGTGCTGGC160CAGAAGCCAACTTCATGTCTGAGTGCACGAGCAGCAGTTT200GCCATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTG240ATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGA280GAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGG320ACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAG360CTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGA400TGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGGC440TATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATG480GCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATC520GGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTG560GAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAG600ACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCT640TCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAA680GTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTG720GGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGA760ACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTC800CCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGA840AGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAA880GTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCA920GGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。