演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF384CAGH1A

zinc finger protein 384

ZNF384(zinc finger protein 384)是 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族的轉錄因子,可辨識特定 DNA 共識序列;其對部分基因啟動子的調控目前屬於相似性推定。

Homo sapiens12p13.31UniProt Q8TF68
OFFICIAL SYMBOL
ZNF384
CHROMOSOME
12
UNIPROT
Q8TF68
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF384(zinc finger protein 384)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。這種蛋白質具有多個 C2H2 型鋅指結構,整體包含八個此類註解區段,並有兩段被註解為無序區域。其基本分子特性與 DNA 結合相關;來源將它描述為轉錄因子,並指出它能辨識特定共識 DNA 序列。

Official symbol
ZNF384
Gene name
zinc finger protein 384
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11955
UniProt
Q8TF68
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CAGH1ACIZNMP4NPTNRC1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212p13.31
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegZNF384pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr12:6,665,037–6,689,572
Gene span
24,536 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000683879 ★6,666,477–6,689,37512
ENST000007103996,665,037–6,689,51012
ENST000003197706,665,037–6,689,51010
ENST000003968016,665,037–6,689,51011
ENST000003619596,665,037–6,689,29211
ENST000003557726,665,037–6,689,4549
ENST000011350086,665,037–6,689,37512
ENST000005459466,667,692–6,669,1572
ENST000004177726,672,404–6,689,4559
ENST000004367746,673,248–6,689,2976
ENST000005409156,678,201–6,688,6895
ENST000005354856,678,261–6,688,5694

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF384 是轉錄因子,能結合共識 DNA 序列 [GC]AAAAA。這項序列辨識特性提供其與 DNA 調控區域互動的分子基礎;不過,現有資料未進一步說明結合的實驗條件或此序列在不同基因中的具體作用方式。

依相似性推定,ZNF384 似乎會結合 MMP1、MMP3、MMP7 與 COL1A1 的啟動子,並調節這些啟動子的活性。此描述指出可能的標的基因及調控方向涉及啟動子調節,但證據屬於 By similarity,因此應視為基於相似性的推論,不能據此表述為已直接確立的調控關係。

來源支持的功能範圍主要集中在 DNA 序列結合與上述啟動子調節,未提供更細節的分子機制、細胞或生理情境,也未說明調控對基因表現造成的具體結果。因此,ZNF384 的轉錄調控作用可依現有資料概述,但其在特定生物學過程中的功能意義仍無法由這些資訊進一步界定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 6689375 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF384 ENST00000683879 GRCh38 chr12:6689275-6690375 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTATTAAATACTATGGGAATTCAGAGGGACCATTACAGGTTGGAGCAATCAGGCAAGGCTTCCTAAAAGG
GTTCATATTTAGGTGTTCATAATGAACTATAGTTCATTTATACAACAAGAGTTTACAGACCACTTAACTG
CCAGGATATGAGGATACAGCAACGAACAATTCAGTCCTCGCTGTCCTGTAGCCAATATTTTAGTTGGGAG
AGGTGGACAGCAAACAATAAATCAGGCAGTAATAAGTGCTATATTTAAGTAAAACAGGGTAAGGGGATAG
AGATGTGGGTATGGGCAACAAGAAAAGACCAAAGTAAAGTAAGGGATGTGTCAGAGAGACAGATTTTGAT
GGCTGGGAGAGTTTCTAACTGGACCTAAGTAGGGACCTCCGAAAAACAAGGATACGTCCTAGTCCTTTCC
CGCATATTCAAAGCATTGAGACATTCTTGGGGGTATCAGAAAAAATAATGGTAATTTCCTACATCAGCTT
ATTCAACATCCAGAGGGAAGAGAAACGGGGTCCCAGCATCTGAAGAACCCACACCTCCTCTCCTACCTTG
ATGGATAATTCATGAACCTGTCGCGTTTCCACCCCCCCACCTTCCCCAGATGTCCCTTCCGGAAGCTCAG
GGCCGGAGTCCTCCGGTTTCAGCTTTTGCCCCTAGCGGAACCCGCCTTCACTTCCGCTATAGCGTCACAT
CCCCTCTTCCCAGTCGCTGGGCAGAAGCTATTTCCGCCCCGAGTTATCGTAACTTCTGCCCTGAATATCT
CGCAGCGCTAGCGGCGCCGGAAGTGTTCCAGCCACTCCCGGAAGTGACTCGGCTTCTGCACGCCCCTCTT
TCTCCATTAGCGCCCCCCCTACATTGCTATTTCCCTCCCTCCCCCCTTTTCGTTTCCGGCGCTCCCGCCT
TCTCTCCGCAGAGCTCTTCTCTGAGCCTGTTGGGGGGAGGGAGGGGGGCGTGGAGGAACTGGGGTTCGCG
GGAGCACGAGCTGCAGCACCACTTCCGGGTGAGTGCAAGGGGAGGGCAGCAAGGAGGGGGGGCCACCCAC
TACCTCGCGCCCCCGCCCTGCGGGTGTCTCGCGCGCGTTCCGTGCGTGTGA
ZNF384 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF384_2 ↗12:6,688,925負股6,688,915–6,688,974
ZNF384_1 ↗12:6,689,490負股6,689,480–6,689,539

