演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF33AKOX5

zinc finger protein 33A

ZNF33A(zinc finger protein 33A)是 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族成員,可能參與轉錄調控;其蛋白質含有 KRAB 結構域與多個 C2H2 型鋅指。

Homo sapiens10p11.1UniProt Q06730
OFFICIAL SYMBOL
ZNF33A
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q06730
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF33A(zinc finger protein 33A)是蛋白質編碼基因,產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其蛋白質長 810 個胺基酸,具有 KRAB 結構域,並含有 16 個 C2H2 型鋅指。這些結構特徵是此蛋白質的主要辨識資訊;目前提供的資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未進一步說明具體作用方式或調控對象。

Official symbol
ZNF33A
Gene name
zinc finger protein 33A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13096
UniProt
Q06730
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX5KOX31KIAA0065FLJ23404ZZAPKZNF33ZNF11A

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010p11.1
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegZNF33Apq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr10:38,010,295–38,085,091
Gene span
74,797 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000432900 ★38,010,675–38,060,0875
ENST0000086760738,010,295–38,060,0556
ENST0000086760938,010,474–38,059,3856
ENST0000062882538,010,485–38,056,8614
ENST0000111998138,010,518–38,058,1036
ENST0000109961538,010,630–38,054,6316
ENST0000111998238,010,638–38,058,0996
ENST0000112325238,010,642–38,058,1616
ENST0000111998438,010,645–38,035,8325
ENST0000030744138,010,650–38,060,0636
ENST0000037461838,010,650–38,060,0635
ENST0000112324938,010,653–38,066,1366

顯示 12/33 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF33A 可能參與轉錄調控。這項描述指出其可能與基因轉錄活動的調節有關,但來源沒有說明它促進或抑制轉錄,也未指出受調控的基因、細胞條件或特定生物學過程。因此,現有資訊支持的是一項概括性的功能可能性,而非已界定的分子機制。

來源亦未提供 ZNF33A 如何作用於轉錄的實驗細節,無法據此判斷其是否直接接觸 DNA、是否透過其他分子發揮作用,或其作用是否取決於特定複合體。KRAB 結構域及多個 C2H2 型鋅指是蛋白質的結構特徵,但此處資料未將它們與特定靶點或調控結果連結,故不能進一步推定其功能細節。

因此,ZNF33A 的生物學角色目前宜描述為可能參與轉錄調控;其調控方向、作用對象與生理情境仍未由所提供資料界定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 38010675 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF33A ENST00000432900 GRCh38 chr10:38009675-38010775 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCAAAAATTTTTACTCTTTTAGTGGTTTAAATGTTTAAGTATTGTATACATGTGAGATTTTATCATGTGT
GATCTATGTATATCTCTACATTCCAAATTGCTCGGAATGACATGCTCTTTGGAATACTCCATTCTTTCCC
TCACTGTTTTGAAATGCTGTATCTACTACACATTAAAGAATACTCTTAAGCTGTCTTATTTCCATGGAGC
AGGTGCCAAACTACTTTGAATAGAGCAATATTATATAGATAGATGTAGATAGATACAGATATTCCTTAGG
CATTTTTTTCCTGCTTTTTAAAATGTATACTGGCTGTTCATTTGGGTTTTTACTTATTCTAGATAAAGTT
GAGAATGCTTTTGTGAAGTACAGAATACACTAAAGATCAAAGAGAAAAAATACATAACAAAAATTTGTTG
ATATTCTTTTAGGAATTTTGTCTTCCTAAGAAAGGTACAGATAGACTAAAAGTATTTCCATTTAGTCAAG
CAATTTTAATGTCACAGAGGAAATCATACGTGACATTTATTTTCTTCTTTCAGATTATGTCTAGTTCCTT
ACTGAGCTACAATTTCCGTTTATTGCTTTAACCATTTTGATGAAGTAGCTTTCCGGCCGCACCTTCCCCT
TTTTTCCCCCGCTCCCAAAGAACCGCTGATAGCATGAAAGTCTTTTAAACTGTATGGACGAGATCTATTT
CCTAACATTTAAACGGAAAATGACACGCAGCGGTCCTTTCCTTGAGCGTCTGCGTCTAAACTGCCCACAG
ACCTCCCCCGCAGTATATCCCTTTGGAGTGCCCCGGGGAAAGCCAGGGCTGCAGGCAGTTCCAGCACCAA
CTCAGACCGCATCTGCCCACTGCCTAGCGGGGCACTTCTCTACCAATCCGAAGGGCTGCTCGCCCGGCCT
CACGGGAAAGGTAGTTTCCAGGTAGGGCGCCAACAGCATCAAGCTGTGCGCGTGGGCTCTGCGCATGCCT
CGTCCGCCGGCTACGTCTGCGTTTCCGCCTTTCCTTTTGTTTTTCTCAGGTTTTGCGTGGGAGGCGGTCC
CGGGATTTCAAGGGTCTACGCGCTTTTCTATGGCGAATGCAACCCGACGAG
ZNF33A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF33A_2 ↗10:38,010,518正股38,010,469–38,010,528
ZNF33A_1 ↗10:38,010,693正股38,010,644–38,010,703

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_9K4BP · enhancer · 38008024–38008283 · regulatory

