基因總覽
ZNF75D(zinc finger protein 75D)是蛋白質編碼基因,產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其蛋白質具有 SCAN box、KRAB 區域及多個 C2H2-type zinc finger,呈現由不同結構區域組成的特徵。資料指出它可能參與轉錄調控,但未提供更具體的作用方式或調控對象。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370766 ★ | 135,285,791–135,344,109 | 7 |
| ENST00000370764 | 135,285,783–135,296,616 | 4 |
| ENST00000865785 | 135,285,783–135,344,113 | 7 |
| ENST00000865786 | 135,285,783–135,344,109 | 6 |
| ENST00000865787 | 135,285,783–135,344,109 | 8 |
| ENST00000865788 | 135,285,783–135,344,109 | 8 |
| ENST00000865789 | 135,285,783–135,344,109 | 7 |
| ENST00000865790 | 135,285,783–135,344,109 | 6 |
| ENST00000865791 | 135,285,783–135,296,616 | 6 |
| ENST00000942296 | 135,285,783–135,344,109 | 4 |
| ENST00000942297 | 135,285,783–135,344,113 | 4 |
| ENST00000942298 | 135,285,783–135,344,113 | 7 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料將 ZNF75D 的可能功能描述為參與轉錄調控。這項敘述帶有不確定性,表示其可能涉及調整轉錄活動,但資料未指出調控的基因、作用方向或發生條件,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的表現。
ZNF75D 蛋白質具有 SCAN box、KRAB 區域與 C2H2-type zinc finger 等結構特徵;不過,現有功能資料沒有說明這些區域如何共同作用,也未提供其分子作用機制或相關生物學過程的細節。因此,目前可支持的功能描述限於「可能參與轉錄調控」,不宜延伸為已確認的調控路徑或特定生理作用。
Promoter 與基因調控
>ZNF75D ENST00000370766 GRCh38 chrX:135344009-135345109 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCCCCTGTTCGCTCTTGGGCGACGAGGCCCCGACGCCTGGAGGGGAGCTCCCAGCCCAGAAGGACTCCCG GGAAGGCCCGGTCGGGTCGCAGGGAGTGGTGGCGGGGACCCTGGCCGGATAGGGGCCCACCGCCCACCAC TCCTTCCGGCGCCCGCCGCCCGGGGCACAGCTGGAATCACCCAGTTAGCATGGCCCCGGCCACGGAAAGG AGCCCCGCTACCCGCGCCCGCGCCCCAGGGAACGGCCACGCCCTCTGGCCGCTCGGGGACTCACCGCCTC AGCGCCCACGGTTCTCCCAAGCTCACCGGCAACTGCCCAGGGCGCAGGCGCGGGACTGCGCTACGGACTA CATCTCCCGGCAGGCCACACGCCGCCCGCCGGGCTGTGCGCCCACAGGGATGCTGACGTGGGAGGGGCTG GGACTCTTCCTGGCTTCCAACCAGCCTCAAGCTGTTTTGGAAGGGCTCCCGTTTCCTGTTTAAGCGCTTC TTAGTCGCAGGGTGTTGGGTGGGGCGAACCCCGGGTCGTGATCCAAATGAGCGCTTCTCCTTGAGCCTTG GAGTAACTGGAGCGGGTGGGGACCACCTTTAAATCTGTTACGACCCGGTCAGTGATTCTTAAACCTGGCT GTGTGGGGAGAATTTGTAGGGAGAGCTTGTTAAAAAGTCGTATTTCGGGGCTCCACCCGCTACCCTGACG CATTGAATCTCACAGGAACCCGGGGATTCGCATTTTAATAAACCATCCTGGAGATTTTGACTCCGGTCGT CCGCCTGCAGTTCACAGTGGCTTTGGATTTGCTTTTTAGTATCCCCATCTTCAAGACCTAAGCTTCGATC TAGCGAACCCGCCCATTACCCTCTGCCTTCAACAGCCACGGAGGTCTCTGGGGTTAAGGTTTGCCTGCGG GCCCCGCCTCTTGTCTTTCAATTGGTCCCTCGCTGGTCCCGTCCTGGAGCCAAATTTTCTTTTCTGATTG GTCAGCTGCGAATTGTGGCTAGACCTGATCCAATGGCCGCTTGATACAATGGTGTCGTTCGGGAAACGCA GCCCTAACGTTGGTCCTAAGCTGACAAATTGGTCTGTGGACGCCAAACTTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF75D_3 ↗ | X:135,307,741 | 負股 | 135,307,731–135,307,790 |
