演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF75AFLJ31529

zinc finger protein 75A

ZNF75A(zinc finger protein 75A)是人類蛋白質編碼基因,其產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q96N20
OFFICIAL SYMBOL
ZNF75A
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q96N20
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF75A(zinc finger protein 75A)是人類的蛋白質編碼基因,產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質全長 296 個胺基酸,含有位於 N 端的 KRAB 結構域,以及五個 C2H2 型鋅指;其可能參與轉錄調控。

Official symbol
ZNF75A
Gene name
zinc finger protein 75A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13146
UniProt
Q96N20
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ31529

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegZNF75Apq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:3,305,385–3,320,003
Gene span
14,619 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000669516 ★3,305,497–3,318,8517
ENST000005742983,305,472–3,318,8656
ENST000009034073,305,472–3,318,8656
ENST000009034083,305,472–3,318,5737
ENST000009034093,305,472–3,318,8654
ENST000009389893,305,472–3,318,8657
ENST000009389903,305,472–3,318,8657
ENST000009415693,305,472–3,318,8655
ENST000010991933,305,472–3,318,8655
ENST000011260233,305,472–3,318,8653
ENST000011410383,305,472–3,318,8657
ENST000006121863,308,332–3,309,4491

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF75A 的蛋白質產物可能參與轉錄調控。現有資料僅指出這項可能的角色,未提供其調節轉錄的具體方式、作用標的或相關生物學過程,因此無法進一步說明其調控方向與功能後果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 3305497 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF75A ENST00000669516 GRCh38 chr16:3304497-3305597 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGATTGCTTAAGGACAAAGACTTCTTACTCAACTCTGCAATATTGGCTACACATAGCTGACTTAATAAAT
AGTCCCTTGACTGGTATAAGCTGACGTTACAAAAACTGGTAATTCCGAAACCACTCATACTGGACTTATT
AAATAATCCCTCAACTGGTACAGACTGACATTACAAAAACGGATTAATTCAGAGATCACTGAACACCCAA
AACACTCAGATTCTTATAACTATGATTCAGTAAATATGTGTGGAATGCCTATCTTACCAGGTGACTATGT
TAGGCGCTGCATGAGATATAAGATGAAAACAAGGTTCCCATTTTCCAGGGAAGAATACTGGAGTGGAAAA
CGCAGAGGATACCACAACAGGAGAGCTATTTCCGATTAGCGGCCGCCACTGCTGAGCTATGTGACCCTGA
GCAAGTCACTTCTTAGGTCTCCGTTTCTCTGTCAAGGAGAGATAGAAAAAGAACCTATTTCACAGGTTCA
AACCTACCTCAAGAAAAAATAGTTGTGGGGAATGCGTCACGAGACCTAGAAAACGGTACAAAACCCTCGG
GGGGCCGCTGTTTCTGACCTAGCGAGTGGCCCGACCCGGACAAAATGCCTCTTCCTCGAGGAGGCGGCGA
CGAGCCCAGCAACAGCTCGAGCACGGCCGGCCGGGCCGCGGGAAGCCCGAGAACGCGGCGCGCGCAGCTG
GGAGGCGACCCTTACCCGGCGAGGCTCCCGGGACCAAACGCCGCCCGACAGCCACGCAGAACAGACGCGG
CAGTGCGACGCCTCCCCCACTGGGGACACGAGACAGCGACAGCCACGCGGTGAGCCGGTACAAGGCCCTC
TAGGCTTCAGCGGGTCTGGATACTCGGTGGCATTAACCCTTCCCTACCGCCGGGGAAGACAGCAGTTTCT
CTGGCGAGGAAGTAGGCCGGGCTCAGGCGCCTTAGCCAGAGGGCGGGCCTGCGCCACCCTCGGAAAGCGT
CACTTCCACTTCCGGCCGGCGCTCTGGCTCTGTACCTGGACAGGGCTGCGGTAGGCCAGCGGTGGGCTGG
CGGTTGCGCTCCTCAGATCGGCGGCCTTTCGGGCGGTGGCTTGCGTTTGAG
ZNF75A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_BMP5 · enhancer · 3304445–3305419 · regulatory

