演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF41MGC8941

zinc finger protein 41

ZNF41(zinc finger protein 41)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族的蛋白質,可能參與轉錄調控;其序列含 KRAB 區域及多個 C2H2 型鋅指。

Homo sapiensXp11.3UniProt P51814
OFFICIAL SYMBOL
ZNF41
CHROMOSOME
X
UNIPROT
P51814
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF41 是一個蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 41,位於 X 染色體的 Xp11.3 區域。其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,長 821 個胺基酸。蛋白質具有 KRAB 區域,並在序列後段排列多個 C2H2 型鋅指;其中一個鋅指被註記為退化型,此外 N 端含有一段無序區。這些特徵構成 ZNF41 的主要蛋白質架構。現有資料將其角色概括為可能參與轉錄調控,但未提供更具體的作用對象或調控方式。

Official symbol
ZNF41
Gene name
zinc finger protein 41
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13107
UniProt
P51814
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MGC8941MRX89

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXp11.3
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegZNF41pq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrX:47,444,693–47,483,247
Gene span
38,555 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000684689 ★47,445,178–47,483,2225
ENST0000031311647,444,693–47,482,9245
ENST0000037706547,444,693–47,482,9465
ENST0000089417447,444,693–47,483,2395
ENST0000089417547,444,693–47,483,2395
ENST0000089417647,444,693–47,483,2395
ENST0000089417747,444,693–47,483,1795
ENST0000089417847,444,693–47,482,9245
ENST0000089417947,444,693–47,483,2396
ENST0000089418047,444,693–47,482,9306
ENST0000089418147,444,693–47,482,9246
ENST0000089418247,444,693–47,483,2396

顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF41 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述反映其可能涉入基因表現調節,但來源未說明 ZNF41 作用於哪些基因,也未界定它促進或抑制轉錄,因此不宜將其角色解讀為特定方向或已知靶標的調控。

目前提供的資料僅支持上述概括性功能判斷,沒有交代參與轉錄調控的分子步驟、作用條件或相關生物學過程,也未提供實驗情境或功能效應的細節。因此,ZNF41 的具體調控機制及其生物學影響仍無法由這些資料進一步說明。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 47483222 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF41 ENST00000684689 GRCh38 chrX:47483122-47484222 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAGCAAAAATTGAATAGCACAAGGAAAACCTGCCAGTACAGTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTCCC
TGCCACATCACCCCCAGTTGACAAGCTGAAGGGAATTATCAGGAAACACACATTTTAAAAGGCCCAACGC
ACAAGCTTGAACCAATAGAGCCGCAGAGTACGATAAATCCAACAACTAGAAGATACAGTGTTTTCAATCA
AGGCACAAAACCATTTTTGAAAGCTGGCCTCGTACTTGAGCCTTAAGGCAAGTTTCATCAAATTTCAAAC
TCAACGTTCTTGGGCCACAAGGCAAATGGGCTTAGAAATCACTAACACAGGGATTAACTTCTTGTTCGTT
TGCGGAAATGCAAAATGGTGTTAAGACCTGTAACATTTTCTGCAGTCCCTCTAAATTCCTTCTTTGAATA
ATCGATTCCTAGAACAGGACGCGACGGACCAAGCTGGGTCAAACTGCCGACAGCTCCATTGGGCAGCATG
TCCACCCCTGATGACCAAATCCCACCAAACGTGCAGCTGGCACTCGGCCGCCTTTGTTTCCTTCCCCTAG
AATAAAACTCCGCTGCTTTCCCACGTTCCTGGAGCAGCAGCCGGAATAAAGCGCCCATGGCCTTGCCCTT
TGAGTCTCGGAGGATGTTTGCCACTCCAACAATGGACTTTTAAATAATTCAGGGGTCAAAAGGCGTGTGT
GGGGGGGGGAGAAAAGTTACAAATCAGCACTTGAAACCGAACACAAACAAAAATCAAACAAATCCGAACT
AATATAACAAATCAAAACTTTGATCTTTAGAAGAAAACTTCAACCTTAATGCTTCCAGGAGGAAAGCAGA
AAGGATAATGACTGAATTGTGAAAACGAGCCAAAATGTTCCACCACTGATGTCACACACACCTATGACTC
CCTGCACAGATCCACGGTCCCGGGCGCTGAATCCCCGCAACCCTCTGCGCCCACAGAGGTTAAACTCTCG
CTGCTGGCGACTTCCGCTTCCTGGCCTAAATCTGACACGCACGACTCCCCCCGCGGCAACTGCACAGGTT
CGGTGACAGCCGAGACGCCGAGTGTTTCCCGCAGCCGGCCGGGGTCCAGGT
ZNF41 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF41_4 ↗X:47,482,577負股47,482,567–47,482,626
ZNF41_3 ↗X:47,482,890負股47,482,880–47,482,939
ZNF41_5 ↗X:47,483,029負股47,483,019–47,483,078
ZNF41_1 ↗X:47,483,209負股47,483,199–47,483,258

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_BCFFJ · enhancer · 47482057–47482574 · regulatory