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_94MM8 · enhancer · 6684577–6684952 · regulatory

ENSR12_53KG8C · CTCF_binding_site · 6684830–6684851 · regulatory

ENSR12_CMWS · enhancer · 6688204–6689281 · regulatory

ENSR12_53KGW6 · CTCF_binding_site · 6688685–6688706 · regulatory

ENSR12_94MNL · promoter · 6689282–6689789 · regulatory

ENSR12_B3BSW · enhancer · 6689790–6690508 · regulatory

ENSR12_94MP9 · enhancer · 6691544–6691886 · regulatory

· motif · 6684832–6684848 · motif

· motif · 6684845–6684854 · motif

· motif · 6685520–6685542 · motif

· motif · 6685520–6685542 · motif

· motif · 6688120–6688131 · motif

· motif · 6688122–6688133 · motif

· motif · 6688518–6688530 · motif

· motif · 6688520–6688527 · motif

· motif · 6688687–6688703 · motif

· motif · 6688788–6688801 · motif

· motif · 6688788–6688801 · motif

· motif · 6688889–6688902 · motif

· motif · 6688960–6688974 · motif

· motif · 6688966–6688975 · motif

· motif · 6688966–6688977 · motif

· motif · 6688966–6688977 · motif

· motif · 6688966–6688979 · motif

· motif · 6688966–6688980 · motif

· motif · 6689218–6689233 · motif

· motif · 6689276–6689292 · motif

· motif · 6689276–6689292 · motif

· motif · 6689307–6689320 · motif

· motif · 6689333–6689343 · motif

· motif · 6689362–6689376 · motif

· motif · 6689365–6689376 · motif

· motif · 6689365–6689376 · motif

· motif · 6689367–6689376 · motif

· motif · 6689391–6689402 · motif

· motif · 6689392–6689407 · motif

· motif · 6689412–6689422 · motif

· motif · 6689419–6689429 · motif

· motif · 6689423–6689433 · motif

· motif · 6689426–6689437 · motif

· motif · 6689476–6689485 · motif

· motif · 6689477–6689491 · motif

· motif · 6689491–6689501 · motif

· motif · 6689539–6689549 · motif

· motif · 6689560–6689569 · motif

· motif · 6689560–6689571 · motif

· motif · 6689560–6689571 · motif

· motif · 6689581–6689590 · motif

· motif · 6689581–6689592 · motif

· motif · 6689581–6689595 · motif

· motif · 6689636–6689647 · motif

· motif · 6689683–6689697 · motif

· motif · 6689684–6689697 · motif

· motif · 6689686–6689697 · motif

· motif · 6689686–6689697 · motif

· motif · 6689688–6689697 · motif

· motif · 6689827–6689836 · motif

· motif · 6689949–6689960 · motif

· motif · 6690998–6691009 · motif

· motif · 6691479–6691488 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:577 aa

1 aa577 aa功能區域鋅指
依 Q8TF68 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF384 蛋白質長 577 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。序列中註解有八個 C2H2 型鋅指區段,位於第 228–250、256–278、284–306、317–339、345–367、373–397、403–425 與 433–455 個胺基酸;另有兩段無序區域,分別位於第 171–225 與 501–550 個胺基酸。

