基因總覽
zinc finger protein 35 是由 ZNF35 編碼的蛋白質。資料將其描述為可能參與轉錄調控,並指出它與細胞分化及/或增殖相關;現有資訊未進一步說明其調控對象或具體作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000396056 ★ | 44,648,732–44,660,791 | 4 |
| ENST00000399560 | 44,648,720–44,665,331 | 3 |
| ENST00000296092 | 44,648,720–44,665,331 | 3 |
| ENST00000453164 | 44,648,720–44,665,331 | 3 |
| ENST00000865407 | 44,648,720–44,665,331 | 4 |
| ENST00000865408 | 44,648,720–44,665,331 | 3 |
| ENST00000989024 | 44,648,720–44,665,331 | 3 |
| ENST00001142308 | 44,648,720–44,665,331 | 4 |
| ENST00000432115 | 44,648,741–44,652,701 | 3 |
| ENST00000415571 | 44,648,741–44,658,765 | 4 |
| ENST00000921897 | 44,648,785–44,665,331 | 4 |
| ENST00001065000 | 44,648,785–44,665,331 | 3 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF35 可能參與轉錄調控,但目前提供的資料未說明其作用於哪些基因或轉錄步驟,也未交代調控方向及其分子機制,因此其轉錄調控角色仍只能概括描述。
此外,資料指出 ZNF35 與細胞分化及/或增殖有關。這項描述未區分兩者是否同時涉及,也沒有提供特定細胞類型、實驗條件或作用結果,故無法據此判定其在這些細胞過程中的具體功能。
Promoter 與基因調控
>ZNF35 ENST00000396056 GRCh38 chr3:44647732-44648832 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATTCTCAAAATGATAAAACTATAGAGATGAAAAATGGATTAATGGTTGCCAAAGGTTAGGGATGGTGGGA GGAAAAATGGGGAGAGGGTTGGATGGAACTATTAAAAGGTAGCACCAGAAAGGTCTTTGTGGTGATGGAA CACTTGTGTATCTTGATTGCAGTGGTGGTTACACAAATCTATAGGTGCTATACCTATACACACATACTGT ACCAATGTTGATTTCCTTTTTCATTTTATGTAAGATGTAACCATGAGGGGAAAGTGGGTGAAGGGTGCTA TCTTTGCAACTTCCTGTGATTCTATCATTTCAAAATAAAAAGTAAAAACCAACAATGGCAACGAAAACCC AAAACTAAAGAGCTGTAACCAACTAAAGTGTGTGAAACTGATTTGAAAAAAAGTTATAAAATACATGTTT TAGGACAGTTGGGAAATTTGAATATGACTGGTTATTAGATGGTATTAGGGAATTTTTGTTGATTTTCTTA CCTGTGACGGTGGTGGTAGTTTGAAGAATATTCTTAATCTTAAGGGATGCATGTTGAAGTATTTGGAATG AAGTGTTCTGATGTTTACAACTTTCAAAAAAATGATTTTAAATATGTATTGAGAGATCAGGCAAACATAG CAAAATGTTCATTGTTGAGTCCACATGGAAAATACGGGTATTCAATGTGCCATACTTTCAACTCTTCTGT ACTCTGATATTTTCAAAATAAAACATTTGAGGGGAAATTATCAGGGCTTTCTACAGATTAATGCTGTGTA GCTTCAGGCTCTTGGGTGCGCGCCTCGCCTGAGTGTCTCATCCCTGCTTGGGATGCGCCCCTCCCTGAGG CTCACTTAGAGCTTCCAACAGCACAATCCTCCTAAGCGCTTCTGCCCCATCCCTGGTCTGGGGCGACATT GGACACCCATCGAGAGGAAAGCACCTCCGAGGTTCCTAGAGAGGCCGGCTTGGCGACTTGGGGAGCCGGA AGCCCATCCCGAGGCACTTCCTGTCCGGTCATTGTTCTCGTGCCGGTAGAAGCTGAAGTACCGGTCAGCC AGCCTCCTGCTGCAGAGCCAGTGAACTCAGGTCGGGCTTCTCAGCTGCGCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF35_1 ↗ | 3:44,648,742 | 正股 | 44,648,693–44,648,752 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_9MPH5 · promoter · 44648365–44648755 · regulatory
ENSR3_BBT8M · enhancer · 44648756–44649394 · regulatory
· motif · 44645008–44645019 · motif
· motif · 44648457–44648468 · motif
· motif · 44648704–44648715 · motif
· motif · 44648706–44648715 · motif
· motif · 44648726–44648735 · motif
· motif · 44651100–44651113 · motif
· motif · 44651100–44651113 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:527 aa
