演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF35HF.10

zinc finger protein 35

ZNF35 是一種可能參與轉錄調控的蛋白質,並與細胞分化及/或增殖相關。

Homo sapiens3p21.31UniProt P13682
OFFICIAL SYMBOL
ZNF35
CHROMOSOME
3
UNIPROT
P13682
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

zinc finger protein 35 是由 ZNF35 編碼的蛋白質。資料將其描述為可能參與轉錄調控,並指出它與細胞分化及/或增殖相關;現有資訊未進一步說明其調控對象或具體作用方式。

Official symbol
ZNF35
Gene name
zinc finger protein 35
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13099
UniProt
P13682
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HF.10HF10Zfp105

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p21.31
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegZNF35pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr3:44,648,720–44,665,331
Gene span
16,612 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000396056 ★44,648,732–44,660,7914
ENST0000039956044,648,720–44,665,3313
ENST0000029609244,648,720–44,665,3313
ENST0000045316444,648,720–44,665,3313
ENST0000086540744,648,720–44,665,3314
ENST0000086540844,648,720–44,665,3313
ENST0000098902444,648,720–44,665,3313
ENST0000114230844,648,720–44,665,3314
ENST0000043211544,648,741–44,652,7013
ENST0000041557144,648,741–44,658,7654
ENST0000092189744,648,785–44,665,3314
ENST0000106500044,648,785–44,665,3313

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF35 可能參與轉錄調控,但目前提供的資料未說明其作用於哪些基因或轉錄步驟,也未交代調控方向及其分子機制,因此其轉錄調控角色仍只能概括描述。

此外,資料指出 ZNF35 與細胞分化及/或增殖有關。這項描述未區分兩者是否同時涉及,也沒有提供特定細胞類型、實驗條件或作用結果,故無法據此判定其在這些細胞過程中的具體功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 44648732 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF35 ENST00000396056 GRCh38 chr3:44647732-44648832 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATTCTCAAAATGATAAAACTATAGAGATGAAAAATGGATTAATGGTTGCCAAAGGTTAGGGATGGTGGGA
GGAAAAATGGGGAGAGGGTTGGATGGAACTATTAAAAGGTAGCACCAGAAAGGTCTTTGTGGTGATGGAA
CACTTGTGTATCTTGATTGCAGTGGTGGTTACACAAATCTATAGGTGCTATACCTATACACACATACTGT
ACCAATGTTGATTTCCTTTTTCATTTTATGTAAGATGTAACCATGAGGGGAAAGTGGGTGAAGGGTGCTA
TCTTTGCAACTTCCTGTGATTCTATCATTTCAAAATAAAAAGTAAAAACCAACAATGGCAACGAAAACCC
AAAACTAAAGAGCTGTAACCAACTAAAGTGTGTGAAACTGATTTGAAAAAAAGTTATAAAATACATGTTT
TAGGACAGTTGGGAAATTTGAATATGACTGGTTATTAGATGGTATTAGGGAATTTTTGTTGATTTTCTTA
CCTGTGACGGTGGTGGTAGTTTGAAGAATATTCTTAATCTTAAGGGATGCATGTTGAAGTATTTGGAATG
AAGTGTTCTGATGTTTACAACTTTCAAAAAAATGATTTTAAATATGTATTGAGAGATCAGGCAAACATAG
CAAAATGTTCATTGTTGAGTCCACATGGAAAATACGGGTATTCAATGTGCCATACTTTCAACTCTTCTGT
ACTCTGATATTTTCAAAATAAAACATTTGAGGGGAAATTATCAGGGCTTTCTACAGATTAATGCTGTGTA
GCTTCAGGCTCTTGGGTGCGCGCCTCGCCTGAGTGTCTCATCCCTGCTTGGGATGCGCCCCTCCCTGAGG
CTCACTTAGAGCTTCCAACAGCACAATCCTCCTAAGCGCTTCTGCCCCATCCCTGGTCTGGGGCGACATT
GGACACCCATCGAGAGGAAAGCACCTCCGAGGTTCCTAGAGAGGCCGGCTTGGCGACTTGGGGAGCCGGA
AGCCCATCCCGAGGCACTTCCTGTCCGGTCATTGTTCTCGTGCCGGTAGAAGCTGAAGTACCGGTCAGCC
AGCCTCCTGCTGCAGAGCCAGTGAACTCAGGTCGGGCTTCTCAGCTGCGCA
ZNF35 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF35_1 ↗3:44,648,742正股44,648,693–44,648,752

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_9MPH5 · promoter · 44648365–44648755 · regulatory