ENSR16_5QZPG · CTCF_binding_site · 3305106–3305127 · regulatory

ENSR16_778NQ · promoter · 3305420–3305507 · regulatory

ENSR16_BMP9 · enhancer · 3305508–3306282 · regulatory

· motif · 3305108–3305124 · motif

· motif · 3305483–3305492 · motif

· motif · 3305483–3305494 · motif

· motif · 3305483–3305494 · motif

· motif · 3305580–3305595 · motif

· motif · 3305743–3305752 · motif

· motif · 3305981–3305992 · motif

· motif · 3305981–3305992 · motif

· motif · 3306239–3306250 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:296 aa

1 aa296 aa結構域鋅指
依 Q96N20 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF75A 蛋白質長 296 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其 N 端第 1–66 個胺基酸為 KRAB 結構域;另有五個 C2H2 型鋅指,分別位於第 161–183、189–211、217–239、245–267 與 273–295 個胺基酸。

結構域KRAB1–66 aa
鋅指C2H2-type 1161–183 aa
鋅指C2H2-type 2189–211 aa
鋅指C2H2-type 3217–239 aa
鋅指C2H2-type 4245–267 aa
鋅指C2H2-type 5273–295 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96N20…

AlphaFold · Q96N20

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF75A 蛋白質的定位資料記載為細胞核;來源未提供定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ31529ZNF75ASPANXN2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF75A 的蛋白質產物可能參與轉錄調控;資料以可能性描述此功能,未進一步指出調控機制、標的或生物學情境。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF75A 蛋白質的定位記載為細胞核;此項資料沒有提供定位所依據的條件、異構型差異或細胞內動態資訊。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000669516 · 2,859 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTCTGGCTCTGTACCTGGACAGGGCTGCGGTAGGCCAGC40
41GGTGGGCTGGCGGTTGCGCTCCTCAGATCGGCGGCCTTTC80
81GGGCGGTGGCTTGCGTTTGAGCCTCAGAAAGCGAGGAGCG120
121GCCTCCACGGAAGCCAAGCTGGCCGAGTGCTTTTAGGAAG160
161AAGATCCTTTTATTGCTTTTGTACAAGACCAGACAGGATC200
201TCATTTGTTAAACGTGGTACCAATTGGGTGTCTTAACACA240
241GGAGCAGAACTTCCTAGAGCAGAATGATGATGGTAGATCT280
281GAAAGTGGCTGCGTACTTGGACCCTCAGATCAGGGCTTTG320
321TGGGAGACCAAGGGGCCTGCAAGAGAGAGCTCCGGTCAGA360
361GTAAAAAATCTCCTCAAATGGACTGTCTCGATCCTAAGAG400
401CTCTTGCTGGCACTTCCGGAATTTCACCTATGATGAAGCA440
441GGTGGACCCCGTGAGGCTGTCAGCAAACTTCAAGAATTAT480
481GTCATCTATGGCTGAAGCCAGAGATCCACTCAAAAGAGCA520
521GATACTGGAACTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTGACTATT560
561CTGCCCAGGGAGACACAGACCCAGATGCAGAAGCACCATC600
601CACAGAGCATTGAGGAGGCTGTGGCTCTGGTAGAACACTT640
641GCAGAGGGAATCTGGTCAAACATGGAATGGGGTTGCAGTC680
681CATGAGCTGGGAAAGGAGGCAGTGCTCTTGGGAGAAACAG720
721CAGAGGCCTCAAGTTTCGGGCTGAAGCCAACAGAGTCCCA760
761ACCAGTGGGCGTATCCCAAGATGAAGAATTTTGGAATACA800
801TACGAGGGTCTGCAAGAACAGCTCAGCAGGAATACTCATA840
841AAGAGACTGAGCCTGTGTATGAGAGGGCTGTGCCTACTCA880
881ACAGATTCTAGCTTTTCCTGAGCAAACAAACACCAAAGAC920
921TGGACAGTGACACCTGAGCACGTCTTGCCTGAGTCCCAGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。