基因總覽
ZNF7(zinc finger protein 7)是位於人類第 8 號染色體 8q24.3 的蛋白質編碼基因。其產物 Zinc finger protein 7 屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,長 686 個胺基酸。序列中包含 N 端 KRAB 結構域,以及多個 C2H2-type zinc finger 區域;這些結構特色構成其家族辨識特徵。現有資料將其主要角色概述為可能參與轉錄調控,但未提供更具體的調控標的或作用情境。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000532777 ★ | 144,827,560–144,843,772 | 5 |
| ENST00000908822 | 144,826,894–144,843,686 | 5 |
| ENST00000544249 | 144,827,518–144,843,222 | 4 |
| ENST00000446747 | 144,827,518–144,843,772 | 5 |
| ENST00000525266 | 144,827,518–144,848,546 | 5 |
| ENST00000325217 | 144,827,518–144,848,546 | 5 |
| ENST00000527218 | 144,827,518–144,843,772 | 5 |
| ENST00000533314 | 144,827,518–144,843,772 | 6 |
| ENST00000529819 | 144,827,518–144,843,772 | 6 |
| ENST00000908825 | 144,827,518–144,843,214 | 6 |
| ENST00000933362 | 144,827,518–144,843,690 | 6 |
| ENST00000979792 | 144,827,518–144,848,546 | 5 |
顯示 12/37 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF7 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。此描述帶有不確定性,表示現有註解僅支持其可能涉入基因轉錄活動的調節,並未指出它會促進或抑制轉錄,也沒有列明特定基因、細胞類型或生物學條件。因此,不能據此推定其調控方向、作用對象或下游結果。
ZNF7 蛋白具有 KRAB 結構域與多個 C2H2-type zinc finger 區域,這些是其蛋白質結構特徵;然而目前提供的功能敘述沒有說明這些區域如何共同作用,也未描述其是否直接辨識 DNA、如何影響轉錄機器,或是否透過特定分子夥伴執行調控。這些可能的分子步驟不能單由結構註解確立。
因此,現有資料能支持的功能性結論限於:ZNF7 可能參與轉錄調控。至於它在何種生物學過程中發揮作用、調節哪些基因,以及這種作用對細胞功能有何影響,來源未提供進一步資訊。
Promoter 與基因調控
>ZNF7 ENST00000532777 GRCh38 chr8:144826560-144827660 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTGACTCTTCCCTCCTTTGGTTTGCGCAAGTTTTCCCGCGCGGGTTCGGATCAACACGCCGGGGGAGCCC GGCTTACGTCCCTCCTGGACCCCCGCCCCGTTCTTCCCGTGGGGAGGGGCGCGTCAGGCGGACCTGGCAC CCTCCGGCTGCTGGGCTTCGCCGGGAGCCACGCGGGGAGGTCCAGGCAGTCGGGACGCAGGCAGCGTCCT CGCCGAGGCTGCGAGTCCGTGGCCGTCCGGGGGAGGCGCGCAGGCTCTGCCGGACGCAGAAGGAACCCGA AGGAGGCGGGGTGGAGGGCGGTGCGGGGCCGGGGAGGGGCGAGGCGAGTGGCGAGTGGACGCCGGGCCCG GCCTCGGGCAACTCCGAGGGGCGCCCTTCCTCGGGGTCCCGGAGGCTCTGCGACCCCGCGGCCGCTCCAG CCGCTCACTGGGGACAAGGCCCGAGCCAGGCGTCTCCGCGAGGCGGGGTCCATAGCGCGCCCAGCAGGCG CCTCCTGTCGCAGGGACGCGGGGGAGCGGCGCCTGAACAGCCTCGGTGGGAACCAGCGCCCGAAGCTGGT GATCCGGGGTGCGCAGGGCCCAACCGGGCGATCCCCTGGATCTCCGCCAGCCTCGCCCCGACTCCGCTCC TCCCACCCGCCAGCGAGTCCGCAACTCCCGGCCCCGGCCCGCGTCCCCAGCTCCAGGCCCCGGCCCCGCC CCGCCCCTGCTCAGGCACCGCCCACTCCGGGCTCTGGGCCCTCCTCTCCCTCGCGGCTCCGCCCCCTGCC CGCCTCTGACTGTACCCCGCCCCCAGGCGCCAGCCCCGCCTATCTGGGCTTCTGGTCCCGCCCAGGTTCT TGTCCCTCGGGCCCCAGCCTCGCCCCTCCTCGGCTCTGACTCCACCCCTTCTCCGGAGCCTGGGAGGCGG GGCTGAGAACCACAGAGATGGCCGGGCCTCCGAGCGGCCCAGGGCGGCCGGAAGTTTGCGGGGCGGGGCG GACGCGGGTGGCCAAGGCCCGTTTCCGGCGGCGTCGCGCGTTTGCGAGCCTCGGGTGGTCCTCAGGGAGG GTGAGTCGGCGCGGCGGGCGCGGACTCGGGTTGCCCTCGGTCCGAGTGATC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF7_1 ↗ | 8:144,827,560 | 正股 | 144,827,511–144,827,570 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_945H3M · enhancer · 144825697–144826027 · regulatory
