基因總覽
ZNF75A(zinc finger protein 75A)是人類的蛋白質編碼基因,產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質全長 296 個胺基酸,含有位於 N 端的 KRAB 結構域,以及五個 C2H2 型鋅指;其可能參與轉錄調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000669516 ★ | 3,305,497–3,318,851 | 7 |
| ENST00000574298 | 3,305,472–3,318,865 | 6 |
| ENST00000903407 | 3,305,472–3,318,865 | 6 |
| ENST00000903408 | 3,305,472–3,318,573 | 7 |
| ENST00000903409 | 3,305,472–3,318,865 | 4 |
| ENST00000938989 | 3,305,472–3,318,865 | 7 |
| ENST00000938990 | 3,305,472–3,318,865 | 7 |
| ENST00000941569 | 3,305,472–3,318,865 | 5 |
| ENST00001099193 | 3,305,472–3,318,865 | 5 |
| ENST00001126023 | 3,305,472–3,318,865 | 3 |
| ENST00001141038 | 3,305,472–3,318,865 | 7 |
| ENST00000612186 | 3,308,332–3,309,449 | 1 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF75A 的蛋白質產物可能參與轉錄調控。現有資料僅指出這項可能的角色,未提供其調節轉錄的具體方式、作用標的或相關生物學過程,因此無法進一步說明其調控方向與功能後果。
Promoter 與基因調控
>ZNF75A ENST00000669516 GRCh38 chr16:3304497-3305597 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGATTGCTTAAGGACAAAGACTTCTTACTCAACTCTGCAATATTGGCTACACATAGCTGACTTAATAAAT AGTCCCTTGACTGGTATAAGCTGACGTTACAAAAACTGGTAATTCCGAAACCACTCATACTGGACTTATT AAATAATCCCTCAACTGGTACAGACTGACATTACAAAAACGGATTAATTCAGAGATCACTGAACACCCAA AACACTCAGATTCTTATAACTATGATTCAGTAAATATGTGTGGAATGCCTATCTTACCAGGTGACTATGT TAGGCGCTGCATGAGATATAAGATGAAAACAAGGTTCCCATTTTCCAGGGAAGAATACTGGAGTGGAAAA CGCAGAGGATACCACAACAGGAGAGCTATTTCCGATTAGCGGCCGCCACTGCTGAGCTATGTGACCCTGA GCAAGTCACTTCTTAGGTCTCCGTTTCTCTGTCAAGGAGAGATAGAAAAAGAACCTATTTCACAGGTTCA AACCTACCTCAAGAAAAAATAGTTGTGGGGAATGCGTCACGAGACCTAGAAAACGGTACAAAACCCTCGG GGGGCCGCTGTTTCTGACCTAGCGAGTGGCCCGACCCGGACAAAATGCCTCTTCCTCGAGGAGGCGGCGA CGAGCCCAGCAACAGCTCGAGCACGGCCGGCCGGGCCGCGGGAAGCCCGAGAACGCGGCGCGCGCAGCTG GGAGGCGACCCTTACCCGGCGAGGCTCCCGGGACCAAACGCCGCCCGACAGCCACGCAGAACAGACGCGG CAGTGCGACGCCTCCCCCACTGGGGACACGAGACAGCGACAGCCACGCGGTGAGCCGGTACAAGGCCCTC TAGGCTTCAGCGGGTCTGGATACTCGGTGGCATTAACCCTTCCCTACCGCCGGGGAAGACAGCAGTTTCT CTGGCGAGGAAGTAGGCCGGGCTCAGGCGCCTTAGCCAGAGGGCGGGCCTGCGCCACCCTCGGAAAGCGT CACTTCCACTTCCGGCCGGCGCTCTGGCTCTGTACCTGGACAGGGCTGCGGTAGGCCAGCGGTGGGCTGG CGGTTGCGCTCCTCAGATCGGCGGCCTTTCGGGCGGTGGCTTGCGTTTGAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_BMP5 · enhancer · 3304445–3305419 · regulatory
ENSR16_5QZPG · CTCF_binding_site · 3305106–3305127 · regulatory
ENSR16_778NQ · promoter · 3305420–3305507 · regulatory
ENSR16_BMP9 · enhancer · 3305508–3306282 · regulatory
· motif · 3305108–3305124 · motif
· motif · 3305483–3305492 · motif
· motif · 3305483–3305494 · motif
· motif · 3305483–3305494 · motif
· motif · 3305580–3305595 · motif
· motif · 3305743–3305752 · motif
· motif · 3305981–3305992 · motif
· motif · 3305981–3305992 · motif
· motif · 3306239–3306250 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:296 aa
ZNF75A 蛋白質長 296 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其 N 端第 1–66 個胺基酸為 KRAB 結構域;另有五個 C2H2 型鋅指,分別位於第 161–183、189–211、217–239、245–267 與 273–295 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF75A 蛋白質的定位資料記載為細胞核;來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SPANXN2Q5MJ10 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCTCTGGCTCTGTACCTGGACAGGGCTGCGGTAGGCCAGC40GGTGGGCTGGCGGTTGCGCTCCTCAGATCGGCGGCCTTTC80GGGCGGTGGCTTGCGTTTGAGCCTCAGAAAGCGAGGAGCG120GCCTCCACGGAAGCCAAGCTGGCCGAGTGCTTTTAGGAAG160AAGATCCTTTTATTGCTTTTGTACAAGACCAGACAGGATC200TCATTTGTTAAACGTGGTACCAATTGGGTGTCTTAACACA240GGAGCAGAACTTCCTAGAGCAGAATGATGATGGTAGATCT280GAAAGTGGCTGCGTACTTGGACCCTCAGATCAGGGCTTTG320TGGGAGACCAAGGGGCCTGCAAGAGAGAGCTCCGGTCAGA360GTAAAAAATCTCCTCAAATGGACTGTCTCGATCCTAAGAG400CTCTTGCTGGCACTTCCGGAATTTCACCTATGATGAAGCA440GGTGGACCCCGTGAGGCTGTCAGCAAACTTCAAGAATTAT480GTCATCTATGGCTGAAGCCAGAGATCCACTCAAAAGAGCA520GATACTGGAACTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTGACTATT560CTGCCCAGGGAGACACAGACCCAGATGCAGAAGCACCATC600CACAGAGCATTGAGGAGGCTGTGGCTCTGGTAGAACACTT640GCAGAGGGAATCTGGTCAAACATGGAATGGGGTTGCAGTC680CATGAGCTGGGAAAGGAGGCAGTGCTCTTGGGAGAAACAG720CAGAGGCCTCAAGTTTCGGGCTGAAGCCAACAGAGTCCCA760ACCAGTGGGCGTATCCCAAGATGAAGAATTTTGGAATACA800TACGAGGGTCTGCAAGAACAGCTCAGCAGGAATACTCATA840AAGAGACTGAGCCTGTGTATGAGAGGGCTGTGCCTACTCA880ACAGATTCTAGCTTTTCCTGAGCAAACAAACACCAAAGAC920TGGACAGTGACACCTGAGCACGTCTTGCCTGAGTCCCAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。