ENSR10_B9JN7 · promoter · 38010160–38010696 · regulatory

ENSR10_9K4CH · enhancer · 38010697–38011011 · regulatory

ENSR10_9K4CL · promoter · 38011012–38011512 · regulatory

· motif · 38006362–38006373 · motif

· motif · 38010245–38010256 · motif

· motif · 38010295–38010308 · motif

· motif · 38010472–38010485 · motif

· motif · 38010631–38010642 · motif

· motif · 38010644–38010655 · motif

· motif · 38010644–38010655 · motif

· motif · 38010674–38010685 · motif

· motif · 38010706–38010719 · motif

· motif · 38011021–38011032 · motif

· motif · 38011029–38011040 · motif

· motif · 38011029–38011040 · motif

· motif · 38011089–38011100 · motif

· motif · 38011111–38011124 · motif

· motif · 38011201–38011208 · motif

· motif · 38011367–38011379 · motif

· motif · 38011369–38011376 · motif

· motif · 38011709–38011721 · motif

· motif · 38011712–38011719 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:810 aa

1 aa810 aa結構域鋅指
依 Q06730 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF33A 蛋白質長 810 個胺基酸,N 端第 12–83 位含 KRAB 結構域。第 328–770 位分布著 16 個 C2H2 型鋅指,依序排列;資料將其歸入 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。

結構域KRAB12–83 aa
鋅指C2H2-type 1328–350 aa
鋅指C2H2-type 2356–378 aa
鋅指C2H2-type 3384–406 aa
鋅指C2H2-type 4412–434 aa
鋅指C2H2-type 5440–462 aa
鋅指C2H2-type 6468–490 aa
鋅指C2H2-type 7496–518 aa
鋅指C2H2-type 8524–546 aa
鋅指C2H2-type 9552–574 aa
鋅指C2H2-type 10580–602 aa
鋅指C2H2-type 11608–630 aa
鋅指C2H2-type 12636–658 aa
鋅指C2H2-type 13664–686 aa
鋅指C2H2-type 14692–714 aa
鋅指C2H2-type 15720–742 aa
鋅指C2H2-type 16748–770 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q06730…

AlphaFold · Q06730

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF33A 的定位資料為細胞核。 來源未提供不同條件下的定位變化或異構型差異資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX5ZNF33A
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZNF33A 與 MAP3K20/ZAK 有交互作用記錄。來源將此關係描述為互作,但未提供其是否為直接結合、是否同屬特定複合體,或互作所造成的功能結果等細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF33A 可能參與轉錄調控。此描述僅指出其可能涉及轉錄調節,沒有說明調控方向、目標或具體作用機制,因此不宜視為已確立的詳細功能。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZNF33A 與 MAP3K20/ZAK 有交互作用記錄;資料未進一步說明此關係是否為直接結合、是否形成特定複合體,或具有何種功能後果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with MAP3K20/ZAK

PMID 12535642 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF33A 的細胞內定位記錄為細胞核;來源未提供其他定位條件或定位動態的說明。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000432900 · 6,116 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTTTCCGCCTTTCCTTTTGTTTTTCTCAGGTTTTGCGTGG40
41GAGGCGGTCCCGGGATTTCAAGGGTCTACGCGCTTTTCTA80
81TGGCGAATGCAACCCGACGAGGGAGTGGGCTGTATCTTCA120
121GAGTTGTCTCCGTCTTTCCAAGAACAGAACAAAATGAACA160
161AGGTAGAACAGAAGTCCCAGGAGTCAGTATCATTTAAAGA200
201TGTGACTGTGGGCTTCACCCAGGAGGAGTGGCAGCACCTG240
241GACCCTAGTCAGAGGGCTCTGTATAGAGATGTGATGCTGG280
281AGAACTACAGCAACCTTGTCTCAGTGGGGTATTGTGTTCA320
321CAAACCAGAGGTGATCTTCAGGCTGCAACAAGGAGAAGAG360
361CCATGGAAACAGGAGGAAGAATTCCCAAGCCAAAGCTTTC400
401CAGAAGTCTGGACAGCTGATCACCTGAAAGAGAGGAGCCA440
441AGAAAACCAATCTAAACATTTGTGGGAAGTTGTATTCATC480
481AATAATGAAATGCTGACTAAGGAACAAGGTGATGTAATAG520
521GAATACCATTTAATGTGGATGTAAGTTCTTTTCCTTCCAG560
561AAAAATGTTCTGTCAGTGTGATTCATGTGGAATGAGTTTC600
601AACACTGTTTCAGAATTGGTTATCAGTAAGATAAACTATT640
641TAGGAAAAAAGTCTGATGAATTTAATGCCTGTGGGAAATT680
681GTTACTCAATATTAAGCATGATGAAACTCATACTCAAGAG720
721AAAAATGAAGTTTTGAAAAATAGGAACACACTGAGTCATC760
761ATGAGGAGACTTTGCAGCATGAGAAGATTCAAACTTTAGA800
801GCACAATTTTGAATACAGTATATGTCAGGAAACCCTCCTT840
841GAAAAGGCAGTATTCAATACACAGAAGAGAGAGAACGCAG880
881AAGAGAATAACTGTGATTATAATGAATTTGGGAGAACTTT920
921GTGTGATAGTTCATCCCTCTTGTTCCATCAGATATCTCCG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。