基因總覽
ZNF329 是蛋白質編碼基因,其產物為 zinc finger protein 329,屬於 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質全長 541 個胺基酸,序列中具有 12 個 C2H2 型鋅指區域,依序分布於胺基酸 203–533。這些序列特徵構成其家族與結構上的基本辨識依據。現有資料指出它可能參與轉錄調控,但未提供更進一步的作用方式或調控對象。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000598312 ★ | 58,126,248–58,150,789 | 4 |
| ENST00000597186 | 58,126,248–58,150,799 | 5 |
| ENST00000358067 | 58,126,248–58,142,664 | 2 |
| ENST00000858110 | 58,126,248–58,155,085 | 3 |
| ENST00000858111 | 58,126,248–58,150,799 | 3 |
| ENST00000858112 | 58,126,248–58,143,177 | 4 |
| ENST00000933728 | 58,126,248–58,155,100 | 3 |
| ENST00000933729 | 58,126,248–58,155,085 | 4 |
| ENST00000933730 | 58,126,248–58,155,100 | 2 |
| ENST00000933731 | 58,126,248–58,150,799 | 2 |
| ENST00000941681 | 58,126,248–58,155,100 | 4 |
| ENST00000941682 | 58,126,248–58,155,100 | 3 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料指出,zinc finger protein 329 可能參與轉錄調控。這項描述表示其可能與控制基因轉錄的過程有關,但資料沒有說明它如何影響轉錄,也未指出受調控的基因、調控方向或作用條件。因此,ZNF329 的功能目前只能概述為可能涉及轉錄調控,不能據此判定其具體作用機制或生物學結果。
Promoter 與基因調控
>ZNF329 ENST00000598312 GRCh38 chr19:58150689-58151789 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCTATCTGGTCCATGTTATTGTTACTTTACTACTTATGTATCAATCTCTGTATAACATATAGATTTTGTG TCTTTTATTTCCAGGTAAGTTGTATCATGTGGATAAGTGCACAGTTTACTTTTCGAACTGTTTTTGGAGA ACTGTCTATCTTGTATATAAGTTAGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTCTCCCTCTTGTC CCCCAGGCTGGAGTGTGATGGTACGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCT CTTGCCTCAGCCTCCCGAGGAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTAGCTAATTTTTGTATTTT TAGTGGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAGGTGAGCCCAGTCC GTTTGTTTTAACCACCCCCTATTGCTCCGTTGCACATACCACAGTTTCTCTCTTCCCTGTCAGTAAATAT TTAGGCTTCCCCATGCTAAAGTTTAAGAGAACCACTGAAAGAATGAAAATGTGTAGTTTTCATTTTCAAC CGGCTATTGTTACTACAGAGGAAAGTTACTGGCTTTGTTTACATTTCTTAGATCTAGTCATTTTAACAAA TTAGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACGCACCCAGTAAATAATTATATTGCCAATGA ATAATGAGTGTACTTATTCTGAATTTTAACATTATTATCTCAAAAAAAGATTATAGATAAAGAAATATTT TAGGAAATTATGCAGTAAATAAAAGGAAGGCTCTATAACAAAAGAATGATAGCATCGGGTTAAAAATCAG AGGAGACCATAGGAGAAAGTAAATGCCTGCGCGTCCGCCCCGAGGCAAGTCCACGCCAGGGTAATGAATA ACCCGGTACCCGCGGCCGCCCCAGCGTTGGGCGGGGGAAGCTCGGGGACTCCGCGCACGCGCACATCCTT GTCCCGGCAGCCGCGCAAGCGCAATCGCCCGGAACATGGCTGCCGCCGGCCGCCAACCGTAAGTGCCGAC GCATCCCTGAGCCCTGCGCTGCCTCCGTTTCCTGCGGAGGGAAGTCTTGGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF329_2 ↗ | 19:58,144,718 | 負股 | 58,144,708–58,144,767 |
| ZNF329_1 ↗ | 19:58,150,787 | 負股 | 58,150,777–58,150,836 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BFJKX · enhancer · 58149996–58150776 · regulatory
ENSR19_9T474 · promoter · 58150777–58151097 · regulatory
ENSR19_5HNB47 · CTCF_binding_site · 58151341–58151362 · regulatory
ENSR19_5HNBLT · CTCF_binding_site · 58154502–58154523 · regulatory
ENSR19_9T488 · promoter · 58154700–58155200 · regulatory
ENSR19_9T48D · enhancer · 58155201–58155597 · regulatory
ENSR19_5HNBQ8 · CTCF_binding_site · 58155230–58155251 · regulatory
· motif · 58149183–58149198 · motif
· motif · 58150458–58150474 · motif
· motif · 58150787–58150798 · motif
