演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF33BKOX31

zinc finger protein 33B

ZNF33B 是含 KRAB 與多個 C2H2 型鋅指的蛋白質,可能參與轉錄調控;在日本腦炎病毒感染相關研究中,也與病毒複製及 NS5 蛋白修飾有關。

Homo sapiens10q11.21UniProt Q06732
OFFICIAL SYMBOL
ZNF33B
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q06732
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF33B(zinc finger protein 33B)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質全長 778 個胺基酸,具有位於 N 端的 KRAB domain,以及排列於蛋白質後段的 16 個 C2H2 型鋅指。來源指出,ZNF33B 可能參與轉錄調控;另有感染相關資料描述其與日本腦炎病毒複製的關係。這些資料呈現了它的家族歸屬、主要結構特徵及已報告的角色,但未提供更廣泛的生理功能或一般細胞條件下的作用細節。

Official symbol
ZNF33B
Gene name
zinc finger protein 33B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13097
UniProt
Q06732
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX31KOX2ZNF11B

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q11.21
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegZNF33Bpq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr10:42,572,956–42,638,863
Gene span
65,908 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000359467 ★42,589,109–42,638,5705
ENST0000046207542,574,185–42,594,6672
ENST0000099964242,581,583–42,638,7486
ENST0000103659442,581,583–42,638,7487
ENST0000110624742,581,604–42,638,7486
ENST0000046520642,582,691–42,632,3674
ENST0000109251242,582,696–42,638,7485
ENST0000061341942,589,107–42,632,9124
ENST0000113495742,589,109–42,638,7485
ENST0000099964342,589,111–42,638,7486
ENST0000107568842,589,135–42,638,1585
ENST0000087641442,589,784–42,638,7485

顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF33B 可能參與轉錄調控,但現有資料未進一步說明其調控的基因、作用方向或細胞情境,因此不宜將這項可能性延伸為特定的轉錄機制。

在日本腦炎病毒感染相關情境中,ZNF33B 被報告可促進病毒複製。其作用與病毒 RNA 的穩定性,以及病毒聚合酶 NS5 的蛋白質修飾狀態有關:ZNF33B 穩定病毒 RNA,並抑制 NS5 的 Lys-63 連結型多聚泛素化。

同一感染情境下,ZNF33B 促進 NS5 的 SUMO 化。來源指出,這種修飾會與 NS5 的泛素化及降解相競爭;因此,ZNF33B 所促進的 SUMO 化及其對 Lys-63 連結型多聚泛素化的抑制,與 NS5 的降解調控及病毒複製促進相關。這些描述限於日本腦炎病毒感染研究,並未說明此作用是否適用於其他病毒或未感染的細胞。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 42638570 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF33B ENST00000359467 GRCh38 chr10:42638470-42639570 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTAAATGTTTCAATACTGTATACATGTGAATTTTATCACGTGTGATCTATATATATCTCTATATTCCAAA
TTGTTAGGAATGACATGCTCTTTGGAATACTCCATTCTTTCCCTCACTGTTTTGAAATGCTGTATTTACT
ACACATTAAAGAATACTCTCAATCATGGTGTCTTATTTCCATGGAGCAGGTGCCAAACTACTTTGAATAG
AGCAATATTATATATATAGATAGATATAGATATTTCTCAGGCATTTTTTCAAGCTTTTTAAAACGTATAA
TGGCTGTTCATTTAGTTTTTTACTTACTCTGGATAAAGTTGACAATGCTTTTGTAAAGTACACAATACAC
TAAAGATCAAAGAGAAAAAATACATAAAAAAATTTGTTGATATTCTTTTAGGAATTTTGTCTTCCTAAGA
AAGGTACAGATAGACTAAATGTATTTCCATTTAGTCAAGCAATTTTAATGTCACAGGGGAAATCATGTGA
CATTTATTTTCTTCTTTCGGATTATGTCTATTTTCTGACTTTTCAATTTCCGTTTATTGCGTTAACGATT
TTGATGAAGTAGCTTTCCTGTGGCACCTCCCCCATCCCCCCCATCCCTGCTCTCAAAGAATCGCTGATAG
TGTCAAAGTCTTTTAAACTGTATCAATAAGATCTACTTCCTAACATTTAAAGTGAAACTGACACACAGCT
GTCCTTTCCTTGAGGCGTCTGTGTCTAACCTGCACACTTGCTGCACACAGACCTCCCCTGCAGTGCATCC
CTTTGGGTCGCCCCGGGAGAGCCAGGGCTGCGGGCAGTTCCCACACCAACTCAGACCGCATCTGTCCACT
GCCTAGCGGGGCACCTCTCTGCCAATCCCGAAGGGCTGCTCTCGCGTCCTCACGGGAAAGGTAGTTTCCA
GGTTGGGCGCCAACAGCGCCAGGCTTTGAGCGTGGGCTCTGCGCATGCCTCATCCACTGGCTACCTCTGC
GTTTCTGCGTTTCCGCCTTTCCTTTTGTTTGTCTCACGTTTTGCGTGGGAGGCGGTCCCGGGATTTCAGG
GGTCTACCGGCTCTCTTATGGCGAATGCAACCCGAAGAGAGAGTGAGGTAA
ZNF33B 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF33B_1 ↗10:42,638,570負股42,638,560–42,638,619

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_BBGGN · promoter · 42637815–42638340 · regulatory

