演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF7KOX4

zinc finger protein 7

ZNF7(zinc finger protein 7)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens8q24.3UniProt P17097
OFFICIAL SYMBOL
ZNF7
CHROMOSOME
8
UNIPROT
P17097
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF7(zinc finger protein 7)是位於人類第 8 號染色體 8q24.3 的蛋白質編碼基因。其產物 Zinc finger protein 7 屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,長 686 個胺基酸。序列中包含 N 端 KRAB 結構域,以及多個 C2H2-type zinc finger 區域;這些結構特色構成其家族辨識特徵。現有資料將其主要角色概述為可能參與轉錄調控,但未提供更具體的調控標的或作用情境。

Official symbol
ZNF7
Gene name
zinc finger protein 7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13139
UniProt
P17097
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX4HF.16

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q24.3
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegZNF7pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:144,826,894–144,848,546
Gene span
21,653 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000532777 ★144,827,560–144,843,7725
ENST00000908822144,826,894–144,843,6865
ENST00000544249144,827,518–144,843,2224
ENST00000446747144,827,518–144,843,7725
ENST00000525266144,827,518–144,848,5465
ENST00000325217144,827,518–144,848,5465
ENST00000527218144,827,518–144,843,7725
ENST00000533314144,827,518–144,843,7726
ENST00000529819144,827,518–144,843,7726
ENST00000908825144,827,518–144,843,2146
ENST00000933362144,827,518–144,843,6906
ENST00000979792144,827,518–144,848,5465

顯示 12/37 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF7 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。此描述帶有不確定性,表示現有註解僅支持其可能涉入基因轉錄活動的調節,並未指出它會促進或抑制轉錄,也沒有列明特定基因、細胞類型或生物學條件。因此,不能據此推定其調控方向、作用對象或下游結果。

ZNF7 蛋白具有 KRAB 結構域與多個 C2H2-type zinc finger 區域,這些是其蛋白質結構特徵;然而目前提供的功能敘述沒有說明這些區域如何共同作用,也未描述其是否直接辨識 DNA、如何影響轉錄機器,或是否透過特定分子夥伴執行調控。這些可能的分子步驟不能單由結構註解確立。

因此,現有資料能支持的功能性結論限於:ZNF7 可能參與轉錄調控。至於它在何種生物學過程中發揮作用、調節哪些基因,以及這種作用對細胞功能有何影響,來源未提供進一步資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 144827560 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF7 ENST00000532777 GRCh38 chr8:144826560-144827660 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTGACTCTTCCCTCCTTTGGTTTGCGCAAGTTTTCCCGCGCGGGTTCGGATCAACACGCCGGGGGAGCCC
GGCTTACGTCCCTCCTGGACCCCCGCCCCGTTCTTCCCGTGGGGAGGGGCGCGTCAGGCGGACCTGGCAC
CCTCCGGCTGCTGGGCTTCGCCGGGAGCCACGCGGGGAGGTCCAGGCAGTCGGGACGCAGGCAGCGTCCT
CGCCGAGGCTGCGAGTCCGTGGCCGTCCGGGGGAGGCGCGCAGGCTCTGCCGGACGCAGAAGGAACCCGA
AGGAGGCGGGGTGGAGGGCGGTGCGGGGCCGGGGAGGGGCGAGGCGAGTGGCGAGTGGACGCCGGGCCCG
GCCTCGGGCAACTCCGAGGGGCGCCCTTCCTCGGGGTCCCGGAGGCTCTGCGACCCCGCGGCCGCTCCAG
CCGCTCACTGGGGACAAGGCCCGAGCCAGGCGTCTCCGCGAGGCGGGGTCCATAGCGCGCCCAGCAGGCG
CCTCCTGTCGCAGGGACGCGGGGGAGCGGCGCCTGAACAGCCTCGGTGGGAACCAGCGCCCGAAGCTGGT
GATCCGGGGTGCGCAGGGCCCAACCGGGCGATCCCCTGGATCTCCGCCAGCCTCGCCCCGACTCCGCTCC
TCCCACCCGCCAGCGAGTCCGCAACTCCCGGCCCCGGCCCGCGTCCCCAGCTCCAGGCCCCGGCCCCGCC
CCGCCCCTGCTCAGGCACCGCCCACTCCGGGCTCTGGGCCCTCCTCTCCCTCGCGGCTCCGCCCCCTGCC
CGCCTCTGACTGTACCCCGCCCCCAGGCGCCAGCCCCGCCTATCTGGGCTTCTGGTCCCGCCCAGGTTCT
TGTCCCTCGGGCCCCAGCCTCGCCCCTCCTCGGCTCTGACTCCACCCCTTCTCCGGAGCCTGGGAGGCGG
GGCTGAGAACCACAGAGATGGCCGGGCCTCCGAGCGGCCCAGGGCGGCCGGAAGTTTGCGGGGCGGGGCG
GACGCGGGTGGCCAAGGCCCGTTTCCGGCGGCGTCGCGCGTTTGCGAGCCTCGGGTGGTCCTCAGGGAGG
GTGAGTCGGCGCGGCGGGCGCGGACTCGGGTTGCCCTCGGTCCGAGTGATC
ZNF7 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF7_1 ↗8:144,827,560正股144,827,511–144,827,570

