演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF329FLJ12586

zinc finger protein 329

ZNF329(zinc finger protein 329)是 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族成員,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19q13.43UniProt Q86UD4
OFFICIAL SYMBOL
ZNF329
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q86UD4
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF329 是蛋白質編碼基因,其產物為 zinc finger protein 329,屬於 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質全長 541 個胺基酸,序列中具有 12 個 C2H2 型鋅指區域,依序分布於胺基酸 203–533。這些序列特徵構成其家族與結構上的基本辨識依據。現有資料指出它可能參與轉錄調控,但未提供更進一步的作用方式或調控對象。

Official symbol
ZNF329
Gene name
zinc finger protein 329
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14209
UniProt
Q86UD4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ12586

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.43
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF329pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:58,126,248–58,155,110
Gene span
28,863 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000598312 ★58,126,248–58,150,7894
ENST0000059718658,126,248–58,150,7995
ENST0000035806758,126,248–58,142,6642
ENST0000085811058,126,248–58,155,0853
ENST0000085811158,126,248–58,150,7993
ENST0000085811258,126,248–58,143,1774
ENST0000093372858,126,248–58,155,1003
ENST0000093372958,126,248–58,155,0854
ENST0000093373058,126,248–58,155,1002
ENST0000093373158,126,248–58,150,7992
ENST0000094168158,126,248–58,155,1004
ENST0000094168258,126,248–58,155,1003

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有資料指出,zinc finger protein 329 可能參與轉錄調控。這項描述表示其可能與控制基因轉錄的過程有關,但資料沒有說明它如何影響轉錄,也未指出受調控的基因、調控方向或作用條件。因此,ZNF329 的功能目前只能概述為可能涉及轉錄調控,不能據此判定其具體作用機制或生物學結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 58150789 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF329 ENST00000598312 GRCh38 chr19:58150689-58151789 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCTATCTGGTCCATGTTATTGTTACTTTACTACTTATGTATCAATCTCTGTATAACATATAGATTTTGTG
TCTTTTATTTCCAGGTAAGTTGTATCATGTGGATAAGTGCACAGTTTACTTTTCGAACTGTTTTTGGAGA
ACTGTCTATCTTGTATATAAGTTAGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTCTCCCTCTTGTC
CCCCAGGCTGGAGTGTGATGGTACGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCT
CTTGCCTCAGCCTCCCGAGGAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACGCCTAGCTAATTTTTGTATTTT
TAGTGGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTAGGTGAGCCCAGTCC
GTTTGTTTTAACCACCCCCTATTGCTCCGTTGCACATACCACAGTTTCTCTCTTCCCTGTCAGTAAATAT
TTAGGCTTCCCCATGCTAAAGTTTAAGAGAACCACTGAAAGAATGAAAATGTGTAGTTTTCATTTTCAAC
CGGCTATTGTTACTACAGAGGAAAGTTACTGGCTTTGTTTACATTTCTTAGATCTAGTCATTTTAACAAA
TTAGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACGCACCCAGTAAATAATTATATTGCCAATGA
ATAATGAGTGTACTTATTCTGAATTTTAACATTATTATCTCAAAAAAAGATTATAGATAAAGAAATATTT
TAGGAAATTATGCAGTAAATAAAAGGAAGGCTCTATAACAAAAGAATGATAGCATCGGGTTAAAAATCAG
AGGAGACCATAGGAGAAAGTAAATGCCTGCGCGTCCGCCCCGAGGCAAGTCCACGCCAGGGTAATGAATA
ACCCGGTACCCGCGGCCGCCCCAGCGTTGGGCGGGGGAAGCTCGGGGACTCCGCGCACGCGCACATCCTT
GTCCCGGCAGCCGCGCAAGCGCAATCGCCCGGAACATGGCTGCCGCCGGCCGCCAACCGTAAGTGCCGAC
GCATCCCTGAGCCCTGCGCTGCCTCCGTTTCCTGCGGAGGGAAGTCTTGGC
ZNF329 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF329_2 ↗19:58,144,718負股58,144,708–58,144,767
ZNF329_1 ↗19:58,150,787負股58,150,777–58,150,836

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BFJKX · enhancer · 58149996–58150776 · regulatory