| ZNF75D_1 ↗ | X:135,344,109 | 負股 | 135,344,099–135,344,158 |
| ZNF75D_2 ↗ | X:135,344,626 | 負股 | 135,344,616–135,344,675 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_85ZFSC · enhancer · 135340927–135341157 · regulatory
ENSRX_CHFLG · enhancer · 135342504–135344098 · regulatory
ENSRX_BZT84 · promoter · 135344099–135344806 · regulatory
ENSRX_CHFLL · enhancer · 135344807–135345864 · regulatory
· motif · 135342747–135342769 · motif
· motif · 135344003–135344014 · motif
· motif · 135344003–135344014 · motif
· motif · 135344109–135344124 · motif
· motif · 135344207–135344220 · motif
· motif · 135344214–135344231 · motif
· motif · 135344340–135344353 · motif
· motif · 135344778–135344789 · motif
· motif · 135344778–135344789 · motif
· motif · 135344876–135344887 · motif
· motif · 135344876–135344887 · motif
· motif · 135344960–135344969 · motif
· motif · 135347135–135347144 · motif
· motif · 135347135–135347144 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:510 aa
ZNF75D 蛋白質長 510 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其第 49–131 位胺基酸為 SCAN box,第 235–318 位為 KRAB 區域;第 365–499 位則包含五個 C2H2-type zinc finger。另有兩段被註記為無序區,分別位於第 1–35 位及第 313–342 位胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF75D 的細胞內定位註記為細胞核。 現有資料未提供定位改變的條件、不同異構型之間的差異或其他定位動態。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGACCTGATCCAATGGCCGCTTGATACAATGGTGTCGTTC40GGGAAACGCAGCCCTAACGTTGGTCCTAAGCTGACAAATT80GGTCTGTGGACGCCAAACTTCCGTGCTAGGACTTTCTGCG120TGTGGACCGGGGGCCTAGTCCTGCGTGGGTCCAACACAGA160CAGGAGAAAGCTGCCTGCTTTTGTGCCTCCCGGAGGTCCT200GGTAGAAGCGAAACGGGGACAGGAGCTGCAGCGTCCCAAG240CCCAGTGAGGCGAAGCTACTGGAGACAGCTCTGCCGGGTC280CAAAGTTGGGCTCACCGGCTGGAACTTGAAACCGGAGCAC320GCCGGACTCCTGCTGAAGCCATCATCTCTCTCTCCTGGCC360CCGGGCGCCTTGGCCGGCGGGCACAACTGGTTTCGGGGCC400AAGGTGGTCTGGAAGCCTGACTGTGGCGTCTGGCCTGGGC440TCCCGCGAGCGGAAAAGGTTCCCCTCCTGTGAGAGGGAAA480CTATGGAAGTTCCTACGCCCGGAGCCAGAACTCCTGCTGC520TCCCGCCCGACCCAAGGTCTAGCTTGGCGGCCTCCCACCT560GTGCTTCTGAGGGTTCTGCTTCCAAGAGGCTGCTGGTGCC600CGGGACACCAGCAGTTTCGCCATGGGTGTTTCGCCATGGG640AGTTTCGCCATGGGTGACTTTGGCCTGAGATGCGCTCCAT680GGAGCAGATTCTGGAGTTGCTGGTGTTGGAGGAGTTCCTG720ACTATCCTGTCCCAGGACATCCACAGCAGGGTGCAGAAGC760TGCAACGGGCGAGCTGTGAAGAAGCTGTAACTCTTTTAAA800GTATATGTATGACTTTTAAAAGAGAGAGCTTGTGAAACTG840AGGGAATAGGTGAGTGAGAGAGAGGTTTTATCTGCCATCT880TCCTCAAGGAGGCCCAGCCTCCCCTTTATTCATAGGGTTC920TGGGTCTGGTGGGTCCAGAGGACTGAGACATCTCGCTGTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。