zinc finger protein 35 屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,長度為 527 個胺基酸。其序列包含 11 個 C2H2-type Zinc finger,位於胺基酸 222–524;另有一段標註為 Globular domain 的區域(9–221),以及一段標註為 Disordered 的區域(16–38)。
蛋白質三維結構
細胞內定位
zinc finger protein 35 的定位註記為細胞核。 現有資料未提供其定位變化的條件或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 30 個夥伴
- ARIH1Q9Y4X5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ATPAF2Q8N5M1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDR2Q01850 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDR2LQ86X02 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CWF19L2Q2TBE0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EEF2KMTQ96G04 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EXOC8Q8IYI6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FSD2A1L4K1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GEMIN4P57678 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA2Q08379 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRIPAP1Q4V328 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOMER3Q9NSC5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOOK1Q9UJC3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOOK2Q96ED9-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LZTS1Q9Y250 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAP3K20Q9NYL2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MCCP23508 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYD88Q99836 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NDEL1Q9GZM8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIBF1Q4G0R1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PICK1Q9NRD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PNMA1Q8ND90 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CTGTCCGGTCATTGTTCTCGTGCCGGTAGAAGCTGAAGTA40CCGGTCAGCCAGCCTCCTGCTGCAGAGCCAGTGAACTCAG80GTCGGGCTTCTCAGCTGCGCACATAGGCAGTACTCATCTT120GGCCCTGGGAAGAAACTCAAGAAGAAGCTTTTGAAACATA160AAGCTTGGATGGGGTTTGACCTCTGCAGGGCAGCGCCCAG200CTATAGGAGTTCCCCTGCTGAGCAGAGAAGATGACTGCAG240AATTGAGAGAAGCCATGGCCCTAGCCCCATGGGGCCCAGT280GAAGGTGAAAAAGGAGGAGGAAGAAGAAGAAAACTTCCCA320GGTCAGGCATCCAGCCAACAAGTGCACTCCGAGAACATCA360AAGTCTGGGCCCCAGTGCAGGGTCTTCAGACAGGCCTTGA400TGGATCAGAAGAGGAAGAAAAGGGTCAGAACATATCCTGG440GATATGGCGGTAGTCCTGAAAGCAACTCAGGAGGCACCTG480CTGCTTCAACCCTTGGCAGCTACTCATTACCAGGGACTCT520GGCCAAGAGTGAGATACTGGAGACTCATGGGACCATGAAC560TTTCTAGGTGCTGAAACCAAGAACCTACAGTTACTGGTTC600CAAAAACTGAGATATGTGAGGAAGCTGAAAAACCCCTCAT640CATATCAGAAAGAATCCAGAAAGCTGATCCTCAAGGACCT680GAGTTAGGAGAAGCTTGTGAAAAGGGAAACATGTTAAAGA720GGCAGAGAATAAAGAGAGAAAAGAAAGATTTCAGACAAGT760GATAGTGAATGACTGTCACTTACCTGAAAGCTTCAAAGAA800GAGGAAAACCAGAAATGTAAGAAATCTGGAGGAAAATATA840GCCTTAATTCTGGCGCTGTTAAAAATCCAAAAACCCAGCT880TGGACAAAAGCCTTTTACGTGTAGCGTGTGTGGGAAAGGA920TTTAGTCAGAGTGCAAACCTCGTTGTGCATCAGCGAATCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。