基因總覽
ZNF70 是由 ZNF70 基因編碼的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列含有多個 C2H2-type zinc finger,並有一段被註記為無序的區域;這些是目前資料所列的主要結構特色。現有功能資料僅指出它可能參與轉錄調控,尚未提供更具體的作用機制或調控對象。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000341976 ★ | 23,738,682–23,751,112 | 2 |
| ENST00000871908 | 23,738,682–23,751,730 | 2 |
| ENST00000871909 | 23,738,682–23,751,140 | 3 |
| ENST00000871910 | 23,738,682–23,751,138 | 2 |
| ENST00000964215 | 23,738,682–23,751,112 | 2 |
| ENST00001132067 | 23,738,682–23,751,140 | 2 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料指出,ZNF70 可能參與轉錄調控。這項描述表示其功能與調節轉錄過程有關,但資料未說明它會促進或抑制轉錄,也未指出其作用的基因、細胞情境或調控方式。因此,目前只能將其角色概述為可能參與轉錄調控,不能據此推定更具體的分子機制或生物學結果。
Promoter 與基因調控
>ZNF70 ENST00000341976 GRCh38 chr22:23751012-23752112 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGTCTTGCCATCAGCAGCAAGGAGGGGGCGGAGATTCCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGAGATG GAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACTATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTCA GGGTCAAACGATTCTCCTGTCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCGCTTGTCACCACTCCCGGATAATTTTTA GTAGAAACAGGGTTTCACCATGTTGGTCTGGCTGAGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTC CGCCTCCCAAAATGCTGGGATTAAAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGGGGGCGGCCATTTCAAGAA CACATTCCTCTTCCCTCCCGGTGCGCCTGAGAGGAGGCGCTTCATGTCGAAGTCAGCCCTGGGATGCAGA GAGTTGGGGGGCTCAGGGTCCTGGGATGGTCTCGCAGACACTCCTAGTTCTTCGCCTGCCCCTTCTCATC TCTATTTCTGTGGGGGCGGGGAGGGCAGACAGGAACAGGGCTACCCTTGAAGCAGGTTGGGGGAGGGGGA TCCTAACAGGACCCCGGTGCCTGTGGACAGTGACAGGGTCGACAGCTCTGGGGCTCCACTCTCCTTTCCC TGAAGACCCCAGCTGCCTCAGTGGCTTCTGGCTTGCACCCAGCACCAGCGCAGATGCCCCGAGTGCCGGC GGCTCGAGGTCGGCCCGCCCGTCCGGACCTGTTTCCTCCTCTGCTCTCCTGCCAACGCCTGCCCATCTCT GTTTCCCCCACGTCCAGCACGCGCTTCGGGGACGGCCAGAGCCACCATGCCGACTGGAGAGACTCTCCTG ATTCGGGTCCTTGTGTCCCGGGGCCCGGGCGGCTTCGCGCGGCGACAACCGGCGCGGTGGGACCACCGAG ACGCCGGGACCTCCGCGCGGCCTAGAGTGGTCCCGGAAGTGCCCGCGGGCCGGGGGCGGGGCTCTGGGTG CTCGGGCGGCCGCGGGCTCCGCGTCAGCAGCTGCTGTGGAGCCAGGCAGCGTCGGCCGCGTCGGCCGCGG GTTGGAGCAGCTCAGGTGCGGCCCCGCCCCGCCCGCCTGCGGCCCCGCCCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF70_2 ↗ | 22:23,750,295 | 負股 | 23,750,285–23,750,344 |
| ZNF70_1 ↗ | 22:23,751,112 | 負股 | 23,751,102–23,751,161 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_C4CM3 · enhancer · 23749812–23751101 · regulatory
ENSR22_9CFJH · promoter · 23751102–23751602 · regulatory
ENSR22_57KSPD · CTCF_binding_site · 23752079–23752100 · regulatory
ENSR22_8NT59 · enhancer · 23753447–23753687 · regulatory
· motif · 23751162–23751171 · motif
· motif · 23751162–23751173 · motif
· motif · 23751162–23751173 · motif
· motif · 23751603–23751616 · motif
· motif · 23751742–23751762 · motif
· motif · 23751963–23751975 · motif
· motif · 23751966–23751973 · motif
· motif · 23752081–23752097 · motif
· motif · 23752447–23752462 · motif
· motif · 23752448–23752461 · motif
· motif · 23752496–23752509 · motif
· motif · 23752521–23752533 · motif
· motif · 23752554–23752567 · motif
· motif · 23752554–23752567 · motif
· motif · 23752608–23752621 · motif
· motif · 23752718–23752733 · motif
· motif · 23752723–23752735 · motif
· motif · 23752871–23752884 · motif
· motif · 23752871–23752884 · motif
· motif · 23754462–23754475 · motif
· motif · 23754689–23754702 · motif
· motif · 23754689–23754702 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:446 aa
ZNF70 蛋白質長 446 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。序列註解標示 11 個 C2H2-type zinc finger,分布於胺基酸 140–441;另有胺基酸 114–138 的區域被預測為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZNF70 定位於細胞核;未提供其定位隨條件或異構型而改變的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCGTCAGCAGCTGCTGTGGAGCCAGGCAGCGTCGGCCGCG40TCGGCCGCGGGTTGGAGCAGCTCAGGTGCGGCCCCGCCCC80GCCCGCCTGCGGCCCCGCCCCGGCCCAGGTGAGCTGCCCC120GCCCCGGCCCAGGTGAGTGGCCCCGCGTCCGCCGGTGTGA160CCTGAGTCCGCCTGACCACCTGTCCCTCCGGTGGCCCTGG200GTGTGCGTGTCCCCAATCGCGGGGAAGCCTGTAGGGGCGC240CACGTCGCCGCCTGGGCAGCGTGTGCGGGTCCGTGGCAAC280TCTTGGGCCCCCAGCCAGGAAACCTTGACTGCACTAAGAG320TTTGCAGGGTGCCCAGGCCCTAGGGACTCTCTGGAGGATG360GGATGACAGATGCAGGAGGACCCGGAGAAGGCCCCGACAG400AGATTGTGAGAACAGTAAGTGTGGCCCAAAGAAGAACATT440TTTAAAGAAATACAACCATTGGGGATGATAGCAGATTCAC480AATGGAGGTTCCCCCAGCAACAAAGTTTGGTGAGACCTTT520GCATTTGAGAACAGGTTAGAGTCACAACAAGGGCTTTTCC560CAGGGGAGGACCTGGGGGACCCTTTTCTTCAGGAAAGAGG600TTTGGAGCAAATGGCTGTGATCTACAAGGAGATCCCTCTT640GGTGAGCAGGACGAAGAAAATGATGATTACGAGGGGAATT680TCAGTTTGTGCTCAAGCCCTGTTCAGCATCAAAGTATCCC720CCCAGGAACCAGACCCCAGGATGATGAGCTCTTCGGACAA760ACCTTCCTCCAGAAATCCGACCTCAGCATGTGTCAGATAA800TCCACAGTGAAGAGCCCAGTCCATGCGATTGTGCAGAAAC840AGACAGAGGGGACTCAGGACCTAACGCACCTCACAGAACC880CCACAACCAGCCAAGCCCTATGCGTGTCGAGAGTGTGGGA920AGGCCTTCAGCCAGAGCTCGCACCTGCTCCGACACCTGGT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。