演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF45ZNF13

zinc finger protein 45

ZNF45(zinc finger protein 45)是 Krüppel C2H2-type zinc-finger protein 家族成員,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19q13.31UniProt Q02386
OFFICIAL SYMBOL
ZNF45
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q02386
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF45 是一種蛋白質編碼基因,其產物為 zinc finger protein 45,屬於 Krüppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質全長 682 個胺基酸,具有 N 端 KRAB 結構域及多個 C2H2-type zinc finger 區域;其中第一個被註記為退化型。這些結構特徵構成此蛋白質的基本分子架構。現有資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未進一步說明其作用方式或調控對象。

Official symbol
ZNF45
Gene name
zinc finger protein 45
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13111
UniProt
Q02386
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZNF13

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.31
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF45pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:43,910,549–43,935,306
Gene span
24,758 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000269973 ★43,912,624–43,935,28210
ENST0000061598543,910,549–43,924,3125
ENST0000058970343,910,549–43,922,2874
ENST0000086460443,910,549–43,935,3069
ENST0000086460543,910,549–43,935,29511
ENST0000086460643,910,549–43,935,29512
ENST0000086460743,910,549–43,935,29511
ENST0000086460843,910,549–43,935,30612
ENST0000086460943,910,549–43,935,30612
ENST0000086461043,910,549–43,935,30611
ENST0000086461143,910,549–43,935,29512
ENST0000086461243,910,549–43,934,5808

顯示 12/70 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF45 可能參與轉錄調控。這項描述指出它與調節轉錄的過程可能有關,但使用「可能」表示目前資訊並未將此角色表述為確定功能。

現有資料未提供 ZNF45 如何影響轉錄的分子機制,也未指出它作用於哪些基因、是否直接接觸 DNA,或參與何種特定生物學過程。因此,不能據此進一步判定其調控方向、作用對象或生理後果。資料所支持的功能範圍僅限於「可能參與轉錄調控」這一概括性描述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 43935282 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF45 ENST00000269973 GRCh38 chr19:43935182-43936282 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGAACATTGTTCAGATGTTTACAGCTACTCCTATGTAGTCAACTTCCATTTTTTCTTCTTTACCCTTTCA
TAATAAACTTGGAAAAATATTTAGTTTCTACCTAGGAGAAAAGTGAATAGTATAGCTTTCTGTATTTTTT
GCACTTCATGTCTTAATCCCTCACTTCACCTCCCTCTCCTTACTGAATATTCATAGACACTTTGGCAAAT
CATAAGACACCTTTACAGATTCCTGATTCTGAGAGCAAGAAGTGATGTGATTCCTTAATCTGAACTGAAT
GTTTTCAAGATTTTATATAGGATAGAGCCTATTCAATACTATAATACTTTCTTCAGTATCCTGCGAATGA
AAGAAAACTAAGCGCAAGAAAAGTGGAGAATTTTGCTGCTTTTGTTTCATGTCCTGCTGGATGATTGCAT
CTCCTTTTTTGAGCATTTTTAATCACAGATGAATCCATACCCATATTATAAAAGGCTTGTTGCTCTGGGC
GGCTCTGGCCACCTCTTTTATTACCTCTGTTTTTAGCTCACACATAGCATTCCTTTGTATTTTCCTTTTT
TTTTTTCATATTCGCAACTTCTGTCACGTATAAAAGGGAACAATGGCAAAAGGAAAAAGCAGGCTGAGCT
CTACAAGCAATGACTTAGACTCCCCCCGCTAATTCAAAAGGAAAATTGCAGGCTGGCGGGAAGCTCAGCC
CTACAGAGGATTCTGGGACGTGTGGTCCAGACTTTTGGGGGCACTTCAGCTCTGGGAAAGCGCGGCTTTG
TTATTTGCTCCCCTGGGGAAATAGGAACCTATACCCCAGTGCTCAGTGGGTTCGGTGGTACTTCGACTAT
TTGAGGACGAGAACACGAAGCCCGCTCCCCTTGGGGATTCTGAGAAATAAGATTCGGCCGTGGGAGTCGA
AGCCCGCACTTCCGCCCAGGGGGCGGGGCAGCGGCTTCCGTTCCTCCCGGGGATGCTGGGAAATGTAGTT
CCAGAGCTCCCTGCTCTCCCGGGCACTTCCGCGGCAAGAGGTTGAGAGCGCGGCCTTCATTCCTCTCGTG
GAAGTGAGTGAGTCCTGGGACCCCGCGACCTGTTTTAACTTTTATGGTTTG
ZNF45 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BBPFB · enhancer · 43934264–43935271 · regulatory

