演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF57ZNF424

zinc finger protein 57

ZNF57(zinc finger protein 57)是 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族的蛋白質編碼基因;其產物可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19p13.3UniProt Q68EA5
OFFICIAL SYMBOL
ZNF57
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q68EA5
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF57(zinc finger protein 57)是位於人類第 19 號染色體 19p13.3 的蛋白質編碼基因。其產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族,長 555 個胺基酸。蛋白質序列包含 N 端 KRAB 區域,以及多個 C2H2 型鋅指;其中一個鋅指被註記為退化型。這些特徵構成 ZNF57 的家族與結構背景;目前提供的功能資料則將其角色概述為可能參與轉錄調控。

Official symbol
ZNF57
Gene name
zinc finger protein 57
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13125
UniProt
Q68EA5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZNF424

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.3
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF57pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:2,900,914–2,919,102
Gene span
18,189 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000306908 ★2,900,928–2,918,4734
ENST000008817732,900,914–2,919,1024
ENST000008817742,900,914–2,918,4734
ENST000009391112,900,914–2,919,1024
ENST000009858352,900,914–2,918,4694
ENST000011415412,900,914–2,918,4734
ENST000005222942,907,108–2,917,1595
ENST000005234282,907,108–2,918,4734
ENST000005903052,915,445–2,917,1703

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF57 的功能註記指出,它可能參與轉錄調控。這項描述保留了不確定性,表示目前資料僅支持將其視為可能的轉錄調控參與者,尚未提供可據以確定其調控方向、靶基因或作用條件的細節。

轉錄調控涉及對基因轉錄活動的調節;就 ZNF57 而言,來源沒有說明它在此過程中的具體分子作用方式,也未指出其是否直接作用於 DNA、調控哪些基因,或在何種細胞與生物學情境中發揮作用。因此,不能由這項概括性註記進一步推定其靶點、調控效應或下游結果。

現有資料亦未描述 ZNF57 參與的特定生物學過程,或其轉錄調控可能帶來的生理意義。較恰當的理解是:ZNF57 被註記為可能與轉錄調控相關,但此處沒有提供足以界定其作用機制與功能後果的證據細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 2900928 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF57 ENST00000306908 GRCh38 chr19:2899928-2901028 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CGGGGGCGAGCCAAAGTGCAGGGGCCTGTGGGAAGGACAGGAGGCTGGGAAACGTTTGGGTAAAAAAATC
AGGACACTGGCCGTGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCCGATC
ACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA
ATTAGCCGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATGGCCTGAA
CCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATGGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGAC
TCCACCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAGGACACTGACAGCACGTGCTCCAGCACGGG
GCAGGGCCTCCATGGGGTCCGCGCCCACGCGGGGCAGCGCGGTGACGTCACGGCTGAGGACCCCGCCCCA
CGAAGGGCTCACCCCACGCGACCCACGCCGCTCGCTCGCCCCTCCCCTCCACGCAGCACTCCGGCTGCTC
CGTGGGGAAACTGAGTCTGGACTTCTCGTGCCCGTTCGGGAGAAGGACGCGGGAGGCGCGGCCGAGCTGC
GGGGAGAGGTTGGGCTCACCCCGGGCCAGAGCGAGTTCGCGCAAACGGGAGTGTCCACCGCTGGCGGGTC
AGCCACTAGCGTTGGCTACGCGCCGGTCACTCGGGCGACAGGAGGCGGGGCGGCGCGGAAGTTATCTTCC
AATCAGGTGCTCCGGGGGCGGGTCCGGAAAACTGTCCAATCAAGGCACGGGGCGGACACCGGGAAGCGGA
TTGCAGGTTTGCAGTAGTGTCCAATCGAAGGCCCCAGGGGTGAAGGGGGCGTGTCCAAAACGCTGTCCGC
TCAGAGCGTTGAAAGGGCGGGGGCTTAGAGATTGTCCAATCAGGGCGCCGCTTCCTGAGCTCCGAGGCCC
CGAGGGCGGGACGTTTCGTCCTCCCTGCCGCGCGTGCCCTGCCTACCACGAGCGGCCCGGGAGTACCTGT
ACCTTTCAGCTGCGCCGGCCGCGAGGCCACGGAGAGCTCGCCTTGGAGAGC
ZNF57 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF57_2 ↗19:2,900,443正股2,900,394–2,900,453
ZNF57_1 ↗19:2,900,957正股2,900,908–2,900,967

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9364B · promoter · 2900438–2900938 · regulatory

