基因總覽
ZNF33A(zinc finger protein 33A)是蛋白質編碼基因,產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其蛋白質長 810 個胺基酸,具有 KRAB 結構域,並含有 16 個 C2H2 型鋅指。這些結構特徵是此蛋白質的主要辨識資訊;目前提供的資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未進一步說明具體作用方式或調控對象。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000432900 ★ | 38,010,675–38,060,087 | 5 |
| ENST00000867607 | 38,010,295–38,060,055 | 6 |
| ENST00000867609 | 38,010,474–38,059,385 | 6 |
| ENST00000628825 | 38,010,485–38,056,861 | 4 |
| ENST00001119981 | 38,010,518–38,058,103 | 6 |
| ENST00001099615 | 38,010,630–38,054,631 | 6 |
| ENST00001119982 | 38,010,638–38,058,099 | 6 |
| ENST00001123252 | 38,010,642–38,058,161 | 6 |
| ENST00001119984 | 38,010,645–38,035,832 | 5 |
| ENST00000307441 | 38,010,650–38,060,063 | 6 |
| ENST00000374618 | 38,010,650–38,060,063 | 5 |
| ENST00001123249 | 38,010,653–38,066,136 | 6 |
顯示 12/33 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF33A 可能參與轉錄調控。這項描述指出其可能與基因轉錄活動的調節有關,但來源沒有說明它促進或抑制轉錄,也未指出受調控的基因、細胞條件或特定生物學過程。因此,現有資訊支持的是一項概括性的功能可能性,而非已界定的分子機制。
來源亦未提供 ZNF33A 如何作用於轉錄的實驗細節,無法據此判斷其是否直接接觸 DNA、是否透過其他分子發揮作用,或其作用是否取決於特定複合體。KRAB 結構域及多個 C2H2 型鋅指是蛋白質的結構特徵,但此處資料未將它們與特定靶點或調控結果連結,故不能進一步推定其功能細節。
因此,ZNF33A 的生物學角色目前宜描述為可能參與轉錄調控;其調控方向、作用對象與生理情境仍未由所提供資料界定。
Promoter 與基因調控
>ZNF33A ENST00000432900 GRCh38 chr10:38009675-38010775 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCAAAAATTTTTACTCTTTTAGTGGTTTAAATGTTTAAGTATTGTATACATGTGAGATTTTATCATGTGT GATCTATGTATATCTCTACATTCCAAATTGCTCGGAATGACATGCTCTTTGGAATACTCCATTCTTTCCC TCACTGTTTTGAAATGCTGTATCTACTACACATTAAAGAATACTCTTAAGCTGTCTTATTTCCATGGAGC AGGTGCCAAACTACTTTGAATAGAGCAATATTATATAGATAGATGTAGATAGATACAGATATTCCTTAGG CATTTTTTTCCTGCTTTTTAAAATGTATACTGGCTGTTCATTTGGGTTTTTACTTATTCTAGATAAAGTT GAGAATGCTTTTGTGAAGTACAGAATACACTAAAGATCAAAGAGAAAAAATACATAACAAAAATTTGTTG ATATTCTTTTAGGAATTTTGTCTTCCTAAGAAAGGTACAGATAGACTAAAAGTATTTCCATTTAGTCAAG CAATTTTAATGTCACAGAGGAAATCATACGTGACATTTATTTTCTTCTTTCAGATTATGTCTAGTTCCTT ACTGAGCTACAATTTCCGTTTATTGCTTTAACCATTTTGATGAAGTAGCTTTCCGGCCGCACCTTCCCCT TTTTTCCCCCGCTCCCAAAGAACCGCTGATAGCATGAAAGTCTTTTAAACTGTATGGACGAGATCTATTT CCTAACATTTAAACGGAAAATGACACGCAGCGGTCCTTTCCTTGAGCGTCTGCGTCTAAACTGCCCACAG ACCTCCCCCGCAGTATATCCCTTTGGAGTGCCCCGGGGAAAGCCAGGGCTGCAGGCAGTTCCAGCACCAA CTCAGACCGCATCTGCCCACTGCCTAGCGGGGCACTTCTCTACCAATCCGAAGGGCTGCTCGCCCGGCCT CACGGGAAAGGTAGTTTCCAGGTAGGGCGCCAACAGCATCAAGCTGTGCGCGTGGGCTCTGCGCATGCCT CGTCCGCCGGCTACGTCTGCGTTTCCGCCTTTCCTTTTGTTTTTCTCAGGTTTTGCGTGGGAGGCGGTCC CGGGATTTCAAGGGTCTACGCGCTTTTCTATGGCGAATGCAACCCGACGAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF33A_2 ↗ | 10:38,010,518 | 正股 | 38,010,469–38,010,528 |
| ZNF33A_1 ↗ | 10:38,010,693 | 正股 | 38,010,644–38,010,703 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR10_9K4BP · enhancer · 38008024–38008283 · regulatory
