基因總覽
ZNF354A 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 zinc finger protein 354A。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 5q35.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000335815 ★ | 178,711,512–178,730,659 | 5 |
| ENST00000865234 | 178,711,512–178,730,659 | 5 |
| ENST00000865235 | 178,711,512–178,730,567 | 5 |
| ENST00000865236 | 178,711,512–178,730,560 | 5 |
| ENST00000916334 | 178,711,512–178,732,381 | 5 |
| ENST00000916335 | 178,711,512–178,729,805 | 5 |
| ENST00000916336 | 178,711,512–178,729,472 | 5 |
| ENST00001033069 | 178,711,512–178,730,733 | 5 |
| ENST00001136500 | 178,711,512–178,730,733 | 5 |
| ENST00000520331 | 178,713,473–178,729,383 | 4 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>ZNF354A ENST00000335815 GRCh38 chr5:178730559-178731659 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTCGGCCAGGCTGGTCTTGAACTAACG TCGTGATCAACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCGCCCCCAGCCAATT AAACGTTTTTTTTAAAAAAATAAATGCAATGGAATGCAATGAAGCTATCAAAAATGCCACTGAGGGAGAA TATTTATTGACAAATTCAAATGTTCAAGGCATATTCTTAAGTAGGGAAGCGCCAAACTTTCTAAATGGAG CCGGTGTTCTTTTTGTAACTGAGAAGATTTAGTTTAAAAAAAATATATATATATATACACACACACACAC ACACATATACATACATACATCCGTTGGCTTCACAGTAGCTGGCACCTCCCTCCCCTTTGCTTCAGGCACT TCCTGGGAGTCCTCGTCCATTCTCACCTCAGCGACGAAACCCCTCCACATACCCTGTTTCTCCTCACATT TATCCCCGAAAATGTTATATAATTATGTGTATGGCTTATTGTCTGCTCCCTACCCCCCAAAAAAATGTTC TCCAGGGCAGTGACGTTTCTTTCATTGATTGATACATGTGAAACCACTTGCAACCGTGCTTGGCACACAG CAGGTGCTCAGTGCCCCTCTGGTGAATAACTGAGGGGCACTAGGTCTGTTCTGGGCCGTTTTCCTGCCGC CCACGCCCTCCCTCCCGAAATTCCCACAGACACAGAGTTGCAAGTTACTGCCCTCAGCGAACCTCCCCTT ATCTTCCCTATAACCAGGAACCTGGGGCCCTCCAGCTCACAGGGGCCCTCTTGTGGCATGTGGGCGCGTA ACAGCTCAGCCGGGACCCCGCCTCAAACGCATGGAACTACACTTCCCCGAATGCAGGTGTCCTCTCGTGG ACTCCATTTCCCAGCGGCCTCAGCGGCTGCCCCGCCCCTCCTGGTCCCCGGCGCGCCGCGGGGTGAGCGG CGCCGGGCCTGAGGTCGCCCAGACGCCGTCGGGGCGGAGCCGGGTCGCGAGGCTGCATCCCGGCCGGCGG TTCCGGAGCCTCGCGGCTGGGGAGGCGCGGCCCGGGACGCTCGAGCTTAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF354A_1 ↗ | 5:178,730,659 | 負股 | 178,730,649–178,730,708 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_B3BGNS · enhancer · 178728992–178729587 · regulatory
ENSR5_B3BGNZ · enhancer · 178729863–178730648 · regulatory
ENSR5_53K33J5 · CTCF_binding_site · 178730516–178730537 · regulatory
ENSR5_B3BGP3 · promoter · 178730649–178731167 · regulatory
ENSR5_53K33K7 · CTCF_binding_site · 178730746–178730767 · regulatory
ENSR5_878TSF · enhancer · 178731168–178731334 · regulatory
· motif · 178730085–178730100 · motif
· motif · 178730090–178730102 · motif
· motif · 178730093–178730100 · motif
· motif · 178730093–178730108 · motif
· motif · 178730482–178730499 · motif
· motif · 178730518–178730534 · motif
· motif · 178730721–178730738 · motif
· motif · 178730748–178730764 · motif
· motif · 178730803–178730819 · motif
· motif · 178730886–178730892 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：605 aa
ZNF354A（zinc finger protein 354A）是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 成員，蛋白質長 605 個胺基酸。序列含 N 端 KRAB domain（第 14–85 位）及 13 個 C2H2-type zinc finger，分布於第 214–600 位；另有第 74–106 位的無序區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | ZNF354A 位於細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGACGCCGTCGGGGCGGAGCCGGGTCGCGAGGCTGCATCC40CGGCCGGCGGTTCCGGAGCCTCGCGGCTGGGGAGGCGCGG80CCCGGGACGCTCGAGCTTAGGGAGATCTGCCTTCTGGAGA120CTGCGCCGTCCTCCCGGGAGAGCCAGAAAGAGGACATGGC160TGCTGGGCAGCGGGAAGCGAGGCCCCAGGTGTCACTGACG200TTTGAGGATGTGGCTGTGCTGTTTACCCGAGATGAGTGGA240GAAAGCTGGCCCCTTCTCAGAGAAACTTGTACCGGGATGT280GATGCTGGAGAACTATAGGAACCTGGTCTCACTGGGGCTC320CCATTTACCAAACCAAAAGTGATCTCCCTGTTGCAGCAAG360GAGAAGATCCCTGGGAGGTGGAGAAAGACGGTTCTGGCGT400CTCCTCTCTAGGATCGAAGAGCAGTCATAAAACCACAAAG440TCAACGCAAACACAAGACTCTTCATTTCAGGGACTGATAC480TGAAAAGATCCAACAGGAATGTACCTTGGGATTTGAAATT520AGAAAAGCCTTACATATATGAAGGCAGATTAGAGAAAAAG560CAGGATAAAAAGGGAAGTTTTCAGATAGTTTCAGCCACCC600ACAAAAAAATCCCCACTATAGAAAGAAGCCATAAAAATAC640TGAATTGAGCCAAAACTTCAGCCCAAAGTCAGTGCTTATT680AGGCAACAGATACTTCCCAGAGAAAAAACACCACCAAAAT720GTGAAATACAAGGAAACAGCCTCAAACAGAATTCACAATT760ACTTAATCAACCAAAAATTACAGCAGATAAACGCTATAAA800TGTAGTCTGTGTGAAAAAACCTTCATTAACACTTCATCCC840TTCGTAAACATGAGAAAAACCATAGTGGAGAGAAACTATT880TAAGTGTAAAGAATGTTCAAAAGCCTTTAGCCAAAGTTCA920GCTCTTATTCAACATCAAATAACGCATACTGGAGAGAAAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。