演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN GENE LOCUS

ZNF75CPZNF75C

zinc finger protein 75C, pseudogene

ZNF75CP(zinc finger protein 75C, pseudogene)被分類為假基因;資料庫另收錄其可能與 RNA polymerase II 轉錄調控相關的預測註釋。

Homo sapiens11q14.1
OFFICIAL SYMBOL
ZNF75CP
CHROMOSOME
11
LOCUS TYPE
transcribed_processed_pseudogene
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF75CP 的正式名稱為 zinc finger protein 75C, pseudogene,基因類型為假基因。現有資料將其列為假基因,未提供可據以描述的 RNA 或蛋白質產物性質、家族特徵或結構資訊。另有資料庫註釋預測其可能涉及 RNA polymerase II 相關轉錄調控,以及 DNA 結合轉錄因子活性;這些內容屬預測,不能據此視為已確認的產物或功能。

Official symbol
ZNF75CP
Gene name
zinc finger protein 75C, pseudogene
Organism
Homo sapiens
Gene type
pseudogene
HGNC ID
HGNC:13148
Locus type
pseudogene
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZNF75C

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q14.1
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegZNF75CPpq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:78,384,208–78,385,739
Gene span
1,532 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000671814 ★78,384,208–78,385,7391

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

已知功能與來源註解

資料庫預測 ZNF75CP 可能具有 DNA 結合轉錄因子活性,並可能具備對 RNA polymerase II 特異的 DNA 結合活性,以及辨識 RNA polymerase II 順式調控區域序列的能力。另有預測指出,此基因可能參與 RNA polymerase II 介導的轉錄調控。上述註釋均為預測性資訊;由於 ZNF75CP 被分類為假基因,資料並未確認其產物或證實這些功能,因此不宜將其解讀為已確立的分子作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 78384208 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF75CP ENST00000671814 GRCh38 chr11:78383208-78384308 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTTGCAGTGAGCTGAGACCATGCCATTGCACTCCAGACTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAA
AGAAAAAACAGAAATGAAATAATCTTCCAGAAAAGGCTGCAAGTCATGACTGGCAAGTAGAGAATACTAC
CATTTCCATGAAAAGTAGGCATAAGATAAAAAATTCATTAATTCAAACACTGAAACACAAGGAATGGCAT
AGCTACGACAATGTCTTTTTCTTTTTTTTTAAGACGTGGGGTCTCAGCCGTGTGTGGTGGCTCACGTATG
TAATCCTAATACTTTGGGAGGCGAGGTGGACAAAATCATTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGC
AACATGGCAAAACCCTGTCTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTG
TGCGCCTGTAATGCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGTGGGAGGATGGCTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGTTG
CAGTAAGCTGAGATCATGCCCCTGCACTCCAGTCTGGGCAACAGAGCCAGACCGTGTCTCAATTAATTAA
ATGAATGGCCACAGACCTCGTCCCAGGAGTAGTGAGTCAGGGTAAGGTCTCTGGGAGGTGGAGGGATTGA
ATGGGAGAAATGATCTTCCAAGGCCCTTTCCAAGGCTCCCAAAATCTTGGAACTTTACTCGCCAGGCATT
GCGGGCTTTCGTGACATTGCTGGCTTTCCTGACATTGCTTTTCAGTGGTGCAGGAGCAGAGAGCTTCACT
GCCCAGAGCAGCAGCGTGGCGACAGAGGCATAGTTGAGCAAAGAAAGAGGAAAGGGGCCTCCAGGGAAGC
CAGAGCTGACTGAAGTGTTCTTGGGAAGATCTATTCATTGATTTTGTACCAAACCTGCACTCTCATTTTG
TACCAAAATGTACCAAACCTGATGCACCTCAAAGGTGGCACCAGATGGGTGTGAATGTCACACACAGGAG
TAAAACTCTTCCTAGAGCAAATGATAATGAGAGAGCTGAAGGCAGATGCATGCTTGAACTCTCATATGGG
AGCTATGTGGGAGACCAACAGGTCTGTGAAAGAGAACTCCAGTCAGAGTAA
ZNF75CP 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_84B7XB · enhancer · 78379070–78379320 · regulatory

ENSR11_9364ZM · enhancer · 78380635–78381130 · regulatory

ENSR11_9364ZZ · enhancer · 78381833–78382174 · regulatory

· motif · 78379288–78379299 · motif

· motif · 78379292–78379306 · motif

· motif · 78379292–78379306 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

pseudogene

ZNF75CP 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000671814 ★transcribed_processed_pseudogene1,532 nt1

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料庫預測 ZNF75CP 位於細胞核;此為預測性定位註釋,來源未提供實驗驗證或異構型差異資訊。

深綠色圓點:來源記載的基因產物定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能資料庫預測 ZNF75CP 可能具有 DNA 結合轉錄因子活性,包括 RNA polymerase II 特異的 DNA 結合,以及對 RNA polymerase II 順式調控區域序列的辨識;並可能參與 RNA polymerase II 介導的轉錄調控。這些均為預測,未在此資料中證實。推論支持
證據與來源

Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be located in nucleus.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
細胞定位資料庫預測 ZNF75CP 位於細胞核。此註釋屬預測性定位資訊,來源未提供實驗驗證、定位變化條件或異構型差異。推論支持
證據與來源

Predicted to be located in nucleus.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000671814 · 1,532 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATGATAATGAGAGAGCTGAAGGCAGATGCATGCTTGAACT40
41CTCATATGGGAGCTATGTGGGAGACCAACAGGTCTGTGAA80
81AGAGAACTCCAGTCAGAGTAAGAAATACAGCACACAAATC120
121GAGTGTCTCAGTCCTGGGAGTGCTTGCAGGCACTTCCGGA160
161GCTTCCATTATCATGAAGCAACTGAACCGCTTGAGGCTAT200
201CAACCAACTTCAGAAATTGTGCCATCAGTGGCTGAGGCCA240
241GAGATCCACTCAAAAAAGCACATTTTGGAAATGCTGGTAC280
281TAGAGCACTTCCTGACCATCCTGCCAAAGGGGACCCAGAA320
321CTGGGTGCAGAAGCATCATCCACAGCTTGCCAAACAGGCC360
361CTGGTCCTGGTGGAACGCTTGCAGAGAGAACCTGGTGGAA400
401CAAAGAATGAGGTCACAGCCCATGAGCTGGGAGAGGAGGC440
441AGTGCTCTTGAGAGGAACAACAGTGGCCCCAGGCTTCAAG480
481TGGAAGCCAGCAGAGCTCGAACCAATGGGTCTGTTCTAGA520
521AAGAATACTGGAACACATACAGGGTACTACAAGAACAGCT560
561GGGCTGGAATACTCAGAAAGAAACCCAGCCTGTATATGAA600
601AGAGCTGTGCATGTTCAACAGATTTTAGCCCTTTCTGAGC640
641ACAAAAGCACCAAAGACTGGAAGATGGCACCTAAGCTCAT680
681CTGGCCTGAGTCCCAGAGTTTATTGACATTTGAAGACATG720
721GCTGTGTACTTCTCTGAGGAAGAATGGCAATTATTAGGTC760
761CTCTTGAGAAGACTCTCTACAATGATGTAATGCAGGATAT800
801CTATGAGACTGCCATCTCTCTAGGGTTAAAGCTAAAAAAT840
841GACAATGGAAATGACTATCCTATAATATCGGTTTCTGCAC880
881CTGAAATACAAACAGCAGGATACAAAGTATCAAAAAAGAC920
921CAGAATGAAAATTGCCCAGAAAACAAAGGACAGGGAAAAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。