ENSR10_B9JN7 · promoter · 38010160–38010696 · regulatory
ENSR10_9K4CH · enhancer · 38010697–38011011 · regulatory
ENSR10_9K4CL · promoter · 38011012–38011512 · regulatory
· motif · 38006362–38006373 · motif
· motif · 38010245–38010256 · motif
· motif · 38010295–38010308 · motif
· motif · 38010472–38010485 · motif
· motif · 38010631–38010642 · motif
· motif · 38010644–38010655 · motif
· motif · 38010644–38010655 · motif
· motif · 38010674–38010685 · motif
· motif · 38010706–38010719 · motif
· motif · 38011021–38011032 · motif
· motif · 38011029–38011040 · motif
· motif · 38011029–38011040 · motif
· motif · 38011089–38011100 · motif
· motif · 38011111–38011124 · motif
· motif · 38011201–38011208 · motif
· motif · 38011367–38011379 · motif
· motif · 38011369–38011376 · motif
· motif · 38011709–38011721 · motif
· motif · 38011712–38011719 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:810 aa
ZNF33A 蛋白質長 810 個胺基酸,N 端第 12–83 位含 KRAB 結構域。第 328–770 位分布著 16 個 C2H2 型鋅指,依序排列;資料將其歸入 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF33A 的定位資料為細胞核。 來源未提供不同條件下的定位變化或異構型差異資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
ZNF33A 與 MAP3K20/ZAK 有交互作用記錄。來源將此關係描述為互作,但未提供其是否為直接結合、是否同屬特定複合體,或互作所造成的功能結果等細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF33A 可能參與轉錄調控。此描述僅指出其可能涉及轉錄調節,沒有說明調控方向、目標或具體作用機制,因此不宜視為已確立的詳細功能。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | ZNF33A 與 MAP3K20/ZAK 有交互作用記錄;資料未進一步說明此關係是否為直接結合、是否形成特定複合體,或具有何種功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ZNF33A 的細胞內定位記錄為細胞核;來源未提供其他定位條件或定位動態的說明。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GTTTCCGCCTTTCCTTTTGTTTTTCTCAGGTTTTGCGTGG40GAGGCGGTCCCGGGATTTCAAGGGTCTACGCGCTTTTCTA80TGGCGAATGCAACCCGACGAGGGAGTGGGCTGTATCTTCA120GAGTTGTCTCCGTCTTTCCAAGAACAGAACAAAATGAACA160AGGTAGAACAGAAGTCCCAGGAGTCAGTATCATTTAAAGA200TGTGACTGTGGGCTTCACCCAGGAGGAGTGGCAGCACCTG240GACCCTAGTCAGAGGGCTCTGTATAGAGATGTGATGCTGG280AGAACTACAGCAACCTTGTCTCAGTGGGGTATTGTGTTCA320CAAACCAGAGGTGATCTTCAGGCTGCAACAAGGAGAAGAG360CCATGGAAACAGGAGGAAGAATTCCCAAGCCAAAGCTTTC400CAGAAGTCTGGACAGCTGATCACCTGAAAGAGAGGAGCCA440AGAAAACCAATCTAAACATTTGTGGGAAGTTGTATTCATC480AATAATGAAATGCTGACTAAGGAACAAGGTGATGTAATAG520GAATACCATTTAATGTGGATGTAAGTTCTTTTCCTTCCAG560AAAAATGTTCTGTCAGTGTGATTCATGTGGAATGAGTTTC600AACACTGTTTCAGAATTGGTTATCAGTAAGATAAACTATT640TAGGAAAAAAGTCTGATGAATTTAATGCCTGTGGGAAATT680GTTACTCAATATTAAGCATGATGAAACTCATACTCAAGAG720AAAAATGAAGTTTTGAAAAATAGGAACACACTGAGTCATC760ATGAGGAGACTTTGCAGCATGAGAAGATTCAAACTTTAGA800GCACAATTTTGAATACAGTATATGTCAGGAAACCCTCCTT840GAAAAGGCAGTATTCAATACACAGAAGAGAGAGAACGCAG880AAGAGAATAACTGTGATTATAATGAATTTGGGAGAACTTT920GTGTGATAGTTCATCCCTCTTGTTCCATCAGATATCTCCG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。