基因總覽
ZNF71(zinc finger protein 71)是位於人類第 19 號染色體的蛋白質編碼基因。現有資料將其產物的角色概述為可能參與轉錄調控,但未提供更詳細的生物學作用、家族歸屬或結構資訊,因此這項基本描述不延伸推定其具體調控對象或方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000599599 ★ | 56,595,302–56,624,486 | 4 |
| ENST00000716548 | 56,595,257–56,615,212 | 4 |
| ENST00000716549 | 56,595,257–56,615,212 | 3 |
| ENST00000862326 | 56,595,257–56,626,833 | 4 |
| ENST00001034785 | 56,595,257–56,615,205 | 4 |
| ENST00001081788 | 56,595,257–56,624,186 | 4 |
| ENST00001137105 | 56,595,257–56,626,833 | 4 |
| ENST00000716547 | 56,595,265–56,626,833 | 3 |
| ENST00000328070 | 56,595,300–56,626,833 | 3 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF71 的產物可能參與轉錄調控。這項描述指出其可能與調控轉錄的過程有關,但來源未說明它是促進或抑制轉錄,也未指出受影響的基因、作用機制或相關生物學情境。因此,目前可支持的功能範圍僅限於可能參與轉錄調控,不能據此判定其調控方向或具體作用。
Promoter 與基因調控
>ZNF71 ENST00000599599 GRCh38 chr19:56594302-56595402 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CATTTTATTCTACACCTATGCTCATTTTCTTCTTTGCACATCTGTATGCTTAAAAAGTGTTCTTTAAAGA TAAGCATGATTATCAGGTTTAAAGTTGCCTGGGATGGTCCCTCAGGCCAGTCCATTGGCTGGACTGCAGA AATGTCTGCAGCAGATGTGACACGCCTCTTTTATCCCCCTCATTTCTCTGCCTCCACCCATCCCTTGTCC TTTTCTGTTTTCCTTCCTCCCTCCTCCCTCTCCTTACCCATTCTTTCCTCTCTTCAGCCTGTCCTGCCCT CCCCAACTCGACTTCCTCTTTCTTTCCTCCTTTTCCCACCCTTTTCTTCTTCCTTATAGTCCTTTCCACC TTCTCATCCCCCTTTCCACCCTTTCTTCCTTCTCCTCCTTGCCGTCTCCATTCTCTTCCTTTCCTGCCTC CCTGCCCCTCCCTCCTCCCACCCGCTCCCTCTTCTTTCTGTTGGTTCCTCTCCTCTCTGACCTGTTCTTT TCCCTTAGTCTCTCCCCAGCCCTTCCTCCTTCCCCTCCATCCTTCTTCCAACCCCTCCTCCTTCTCCATC TCTTCTTCTTCCTCCCCAGCTCTCCTCCCCAAGTCCCTCTCCATCCTCTCTCTTCTCCCCGCTCCTCCCC ATCCCTCCTCCCCTTCCATCCTTCTTCCCACCTCTCCTACTTCTTTTCTCCCTCCTCCCCCCTTCCCTCC TGTCCCTCCTCCTCGCCCCTCCTTTCCCTCCGTCTTTCTTTCCACCCTTCCTCCCTCCGTCTCTTCTCTC TCCTTCCCTTTCCCTGCCTCCTCCCCCTCAATCCTCCCTCTCGCCCCAGCCTCCTTGGCCGCGGAGTCCT CTGTGAGATGGAGGAGCTCAGTTGGCTCCGCTCGGCTCCACTCGGCTGGGCTCGGCTGAAAAAAGCCGGG GGGAGGTGGCGCGCGCGGGTTTCTGGGAAGCGTAGTCCGGCGCAGTCCGCGCAGGCGCACTGCCGTCGGG CGGGCCTAGCGGGCGCGGTCATTGTCCTGGCAGAGCGGCGAGCCGGTGAGTGTGGCTGCGGGGTCGCGCC CACCCTCTACCTGTGCCGGGGGCCGGAACCTGGCCCCGGGGAGGGCGCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF71_1 ↗ | 19:56,595,302 | 正股 | 56,595,253–56,595,312 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BF88X · promoter · 56594775–56595323 · regulatory
ENSR19_BF893 · enhancer · 56595324–56596203 · regulatory
· motif · 56595259–56595270 · motif
· motif · 56595259–56595270 · motif
來源記載 ZNF71 的調控與 TNF 有關,但未提供調控方向、條件或具體機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:489 aa
zinc finger protein 71 長 489 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。序列中有 13 個 C2H2-type zinc finger,位於胺基酸 130–152、158–180、186–208、214–236、242–264、270–292、298–320、326–348、354–376、382–404、410–432、438–460 及 466–488。另有兩段被註記為無序區,分別位於胺基酸 1–61 與 98–122。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 ZNF71 的定位記為細胞核,未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 22 個夥伴
- BYSLQ13895 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DVL3Q92997 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- ZNF524Q96C55 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF648Q5T619 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF792Q3KQV3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF835Q9Y2P0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ATTGTCCTGGCAGAGCGGCGAGCCGGTGAGTGTGGCTGCG40GGGTCGCGCCCACCCTCTACCTGTGCCGGGGGCCGGAACC80TGGCCCCGGGGAGGGCGCGGCCTCGGGGAGACGGCGTGCA120GGCCCAGCACTGTTGGTCACCGCAGGCCTGTCTTCCTATT160CACCGTGGGCAGCAGAGGGATGGCTGCTCAGCTGCTGACT200GATGAGGCACTGGAATCAGTGACGTTCAGGGATGTGACTG240TGGACTTCACCCAGGAGGAGTGGCAGCAGCTGGAGCCTGC280CCAGAAGGACCTGTACAGGGATGTCATGCTGGAGAACTAC320AGGAACCTGGTCTCACTGGACTGGGAGACTAGACCTGAAA360TGAAAGAGTTGGATCCAAAGAATGACATTTCGGAAGACAA400GCTCTCCGTTGTTGGGGAGGCCACGGGGGGACCCACGAGG440AATGGTGCCAGGGGTCCTGGCTCAGAAGGAGTGTGGGAAC480CAGGCAGCTGGCCAGAGAGGCCGCGGGGAGATGCAGGTGC520AGAGTGGGAGCCATTGGGAATTCCCCAGGGGAACAAACTC560TTAGGGGGCTCAGTACCCGCATGTCATGAACTGAAGGCAT600TTGCCAACCAAGGCTGTGTCCTGGTCCCACCACGGCTGGA640CGACCCCACAGAAAAGGGGGCCTGTCCACCCGTAAGGCGT680GGCAAGAACTTCTCCAGCACTTCAGACCTCAGTAAGCCCC720CCATGCCCTGCGAGGAGAAGAAAACCTACGACTGCAGCGA760GTGTGGCAAGGCCTTTAGCCGAAGCTCGTCCCTGATAAAG800CACCAAAGGATCCACACGGGAGAAAAGCCGTTTGAGTGTG840ACACCTGTGGGAAGCACTTCATCGAGCGCTCGTCCCTCAC880CATCCACCAGCGGGTGCACACGGGCGAGAAGCCCTATGCC920TGCGGGGACTGCGGCAAGGCCTTCAGCCAGCGCATGAACC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。