鋅指C2H2-type 1228–250 aa
鋅指C2H2-type 2256–278 aa
鋅指C2H2-type 3284–306 aa
鋅指C2H2-type 4317–339 aa
鋅指C2H2-type 5345–367 aa
鋅指C2H2-type 6373–397 aa
鋅指C2H2-type 7403–425 aa
鋅指C2H2-type 8433–455 aa
功能區域Disordered171–225 aa
功能區域Disordered501–550 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8TF68…

AlphaFold · Q8TF68

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF384 的細胞內定位註解為細胞核;來源未提供定位改變條件或不同異構型間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CAGH1AZNF384
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZNF384 與 BCAR1 有互作註解;來源未說明兩者是否直接結合、是否同屬特定複合體,或此互作的功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF384 是轉錄因子,可辨識並結合共識 DNA 序列 [GC]AAAAA。依相似性推定,它似乎也會結合 MMP1、MMP3、MMP7 與 COL1A1 的啟動子並調節其活性;這些啟動子調控關係屬於相似性推論。推論支持
證據與來源

Transcription factor that binds the consensus DNA sequence [GC]AAAAA. Seems to bind and regulate the promoters of MMP1, MMP3, MMP7 and COL1A1 (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZNF384 與 BCAR1 有互作註解;資料未進一步說明此互作是否為直接結合、涉及何種複合體或造成何種功能影響。推論支持
證據與來源

Interacts with BCAR1

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF384 的細胞內定位註解為細胞核;此資料未提供定位變化的條件或不同異構型的定位差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000683879 · 3,407 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTTCCGGGTGAGTGCAAGGGGAGGGCAGCAAGGAGGGGG40
41GGCCACCCACTACCTCGCGCCCCCGCCCTGCGGGTGTCTC80
81GCGCGCGTTCCGTGCGTGTGAGTGTGTGGGTCTGTCTCGC120
121TCCAGAAGTGCGTGCCCGCGCGCTGCGCCTTGCGCTTTTT160
161CCCCTCCCTCGCCCCTTCCTGGTCCTCCCACCCTCCTCGG200
201CTCCCTCCTTTCCCAGCAAACGCCGCCCCTCCCGCGCCCT240
241GGCTCAGGCTCTGGCGCCGCCGCAGCCGTCGCCGCCCGAA280
281AGTTCAGGAGCCCTGGAAAGGAGAAGGAATAAGACGGCAG320
321GAGGAAGAGAGAGAGAGGGTAGAATGGAAGAATCTCACTT360
361CAATTCTAACCCGTACTTCTGGCCTTCTATCCCCACAGTC400
401TCAGGTCAGATCGAGAACACAATGTTCATCAACAAGATGA440
441AGGATCAGCTGTTGCCAGAGAAGGGCTGTGGTCTGGCCCC480
481ACCTCACTACCCCACCTTGCTGACAGTGCCTGCCTCAGTG520
521TCCCTGCCCTCAGGCATCAGTATGGACACAGAGTCCAAGT560
561CAGACCAGCTGACCCCACACAGCCAAGCGTCCGTTACCCA600
601GAATATCACGGTGGTCCCTGTGCCGTCTACAGGACTGATG640
641ACTGCTGGAGTCTCCTGTTCTCAGAGGTGGAGAAGAGAAG680
681GGAGTCAATCAAGGGGTCCGGGTTTGGTAATCACGTCCCC720
721CTCAGGCTCTCTTGTGACCACAGCATCATCAGCTCAGACC760
761TTCCCCATTTCGGCTCCCATGATTGTCTCAGCTCTTCCCC800
801CTGGCTCACAAGCCCTGCAGGTTGTCCCTGACCTCTCCAA840
841GAAGGTAGCATCGACCCTAACCGAGGAAGGAGGCGGAGGT880
881GGTGGTGGAGGTGGCAGTGTGGCTCCTAAGCCACCCCGGG920
921GCCGGAAGAAGAAGCGGATGCTGGAATCAGGGCTGCCCGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。