基因總覽
ZNF33B(zinc finger protein 33B)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質全長 778 個胺基酸,具有位於 N 端的 KRAB domain,以及排列於蛋白質後段的 16 個 C2H2 型鋅指。來源指出,ZNF33B 可能參與轉錄調控;另有感染相關資料描述其與日本腦炎病毒複製的關係。這些資料呈現了它的家族歸屬、主要結構特徵及已報告的角色,但未提供更廣泛的生理功能或一般細胞條件下的作用細節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000359467 ★ | 42,589,109–42,638,570 | 5 |
| ENST00000462075 | 42,574,185–42,594,667 | 2 |
| ENST00000999642 | 42,581,583–42,638,748 | 6 |
| ENST00001036594 | 42,581,583–42,638,748 | 7 |
| ENST00001106247 | 42,581,604–42,638,748 | 6 |
| ENST00000465206 | 42,582,691–42,632,367 | 4 |
| ENST00001092512 | 42,582,696–42,638,748 | 5 |
| ENST00000613419 | 42,589,107–42,632,912 | 4 |
| ENST00001134957 | 42,589,109–42,638,748 | 5 |
| ENST00000999643 | 42,589,111–42,638,748 | 6 |
| ENST00001075688 | 42,589,135–42,638,158 | 5 |
| ENST00000876414 | 42,589,784–42,638,748 | 5 |
顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF33B 可能參與轉錄調控,但現有資料未進一步說明其調控的基因、作用方向或細胞情境,因此不宜將這項可能性延伸為特定的轉錄機制。
在日本腦炎病毒感染相關情境中,ZNF33B 被報告可促進病毒複製。其作用與病毒 RNA 的穩定性,以及病毒聚合酶 NS5 的蛋白質修飾狀態有關:ZNF33B 穩定病毒 RNA,並抑制 NS5 的 Lys-63 連結型多聚泛素化。
同一感染情境下,ZNF33B 促進 NS5 的 SUMO 化。來源指出,這種修飾會與 NS5 的泛素化及降解相競爭;因此,ZNF33B 所促進的 SUMO 化及其對 Lys-63 連結型多聚泛素化的抑制,與 NS5 的降解調控及病毒複製促進相關。這些描述限於日本腦炎病毒感染研究,並未說明此作用是否適用於其他病毒或未感染的細胞。
Promoter 與基因調控
>ZNF33B ENST00000359467 GRCh38 chr10:42638470-42639570 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTAAATGTTTCAATACTGTATACATGTGAATTTTATCACGTGTGATCTATATATATCTCTATATTCCAAA TTGTTAGGAATGACATGCTCTTTGGAATACTCCATTCTTTCCCTCACTGTTTTGAAATGCTGTATTTACT ACACATTAAAGAATACTCTCAATCATGGTGTCTTATTTCCATGGAGCAGGTGCCAAACTACTTTGAATAG AGCAATATTATATATATAGATAGATATAGATATTTCTCAGGCATTTTTTCAAGCTTTTTAAAACGTATAA TGGCTGTTCATTTAGTTTTTTACTTACTCTGGATAAAGTTGACAATGCTTTTGTAAAGTACACAATACAC TAAAGATCAAAGAGAAAAAATACATAAAAAAATTTGTTGATATTCTTTTAGGAATTTTGTCTTCCTAAGA AAGGTACAGATAGACTAAATGTATTTCCATTTAGTCAAGCAATTTTAATGTCACAGGGGAAATCATGTGA CATTTATTTTCTTCTTTCGGATTATGTCTATTTTCTGACTTTTCAATTTCCGTTTATTGCGTTAACGATT TTGATGAAGTAGCTTTCCTGTGGCACCTCCCCCATCCCCCCCATCCCTGCTCTCAAAGAATCGCTGATAG TGTCAAAGTCTTTTAAACTGTATCAATAAGATCTACTTCCTAACATTTAAAGTGAAACTGACACACAGCT GTCCTTTCCTTGAGGCGTCTGTGTCTAACCTGCACACTTGCTGCACACAGACCTCCCCTGCAGTGCATCC CTTTGGGTCGCCCCGGGAGAGCCAGGGCTGCGGGCAGTTCCCACACCAACTCAGACCGCATCTGTCCACT GCCTAGCGGGGCACCTCTCTGCCAATCCCGAAGGGCTGCTCTCGCGTCCTCACGGGAAAGGTAGTTTCCA GGTTGGGCGCCAACAGCGCCAGGCTTTGAGCGTGGGCTCTGCGCATGCCTCATCCACTGGCTACCTCTGC GTTTCTGCGTTTCCGCCTTTCCTTTTGTTTGTCTCACGTTTTGCGTGGGAGGCGGTCCCGGGATTTCAGG GGTCTACCGGCTCTCTTATGGCGAATGCAACCCGAAGAGAGAGTGAGGTAA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF33B_1 ↗ | 10:42,638,570 | 負股 | 42,638,560–42,638,619 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR10_BBGGN · promoter · 42637815–42638340 · regulatory
ENSR10_838SW2 · enhancer · 42638341–42638559 · regulatory
ENSR10_9LWXL · promoter · 42638560–42639060 · regulatory