ENSR8_B33Q32 · promoter · 144827028–144827628 · regulatory
ENSR8_5393Q6L · CTCF_binding_site · 144827044–144827065 · regulatory
ENSR8_945H4H · promoter · 144828552–144829052 · regulatory
ENSR8_945H4S · enhancer · 144829836–144830323 · regulatory
ENSR8_945H57 · enhancer · 144831033–144831486 · regulatory
ENSR8_5393QWW · CTCF_binding_site · 144831422–144831443 · regulatory
· motif · 144822617–144822630 · motif
· motif · 144827046–144827062 · motif
· motif · 144827274–144827284 · motif
· motif · 144827315–144827325 · motif
· motif · 144827343–144827353 · motif
· motif · 144827362–144827372 · motif
· motif · 144827462–144827472 · motif
· motif · 144827514–144827525 · motif
· motif · 144827516–144827525 · motif
· motif · 144827528–144827538 · motif
· motif · 144827559–144827568 · motif
· motif · 144827842–144827857 · motif
· motif · 144827842–144827859 · motif
· motif · 144827977–144827997 · motif
· motif · 144828666–144828679 · motif
· motif · 144828666–144828679 · motif
· motif · 144829930–144829939 · motif
· motif · 144829930–144829939 · motif
· motif · 144831424–144831440 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:686 aa
Zinc finger protein 7 長 686 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 N 端含 KRAB 結構域,序列另註解有 15 個 C2H2-type zinc finger 區域,分布於蛋白質不同位置。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Zinc finger protein 7 的定位資料標示為細胞核;來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTTTCCGGCGGCGTCGCGCGTTTGCGAGCCTCGGGTGGTC40CTCAGGGAGGGTCTCTCGGCCAGAACACGTGGATGCCCAC80CCACCACTGAGCCTCATGGAGGTGGTAACATTTGGCGATG120TGGCTGTGCACTTCTCTCGGGAGGAGTGGCAGTGTCTGGA160CCCTGGCCAGAGGGCCCTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAG200AACCACAGCAGTGTGGCTGGACTAGCAGGATTCCTGGTTT240TCAAGCCTGAGCTGATCTCTCGGCTGGAGCAGGGAGAAGA280GCCATGGGTCCTCGACCTGCAGGGAGCAGAGGGGACAGAG320GCACCAAGGACCTCCAAGACAGATTCTACGATTAGGACTG360AAAATGAGCAGGCCTGTGAGGACATGGACATCCTAAAATC400AGAATCCTATGGGACAGTGGTCAGAATCTCCCCACAGGAC440TTTCCTCAGAATCCTGGCTTTGGAGACGTTTCTGATTCTG480AGGTCTGGTTAGACAGTCATCTGGGCAGTCCCGGGCTGAA520AGTGACAGGCTTTACCTTCCAAAATAACTGTTTGAATGAG560GAGACTGTGGTTCCCAAGACCTTCACCAAGGACGCACCCC600AGGGATGTAAGGAGCTGGGAAGCAGCGGCCTGGATTGTCA640GCCTCTTGAAAGTCAGGGAGAGAGTGCGGAAGGGATGTCC680CAGAGATGCGAGGAGTGTGGCAAAGGCATCAGAGCCACTT720CAGATATCGCTCTGCATTGGGAAATTAATACACAGAAAAT760TAGCAGATGTCAAGAATGCCAAAAAAAGTTATCTGACTGC800TTGCAGGGGAAACATACAAATAACTGCCATGGAGAGAAGC840CGTACGAATGTGCAGAGTGTGGGAAAGTCTTCAGGCTCTG880CTCGCAGCTTAATCAGCATCAGAGAATCCACACGGGAGAG920AAACCCTTTAAATGCACTGAGTGTGGAAAAGCCTTCCGCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。