基因總覽
ZNF57(zinc finger protein 57)是位於人類第 19 號染色體 19p13.3 的蛋白質編碼基因。其產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族,長 555 個胺基酸。蛋白質序列包含 N 端 KRAB 區域,以及多個 C2H2 型鋅指;其中一個鋅指被註記為退化型。這些特徵構成 ZNF57 的家族與結構背景;目前提供的功能資料則將其角色概述為可能參與轉錄調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000306908 ★ | 2,900,928–2,918,473 | 4 |
| ENST00000881773 | 2,900,914–2,919,102 | 4 |
| ENST00000881774 | 2,900,914–2,918,473 | 4 |
| ENST00000939111 | 2,900,914–2,919,102 | 4 |
| ENST00000985835 | 2,900,914–2,918,469 | 4 |
| ENST00001141541 | 2,900,914–2,918,473 | 4 |
| ENST00000522294 | 2,907,108–2,917,159 | 5 |
| ENST00000523428 | 2,907,108–2,918,473 | 4 |
| ENST00000590305 | 2,915,445–2,917,170 | 3 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF57 的功能註記指出,它可能參與轉錄調控。這項描述保留了不確定性,表示目前資料僅支持將其視為可能的轉錄調控參與者,尚未提供可據以確定其調控方向、靶基因或作用條件的細節。
轉錄調控涉及對基因轉錄活動的調節;就 ZNF57 而言,來源沒有說明它在此過程中的具體分子作用方式,也未指出其是否直接作用於 DNA、調控哪些基因,或在何種細胞與生物學情境中發揮作用。因此,不能由這項概括性註記進一步推定其靶點、調控效應或下游結果。
現有資料亦未描述 ZNF57 參與的特定生物學過程,或其轉錄調控可能帶來的生理意義。較恰當的理解是:ZNF57 被註記為可能與轉錄調控相關,但此處沒有提供足以界定其作用機制與功能後果的證據細節。
Promoter 與基因調控
>ZNF57 ENST00000306908 GRCh38 chr19:2899928-2901028 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CGGGGGCGAGCCAAAGTGCAGGGGCCTGTGGGAAGGACAGGAGGCTGGGAAACGTTTGGGTAAAAAAATC AGGACACTGGCCGTGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCCGATC ACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA ATTAGCCGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATGGCCTGAA CCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATGGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGAC TCCACCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAGGACACTGACAGCACGTGCTCCAGCACGGG GCAGGGCCTCCATGGGGTCCGCGCCCACGCGGGGCAGCGCGGTGACGTCACGGCTGAGGACCCCGCCCCA CGAAGGGCTCACCCCACGCGACCCACGCCGCTCGCTCGCCCCTCCCCTCCACGCAGCACTCCGGCTGCTC CGTGGGGAAACTGAGTCTGGACTTCTCGTGCCCGTTCGGGAGAAGGACGCGGGAGGCGCGGCCGAGCTGC GGGGAGAGGTTGGGCTCACCCCGGGCCAGAGCGAGTTCGCGCAAACGGGAGTGTCCACCGCTGGCGGGTC AGCCACTAGCGTTGGCTACGCGCCGGTCACTCGGGCGACAGGAGGCGGGGCGGCGCGGAAGTTATCTTCC AATCAGGTGCTCCGGGGGCGGGTCCGGAAAACTGTCCAATCAAGGCACGGGGCGGACACCGGGAAGCGGA TTGCAGGTTTGCAGTAGTGTCCAATCGAAGGCCCCAGGGGTGAAGGGGGCGTGTCCAAAACGCTGTCCGC TCAGAGCGTTGAAAGGGCGGGGGCTTAGAGATTGTCCAATCAGGGCGCCGCTTCCTGAGCTCCGAGGCCC CGAGGGCGGGACGTTTCGTCCTCCCTGCCGCGCGTGCCCTGCCTACCACGAGCGGCCCGGGAGTACCTGT ACCTTTCAGCTGCGCCGGCCGCGAGGCCACGGAGAGCTCGCCTTGGAGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF57_2 ↗ | 19:2,900,443 | 正股 | 2,900,394–2,900,453 |
| ZNF57_1 ↗ | 19:2,900,957 | 正股 | 2,900,908–2,900,967 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9364B · promoter · 2900438–2900938 · regulatory
ENSR19_BKJQ · enhancer · 2900939–2901618 · regulatory
· motif · 2896042–2896053 · motif
· motif · 2896046–2896060 · motif
· motif · 2900328–2900337 · motif
· motif · 2900328–2900337 · motif
· motif · 2900328–2900337 · motif