ENSR19_9T474 · promoter · 58150777–58151097 · regulatory

ENSR19_5HNB47 · CTCF_binding_site · 58151341–58151362 · regulatory

ENSR19_5HNBLT · CTCF_binding_site · 58154502–58154523 · regulatory

ENSR19_9T488 · promoter · 58154700–58155200 · regulatory

ENSR19_9T48D · enhancer · 58155201–58155597 · regulatory

ENSR19_5HNBQ8 · CTCF_binding_site · 58155230–58155251 · regulatory

· motif · 58149183–58149198 · motif

· motif · 58150458–58150474 · motif

· motif · 58150787–58150798 · motif

· motif · 58150787–58150798 · motif

· motif · 58150817–58150828 · motif

· motif · 58150817–58150828 · motif

· motif · 58151343–58151359 · motif

· motif · 58154504–58154520 · motif

· motif · 58155104–58155115 · motif

· motif · 58155104–58155115 · motif

· motif · 58155135–58155146 · motif

· motif · 58155135–58155146 · motif

· motif · 58155197–58155208 · motif

· motif · 58155232–58155248 · motif

· motif · 58155269–58155284 · motif

· motif · 58155276–58155284 · motif

· motif · 58155276–58155291 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:541 aa

1 aa541 aa鋅指
依 Q86UD4 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 329 全長 541 個胺基酸,屬於 Krüppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其序列註解列出 12 個 C2H2 型鋅指區域,分布於胺基酸 203–225、231–253、259–281、287–309、315–337、343–365、371–393、399–421、427–449、455–477、483–505 及 511–533。

鋅指C2H2-type 1203–225 aa
鋅指C2H2-type 2231–253 aa
鋅指C2H2-type 3259–281 aa
鋅指C2H2-type 4287–309 aa
鋅指C2H2-type 5315–337 aa
鋅指C2H2-type 6343–365 aa
鋅指C2H2-type 7371–393 aa
鋅指C2H2-type 8399–421 aa
鋅指C2H2-type 9427–449 aa
鋅指C2H2-type 10455–477 aa
鋅指C2H2-type 11483–505 aa
鋅指C2H2-type 12511–533 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q86UD4…

AlphaFold · Q86UD4

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 ZNF329 的細胞內定位標示於細胞核;未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 23 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ12586ZNF329CARD10CEP70CIB3EMDFANCGGOLGA6L9KATNBL1KRT40KRTAP10-5KRTAP10-7MEOX2MTUS2OPTNPICK1PRKAR1BTNK1TRIM37TRIM41TSPYL2YJU2BZBTB8AZGPATZNF275
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 23 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF329 可能參與轉錄調控;目前資料未指出其調控的基因、作用方向、發生條件或具體分子機制,因此此功能描述保留為可能性。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF329 的細胞內定位標示為細胞核;此項資料未提供定位條件或動態變化的描述。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000598312 · 3,501 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCAATCGCCCGGAACATGGCTGCCGCCGGCCGCCAACCGG40
41TCTTGCTGTCTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATC80
81ACAGCTCACTGCAGCCTTGAGCTCCTGGGCTACCAAGTAG120
121CTGGGACTTCAGAGATGGCTGGAGCCGTGTGGATGGGCAT160
161AAATGGCTAATGTCCAGCAACCATCGATGTCAAGTATCCA200
201CACACCTGGCCTGAATGGATCCCTCTGCCTTTCAGAGTTT240
241GGGATATGAGATTGAAAATGACGACTCGGAATTTTCCTGA280
281GAGAGAAGTACCCTGTGATGTAGAAGTGGAAAGATTCACA320
321AGGGAAGTTCCCTGCTTGTCCAGTTTAGGTGATGGTTGGG360
361ACTGTGAGAACCAGGAGGGACACTTGAGGCAATCAGCTTT400
401AACTCTGGAGAAACCAGGGACTCAGGAAGCAATTTGTGAA440
441TATCCTGGTTTTGGGGAGCATTTGATTGCAAGCTCAGACC480
481TTCCACCGTCTCAGAGAGTTCTGGCAACAAATGGTTTCCA520
521TGCACCTGACTCAAATGTTAGTGGTCTGGATTGTGACCCC560
561GCCTTACCCAGCTATCCTAAAAGTTATGCAGATAAGAGAA600
601CTGGTGACAGTGATGCCTGTGGAAAAGGCTTCAACCATTC640
641CATGGAAGTTATTCATGGAAGAAATCCAGTGAGAGAGAAG680
681CCCTACAAATACCCTGAAAGTGTTAAGTCTTTTAATCATT720
721TTACCTCTCTTGGTCATCAGAAAATAATGAAAAGAGGCAA760
761GAAATCGTATGAAGGTAAGAATTTTGAGAACATCTTTACT800
801CTGAGCTCATCGCTTAATGAAAACCAGAGAAATCTCCCTG840
841GAGAGAAACAATATAGATGTACTGAATGTGGCAAATGCTT880
881CAAACGGAACTCTTCTCTTGTTTTGCATCACCGAACTCAC920
921ACCGGAGAGAAGCCTTATACTTGTAATGAGTGTGGAAAGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。