基因總覽
ZNF74 是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其蛋白質長 644 個胺基酸,具有 N 端 KRAB 結構域,以及一段由 12 個 C2H2-type zinc finger 組成的區域。現有資料指出它可能參與 RNA 代謝,但未提供更具體的分子作用或生物學過程細節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000400451 ★ | 20,394,151–20,408,455 | 5 |
| ENST00000611540 | 20,394,115–20,409,406 | 6 |
| ENST00000357502 | 20,394,115–20,409,406 | 5 |
| ENST00000403682 | 20,394,128–20,409,406 | 4 |
| ENST00000908224 | 20,394,137–20,409,406 | 5 |
| ENST00001135475 | 20,394,151–20,409,406 | 5 |
| ENST00001127229 | 20,394,156–20,409,406 | 3 |
| ENST00001035423 | 20,394,174–20,409,406 | 5 |
| ENST00000420626 | 20,394,189–20,405,493 | 2 |
| ENST00000923876 | 20,394,189–20,409,406 | 6 |
| ENST00001001347 | 20,394,194–20,409,406 | 5 |
| ENST00000405993 | 20,394,629–20,406,968 | 4 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF74 可能參與 RNA 代謝。這項描述指出其功能與 RNA 的代謝過程有關,但現有資料未說明它作用於 RNA 代謝的哪個環節,也未提供可據以界定其具體分子作用方式的資訊。因此,不能進一步判定它是否參與 RNA 的生成、加工、運輸或降解等特定步驟。
目前來源亦未交代 ZNF74 在 RNA 代謝中的作用對象、所需條件或功能結果,故其角色應保留為「可能參與」,而非視為已確認的具體機制。這些資料可支持的結論僅限於它可能與 RNA 代謝相關,尚不足以描述其對相關生物學過程的影響。
Promoter 與基因調控
>ZNF74 ENST00000400451 GRCh38 chr22:20393151-20394251 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTGGGCACAGCTGTGCTGATGTGGGCAGTGGACAGGTGTCACGTGAGAGCCTGTGGCCAAGCCTAAGCTG CGGTTAAGGTGGGAGGCTGAAGGGTTTGGAGTGTGCACCACCCCGGACCACCTCTCAGTAGGAATGTGGC AATGCACTTCGGTGCTGGATTCCTACTTCTGGCTGTGTGATTTGCGACACGTTACCCCACGCACCTGTAC CACAACTTCCTCATCTCCCAAATGGGATGACAGTAGTTAGCAAACCTCCCTGGACTGCTGTGAGCATTCT GCCAGAAAAATGTACTCCAAGCTCTTGAAGTAGGCCTGGCGTTTGGTTGGTGCTCAGTACATATTCAATG TTTCTGTCGCTGGCGTCATCACTGTGTTCATGGCAGAGCTCTGTGCCGCCAGGACTGGGCCGCCACCCAG ACCTTCCTTTCCCGCCCCAGGGGTGAACTGTGGACAGGACCCTCTGGGGGGACTAGGCCAAGGCTCTCCC ACCTCTGGGGACCCGCGCCCATGGGCCTCAGATATGTGGCTCGAGAAGGGGGAGTGGGGGCAGGGCCCCT GGAAAACCCCTCGAGGCCAGACCCACCACTCCCAATATCCGTAAGACCAGGGGCTTGAGTCTTTCCTGCA GACAGATGTGGGCAGGAACCCACCCGACTCCCAGCTACGTGGGGACGTGGACGAACTAACAGGACAAATT CTAGTTCCTGGACACCGCCCTCCCAGTATCCTCGCAATTAGACACCCATGCAGCGGCACTACACTGATCC GCACACGGAGATACACAGCGACATCCGCCCGCAAGAGCATGGTGGGTGCCGGAGCTCCCGGCTGTGGGCC CAGGAACTACATTTCCTAGAAGGATGTGCTAGATACTCGTTCGCGTCGGGACGCAAGCACCGGCCCGAAC TCGCTCTAGGAAATGGAGTCTGACGCCTGCGCGGCGCAAACGCTCCCGGGAGGTGTAGTTTGCGCCTATT