· motif · 2900328–2900337 · motif
· motif · 2900387–2900400 · motif
· motif · 2900387–2900400 · motif
· motif · 2900668–2900678 · motif
· motif · 2900679–2900690 · motif
· motif · 2900679–2900690 · motif
· motif · 2900711–2900721 · motif
· motif · 2900812–2900822 · motif
· motif · 2902770–2902781 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:555 aa
zinc finger protein 57 長 555 個胺基酸,N 端第 4–76 位具有 KRAB 區域。序列中註記 13 個 C2H2 型鋅指,分布於第 140–526 位;其中第 196–218 位的第二個鋅指標示為退化型。該蛋白質歸屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF57 的定位註記為細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件、動態資訊或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 19 個夥伴
- CABP2Q9NPB3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DMWDG5E9A7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFEMP2O95967 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GLE1Q53GS7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 15 experiments
- KIF1BO60333-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAGOHBQ96A72 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NDEL1Q9GZM8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NEFLP07196 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PMP22A0A6Q8PF08 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRPS1P60891 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF11Q9Y3C5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNCAP37840 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPRED1Q7Z699 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- U2AF2P26368-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF250P15622-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF572Q7Z3I7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CTCCCTGCCGCGCGTGCCCTGCCTACCACGAGCGGCCCGG40GAGTACCTGTACCTTTCAGCTGCGCCGGCCGCGAGGCCAC80GGAGAGCTCGCCTTGGAGAGCCCAGGAGCAGGGGAGACAT120GGACTCAGTGGTCTTTGAGGATGTGGCTGTGGACTTCACC160CTGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATTCTGCTCAGAGGGACC200TCTACAGAGATGTGATGCTGGAGACCTTCCGGAACCTGGC240CTCAGTAGATGATGGGACTCAATTTAAAGCCAATGGGTCA280GTTTCTCTGCAGGATATGTACGGGCAAGAAAAATCTAAGG320AACAGACAATACCAAACTTCACAGGAAATAATTCCTGTGC360CTACACTTTAGAAAAAAATTGTGAAGGCTATGGCACTGAA400GACCACCACAAAAATCTGAGAAATCATATGGTGGACAGAT440TCTGTACACATAATGAAGGTAATCAATATGGAGAAGCCAT480CCATCAAATGCCAGATCTTACCCTGCACAAGAAAGTTTCT520GCTGGAGAAAAACCATATGAATGCACCAAGTGCAGGACAG560TCTTCACGCATCTTTCTTCTCTTAAAAGGCACGTCAAGTC600TCACTGTGGACGAAAAGCACCTCCAGGTGAGGAATGTAAG640CAGGCCTGCATTTGTCCCTCACACCTACACAGTCACGGAA680GAACTGACACTGAGGAGAAGCCGTATAAGTGTCAAGCATG720TGGGCAAACTTTCCAACATCCTCGTTACCTCTCCCACCAC760GTAAAGACTCACACAGCAGAGAAAACCTACAAATGCGAGC800AGTGTCGGATGGCGTTTAATGGGTTCGCAAGCTTCACTAG840ACATGTGAGAACTCACACAAAAGACAGGCCATATAAATGT880CAGGAATGTGGGAGAGCCTTCATTTATCCCTCGACATTTC920AAAGACACATGACAACACACACTGGAGAGAAGCCCTATAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。