演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF66FLJ16537

zinc finger protein 66

ZNF66(zinc finger protein 66)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的蛋白質,可能參與轉錄調控;其序列含有 KRAB domain 與多個 C2H2 型鋅指區域。

Homo sapiens19p12UniProt Q6ZN08
OFFICIAL SYMBOL
ZNF66
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q6ZN08
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF66 的正式名稱為 zinc finger protein 66,屬於蛋白質編碼基因;其產物歸於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質序列長 573 個胺基酸,包含位於 N 端的 KRAB domain,以及排列於後段的 15 個 C2H2 型鋅指區域,其中第一個被標註為非典型。這些序列特徵構成 ZNF66 的基本分子輪廓。資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未提供更具體的作用對象或調控方式。

Official symbol
ZNF66
Gene name
zinc finger protein 66
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13135
UniProt
Q6ZN08
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ16537ZNF66P

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p12
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF66pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:20,776,270–20,858,313
Gene span
82,044 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000344519 ★20,776,304–20,809,9954
ENST0000059453420,776,270–20,799,3934
ENST0000091334620,776,270–20,810,3613
ENST0000109763220,776,270–20,805,9483
ENST0000109763320,776,270–20,794,7153
ENST0000111375420,776,270–20,799,8873
ENST0000112268020,776,270–20,803,6264
ENST0000112268120,776,270–20,802,7944
ENST0000112877720,776,270–20,858,3133
ENST0000112877820,776,270–20,849,9184
ENST0000112877920,776,270–20,803,1914
ENST0000112878020,776,270–20,799,8925

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF66 可能參與轉錄調控。現有資料僅提供這項概括性功能描述,並未指出其調控哪些基因或轉錄事件,也未說明它促進或抑制轉錄的方向,因此不宜將其功能進一步定義為特定的轉錄活化或抑制作用。

其蛋白質序列具有 KRAB domain 與多個 C2H2 型鋅指區域,這些結構註解提供了辨識其分子特徵的線索;不過,來源沒有描述這些區域在 ZNF66 中的具體作用,也未提供其與 DNA、其他分子或蛋白質複合體互動的資料。因此,不能由序列註解推定特定結合對象或調控機制。

此功能敘述帶有不確定性,資料未列出實驗系統、擾動方式或功能讀出,也沒有說明轉錄調控可能發生的細胞或生物學情境。現階段可支持的結論限於 ZNF66 可能參與轉錄調控;其作用方式及生物學影響仍無法由所提供資訊進一步界定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 20776304 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF66 ENST00000344519 GRCh38 chr19:20775304-20776404 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GACATTTCTTTGATACAGCTCTGGATGAACACCTCAGGGGCTCACAACCAGGACCTGTTCTGGGACTTGG
TGACCATTGTGTCCACGTTCAATTGAGTTCAAATTTAACATTTAACTTTTCCTCCATAAATTCTCCTGTC
TTCATGAATTGGCTCTGTCTAGGCAAAGGGCAAAATGAACCCCTTGGGCTGTTACATAACCTCCACCTCC
TGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCGGAGTAGCTGGGACCACAGATGTGCACCACCATACCCA
GCTAATTTTTTACATTGTGAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGAC
CTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACTGGCATGAGCTACCTGTGCCTGACC
CTAAATTATTTCTATCTCTTATAGCAGTTTGAAATTACTTAAAGGTTGTTTCAAGTTGAAAAAATAAGAA
GAATGTGGATAAAAATAAAATATAAATAGATAAAAAAATTACAGGGATTACAAAATATATATGTAAATCT
GGAGTGGTCAAAAATGACAAATTTGATTTATTTATAAGGTTTTATTAAAATTAGCTTTAATCGTTAATAC
ACTATTACCAAAGTAAAAGCTGATTTTCTCTTGAACAAAAATTTTATGTATTATTAATATGACAGCAAAA
TACTTCTGTTCACCTTTGAATACATTCAACAAGACAGAGAGTAAAAAAGAGATAAAATGTTCCCATGCTC
TGGCATGGACCAGGCTCAGCTCTGGGAGGAAGCCCTGCCTGAAAAGGCTGCAGCTTAGGCTGTCACTCTT
TTCTTCACTCCGCCCAGCAGCTGATCACATCTTCTGTCACTCAGTGTCTGAGGGGGCGGGACCTTAAGCA
TTAGCCAATCAGAGGCGCTGGGCTGGAAACCGTCCAATCAGGCACGCAGCTGGAATGAACAGGACGGCTT
CCGGATTTGGCGGGGTCTTTGTCTCTCCCTGCAGCTGGAGCTCCAGGTCGTCTGTTCACTGCTCTCTGTC
TTCTTCTCCTAGAGGCCCAGCCTCTGTGGCCCTGTGTCCTGCAGGTATTGG
ZNF66 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF66_1 ↗19:20,776,304正股20,776,255–20,776,314

