基因總覽
ZNF66 的正式名稱為 zinc finger protein 66,屬於蛋白質編碼基因;其產物歸於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質序列長 573 個胺基酸,包含位於 N 端的 KRAB domain,以及排列於後段的 15 個 C2H2 型鋅指區域,其中第一個被標註為非典型。這些序列特徵構成 ZNF66 的基本分子輪廓。資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未提供更具體的作用對象或調控方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000344519 ★ | 20,776,304–20,809,995 | 4 |
| ENST00000594534 | 20,776,270–20,799,393 | 4 |
| ENST00000913346 | 20,776,270–20,810,361 | 3 |
| ENST00001097632 | 20,776,270–20,805,948 | 3 |
| ENST00001097633 | 20,776,270–20,794,715 | 3 |
| ENST00001113754 | 20,776,270–20,799,887 | 3 |
| ENST00001122680 | 20,776,270–20,803,626 | 4 |
| ENST00001122681 | 20,776,270–20,802,794 | 4 |
| ENST00001128777 | 20,776,270–20,858,313 | 3 |
| ENST00001128778 | 20,776,270–20,849,918 | 4 |
| ENST00001128779 | 20,776,270–20,803,191 | 4 |
| ENST00001128780 | 20,776,270–20,799,892 | 5 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF66 可能參與轉錄調控。現有資料僅提供這項概括性功能描述,並未指出其調控哪些基因或轉錄事件,也未說明它促進或抑制轉錄的方向,因此不宜將其功能進一步定義為特定的轉錄活化或抑制作用。
其蛋白質序列具有 KRAB domain 與多個 C2H2 型鋅指區域,這些結構註解提供了辨識其分子特徵的線索;不過,來源沒有描述這些區域在 ZNF66 中的具體作用,也未提供其與 DNA、其他分子或蛋白質複合體互動的資料。因此,不能由序列註解推定特定結合對象或調控機制。
此功能敘述帶有不確定性,資料未列出實驗系統、擾動方式或功能讀出,也沒有說明轉錄調控可能發生的細胞或生物學情境。現階段可支持的結論限於 ZNF66 可能參與轉錄調控;其作用方式及生物學影響仍無法由所提供資訊進一步界定。
Promoter 與基因調控
>ZNF66 ENST00000344519 GRCh38 chr19:20775304-20776404 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GACATTTCTTTGATACAGCTCTGGATGAACACCTCAGGGGCTCACAACCAGGACCTGTTCTGGGACTTGG TGACCATTGTGTCCACGTTCAATTGAGTTCAAATTTAACATTTAACTTTTCCTCCATAAATTCTCCTGTC TTCATGAATTGGCTCTGTCTAGGCAAAGGGCAAAATGAACCCCTTGGGCTGTTACATAACCTCCACCTCC TGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCGGAGTAGCTGGGACCACAGATGTGCACCACCATACCCA GCTAATTTTTTACATTGTGAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGAC CTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACTGGCATGAGCTACCTGTGCCTGACC CTAAATTATTTCTATCTCTTATAGCAGTTTGAAATTACTTAAAGGTTGTTTCAAGTTGAAAAAATAAGAA GAATGTGGATAAAAATAAAATATAAATAGATAAAAAAATTACAGGGATTACAAAATATATATGTAAATCT GGAGTGGTCAAAAATGACAAATTTGATTTATTTATAAGGTTTTATTAAAATTAGCTTTAATCGTTAATAC ACTATTACCAAAGTAAAAGCTGATTTTCTCTTGAACAAAAATTTTATGTATTATTAATATGACAGCAAAA TACTTCTGTTCACCTTTGAATACATTCAACAAGACAGAGAGTAAAAAAGAGATAAAATGTTCCCATGCTC TGGCATGGACCAGGCTCAGCTCTGGGAGGAAGCCCTGCCTGAAAAGGCTGCAGCTTAGGCTGTCACTCTT TTCTTCACTCCGCCCAGCAGCTGATCACATCTTCTGTCACTCAGTGTCTGAGGGGGCGGGACCTTAAGCA TTAGCCAATCAGAGGCGCTGGGCTGGAAACCGTCCAATCAGGCACGCAGCTGGAATGAACAGGACGGCTT CCGGATTTGGCGGGGTCTTTGTCTCTCCCTGCAGCTGGAGCTCCAGGTCGTCTGTTCACTGCTCTCTGTC TTCTTCTCCTAGAGGCCCAGCCTCTGTGGCCCTGTGTCCTGCAGGTATTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF66_1 ↗ | 19:20,776,304 | 正股 | 20,776,255–20,776,314 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9B8ML · promoter · 20775976–20776320 · regulatory
ENSR19_B65BW · enhancer · 20776321–20777131 · regulatory
ENSR19_56TXHW · CTCF_binding_site · 20776575–20776596 · regulatory
· motif · 20776195–20776205 · motif
· motif · 20776279–20776290 · motif
· motif · 20776279–20776290 · motif
· motif · 20776577–20776593 · motif
· motif · 20776584–20776594 · motif
· motif · 20776897–20776909 · motif
· motif · 20776899–20776906 · motif
· motif · 20776899–20776914 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:573 aa
ZNF66 的蛋白質長 573 個胺基酸。N 端第 4–75 位為 KRAB domain;第 145–559 位則標註 15 個 C2H2 型鋅指區域,其中第一個為非典型,其餘標註為 C2H2-type。蛋白質家族分類為 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF66 的定位資料標示為細胞核;來源未提供定位隨條件變化的描述,也未指出異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTCTCTCCCTGCAGCTGGAGCTCCAGGTCGTCTGTTCACT40GCTCTCTGTCTTCTTCTCCTAGAGGCCCAGCCTCTGTGGC80CCTGTGTCCTGCAGGTATTGGGAGATCCACAGCTAAGACG120CCAGGACCCCCTGGAAGCCTAGAAATGGGGCCATTGCAAT160TTAGAGATGTGGCCATAGAATTCTCTCTGGAGGAGTGGCA200TTGCCTGGACATGGCACAGCGGAATTTATATAGGGATGTG240ATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTTCTTGGTATTG280TTGTCTCAAAGCCAGACCTCATCACCCATCTGGAGCAAGG320AAAAAAACCTTCGACTATGCAGAGACATGAGATGGTAGCC360AACCCCTCAGTTTTGTGTTCTCATTTTAACCAAGACCTTT400GGCCAGAGCAGAGCATAAAAGATTCTTTCCAAAAACTGAT440ACTGAGAAGGCATAAAAAATGTGGACATGATAATTTGCAG480TTAAAAAAAGGCTGTGAAAGTGTGGATAAGTGTAAAGTGC520ACAAAAGAGGTTATAATGGACTTAACCAATGTTTGACAAC560TACCCAAAGCAAAATGTTTCAATGTGATAAACATGGGAAA600GTCTTTCATCAATTTTCAAATACAAACAGACATAAGATAA640GACATACTGGAAAAAACCCTTGCAAATTTACAGAATGTGG680CAAAGCTTTTAACCGGTCCTCAACCTTTACTACACATAAG720AAAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTATAGAAT760GTGGCAAAGCCTTCAACCGGTCCTCACACCTTACTACACA800TAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACGGTACAAATGTGAA840GACTGTGGCAAAGCCTTTAACCGCTCCTCTAACCTTACTA880CACATAAGAAAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATG920TGAAGAATGTGGCAAGGCCTTTAAGCGCTCCTCTATCCTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。