ENSR19_9MFSS · promoter · 43935272–43935772 · regulatory

· motif · 43935268–43935279 · motif

· motif · 43935268–43935279 · motif

· motif · 43935355–43935366 · motif

· motif · 43935357–43935366 · motif

· motif · 43935405–43935418 · motif

· motif · 43935405–43935418 · motif

· motif · 43935492–43935505 · motif

· motif · 43935492–43935505 · motif

· motif · 43935493–43935506 · motif

· motif · 43935493–43935506 · motif

· motif · 43935749–43935764 · motif

· motif · 43935756–43935767 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:682 aa

1 aa682 aa結構域功能區域鋅指
依 Q02386 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 45 全長 682 個胺基酸,N 端含 KRAB 結構域;其後有 18 個 C2H2-type zinc finger 註記,其中第一個為退化型。C 端另有一段被註記為無序區域。

結構域KRAB8–78 aa
鋅指C2H2-type 1; degenerate164–186 aa
鋅指C2H2-type 2192–214 aa
鋅指C2H2-type 3220–247 aa
鋅指C2H2-type 4248–275 aa
鋅指C2H2-type 5276–298 aa
鋅指C2H2-type 6304–326 aa
鋅指C2H2-type 7332–354 aa
鋅指C2H2-type 8360–382 aa
鋅指C2H2-type 9388–410 aa
鋅指C2H2-type 10416–438 aa
鋅指C2H2-type 11444–466 aa
鋅指C2H2-type 12472–494 aa
鋅指C2H2-type 13500–522 aa
鋅指C2H2-type 14528–550 aa
鋅指C2H2-type 15556–578 aa
鋅指C2H2-type 16584–606 aa
鋅指C2H2-type 17612–634 aa
鋅指C2H2-type 18640–662 aa
功能區域Disordered662–682 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q02386…

AlphaFold · Q02386

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 ZNF45 的細胞內定位標示為細胞核;未提供定位變化條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF13ZNF45
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF45 可能參與轉錄調控;此描述保留可能性,未進一步說明其分子作用方式、調控對象或功能後果。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF45 被標示定位於細胞核。資料庫紀錄
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000269973 · 3,926 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGGCACTTCCGCGGCAAGAGGTTGAGAGCGCGGCCTTCAT40
41TCCTCTCGTGGAAGTGAGTGAGTCCTGGGACCCCGCGACC80
81TGTTTTAACTTTTATGGTTTGGTCGTAGGATCAGCAGGGC120
121TCGCACTTCGGTCAGCAGGAAAAGACGCTGCGGCGAGCAG160
161CGGAGGGCGGAGTTGAATGGCTGGGCAGCTGATTGCCTTA200
201CTGTATCCGGAGCTGCTGCGTTCGGGGCGGTTCGGGAGTC240
241CCCTGGTTGGAAGTGGACCTGAATGGGGAGGCGTCTGAGG280
281ATCTCCTGGGCTCTCAGCGGCCCGACCCGCCTTCCCCCAC320
321CTCCCACAGCTCTGTAGCTTCCTAGCGGTGTAACGTTGGG360
361AAAGGAGGCTGTTCTTGGACTATGCCTGACCCGTTTTTTA400
401AGAAAGAGTGCATCACTCAACAGGTGGCGTCTGGAGTTAT440
441CCTCTGTGGATTTTCCAGGATCTCAGACAAGATCGTGCAA480
481TCTCCCAGCCTCCTTTCCTTCCCCTGCCCTGACTTCTGAA520
521AGAATGCTGCGGGAGAGGAGGAAGGAGAGCATCCTGGCTT560
561CTGGCAGCAGAGCCCCACTGTGACAGGACCTAGCATTCAC600
601CTTCCTCTTCTGTTCCGAGTGCGAGAAGACTTCAGGGACC640
641TCTGTTTCATGGACATTATCATATTCTTCTCAAGAGTACC680
681CAGCAAGAGGTTTGCAAAGAGGAGTTATTCAGTGAAATCA720
721GAATCATACCCTGAGAGCTACAAGAACTCCATTTTTCACT760
761GTGCAGAGGCTCTCTGCTGAAGGGTCAAGTGGAATCTGGA800
801ATCCAGCCCATGTTTCCCCATCATCAAGCCATGTGAAGCT840
841GCAGACTCCAAGCAACAGAGAGACAAGATTTAGAATACTG880
881GCTCTGGTATGAAAGCTGGATTCAGGTACTGTTCCTGCCT920
921CTTGACCTCACCAAGCCTCAGCTTCCTCGCCTGTTAAATG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。