演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF708KOX8

zinc finger protein 708

ZNF708(zinc finger protein 708)是人類蛋白質編碼基因,產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19p12UniProt P17019
OFFICIAL SYMBOL
ZNF708
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P17019
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF708(zinc finger protein 708)是位於人類第 19 號染色體的蛋白質編碼基因。其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,蛋白質長度為 563 個胺基酸。序列包含 N 端 KRAB domain,以及多個連續排列的 C2H2-type zinc finger;其中第一個鋅指被註記為退化型。這些家族與結構特徵界定了 ZNF708 蛋白質的基本分子類別;目前提供的功能資訊則指出,它可能參與轉錄調控。

Official symbol
ZNF708
Gene name
zinc finger protein 708
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12945
UniProt
P17019
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX8ZNF15ZNF15L1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p12
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF708pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:21,284,033–21,329,443
Gene span
45,411 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000356929 ★21,291,160–21,329,4104
ENST0000060129521,284,033–21,329,3363
ENST0000098953421,284,033–21,329,4434
ENST0000109749821,284,033–21,329,4432
ENST0000114167721,284,033–21,329,4434
ENST0000060202321,294,543–21,329,3824
ENST0000101273821,305,428–21,329,4434
ENST0000109750021,327,696–21,329,4432

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前資料將 ZNF708 的功能描述為可能參與轉錄調控。這表示它或許與控制基因轉錄的過程有關,但現有資訊沒有明確指出其作用方向,也未說明它會促進或抑制哪些基因的轉錄,因此不宜將其功能描述得更具體。

來源未提供 ZNF708 如何影響轉錄的分子機制、作用目標或調控條件,也沒有列出相關的生物學過程或功能後果。因此,這項功能註記只支持「可能參與轉錄調控」的概括性判斷,不能據此推定特定 DNA 結合序列、調控路徑或細胞效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 21329410 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF708 ENST00000356929 GRCh38 chr19:21329310-21330410 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATGATTTTATTTTATTTATTTATTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGTCCATACTGGAGTGCAG
TGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCCACCGCCCAGGATCAAGCGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCCAA
GTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTGTTTTAGAGACGGGGTTT
CACCATGTTGGCCAGACTGATCTCGAACTCTGAACCTCAGATGATCCACCCTCTTCGGCCTCCCGAAGTA
CTGGGATTACAGGCGTGAGGTACAGCGCCCAACTTGTGGCTCACATTTTATTTCAGAGAATTGCCTCCTT
TTTAAAATCTCAGGCTGCCTGCTCAAAGGACCAGAAGTCAGGAAGGTCACAAAATATAAAATTTTAGAAC
AGTTGGGCCGGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCGGGAGGATCACC
TGAGGTCTGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAA
TTAGCCGGGCATGGTGGCGCATGCCTGTAATCTCAGCTACGCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGA
ACCCGCGAGGTGGAGGTTGCGATGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAA
ACTCAATCTCAAAAAAAAAATTTTTTTTAGAACAATTGGGTTATTATATTCTTTTCATTTGTGAATAGCC
ATATAGCATATTATTTATAAGGGCATATGACCTTATACACAAGATTAAAGGCAAACACCCTCTCGGGTGG
GCCTGGCTCAGCTCAGGGAGGAAGCCTTGCCTGAAAAGGCTGCAGCATAGGCTGTCACACTTCATTCAGC
CCAGCATCTGATCACATCTTCCGTCCCTCAGGGCCTGAAGGGGCGGGTTTTAACATTATCCAATCAGGGA
CTCTGAGCTGGGGACAGTTCACTCAGACACGCAGCTGGACCGGACAGGGCGGCTTCCGGGTTTGGCGCGG
CCTTTGTCTCTTGCTGCAGCCGGAGCTCCGGTCTCGTCTTCACTGCTGTTT
ZNF708 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF708_1 ↗19:21,329,410負股21,329,400–21,329,459

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9BGKJ · promoter · 21328552–21329052 · regulatory