ENSRX_BCFFM · promoter · 47482575–47483581 · regulatory

ENSRX_BCFFQ · enhancer · 47483582–47484218 · regulatory

· motif · 47479142–47479151 · motif

· motif · 47479142–47479151 · motif

· motif · 47480768–47480783 · motif

· motif · 47480768–47480783 · motif

· motif · 47482519–47482530 · motif

· motif · 47482519–47482530 · motif

· motif · 47482580–47482602 · motif

· motif · 47482580–47482602 · motif

· motif · 47482598–47482609 · motif

· motif · 47482604–47482615 · motif

· motif · 47482604–47482615 · motif

· motif · 47482610–47482621 · motif

· motif · 47482610–47482621 · motif

· motif · 47482706–47482716 · motif

· motif · 47482734–47482751 · motif

· motif · 47482999–47483012 · motif

· motif · 47483011–47483024 · motif

· motif · 47483194–47483210 · motif

· motif · 47483221–47483234 · motif

· motif · 47483223–47483234 · motif

· motif · 47483223–47483234 · motif

· motif · 47483225–47483234 · motif

· motif · 47483526–47483541 · motif

· motif · 47483528–47483541 · motif

· motif · 47483531–47483543 · motif

· motif · 47483534–47483541 · motif

· motif · 47484792–47484807 · motif

· motif · 47485092–47485105 · motif

· motif · 47485231–47485243 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:821 aa

1 aa821 aa結構域功能區域鋅指
依 P51814 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF41 蛋白質長 821 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列含 KRAB 區域(第 69–140 位),以及 18 個 C2H2 型鋅指;其中第 2 個被註記為退化型。第 1–55 位另有無序區註解。

結構域KRAB69–140 aa
鋅指C2H2-type 1313–335 aa
鋅指C2H2-type 2; degenerate341–364 aa
鋅指C2H2-type 3369–391 aa
鋅指C2H2-type 4397–419 aa
鋅指C2H2-type 5425–447 aa
鋅指C2H2-type 6453–475 aa
鋅指C2H2-type 7481–503 aa
鋅指C2H2-type 8509–531 aa
鋅指C2H2-type 9537–559 aa
鋅指C2H2-type 10565–587 aa
鋅指C2H2-type 11593–615 aa
鋅指C2H2-type 12621–643 aa
鋅指C2H2-type 13649–671 aa
鋅指C2H2-type 14677–699 aa
鋅指C2H2-type 15705–727 aa
鋅指C2H2-type 16733–755 aa
鋅指C2H2-type 17761–783 aa
鋅指C2H2-type 18789–811 aa
功能區域Disordered1–55 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P51814…

AlphaFold · P51814

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF41 的細胞內定位資料標示為細胞核;來源未提供定位變動條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MGC8941ZNF41FAM9BKRTAP10-7MFAP1NKAPD1RNPS1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

曾在一名重度智能障礙患者中發現涉及 ZNF41 的染色體異常,為 t(X;7)(p11.3;q11.21) 易位。這筆資料記錄的是個案中的染色體變異與疾病並存,未證明該易位與智能障礙之間具有因果關係。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF41 可能參與轉錄調控,但這項描述未指出其調控的基因或作用方向,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的轉錄。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF41 的細胞內定位標示為細胞核;資料未說明定位變化的條件或不同異構型間的差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯一名重度智能障礙患者被發現帶有涉及 ZNF41 的染色體易位 t(X;7)(p11.3;q11.21)。這是患者個案中的變異紀錄,資料未證明該易位會造成智能障礙。含實驗來源
證據與來源

A chromosomal aberration involving ZNF41 has been found in a patient with severe intellectual disability. Translocation t(X;7)(p11.3;q11.21)

PMID 14628291 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000684689 · 4,999 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTGGCCTAAATCTGACACGCACGACTCCCCCCGCGGCAAC40
41TGCACAGGTTCGGTGACAGCCGAGACGCCGAGTGTTTCCC80
81GCAGCCGGCCGGGGTCCAGGTCGGAAATGTAGCCAGTGGG120
121GCCGCCAGCATCCAGCACAGTGAGCGGCCCCTGGGCACCA160
161CCAGAAAACATTTGTGAGTGAACGTGGAGTGATGACCATG200
201TGGACACTGTCTTTCCAGGGTTTCTTGGAGCCTCTGCAGA240
241GTCTGGGGGCCAGGCTTCTTAGTGGAAACTGCAGGATCTT280
281CCTTCTGACCCCTGCTTGCCTCGCCCCAGCAGCTCCGGTT320
321GAGTCCACAGATGCCAGCTCAGCTTCCAGCTTGGGGAAGA360
361GTGGGGTTGTCAGCAGGAGAGCCTGAGGGCTGAGGCCCAG400
401CGTGAACATGGCAGCTAATGGGGACTCTCCCCCATGGTCC440
441CCGGCCCTGGCTGCAGAGGGACGTGGCAGCTCATGTGAGG480
481CTTCAGTGTCATTTGAGGACGTGACTGTGGACTTCAGCAA520
521GGAGGAGTGGCAGCACTTGGACCCTGCCCAGAGACGCCTG560
561TACTGGGATGTGACACTAGAGAACTACAGCCACCTGCTCT600
601CAGTGGGGTACCAAATTCCCAAGTCAGAGGCTGCCTTCAA640
641GTTGGAGCAAGGAGAGGGGCCATGGATGCTGGAGGGGGAA680
681GCCCCACATCAGAGCTGTTCAGGTGAGGCTATTGGGAAAA720
721TGCAGCAACAGGGAATTCCTGGAGGAATTTTCTTCCACTG760
761TGAGAGATTTGATCAACCCATAGGAGAAGATTCATTATGT800
801TCTATTTTAGAAGAACTGTGGCAAGATAATGACCAGCTAG840
841AGCAACGTCAGGAAAACCAGAATAACCTTTTAAGTCATGT880
881GAAAGTATTGATTAAGGAGAGGGGCTATGAACATAAAAAC920
921ATTGAAAAAATAATTCATGTGACTACCAAGCTTGTTCCTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。