基因總覽
ZNF34 的正式名稱為 zinc finger protein 34,屬於蛋白質編碼基因。其產物可能參與轉錄調控;現有資料未提供更具體的調控對象或作用方式,因此無法進一步界定其主要生物學角色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000429371 ★ | 144,772,224–144,787,317 | 6 |
| ENST00000714360 | 144,772,224–144,782,588 | 7 |
| ENST00000714361 | 144,772,224–144,782,826 | 7 |
| ENST00000714362 | 144,772,224–144,782,826 | 6 |
| ENST00000714363 | 144,772,224–144,787,284 | 7 |
| ENST00000714364 | 144,772,224–144,787,284 | 7 |
| ENST00000714365 | 144,772,224–144,787,348 | 7 |
| ENST00000714366 | 144,772,224–144,787,348 | 7 |
| ENST00000714367 | 144,772,224–144,787,348 | 7 |
| ENST00000714368 | 144,772,224–144,787,348 | 5 |
| ENST00000714369 | 144,772,224–144,787,348 | 6 |
| ENST00000343459 | 144,772,224–144,787,304 | 6 |
顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF34 的蛋白質產物可能參與轉錄調控。此描述指出其可能與調節轉錄有關,但沒有說明調控的基因或轉錄過程中的具體步驟,也未提供其作用方向、分子機制或功能發生條件。因此,目前只能將轉錄調控視為可能的功能,不能據此判定它會促進或抑制特定基因的表現。
Promoter 與基因調控
>ZNF34 ENST00000429371 GRCh38 chr8:144787217-144788317 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AACTGGCTGCGCGGTGGTTCCTGGCTGTCATGGTCCACGCTGTCTCTAGAGAACCTTACCCCCCATTTCG TGATCTTGCTTTCCTGATCCTGCTGGTATGGCCCCACCTGTCTTTGGGCGCCCACCACACCTAGGCAGTG ACCCAGCAGGGCCTGTTTATTTTAGACAGGCTCTCGCTATTGCCAGGCTGGTCTCAAGCCCCTGGCCTCA TGTGGTCCTCCCACTCCAGCCCCGCCTCCCCGCCAGTAACTACGGGACCTGGTTTTGATCTCGTCATTCG CAGGGCCGGTCCCAGGGTCCCAGCTGACTTGTCGAGAAAGAATCCAGGAGGGCGGTGTTTCCTCCTGAAG GATGGAGGGGCATCTGGAAAGAGGGTTTTGGGAAAGCACTAGATGCTTAGCTTGGCCATAAGCGGTCACT GTTTTTCTGCTCCCTTCTGGGCAAAGTGGACGGCAGGGCTTGGCCGATGGACCGGCCATGAGGGAAAGTT TGTTCCAGAAGCAGCTCAGGCACCCGAAAAACCCTTTCTCCAGAGTGGACACTGGGCCCCATTTACAGGA GTTAAGGATGAGGAGCAATAGGTTAAACCCAAGACAGGCTTCTTTGGCCAGTAAGCATCCTTTCTTGGCC CTAAGGAAGGGTGCGGTTCCCGTTTCTCTGTAAATCGAAGGGCCTAGTTCTTGTTTGCGGCGCCTTTCGT GCATCATTAGGGAGAGAATTTCTCAGAAAAAGGGAAAGACTAATATGTTTTCGCCTCTGACCATCGCCCC AGTTCTGAGGCCTCTGGGCCGTGGCTTCGGACTGCCACCCGGTGGCAGCATTCCCGCTTTACGGCTTTGC CATTCGCGGGTCCCCGGAGCCTTACTGCAAGCCAGGGAGGTGGGCAGCCGACACGCGGCGTCCTAGCTTC CCAGAGCGGCCCGGACGGCGCCTCGGACCCAGACAGTCGGCTGACGTCACTTCCGGATCGGTTCCGATTG GCGGGGAGGGAGGGCCGAACGGGCGAGGTTGGGCTGCCGTGCTGCTCGGCGGCGCTGAGGTGAGTGTGAG CCCGGCGGGGGCGGGCGCGCGGGGCGCAGACCCTCCCGGCGCAGACCCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF34_1 ↗ | 8:144,787,313 | 負股 | 144,787,303–144,787,362 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_CJCWK · enhancer · 144785599–144787273 · regulatory
ENSR8_B33PS9 · promoter · 144787274–144787838 · regulatory
ENSR8_5393HDJ · CTCF_binding_site · 144787497–144787520 · regulatory
· motif · 144784853–144784865 · motif