ENSR19_572G8L · CTCF_binding_site · 21329043–21329064 · regulatory

ENSR19_9BGKM · enhancer · 21329053–21329325 · regulatory

ENSR19_9BGKQ · promoter · 21329326–21329776 · regulatory

· motif · 21328544–21328566 · motif

· motif · 21328544–21328566 · motif

· motif · 21329044–21329054 · motif

· motif · 21329045–21329061 · motif

· motif · 21329369–21329380 · motif

· motif · 21329369–21329380 · motif

· motif · 21329508–21329520 · motif

· motif · 21329620–21329631 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:563 aa

1 aa563 aa結構域鋅指
依 P17019 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF708 蛋白質長 563 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 N 端第 4–75 位為 KRAB domain;第 140–554 位包含 15 個依序排列的 C2H2-type zinc finger,其中第一個註記為退化型。

結構域KRAB4–75 aa
鋅指C2H2-type 1; degenerate140–162 aa
鋅指C2H2-type 2168–190 aa
鋅指C2H2-type 3196–218 aa
鋅指C2H2-type 4224–246 aa
鋅指C2H2-type 5252–274 aa
鋅指C2H2-type 6280–302 aa
鋅指C2H2-type 7308–330 aa
鋅指C2H2-type 8336–358 aa
鋅指C2H2-type 9364–386 aa
鋅指C2H2-type 10392–414 aa
鋅指C2H2-type 11420–442 aa
鋅指C2H2-type 12448–470 aa
鋅指C2H2-type 13476–498 aa
鋅指C2H2-type 14504–526 aa
鋅指C2H2-type 15532–554 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P17019…

AlphaFold · P17019

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF708 的細胞內定位註記為細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX8ZNF708
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF708 可能參與轉錄調控;目前資訊僅支持這項概括性可能性,未說明調控方向、特定目標或作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF708 的定位註記為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000356929 · 4,004 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTCAGACACGCAGCTGGACCGGACAGGGCGGCTTCCGGG40
41TTTGGCGCGGCCTTTGTCTCTTGCTGCAGCCGGAGCTCCG80
81GTCTCGTCTTCACTGCTGTTTGTCCTCTGCTCCTAGAGGC120
121CCAGACTCTGTGGCTCTGTGACCTGCAGGTATTGGGAGAT160
161CCACAGCTAAGACTCCAGGACCCTCTGGAAGCCTAGAAAT200
201GGGACCATTGACATTTATGGATGTGGCCATAGAATTCTCT240
241CTGGAGGAGTGGCAGTGCCTGGACACAGCACAGCAGAATT280
281TATATAGGAATGTCATGTTAGAGAATTATAGAAACCTGGT320
321ATTCCTGGGTATTGCTGTGTCTAATTTAGACCTGATCACC360
361TGTCTGGAGCAAGGAAAAGAGCCCTGGAATATGAAGAGAC400
401ACGAGATGGCAGCCAAACCCCCAGCTATGTGTTCTCATTT440
441TGCCAAAGACCTTAGGCCAGAGCAATATATAAAAAATTCT480
481TTCCAACAAGTGATACTGAGAAGATATGGAAAATGTGGAT520
521ATCAGAAAGGCTGTAAAAGTGTGGATGAGCATAAGTTGCA560
561CAAAGGAGGTCACAAGGGACTTAACCGGTGTGTGACAACT600
601ACCCAGAGCAAAATAGTTCAGTGTGACAAATACGTGAAAG640
641TCTTTCATAAATATTCAAATGCAAAGAGACATAAGATAAG680
681ACATACTGGAAAAAATCCTTTCAAATGTAAAGAATGTGGC720
721AAATCATTTTGCATGCTTTCACAACTAACTCAACATGAGA760
761TAATTCATACTGGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAGAATG800
801TGGCAAAGCTTTTAAAAAGTCCTCAAACCTTACGAATCAT840
841AAGATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAG880
881AATGTGGAAAAGCTTTTAACCAGTCCTCAACTCTTACTAG920
921ACATAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACTCTACAAATGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。