ENSR10_838SW2 · enhancer · 42638341–42638559 · regulatory

ENSR10_9LWXL · promoter · 42638560–42639060 · regulatory

ENSR10_9LWZ8 · enhancer · 42640790–42641233 · regulatory

· motif · 42637557–42637572 · motif

· motif · 42637558–42637572 · motif

· motif · 42637559–42637572 · motif

· motif · 42637705–42637720 · motif

· motif · 42637873–42637886 · motif

· motif · 42638218–42638229 · motif

· motif · 42638218–42638229 · motif

· motif · 42638226–42638237 · motif

· motif · 42638572–42638583 · motif

· motif · 42638610–42638621 · motif

· motif · 42638610–42638621 · motif

· motif · 42638943–42638954 · motif

· motif · 42639025–42639036 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:778 aa

1 aa778 aa結構域鋅指
依 Q06732 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF33B 蛋白質長 778 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 KRAB domain 位於第 12–83 個胺基酸;第 329–771 個胺基酸區段則包含 16 個依序排列的 C2H2-type zinc finger。

結構域KRAB12–83 aa
鋅指C2H2-type 1329–351 aa
鋅指C2H2-type 2357–379 aa
鋅指C2H2-type 3385–407 aa
鋅指C2H2-type 4413–435 aa
鋅指C2H2-type 5441–463 aa
鋅指C2H2-type 6469–491 aa
鋅指C2H2-type 7497–519 aa
鋅指C2H2-type 8525–547 aa
鋅指C2H2-type 9553–575 aa
鋅指C2H2-type 10581–603 aa
鋅指C2H2-type 11609–631 aa
鋅指C2H2-type 12637–659 aa
鋅指C2H2-type 13665–687 aa
鋅指C2H2-type 14693–715 aa
鋅指C2H2-type 15721–743 aa
鋅指C2H2-type 16749–771 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q06732…

AlphaFold · Q06732

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm

ZNF33B 被記錄於細胞核與細胞質。 現有資料未說明其定位是否會隨感染、條件或異構型而改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX31ZNF33BMAGEA12
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

在日本腦炎病毒感染相關情境中,ZNF33B 與病毒蛋白 NS5 有交互作用。現有資料未指出兩者是否形成更大型複合體;此處所述為蛋白質交互作用,不延伸推定其他結合夥伴。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF33B 可能參與轉錄調控;此描述保留可能性的限定,來源未說明受調控的基因、作用方向或發生此作用的具體條件。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

功能在日本腦炎病毒感染情境中,ZNF33B 促進病毒複製,並藉由穩定病毒 RNA、抑制病毒聚合酶 NS5 的 Lys-63 連結型多聚泛素化,以及促進 NS5 SUMO 化發揮作用;SUMO 化與泛素化及降解相競爭。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Facilitates Japanese encephalitis virus replication by stabilizing viral RNA and inhibiting 'Lys-63'-linked polyubiquitination of viral polymerase NS5. Instead, promotes NS5 SUMOylation that competes with its ubiquitination and degradation

PMID 40919930 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在日本腦炎病毒感染情境中,ZNF33B 與日本腦炎病毒蛋白 NS5 有交互作用;來源未提供更具體的結合方式或複合體資訊。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with Japanese encephalitis virus protein NS5

PMID 40919930 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF33B 的細胞內定位記錄為細胞核與細胞質;此資料未描述定位改變的條件或不同異構型之間的差異。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm

PMID 40919930 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000359467 · 5,982 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCTTTTGTTTGTCTCACGTTTTGCGTGGGAGGCGGTCCCG40
41GGATTTCAGGGGTCTACCGGCTCTCTTATGGCGAATGCAA80
81CCCGAAGAGAGAGTGAGCTGTATCTTCAGAGTTGTCTCCG120
121TCTTTCCAAGAACAGAACAAAATGAACAAGGTAGATCAGA160
161AGTTCCAGGGGTCAGTATCATTTAAAGATGTGACTGTGGG200
201CTTCACCCAGGAGGAGTGGCAGCACCTGGACCCTAGTCAG240
241AGGGCTCTGTATAGAGATGTGATGCTGGAGAACTACAGCA280
281ACCTTGTCTCAGTGGGGTATTGTGCTCACAAACCAGAGGT320
321GATCTTCAGGCTGGAACAAGGAGAAGAACCATGGAGACTG360
361GAGGAAGAATTCCCAAGCCAGAGCTTTCCAGAAGTCTGGA400
401CAGCTGATCACCTGAAAGAGAGGAGCCAAGAAAATCAATC440
441TAAACATTTGTGGGAAGTTGTATTCATCAATAATGAAATG480
481CTGACTAAGGAACAAGGTAATGTAATAGGAATACCATTTA520
521ACATGGACGTAAGTTCTTTTCCTTCCAGAAAAATGTTCTG560
561TCAGTATGACTCACGTGGAATGAGTTTCAACACTGTTTCA600
601GAATTGGTTATCAGTAAGATAAACTATTTAGGAAAAAAGT640
641CTGACGAATTTAATGCATGTGGGAAATTGTTACTCAATAT680
681TAAGCATGATGAAACTCATACTCGAGAGAAAAATGAAGTT720
721TTGAAAAATAGGAACACTCTGAGTCATCGTGAGAACACTT760
761TGCAGCATGAGAAGATTCAAACTTTAGACCACAATTTTGA800
801ATACAGTATATGTCAGGAAACCCTCCTTGAAAAGGCAGTA840
841TTCAATACACGGAAGAGAGAGAATGCAGAAGAGAATAACT880
881GTGACTATAATGAATTTGGGAGAACTTTCTGTGATAGTTC920
921ATCCCTCTTGTTCCATCAGATACCTCCATCAAAGGACAGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。