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_945H3M · enhancer · 144825697–144826027 · regulatory

ENSR8_B33Q32 · promoter · 144827028–144827628 · regulatory

ENSR8_5393Q6L · CTCF_binding_site · 144827044–144827065 · regulatory

ENSR8_945H4H · promoter · 144828552–144829052 · regulatory

ENSR8_945H4S · enhancer · 144829836–144830323 · regulatory

ENSR8_945H57 · enhancer · 144831033–144831486 · regulatory

ENSR8_5393QWW · CTCF_binding_site · 144831422–144831443 · regulatory

· motif · 144822617–144822630 · motif

· motif · 144827046–144827062 · motif

· motif · 144827274–144827284 · motif

· motif · 144827315–144827325 · motif

· motif · 144827343–144827353 · motif

· motif · 144827362–144827372 · motif

· motif · 144827462–144827472 · motif

· motif · 144827514–144827525 · motif

· motif · 144827516–144827525 · motif

· motif · 144827528–144827538 · motif

· motif · 144827559–144827568 · motif

· motif · 144827842–144827857 · motif

· motif · 144827842–144827859 · motif

· motif · 144827977–144827997 · motif

· motif · 144828666–144828679 · motif

· motif · 144828666–144828679 · motif

· motif · 144829930–144829939 · motif

· motif · 144829930–144829939 · motif

· motif · 144831424–144831440 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:686 aa

1 aa686 aa結構域鋅指
依 P17097 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Zinc finger protein 7 長 686 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 N 端含 KRAB 結構域,序列另註解有 15 個 C2H2-type zinc finger 區域,分布於蛋白質不同位置。

結構域KRAB4–76 aa
鋅指C2H2-type 1223–245 aa
鋅指C2H2-type 2250–272 aa
鋅指C2H2-type 3278–300 aa
鋅指C2H2-type 4306–328 aa
鋅指C2H2-type 5334–356 aa
鋅指C2H2-type 6362–384 aa
鋅指C2H2-type 7413–435 aa
鋅指C2H2-type 8441–463 aa
鋅指C2H2-type 9469–491 aa
鋅指C2H2-type 10497–519 aa
鋅指C2H2-type 11525–547 aa
鋅指C2H2-type 12553–575 aa
鋅指C2H2-type 13581–603 aa
鋅指C2H2-type 14634–656 aa
鋅指C2H2-type 15662–684 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P17097…

AlphaFold · P17097

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

Zinc finger protein 7 的定位資料標示為細胞核;來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX4ZNF7
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF7 可能參與轉錄調控。此敘述保留可能性,並未指定調控方向、作用標的或發生條件。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF7 的定位註解為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000532777 · 2,760 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GTTTCCGGCGGCGTCGCGCGTTTGCGAGCCTCGGGTGGTC40
41CTCAGGGAGGGTCTCTCGGCCAGAACACGTGGATGCCCAC80
81CCACCACTGAGCCTCATGGAGGTGGTAACATTTGGCGATG120
121TGGCTGTGCACTTCTCTCGGGAGGAGTGGCAGTGTCTGGA160
161CCCTGGCCAGAGGGCCCTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAG200
201AACCACAGCAGTGTGGCTGGACTAGCAGGATTCCTGGTTT240
241TCAAGCCTGAGCTGATCTCTCGGCTGGAGCAGGGAGAAGA280
281GCCATGGGTCCTCGACCTGCAGGGAGCAGAGGGGACAGAG320
321GCACCAAGGACCTCCAAGACAGATTCTACGATTAGGACTG360
361AAAATGAGCAGGCCTGTGAGGACATGGACATCCTAAAATC400
401AGAATCCTATGGGACAGTGGTCAGAATCTCCCCACAGGAC440
441TTTCCTCAGAATCCTGGCTTTGGAGACGTTTCTGATTCTG480
481AGGTCTGGTTAGACAGTCATCTGGGCAGTCCCGGGCTGAA520
521AGTGACAGGCTTTACCTTCCAAAATAACTGTTTGAATGAG560
561GAGACTGTGGTTCCCAAGACCTTCACCAAGGACGCACCCC600
601AGGGATGTAAGGAGCTGGGAAGCAGCGGCCTGGATTGTCA640
641GCCTCTTGAAAGTCAGGGAGAGAGTGCGGAAGGGATGTCC680
681CAGAGATGCGAGGAGTGTGGCAAAGGCATCAGAGCCACTT720
721CAGATATCGCTCTGCATTGGGAAATTAATACACAGAAAAT760
761TAGCAGATGTCAAGAATGCCAAAAAAAGTTATCTGACTGC800
801TTGCAGGGGAAACATACAAATAACTGCCATGGAGAGAAGC840
841CGTACGAATGTGCAGAGTGTGGGAAAGTCTTCAGGCTCTG880
881CTCGCAGCTTAATCAGCATCAGAGAATCCACACGGGAGAG920
921AAACCCTTTAAATGCACTGAGTGTGGAAAAGCCTTCCGCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。