基因總覽
ZNF326(zinc finger protein 326)是蛋白質編碼基因,產物屬於 AKAP95 family。這種蛋白質是 DBIRD complex 的核心組成部分;該複合體位於核心 mRNP 顆粒與 RNA polymerase II 作用的交界,連結轉錄延伸與可變剪接的調控。ZNF326 的蛋白質序列具有鋅指特徵,並包含轉錄活化區域及多段預測為無序的區域。體外資料顯示它能結合 DNA 並活化基因表現;另有資料指出它可能參與神經元分化。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000340281 ★ | 89,995,110–90,035,533 | 12 |
| ENST00000361911 | 89,995,110–90,006,449 | 4 |
| ENST00000370447 | 89,995,110–90,035,548 | 12 |
| ENST00000902215 | 89,995,110–90,035,548 | 12 |
| ENST00000902216 | 89,995,110–90,035,548 | 12 |
| ENST00000902217 | 89,995,110–90,035,548 | 12 |
| ENST00000918480 | 89,995,110–90,035,548 | 13 |
| ENST00000918481 | 89,995,110–90,035,548 | 11 |
| ENST00000971818 | 89,995,110–90,035,548 | 11 |
| ENST00001141282 | 89,995,110–90,035,548 | 12 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF326 是 DBIRD complex 的核心組成蛋白。DBIRD complex 位於核心 mRNP 顆粒與 RNA polymerase II(RNAPII)作用的交界,將轉錄延伸與可變剪接的調控連結起來。這種位置使該複合體能同時影響新生轉錄本的延伸過程及其剪接結果。
DBIRD complex 會影響局部轉錄延伸速率,也會調節一大群位於富含 A、T 的 DNA 區域內的外顯子之可變剪接。來源指出的是複合體所涉及的作用,並未進一步說明 ZNF326 單獨如何造成這些改變,因此不宜將複合體層級的效應解讀為已界定的單一蛋白質機制。
此外,ZNF326 在體外能結合 DNA 並活化基因表現;這項結果描述的是體外觀察,不能據此擴大為特定細胞環境中的作用。它也可能參與神經元分化,但來源以可能性描述此角色,未提供更具體的作用步驟或條件。整體而言,已有資料支持 ZNF326 作為 DBIRD complex 組成部分,參與轉錄延伸與可變剪接調控;其 DNA 結合、體外轉錄活化及可能的神經元分化角色,則應保留各自的證據範圍與不確定性。
Promoter 與基因調控
>ZNF326 ENST00000340281 GRCh38 chr1:89994110-89995210 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCAGCCTGGTTATCGTAAGAGCTTTGGGGAAGAAGCGCAGGAAGGAAGAACCATGGAAGACTGAAACAGG ATTCCACCGCCTTCCTGTAGGCATTGTGGTGGCTTTGCATCCAAGCCATTGCTTGATGATAATGTTGCCA GTATCTTGCATATACTGGATGAGAATACCAAGGCCTGGTAGCTTTTGATGTTGATGCCTTCACCACTGCC ATCTCCGATTGTGAAAGTCCAAATGGGTGCCGAAACTTGTGGGCGCGCAGCTTGCAGATCCTGGGCGGTG GCCAAGCAGGCCATGTTTTAGAATTCTTTCCAGGCGGGTCGCATTGGCTCACGCCTGTGATCCTAACACT TTGGGAGGCGGAGACGGGGCTGGGGGTGGGGGGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTGGAGACCTGCTTGGGCA ACATGGCAAAACCCCCATCTCTATAAAAATAATTTAAAAATTTTTTAAAAGAATTATTATTTCCATTTTA TTTCAGTGCTTTGTCCTTTAAGAAAATTTATTGACATAGCGATAATCAGACTCCATACGCTATTTTGTAT CTTGCTTTTCAAATTTGCCACAGGCTTCTAGAAACGTCCCAGACTTCTGTGTCTCCATGGAGGAAACCCC GTAAGTACTTACAAATGTTATGATTAGTCATCCCTAGCCAATACTAAGCAAAAGGTAGGCATGCGGTTTT ATTAGTTTGGGCAGGAAGAAGGCATTCCAACCGGCTTCTTTCGCTCTTGCCAGGTTCAAACATGGCGGGC CGCAGCCGGCCCTTCCCGTACACTCGGCTTGCTTTCCCACAACCCCCGCCAATCTTTAGCGCTCCTTTTT TACCTTCCTTCCCCGTCAGCGGCTCCAGAGGGTCAGCACCTCCGAGCGTGACAGCGGACCTGCTTCCCGC CCCCCACGCGAGGGCCCGCCCACCAGCCCGCGTCAGCCAATAGCAGGCCGCGCCGATGGGGCTGGTAGCG CCGGTCGGCCCCGCCTCCCCAGCCTCGCTGTGGCCTGCGGCTCCCGGGCTGGTAGCGCGCCGCTCTCGGT CGCGCGGAGTGATCGTGTGGAATCGCGGGTCGCGGACGCTCGCCGCCGGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF326_1 ↗ | 1:89,995,110 | 正股 | 89,995,061–89,995,120 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_84MFRK · enhancer · 89989918–89990171 · regulatory
ENSR1_93BPG6 · enhancer · 89994579–89995024 · regulatory
ENSR1_779TRZ · promoter · 89995025–89995147 · regulatory
ENSR1_CBX55 · enhancer · 89995148–89996614 · regulatory
ENSR1_5R6JHK · CTCF_binding_site · 89996510–89996531 · regulatory
ENSR1_84MFZG · enhancer · 89998358–89998584 · regulatory
· motif · 89990221–89990236 · motif
· motif · 89990228–89990243 · motif
· motif · 89994762–89994770 · motif
· motif · 89994800–89994808 · motif
· motif · 89994869–89994879 · motif
· motif · 89995013–89995023 · motif
· motif · 89995032–89995042 · motif