ENSR10_9LWZ8 · enhancer · 42640790–42641233 · regulatory
· motif · 42637557–42637572 · motif
· motif · 42637558–42637572 · motif
· motif · 42637559–42637572 · motif
· motif · 42637705–42637720 · motif
· motif · 42637873–42637886 · motif
· motif · 42638218–42638229 · motif
· motif · 42638218–42638229 · motif
· motif · 42638226–42638237 · motif
· motif · 42638572–42638583 · motif
· motif · 42638610–42638621 · motif
· motif · 42638610–42638621 · motif
· motif · 42638943–42638954 · motif
· motif · 42639025–42639036 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:778 aa
ZNF33B 蛋白質長 778 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 KRAB domain 位於第 12–83 個胺基酸;第 329–771 個胺基酸區段則包含 16 個依序排列的 C2H2-type zinc finger。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF33B 被記錄於細胞核與細胞質。 現有資料未說明其定位是否會隨感染、條件或異構型而改變。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- MAGEA12P43365 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
在日本腦炎病毒感染相關情境中,ZNF33B 與病毒蛋白 NS5 有交互作用。現有資料未指出兩者是否形成更大型複合體;此處所述為蛋白質交互作用,不延伸推定其他結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF33B 可能參與轉錄調控;此描述保留可能性的限定,來源未說明受調控的基因、作用方向或發生此作用的具體條件。 | 資料庫紀錄 | |
| 功能 | 在日本腦炎病毒感染情境中,ZNF33B 促進病毒複製,並藉由穩定病毒 RNA、抑制病毒聚合酶 NS5 的 Lys-63 連結型多聚泛素化,以及促進 NS5 SUMO 化發揮作用;SUMO 化與泛素化及降解相競爭。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Facilitates Japanese encephalitis virus replication by stabilizing viral RNA and inhibiting 'Lys-63'-linked polyubiquitination of viral polymerase NS5. Instead, promotes NS5 SUMOylation that competes with its ubiquitination and degradation PMID 40919930 ↗ |
| 交互作用 | 在日本腦炎病毒感染情境中,ZNF33B 與日本腦炎病毒蛋白 NS5 有交互作用;來源未提供更具體的結合方式或複合體資訊。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ZNF33B 的細胞內定位記錄為細胞核與細胞質;此資料未描述定位改變的條件或不同異構型之間的差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCTTTTGTTTGTCTCACGTTTTGCGTGGGAGGCGGTCCCG40GGATTTCAGGGGTCTACCGGCTCTCTTATGGCGAATGCAA80CCCGAAGAGAGAGTGAGCTGTATCTTCAGAGTTGTCTCCG120TCTTTCCAAGAACAGAACAAAATGAACAAGGTAGATCAGA160AGTTCCAGGGGTCAGTATCATTTAAAGATGTGACTGTGGG200CTTCACCCAGGAGGAGTGGCAGCACCTGGACCCTAGTCAG240AGGGCTCTGTATAGAGATGTGATGCTGGAGAACTACAGCA280ACCTTGTCTCAGTGGGGTATTGTGCTCACAAACCAGAGGT320GATCTTCAGGCTGGAACAAGGAGAAGAACCATGGAGACTG360GAGGAAGAATTCCCAAGCCAGAGCTTTCCAGAAGTCTGGA400CAGCTGATCACCTGAAAGAGAGGAGCCAAGAAAATCAATC440TAAACATTTGTGGGAAGTTGTATTCATCAATAATGAAATG480CTGACTAAGGAACAAGGTAATGTAATAGGAATACCATTTA520ACATGGACGTAAGTTCTTTTCCTTCCAGAAAAATGTTCTG560TCAGTATGACTCACGTGGAATGAGTTTCAACACTGTTTCA600GAATTGGTTATCAGTAAGATAAACTATTTAGGAAAAAAGT640CTGACGAATTTAATGCATGTGGGAAATTGTTACTCAATAT680TAAGCATGATGAAACTCATACTCGAGAGAAAAATGAAGTT720TTGAAAAATAGGAACACTCTGAGTCATCGTGAGAACACTT760TGCAGCATGAGAAGATTCAAACTTTAGACCACAATTTTGA800ATACAGTATATGTCAGGAAACCCTCCTTGAAAAGGCAGTA840TTCAATACACGGAAGAGAGAGAATGCAGAAGAGAATAACT880GTGACTATAATGAATTTGGGAGAACTTTCTGTGATAGTTC920ATCCCTCTTGTTCCATCAGATACCTCCATCAAAGGACAGT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。