基因總覽
ZNF37A(zinc finger protein 37A)是蛋白質編碼基因,產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其蛋白質序列長 561 個胺基酸,包含 N 端 KRAB 結構域,以及多個 C2H2 型鋅指區域;其中部分鋅指被註記為退化型。這些序列特徵構成此蛋白質的主要結構概貌。現有功能資料指出,ZNF37A 可能參與轉錄調控,但尚未提供更具體的調控標的或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000685332 ★ | 38,094,337–38,124,625 | 8 |
| ENST00000865427 | 38,094,270–38,121,226 | 7 |
| ENST00000865429 | 38,094,270–38,121,226 | 8 |
| ENST00000865431 | 38,094,270–38,120,445 | 8 |
| ENST00000865432 | 38,094,270–38,120,445 | 8 |
| ENST00000865438 | 38,094,270–38,119,729 | 7 |
| ENST00000865439 | 38,094,270–38,119,570 | 7 |
| ENST00000950340 | 38,094,270–38,121,204 | 8 |
| ENST00001096048 | 38,094,270–38,115,695 | 8 |
| ENST00001096049 | 38,094,270–38,115,693 | 7 |
| ENST00001096052 | 38,094,270–38,115,698 | 7 |
| ENST00001096055 | 38,094,270–38,115,698 | 8 |
顯示 12/54 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前可用的功能註解指出,ZNF37A 可能參與轉錄調控。這項描述保留了不確定性,僅支持將其視為可能涉及轉錄調節的蛋白質,尚不足以判定它會促進或抑制轉錄,也沒有指出其作用的特定基因或轉錄程序。
轉錄調控涉及改變基因轉錄活動,但現有資料沒有說明 ZNF37A 如何介入這一過程,例如是否直接接觸 DNA、如何辨識調控序列,或是否透過其他分子發揮作用。因此,不能由「可能參與轉錄調控」進一步推定其具體分子機制、調控方向或作用對象。
資料也未提供 ZNF37A 參與哪些細胞或生物學過程的證據,無法據此說明其轉錄調控可能帶來的下游影響。現階段較適當的理解是:ZNF37A 被註記為可能具有轉錄調控相關功能,但其作用條件、分子方式與生物學結果仍未由這項功能描述界定。
Promoter 與基因調控
>ZNF37A ENST00000685332 GRCh38 chr10:38093337-38094437 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GATTTCAGCTCACTACAACCTCCACCTCTCGAGTTCAAGGGATTCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCT GGGACTGCAGGTGTGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGTAGTTTTAGTGGAGACGGGGTTTCACCGTGT TACCTAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGAGACTAC AGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCATGTGTAGTTTTTTTAACCTCCGGCCTCCTTCCTACCAGCCCCTTC TGAGTCTCTAAAGTCCATTATATCACTCTGTATGCCTCTGCGTACTCATAGCTTAGCTCCCACTTATAAG TGAGAACCTACGGTTTTTGGTTTTCCACTCCTGTATTACCTCTGCCTGTGAACTTTAAAAAGTTATCGTG ATCAAGAGATCCTGCATACTCCTGAAGAATGGAAAATGCATGTTTGCCATGCAAGATGGTATTACGTGGT TTAACAAATAAAATTTGAAGAGCAATTCCGAGTTATCTTTACGACAGCTTACAGGCTGGTAATGCTCATG TCCAGCGTGTTTTCTCACGGTTAGCGTCCAATGGACCAGAAAGGAGCAAGTGAAGCTCTCCACACTGGCG CAAGTGTAGGTGGTGCTGCGGCAGCGTCGCGGGGCCACAGGAACCGACCTCGTCTGGAGAAATTCCACTC GTGAATTCTGCCAAATGAGGAAGTGTTGAGGACGGCCAAATCATCAGGGGGATGTAATTCATGAGAAAGC TGTGTAATTTAAATACTCATAATTTATTTCAGCTAACGAATAAAACTGCAGTACTGCACTTGCCGCATCT GGGAACTAACTGCCCAATGCGGCTGAAACCTCATGCCCTTTCAAAAGGAGTGGCGCGAGGGCTTGTGGGA AATGTAGTCTGCACTTTCTAAGGGAGCGGCGCGAGGGCTTGTGGGAAATGAAGCGTGCACTTTCTAAGGG AGCGGCGCGAGGACTTGTGGGAGATGTAGTGTGCACTTTTCGGCCCCCGTCGCGGGAGCCGCTTCGGGCC TTCTGGGCATGTCTGCCATATGGCTCCAGGTTTGTTTTTCTCCCCGGCACT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF37A_1 ↗ | 10:38,094,365 | 正股 | 38,094,316–38,094,375 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR10_B9K59 · enhancer · 38093616–38094179 · regulatory