· motif · 58150787–58150798 · motif
· motif · 58150817–58150828 · motif
· motif · 58150817–58150828 · motif
· motif · 58151343–58151359 · motif
· motif · 58154504–58154520 · motif
· motif · 58155104–58155115 · motif
· motif · 58155104–58155115 · motif
· motif · 58155135–58155146 · motif
· motif · 58155135–58155146 · motif
· motif · 58155197–58155208 · motif
· motif · 58155232–58155248 · motif
· motif · 58155269–58155284 · motif
· motif · 58155276–58155284 · motif
· motif · 58155276–58155291 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:541 aa
zinc finger protein 329 全長 541 個胺基酸,屬於 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其序列註解列出 12 個 C2H2 型鋅指區域,分布於胺基酸 203–225、231–253、259–281、287–309、315–337、343–365、371–393、399–421、427–449、455–477、483–505 及 511–533。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZNF329 的細胞內定位標示於細胞核;未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 23 個夥伴
- CARD10Q9BWT7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- CIB3Q96Q77 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EMDP50402 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FANCGO15287 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KATNBL1Q9H079 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-5P60370 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2P50222 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- OPTNQ96CV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PICK1Q9NRD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKAR1BP31321 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNK1Q13470-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM37O94972 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TSPYL2Q9H2G4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YJU2BP13994 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ZBTB8AQ96BR9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZGPATQ8N5A5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF275Q9NSD4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCAATCGCCCGGAACATGGCTGCCGCCGGCCGCCAACCGG40TCTTGCTGTCTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATC80ACAGCTCACTGCAGCCTTGAGCTCCTGGGCTACCAAGTAG120CTGGGACTTCAGAGATGGCTGGAGCCGTGTGGATGGGCAT160AAATGGCTAATGTCCAGCAACCATCGATGTCAAGTATCCA200CACACCTGGCCTGAATGGATCCCTCTGCCTTTCAGAGTTT240GGGATATGAGATTGAAAATGACGACTCGGAATTTTCCTGA280GAGAGAAGTACCCTGTGATGTAGAAGTGGAAAGATTCACA320AGGGAAGTTCCCTGCTTGTCCAGTTTAGGTGATGGTTGGG360ACTGTGAGAACCAGGAGGGACACTTGAGGCAATCAGCTTT400AACTCTGGAGAAACCAGGGACTCAGGAAGCAATTTGTGAA440TATCCTGGTTTTGGGGAGCATTTGATTGCAAGCTCAGACC480TTCCACCGTCTCAGAGAGTTCTGGCAACAAATGGTTTCCA520TGCACCTGACTCAAATGTTAGTGGTCTGGATTGTGACCCC560GCCTTACCCAGCTATCCTAAAAGTTATGCAGATAAGAGAA600CTGGTGACAGTGATGCCTGTGGAAAAGGCTTCAACCATTC640CATGGAAGTTATTCATGGAAGAAATCCAGTGAGAGAGAAG680CCCTACAAATACCCTGAAAGTGTTAAGTCTTTTAATCATT720TTACCTCTCTTGGTCATCAGAAAATAATGAAAAGAGGCAA760GAAATCGTATGAAGGTAAGAATTTTGAGAACATCTTTACT800CTGAGCTCATCGCTTAATGAAAACCAGAGAAATCTCCCTG840GAGAGAAACAATATAGATGTACTGAATGTGGCAAATGCTT880CAAACGGAACTCTTCTCTTGTTTTGCATCACCGAACTCAC920ACCGGAGAGAAGCCTTATACTTGTAATGAGTGTGGAAAGT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。