ENSR19_BKJQ · enhancer · 2900939–2901618 · regulatory

· motif · 2896042–2896053 · motif

· motif · 2896046–2896060 · motif

· motif · 2900328–2900337 · motif

· motif · 2900328–2900337 · motif

· motif · 2900328–2900337 · motif

· motif · 2900328–2900337 · motif

· motif · 2900387–2900400 · motif

· motif · 2900387–2900400 · motif

· motif · 2900668–2900678 · motif

· motif · 2900679–2900690 · motif

· motif · 2900679–2900690 · motif

· motif · 2900711–2900721 · motif

· motif · 2900812–2900822 · motif

· motif · 2902770–2902781 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:555 aa

1 aa555 aa結構域鋅指
依 Q68EA5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 57 長 555 個胺基酸,N 端第 4–76 位具有 KRAB 區域。序列中註記 13 個 C2H2 型鋅指,分布於第 140–526 位;其中第 196–218 位的第二個鋅指標示為退化型。該蛋白質歸屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。

結構域KRAB4–76 aa
鋅指C2H2-type 1140–162 aa
鋅指C2H2-type 2; degenerate196–218 aa
鋅指C2H2-type 3224–246 aa
鋅指C2H2-type 4252–274 aa
鋅指C2H2-type 5280–302 aa
鋅指C2H2-type 6308–330 aa
鋅指C2H2-type 7336–358 aa
鋅指C2H2-type 8364–386 aa
鋅指C2H2-type 9392–414 aa
鋅指C2H2-type 10420–442 aa
鋅指C2H2-type 11448–470 aa
鋅指C2H2-type 12476–498 aa
鋅指C2H2-type 13504–526 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q68EA5…

AlphaFold · Q68EA5

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF57 的定位註記為細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件、動態資訊或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 19 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF424ZNF57CABP2DMWDEFEMP2GLE1GRNHTTKIF1BMAGOHBNDEL1NEFLPMP22PRPS1RNF11SNCASPRED1U2AF2WFS1ZNF250ZNF572
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 19 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF57 可能參與轉錄調控;此註記以可能性描述其角色,未指出具體調控方式、靶基因或作用情境。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF57 的定位註記為細胞核;此項資訊未進一步說明定位改變的條件或動態。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000306908 · 1,970 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTCCCTGCCGCGCGTGCCCTGCCTACCACGAGCGGCCCGG40
41GAGTACCTGTACCTTTCAGCTGCGCCGGCCGCGAGGCCAC80
81GGAGAGCTCGCCTTGGAGAGCCCAGGAGCAGGGGAGACAT120
121GGACTCAGTGGTCTTTGAGGATGTGGCTGTGGACTTCACC160
161CTGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATTCTGCTCAGAGGGACC200
201TCTACAGAGATGTGATGCTGGAGACCTTCCGGAACCTGGC240
241CTCAGTAGATGATGGGACTCAATTTAAAGCCAATGGGTCA280
281GTTTCTCTGCAGGATATGTACGGGCAAGAAAAATCTAAGG320
321AACAGACAATACCAAACTTCACAGGAAATAATTCCTGTGC360
361CTACACTTTAGAAAAAAATTGTGAAGGCTATGGCACTGAA400
401GACCACCACAAAAATCTGAGAAATCATATGGTGGACAGAT440
441TCTGTACACATAATGAAGGTAATCAATATGGAGAAGCCAT480
481CCATCAAATGCCAGATCTTACCCTGCACAAGAAAGTTTCT520
521GCTGGAGAAAAACCATATGAATGCACCAAGTGCAGGACAG560
561TCTTCACGCATCTTTCTTCTCTTAAAAGGCACGTCAAGTC600
601TCACTGTGGACGAAAAGCACCTCCAGGTGAGGAATGTAAG640
641CAGGCCTGCATTTGTCCCTCACACCTACACAGTCACGGAA680
681GAACTGACACTGAGGAGAAGCCGTATAAGTGTCAAGCATG720
721TGGGCAAACTTTCCAACATCCTCGTTACCTCTCCCACCAC760
761GTAAAGACTCACACAGCAGAGAAAACCTACAAATGCGAGC800
801AGTGTCGGATGGCGTTTAATGGGTTCGCAAGCTTCACTAG840
841ACATGTGAGAACTCACACAAAAGACAGGCCATATAAATGT880
881CAGGAATGTGGGAGAGCCTTCATTTATCCCTCGACATTTC920
921AAAGACACATGACAACACACACTGGAGAGAAGCCCTATAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。