· motif · 144786079–144786092 · motif
· motif · 144786079–144786092 · motif
· motif · 144786558–144786572 · motif
· motif · 144786857–144786872 · motif
· motif · 144786903–144786916 · motif
· motif · 144787136–144787147 · motif
· motif · 144787138–144787147 · motif
· motif · 144787152–144787162 · motif
· motif · 144787349–144787360 · motif
· motif · 144787349–144787360 · motif
· motif · 144787351–144787360 · motif
· motif · 144787356–144787369 · motif
· motif · 144787356–144787369 · motif
· motif · 144787499–144787515 · motif
· motif · 144787501–144787517 · motif
· motif · 144787660–144787680 · motif
· motif · 144788337–144788354 · motif
· motif · 144788354–144788369 · motif
· motif · 144788486–144788497 · motif
· motif · 144789520–144789528 · motif
· motif · 144791778–144791793 · motif
· motif · 144792039–144792050 · motif
· motif · 144792039–144792050 · motif
· motif · 144792207–144792217 · motif
· motif · 144792224–144792234 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:560 aa
zinc finger protein 34 長 560 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質含有一個 KRAB 區域,以及 12 個 C2H2 型 zinc finger;另有一段被註記為無序區域。這些結構註解描述蛋白質組成,來源未提供各區域的具體作用。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZNF34 的蛋白質定位記為細胞核;未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- KRTAP10-5P60370 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VAC14Q08AM6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GGGCGAGGTTGGGCTGCCGTGCTGCTCGGCGGCGCTGAGG40CCAAATAGTTGCATCACATGTATCTAATCCGAGAGTCTCA80TGCTTCTGGTAGCTCCTCAGTGACCAGCTCCTGCTCACTG120CCCTCAGAAAGCCCAACCCTCAGGCAATGGCGGCCTTGTT160CCTGTCTGCCCCACCCCAGGCCGAGGTGACCTTCGAGGAC200GTGGCTGTGTACCTCTCCCGGGAGGAATGGGGCCGCCTGG240GCCCTGCTCAGAGGGGCCTCTACAGGGACGTGATGCTGGA280GACCTACGGGAACCTAGTCTCACTGGGAGTAGGACCTGCA320GGCCCCAAGCCTGGAGTGATCTCGCAGTTGGAGCGAGGGG360ATGAGCCCTGGGTCCTGGATGTTCAGGGCACCTCTGGGAA400AGAGCACCTGAGAGTCAACAGCCCAGCTCTTGGGACCAGA440ACTGAGTACAAGGAGTTGACTTCACAGGAGACATTTGGTG480AGGAAGATCCCCAGGGATCTGAGCCAGTAGAAGCCTGTGA520CCACATCAGTAAGTCAGAGGGGAGCCTGGAAAAGCTAGTG560GAGCAGAGAGGCCCCAGGGCAGTCACACTGACCAACGGGG600AGAGCAGCAGGGAGTCTGGGGGAAACCTCAGGTTGCTGTC640AAGACCTGTTCCTGATCAGAGACCTCACAAATGTGATATA680TGTGAGCAAAGTTTTGAACAGAGATCATATCTCAACAACC720ATAAGCGTGTACACAGGTCAAAAAAAACAAATACAGTTCG760TAACTCTGGGGAAATCTTCAGTGCAAACTTAGTTGTTAAA800GAAGATCAGAAAATTCCTACTGGGAAAAAATTGCATTATT840GCAGTTACTGTGGGAAAACATTCAGGTACAGTGCCAACCT880TGTCAAGCATCAGCGGCTTCACACTGAAGAGAAGCCCTAC920AAATGTGATGAGTGTGGGAAAGCCTTCAGCCAGAGCTGCG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。