· motif · 89995097–89995107 · motif
· motif · 89995117–89995132 · motif
· motif · 89995591–89995602 · motif
· motif · 89996297–89996312 · motif
· motif · 89996298–89996312 · motif
· motif · 89996299–89996312 · motif
· motif · 89996512–89996528 · motif
· motif · 89996541–89996556 · motif
· motif · 89998479–89998488 · motif
· motif · 89999605–89999617 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:582 aa
ZNF326 蛋白質長 582 個胺基酸,屬於 AKAP95 family。其 N 端第 1–124 位胺基酸區域註解為介導轉錄活化;第 314–336 與 407–430 位各有一個 C2H2 AKAP95-type zinc finger。另有三段區域被註解為無序區,分別位於第 154–194、243–302 及 472–582 位;第 238–260 位則含雙分段核定位訊號。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF326 的定位註解為核基質;來源未提供定位變化條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- BRINP1O60477 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GEMIN4P57678 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GYS1P13807 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KHDRBS3O75525 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KPNA5O15131 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPTA1P02549 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VMACQ2NL98 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ZNF326 是 DBIRD complex 的組成部分。它也與 CCAR2 直接互作;來源未進一步說明此互作是否屬於 DBIRD complex 的組裝關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF326 是 DBIRD complex 的核心組成部分。此多蛋白複合體位於核心 mRNP 顆粒與 RNA polymerase II(RNAPII)作用的交界,連結轉錄延伸與可變剪接調控,並影響局部轉錄延伸速率及富含 A、T 的 DNA 區域中一大群外顯子的可變剪接。ZNF326 可能參與神經元分化,且在體外能結合 DNA 並活化基因表現。 | 含實驗來源 | 證據與來源Core component of the DBIRD complex, a multiprotein complex that acts at the interface between core mRNP particles and RNA polymerase II (RNAPII) and integrates transcript elongation with the regulation of alternative splicing: the DBIRD complex affects local transcript elongation rates and alternative splicing of a large set of exons embedded in (A + T)-rich DNA regions. May play a role in neuronal differentiation and is able to bind DNA and activate expression in vitro PMID 22446626 ↗ |
| 交互作用 | ZNF326 是 DBIRD complex 的組成部分,並與 CCAR2 直接互作;資料未進一步說明這項互作是否參與複合體組裝。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ZNF326 的細胞內定位註解為核基質。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGCCTCGCTGTGGCCTGCGGCTCCCGGGCTGGTAGCGCGC40CGCTCTCGGTCGCGCGGAGTGATCGTGTGGAATCGCGGGT80CGCGGACGCTCGCCGCCGGCCATAGCTCAGCCTAGCGCCG120CCAAGGCCGACGGCCCTCAGCCTCTGCCATGGACTTCGAG160GACGATTACACACACTCCGCCTGCAGGAATACTTATCAGG200GCTTTAATGGAATGGATCGTGATTATGGCCCTGGATCTTA240TGGAGGGATGGATCGTGACTATGGCCATGGATCCTATGGG280GGTCAGAGATCCATGGATTCCTACCTAAACCAGTCATATG320GCATGGACAATCACAGTGGTGGTGGTGGGGGTAGCAGGTT360TGGACCTTATGAGTCTTACGACTCCAGGTCTTCTCTGGGT400GGGCGAGATCTGTACAGATCTGGCTATGGTTTTAATGAAC440CCGAACAAAGCCGCTTCGGAGGTAGTTATGGTGGTCGATT480TGAGAGCTCCTACCGGAATAGCCTTGACTCTTTCGGAGGT520AGAAACCAGGGCGGGTCTAGCTGGGAAGCACCTTACTCCC560GTTCAAAATTGAGGCCTGGGTTTATGGAGGACAGAGGAAG600AGAGAATTACTCTTCCTACAGCAGTTTTTCTTCACCCCAT640ATGAAGCCTGCACCTGTAGGCTCTCGGGGGAGAGGAACGC680CTGCTTATCCTGAAAGTACGTTTGGAAGCAGAAACTATGA720TGCTTTTGGAGGACCATCAACAGGCAGAGGCCGAGGCCGA760GGACATATGGGTGATTTTGGAAGCATTCATAGACCCGGAA800TTGTTGTTGACTATCAAAACAAATCCACCAATGTGACAGT840TGCTGCTGCAAGAGGAATAAAGAGAAAAATGATGCAGCCA880TTTAATAAGCCCAGTGGAACCTTTATCAAGAAACCCAAAC920TAGCAAAACCTATGGAGAAGATAAGCCTCAGCAAATCACC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。