ENSR10_8358H9 · promoter · 38094180–38094357 · regulatory
ENSR10_C5R3P · enhancer · 38094358–38095584 · regulatory
ENSR10_5BXX2C · CTCF_binding_site · 38094690–38094711 · regulatory
ENSR10_5BXX47 · CTCF_binding_site · 38095086–38095107 · regulatory
· motif · 38093900–38093915 · motif
· motif · 38094048–38094061 · motif
· motif · 38094050–38094061 · motif
· motif · 38094050–38094061 · motif
· motif · 38094110–38094123 · motif
· motif · 38094114–38094127 · motif
· motif · 38094201–38094216 · motif
· motif · 38094692–38094708 · motif
· motif · 38095088–38095104 · motif
在帶有 DM1(Myotonic dystrophy type 1)突變的細胞中,ZNF37A 表現量下調。此變化涉及 CUGBP1 對 ZNF37A mRNA 穩定性的異常控制;資料未進一步說明該機制的細節。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:561 aa
ZNF37A 蛋白質長 561 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。序列第 8–79 位註記有 KRAB 結構域;另有 12 個 C2H2 型鋅指區域,其中第 1、2 個被標示為退化型,其餘 10 個未標示退化。這些為序列特徵註解,資料未提供各區域的實驗功能說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF37A 的定位註記為細胞核。 資料未提供定位隨條件改變或不同異構型之間存在差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF37A 可能參與轉錄調控;這項註記帶有不確定性,未說明調控方向、特定標的或具體作用方式。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | ZNF37A 的定位註記為細胞核。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 帶有 DM1(Myotonic dystrophy type 1)突變的細胞中,ZNF37A 表現量下調;此變化涉及 CUGBP1 對其 mRNA 穩定性的異常控制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Down-regulated in cells with DM1 (Myotonic dystrophy type 1) mutation, via a mechanism that involves abnormal control of its mRNA stability by CUGBP1 PMID 23922231 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAGATGTAGTGTGCACTTTTCGGCCCCCGTCGCGGGAGCC40GCTTCGGGCCTTCTGGGCATGTCTGCCATATGGCTCCAGG80TTTGTTTTTCTCCCCGGCACTCTGACGGGGAGGGCTCCCG120GCATCTCCTGGCGTCCGGGTAGAGGACGCGGAGGGTCGCA160GCTTCATTGCCTGATGTCTTCGGGAAGTATTTTGAAGTCA200TCGTGGCTGTGGATTGGGGAATTTCTTGTTTCCACTGACC240TGTGAGGCCGCGCACGCGGAGGGAGGCACCCCAGGCCCTC280CGGCACTGTCCAGCCTCGCCTGTGTCCCCATTAGCACCAG320TGGGCATTTTCAGAGGGTCCAGCTCATGGCTCAAGTGACA360GGAAGATGTAGGAGCTTTCTGTCTTGAATGAGGATTCGAA400CCAAAGGGCTTAGGCCCAGCTGTCTTGGAGCAAAGCAGCT440GTTGTGGGATGCTGAGCTGCTGGCGCACTGCAGCACAACT480AGAGATGTACGGATGCCCCCATCTTGATCTTACAGAATCA520GAGGTACAGCCGCGAGAAAGAGTCAAGAACAGACAGAGTC560GCTTGAGGACTCAGGAGGGTGTTTGCTGCGTTGACAACAG600ACTACACCCTCACAGTTTGCTCTGCTCTTCCAACACCAGT640GGAAGATGATCACATCCCAGGGATCAGTGTCGTTTAGGGA680TGTGACTGTGGGCTTCACTCAAGAGGAGTGGCAGCATCTG720GACCCTGCTCAGAGGACCCTGTACAGGGATGTGATGCTGG760AGAACTACAGCCACCTTGTCTCAGTAGGGTATTGCATTCC800TAAACCAGAAGTGATTCTCAAGTTGGAGAAAGGCGAGGAG840CCATGGATATTAGAGGAAAAATTTCCAAGCCAGAGTCATC880TGGAATTAATTAATACCAGTAGAAACTATTCAATAATGAA920GTTCAATGAGTTTAACAAAGGTGGAAAATGTTTCTGTGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。