TCGCGCAGGCGCGCTTTCCCGCAGCGGCCGCCTGCTGCTCTTTGTGGCAGTCGCAGTCCTTTTGTGGGAG TCCGGTCTGTCCACTTGCCGGTCCCTCAGACCGTCGGCGGTCTCTGTCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF74_1 ↗ | 22:20,394,153 | 正股 | 20,394,104–20,394,163 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_B639J · promoter · 20393625–20394639 · regulatory
ENSR22_9B4KT · enhancer · 20396652–20396995 · regulatory
· motif · 20394079–20394101 · motif
· motif · 20394082–20394093 · motif
· motif · 20394082–20394093 · motif
· motif · 20394113–20394128 · motif
· motif · 20394132–20394143 · motif
· motif · 20394132–20394143 · motif
· motif · 20394497–20394513 · motif
· motif · 20396043–20396056 · motif
· motif · 20396772–20396785 · motif
· motif · 20396772–20396785 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:644 aa
ZNF74 蛋白質長 644 個胺基酸,含有位於第 43–114 位胺基酸的 KRAB 結構域;第 248–578 位則依序排列 12 個 C2H2-type zinc finger。這些結構特徵與其所屬的 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 相符。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF74 的定位資料為細胞核;來源未提供定位變化條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCAGCGGCCGCCTGCTGCTCTTTGTGGCAGTCGCAGTCCT40TTTGTGGGAGTCCGGTCTGTCCACTTGCCGGTCCCTCAGA80CCGTCGGCGGTCTCTGTCCGCTTCGGGACCTGTCCGCTGG120TCGCTCCGCGTCCGATGGCTCCTGGCCGCGGAACCTTAGG160CCTGGCCCTGGTCTCCGAGCGCGGGTTCGCCGGGAGGAGC200GTGTGGCGGGGGTGTGCCGGGGCGTGAGTGCGCCGAGCAT240GGGGCTGAGCCTGGTGTGGGGAGTGGGTATCTGCGGAGCC280GGCCTGAACCCCACCTCAGCCGGGCGCGGGGAGGGGGCTC320CGTGCGTGTGATCGTGCAGCTGTGAGCGCGTGGCCGCCCC360GCGGGGCTCCGCTGCAGGCCCCTCAGCCCCAGGAGCAGTA400CTCGCTCTTCAGGGCCTGCCCTGGATCCTGGAGGCTACAC440AGCTGCCCACTCCTCCTGGGGAGGCTGCCGTGGAGGCCAT480GGAGATCCCTGCCCCGGAGCCCGAGAAGACAGCTCTTTCC520TCTCAGGATCCTGCTCTTTCCCTGAAAGAGAATCTCGAGG560ATATATCGGGTTGGGGTCTTCCCGAAGCCAGGTCCAAGGA600ATCGGTGAGTTTCAAGGATGTGGCTGTGGACTTCACCCAG640GAGGAGTGGGGTCAACTAGACTCCCCTCAGAGGGCCTTGT680ACCGGGATGTGATGTTGGAGAACTACCAGAACCTTCTTGC720CCTAGGACCTCCACTGCACAAGCCAGATGTGATCTCTCAT760CTGGAACGAGGCGAGGAGCCATGGAGCATGCAGAGGGAAG800TCCCCAGAGGGCCCTGTCCAGAATGGGAGCTGAAGGCGGT840GCCCTCTCAACAGCAGGGCATTTGCAAAGAAGAACCGGCC880CAGGAGCCCATCATGGAGCGGCCCCTCGGCGGGGCGCAGG920CGTGGGGGCGCCAGGCAGGTGCTCTGCAGAGGAGTCAGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。