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9B8ML · promoter · 20775976–20776320 · regulatory

ENSR19_B65BW · enhancer · 20776321–20777131 · regulatory

ENSR19_56TXHW · CTCF_binding_site · 20776575–20776596 · regulatory

· motif · 20776195–20776205 · motif

· motif · 20776279–20776290 · motif

· motif · 20776279–20776290 · motif

· motif · 20776577–20776593 · motif

· motif · 20776584–20776594 · motif

· motif · 20776897–20776909 · motif

· motif · 20776899–20776906 · motif

· motif · 20776899–20776914 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:573 aa

1 aa573 aa結構域鋅指
依 Q6ZN08 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF66 的蛋白質長 573 個胺基酸。N 端第 4–75 位為 KRAB domain;第 145–559 位則標註 15 個 C2H2 型鋅指區域,其中第一個為非典型,其餘標註為 C2H2-type。蛋白質家族分類為 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。

結構域KRAB4–75 aa
鋅指C2H2-type 1; atypical145–167 aa
鋅指C2H2-type 2171–195 aa
鋅指C2H2-type 3201–223 aa
鋅指C2H2-type 4229–251 aa
鋅指C2H2-type 5257–279 aa
鋅指C2H2-type 6285–307 aa
鋅指C2H2-type 7313–335 aa
鋅指C2H2-type 8341–363 aa
鋅指C2H2-type 9369–391 aa
鋅指C2H2-type 10397–419 aa
鋅指C2H2-type 11425–447 aa
鋅指C2H2-type 12453–475 aa
鋅指C2H2-type 13481–503 aa
鋅指C2H2-type 14509–531 aa
鋅指C2H2-type 15537–559 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q6ZN08…

AlphaFold · Q6ZN08

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF66 的定位資料標示為細胞核;來源未提供定位隨條件變化的描述,也未指出異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ16537ZNF66
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF66 可能參與轉錄調控。此描述保留可能性,未指定其調控對象、作用方向或轉錄調控機制,因此不能據此判定其促進或抑制轉錄。推論支持
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF66 的定位資料為細胞核;這項資訊未進一步說明定位條件、動態變化或不同異構型之間的差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000344519 · 4,539 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTCTCTCCCTGCAGCTGGAGCTCCAGGTCGTCTGTTCACT40
41GCTCTCTGTCTTCTTCTCCTAGAGGCCCAGCCTCTGTGGC80
81CCTGTGTCCTGCAGGTATTGGGAGATCCACAGCTAAGACG120
121CCAGGACCCCCTGGAAGCCTAGAAATGGGGCCATTGCAAT160
161TTAGAGATGTGGCCATAGAATTCTCTCTGGAGGAGTGGCA200
201TTGCCTGGACATGGCACAGCGGAATTTATATAGGGATGTG240
241ATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTTCTTGGTATTG280
281TTGTCTCAAAGCCAGACCTCATCACCCATCTGGAGCAAGG320
321AAAAAAACCTTCGACTATGCAGAGACATGAGATGGTAGCC360
361AACCCCTCAGTTTTGTGTTCTCATTTTAACCAAGACCTTT400
401GGCCAGAGCAGAGCATAAAAGATTCTTTCCAAAAACTGAT440
441ACTGAGAAGGCATAAAAAATGTGGACATGATAATTTGCAG480
481TTAAAAAAAGGCTGTGAAAGTGTGGATAAGTGTAAAGTGC520
521ACAAAAGAGGTTATAATGGACTTAACCAATGTTTGACAAC560
561TACCCAAAGCAAAATGTTTCAATGTGATAAACATGGGAAA600
601GTCTTTCATCAATTTTCAAATACAAACAGACATAAGATAA640
641GACATACTGGAAAAAACCCTTGCAAATTTACAGAATGTGG680
681CAAAGCTTTTAACCGGTCCTCAACCTTTACTACACATAAG720
721AAAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTATAGAAT760
761GTGGCAAAGCCTTCAACCGGTCCTCACACCTTACTACACA800
801TAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACGGTACAAATGTGAA840
841GACTGTGGCAAAGCCTTTAACCGCTCCTCTAACCTTACTA880
881CACATAAGAAAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATG920
921TGAAGAATGTGGCAAGGCCTTTAAGCGCTCCTCTATCCTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。