ENSR3_BBT8M · enhancer · 44648756–44649394 · regulatory

· motif · 44645008–44645019 · motif

· motif · 44648457–44648468 · motif

· motif · 44648704–44648715 · motif

· motif · 44648706–44648715 · motif

· motif · 44648726–44648735 · motif

· motif · 44651100–44651113 · motif

· motif · 44651100–44651113 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:527 aa

1 aa527 aa功能區域鋅指
依 P13682 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 35 屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,長度為 527 個胺基酸。其序列包含 11 個 C2H2-type Zinc finger,位於胺基酸 222–524;另有一段標註為 Globular domain 的區域(9–221),以及一段標註為 Disordered 的區域(16–38)。

鋅指C2H2-type 1222–244 aa
鋅指C2H2-type 2250–272 aa
鋅指C2H2-type 3278–300 aa
鋅指C2H2-type 4306–328 aa
鋅指C2H2-type 5334–356 aa
鋅指C2H2-type 6362–384 aa
鋅指C2H2-type 7390–412 aa
鋅指C2H2-type 8418–440 aa
鋅指C2H2-type 9446–468 aa
鋅指C2H2-type 10474–496 aa
鋅指C2H2-type 11502–524 aa
功能區域Globular domain9–221 aa
功能區域Disordered16–38 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P13682…

AlphaFold · P13682

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

zinc finger protein 35 的定位註記為細胞核。 現有資料未提供其定位變化的條件或動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 30 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HF.10ZNF35ARIH1ATPAF2CDR2CDR2LCEP70CWF19L2EEF2KMTEXOC8FSD2GEMIN4GOLGA2GOLGA6L9GRIPAP1HOMER3HOOK1HOOK2LZTS1MAP3K20MCCMTUS2MYD88NDEL1PIBF1PICK1PNMA1PRKAR1BTRAF2YJU2BZBTB8AZGPAT
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 30 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF35 可能參與轉錄調控,並與細胞分化及/或增殖相關;資料未說明具體調控機制,也未指出分化與增殖是否同時受到影響。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation. Involved in cell differentiation and/or proliferation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF35 的細胞內定位註記為細胞核。這筆資料僅提供核定位資訊,未說明定位變化條件、研究系統或其他定位情形。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000396056 · 2,658 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTGTCCGGTCATTGTTCTCGTGCCGGTAGAAGCTGAAGTA40
41CCGGTCAGCCAGCCTCCTGCTGCAGAGCCAGTGAACTCAG80
81GTCGGGCTTCTCAGCTGCGCACATAGGCAGTACTCATCTT120
121GGCCCTGGGAAGAAACTCAAGAAGAAGCTTTTGAAACATA160
161AAGCTTGGATGGGGTTTGACCTCTGCAGGGCAGCGCCCAG200
201CTATAGGAGTTCCCCTGCTGAGCAGAGAAGATGACTGCAG240
241AATTGAGAGAAGCCATGGCCCTAGCCCCATGGGGCCCAGT280
281GAAGGTGAAAAAGGAGGAGGAAGAAGAAGAAAACTTCCCA320
321GGTCAGGCATCCAGCCAACAAGTGCACTCCGAGAACATCA360
361AAGTCTGGGCCCCAGTGCAGGGTCTTCAGACAGGCCTTGA400
401TGGATCAGAAGAGGAAGAAAAGGGTCAGAACATATCCTGG440
441GATATGGCGGTAGTCCTGAAAGCAACTCAGGAGGCACCTG480
481CTGCTTCAACCCTTGGCAGCTACTCATTACCAGGGACTCT520
521GGCCAAGAGTGAGATACTGGAGACTCATGGGACCATGAAC560
561TTTCTAGGTGCTGAAACCAAGAACCTACAGTTACTGGTTC600
601CAAAAACTGAGATATGTGAGGAAGCTGAAAAACCCCTCAT640
641CATATCAGAAAGAATCCAGAAAGCTGATCCTCAAGGACCT680
681GAGTTAGGAGAAGCTTGTGAAAAGGGAAACATGTTAAAGA720
721GGCAGAGAATAAAGAGAGAAAAGAAAGATTTCAGACAAGT760
761GATAGTGAATGACTGTCACTTACCTGAAAGCTTCAAAGAA800
801GAGGAAAACCAGAAATGTAAGAAATCTGGAGGAAAATATA840
841GCCTTAATTCTGGCGCTGTTAAAAATCCAAAAACCCAGCT880
881TGGACAAAAGCCTTTTACGTGTAGCGTGTGTGGGAAAGGA920
921TTTAGTCAGAGTGCAAACCTCGTTGTGCATCAGCGAATCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。