基因總覽
ZNF69 是位於人類第 19 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 69。其蛋白質產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,具有 KRAB 結構域及多個 C2H2-type zinc finger。現有功能註解指出,這種蛋白質可能參與轉錄調控;來源未進一步說明其調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000429654 ★ | 11,887,782–11,906,696 | 4 |
| ENST00000340180 | 11,887,759–11,914,329 | 5 |
| ENST00000885309 | 11,887,759–11,906,400 | 4 |
| ENST00000912670 | 11,887,759–11,910,354 | 4 |
| ENST00001008205 | 11,887,759–11,914,556 | 5 |
| ENST00001029002 | 11,887,759–11,914,548 | 5 |
| ENST00001115446 | 11,887,759–11,907,398 | 3 |
| ENST00001121331 | 11,887,759–11,914,315 | 4 |
| ENST00001121332 | 11,887,759–11,907,122 | 3 |
| ENST00001124839 | 11,887,759–11,919,844 | 2 |
| ENST00001124840 | 11,887,759–11,914,549 | 5 |
| ENST00001124841 | 11,887,759–11,913,030 | 5 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前對 ZNF69 的功能描述有限:其蛋白質產物可能參與轉錄調控。這項註解表示它可能與基因轉錄活動的調節有關,但來源沒有指出它促進或抑制轉錄,也未說明受影響的基因、細胞或生物學過程。因此,不能據此判定其調控方向、作用範圍或生理後果。
現有資料也沒有提供 ZNF69 如何執行這項可能的功能,例如是否直接辨識特定 DNA 序列、是否透過其他分子間接調節轉錄,或其 KRAB 與 C2H2-type zinc finger 區域是否參與其中。這些結構特徵可描述蛋白質的組成,但單憑功能註解不足以確立具體分子機制。關於其在特定組織、發育階段或條件下的作用,來源同樣未提供資訊;因此,現階段可支持的結論僅限於它可能參與轉錄調控。
Promoter 與基因調控
>ZNF69 ENST00000429654 GRCh38 chr19:11886782-11887882 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGTTTTACTTCGTGGGACCAAGAATTTATTCCTAAAGCATTTTATATCCGACAGAGATATTCATATATAT AAAGAAAATGTGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGTGGCCGAGGCGGGTG GATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGTCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATAC AAAAAATTAGCCAGGCGCGGTGGCATGTGCCTGTAATCCTAGCTGCTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATC ACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGTGGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGGGGACAG AGCGAGGCTCTGTCTCAAAAAAAAAAGAAAAGAAAATGTGTGAAGATCAGGCTAGAGACAGAAATGTTTG GGAGCGTCACCTGGATAAAGGGTTCATGAAGTTGGCAGTTTATTTAGGTCAAAAGCTTAACTTAACCCCT GGAGAGAGTTTCCTGCTGGTGAAAATGAAGATCTGGAAGGAGGAAGCATTTTCACACTGTGAGGAGGGGA TGGGGGTGTGAGAGCAAGTCTTAGCCATGCCTCATCCCCAGTTGCGGCCCGCTCCAAGACATATGCCTCT CCTCCTGGCGCAGTCGTGTCTGGCCTGGTCTCGGTTCCCCTGCTGCTCTGAGGCAGGAGATGGCTCCTGT GGACACTGAATCTGAAATTCCCTGCACACTCCTGTGACCCCATGCAGAACGAAGGAGCAGGGACAGTCCC TTGAGTGAGGAAGACGCTAGTGTTCTCCTCTATCAATAGCAAGTTTGGCTGAAATGCAAATATCCAATAA CCAGAGTGCAGGAAGGAGCTCGCCCTTGGAAAAGCTGTGGTCAGAATCCGTCTGTCTGGCTCTGCAGGGC CCGATACCCAGGGCTTCCGCTGTCACTCAGACATGGGGGGCGGGGCCTAGCATTCCATCCAATCAGAGGC ATTGTGGCGGGTCCCTGCCCACTGTTCCTCCAGACACTGAGGGGGTCGCATTCCTTACCTCACCTTTGTC CCTGCGCGGGCTGCGGCTGGGATCCGGTCTTTCCAGCCCCGAGAGGGACCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF69_1 ↗ | 19:11,887,818 | 正股 | 11,887,769–11,887,828 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_B4CNS · promoter · 11887292–11887865 · regulatory
ENSR19_B4CNX · enhancer · 11887866–11888605 · regulatory
· motif · 11887821–11887834 · motif
· motif · 11887835–11887850 · motif
· motif · 11888192–11888209 · motif
· motif · 11888276–11888288 · motif
· motif · 11888445–11888460 · motif
· motif · 11888452–11888460 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:566 aa
ZNF69 蛋白質長 566 個胺基酸,含有位於第 24–106 位的 KRAB 結構域。序列另註解出 14 個 C2H2-type zinc finger,其中第一個標示為退化型;其餘各區段依序分布於第 192–556 位。這些結構特徵與其 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族分類相符。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF69 的細胞內定位註解為細胞核。 來源未提供定位變化的條件、不同異構型之間的差異,或定位動態的相關資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- KATNAL1Q9BW62 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- FAM124BQ9H5Z6-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRS3O43559 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GTPBP3Q969Y2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO3Q8TAP4-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- P4HBP07237 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SMARCD1Q96GM5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF417Q8TAU3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ACTGTTCCTCCAGACACTGAGGGGGTCGCATTCCTTACCT40CACCTTTGTCCCTGCGCGGGCTGCGGCTGGGATCCGGTCT80TTCCAGCCCCGAGAGGGACCTGGTTCCTCTGCCCAGGCTT120CTGTCACTCTGTCACCTACGCTATGCCCTGCTGTAGTCAC160AGGAGGTGTAGAGAGGACCCCGGGACATCTGAAAGCCAGG200AAATGGACCCAGTGGCCTTTGATGATGTTGCTGTGAACTT240CACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGG280AAACTCTACAAGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACC320TGACCTCTGTAGGAAAAAGTTGGAAAGACCAGAACATTGA360ATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTC400ATAGAAAAGAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACAGTCATT440GTGGAGAAACTTTTACCCAGGTTCCAGATGACAGGCTGAA480CTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAATAAAATCATGT520GACAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCAT560CTTTTAATATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGC600CTATGAGTATCAGGAATATGGACCGAAGCCATGTAAGTGT640CAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTTA680GAACACCACAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCTATGC720TTGTAAAGAATGTGGAAAAACTTTTATTTCCCATTCAAGC760ATTCAAAGACACGTGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCTT800ATAAATGTAAATTTTGTGGGAAAGCCTTCCATTGTCTCAG840TTTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAA880CCATATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCCTTTAGTTATT920CTGCTACCCTTCGAATACACGAAAGAACTCACACTGGAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。