基因總覽
ZNF320 是蛋白質編碼基因,產物為 zinc finger protein 320,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其蛋白質序列長 509 個胺基酸,具有 N 端 KRAB 區域,並在後段排列多個 C2H2-type zinc finger。這些結構特徵界定了其家族歸屬;目前來源對其生物學角色僅提供可能參與轉錄調控的簡要描述,未進一步說明作用對象或調控方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000682928 ★ | 52,876,180–52,897,635 | 6 |
| ENST00000673631 | 52,860,851–52,897,693 | 6 |
| ENST00000391781 | 52,876,172–52,890,375 | 3 |
| ENST00001072485 | 52,876,178–52,897,693 | 5 |
| ENST00000595635 | 52,876,180–52,897,693 | 8 |
| ENST00001134360 | 52,876,180–52,897,693 | 6 |
| ENST00000919701 | 52,877,720–52,897,720 | 4 |
| ENST00000952398 | 52,877,730–52,897,720 | 6 |
| ENST00001019477 | 52,877,730–52,897,720 | 6 |
| ENST00000919702 | 52,877,750–52,897,693 | 5 |
| ENST00000919703 | 52,877,916–52,897,720 | 5 |
| ENST00000919704 | 52,878,238–52,897,720 | 5 |
顯示 12/33 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF320 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述保留了推測性:現有資訊沒有說明其調控的是哪些基因,也未指出它會促進或抑制轉錄,因此不能據此界定具體的調控方向或靶標。
此來源僅將轉錄調控列為可能角色,沒有提供實驗系統、細胞或組織情境,也未描述能確認該功能的分子作用方式。因而目前可支持的結論限於 ZNF320 可能與轉錄調控有關;尚無資料可據以延伸其在特定生物學過程中的作用或功能意義。
Promoter 與基因調控
>ZNF320 ENST00000682928 GRCh38 chr19:52897535-52898635 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGGGAGCTCGGATTTCAAGGCAGTAGATTGCTGACGCTCCCAGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTACAAC TCAGTGTCTGAGAAGTTTTGTCTGCCGCTAGCCCTGCTACACACTGTTACAATGTCAATGCTTTTTTTAA AAATCCCTTTTTTTCTTATTGAGGCGGAGGAAGGAGCTCTGGGGTAGAGGGTCTTACTTTGTCGCCCACG CTGGCCTGGACCTCCGGGCTCAGCGGTCTTGCGGCTCCTGCTTCCTGAGTAGCCGGGACCCCAGACTCGC CACCTCGCCCACATCCCTGCTGTGTTTAAGCAGGAGGTGGTGACCTCACTCCTCCCTGGCCTGAGGCCTC CGCTCCGCACCCCAGGCGGTGGCCCTGAGGAAGTCTCTGGAGCTGAGCACAGGGTGGATTCTCCCACCCC AGTGAATGGAAAATAGAAAGGGAGAGGATTTGCTATTCTGTTCTGTGGGCCGTCAGCAGGAAATTGGAGG TTTCGCTGAGGCAGAGCTTTGTATTTCGCATTCTAGTTTGCATTCCTTCCCTTGACAACTTCCAGATTTT GGACATAAATTGCTAAAATTAATTTCAATAGCAAGGAACTTTCCTGGGTCCAATGACCGCCTCACGTTGA CTTCTCAGGGAGGTACTATTTCAATGACTGCTGAGCTGCTCCAGCCTCACTGGCGGCTTTCGCCTCCAAA ACCTGGAAAAAAGGCGCAGAGAGCGAGATGGAGGAAAGCTCAGGACCCACCCGCTTCTCGCCCCCGCCGA CCCCTCATAGCCCAGGACTCTTCTCCCAGCCAGGCCCCTTGTTTCTCAACCCCGCCCCGGCCTTGTTCAG GCCCCGCCCACCTCTTCGCGTCTCATCCCGGCCTAGTCCAGGCCCCGCCTACCTTCTCGGGGGTCCCGCC CAGGCCTGGCCTCTGTCCTGCGCTGATTGGCATAGACCCGGAAGCGGATGGCAGGGACTGAAGGTCACAC CACAGCGCGTGAGTTTCGCTCTGTTTTATGTGTGCTTCCCAGTCCTGTGGTGCTGCTATACCGGGGACGT TGAGTCCCCACAGACCTGGAAATTGCGGCCCCTCTTTCTCAACCCAGAGCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF320_2 ↗ | 19:52,879,897 | 負股 | 52,879,887–52,879,946 |
| ZNF320_1 ↗ | 19:52,897,694 | 負股 | 52,897,684–52,897,743 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BDHFW · promoter · 52896683–52897250 · regulatory
ENSR19_9QZTX · enhancer · 52897251–52897549 · regulatory
ENSR19_5GFX72 · CTCF_binding_site · 52897316–52897337 · regulatory
ENSR19_BDHG3 · promoter · 52897550–52898183 · regulatory
· motif · 52896838–52896851 · motif
· motif · 52897318–52897334 · motif
· motif · 52897517–52897528 · motif
· motif · 52897658–52897673 · motif
· motif · 52897680–52897689 · motif
· motif · 52897680–52897691 · motif
· motif · 52897680–52897691 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:509 aa
zinc finger protein 320 長 509 個胺基酸,含有位於第 8–80 位的 KRAB 區域,並具有 12 個 C2H2-type zinc finger 註解,其中第 12 個被標示為 degenerate。此蛋白質屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF320 的定位資料指向細胞核;來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- KRTAP10-5P60370 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
一種 glioblastoma 中曾發現涉及 ZNF320 的染色體異常,為 t(10;19)(q26;q13.3) 易位,並涉及 BRWD2/WDR11。這項資料描述的是染色體異常與疾病形式中的觀察,未證明 ZNF320 異常是疾病的成因。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF320 可能參與轉錄調控,但此描述具有推測性;資料未指出其調控的基因、作用方向或具體分子機制。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | ZNF320 的定位註記為細胞核;此筆資料未提供定位變化的條件或異構型差異。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | 一種 glioblastoma 中發現涉及 ZNF320 的染色體異常,具體為 t(10;19)(q26;q13.3) 易位,並涉及 BRWD2/WDR11。這是疾病中的染色體異常觀察,並未指出其與疾病之間具有因果關係。 | 含實驗來源 | 證據與來源A chromosomal aberration involving ZNF320 is found in a form of glioblastoma. Translocation t(10;19)(q26;q13.3) with BRWD2/WDR11 PMID 11536051 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTGTTTTATGTGTGCTTCCCAGTCCTGTGGTGCTGCTATA40CCGGGGACGTTGAGTCCCCACAGACCTGGAAATTGCGGCC80CCTCTTTCTCAACCCAGAGCAAATTGAGACGTCCGGGCTG120GAGGGCAGTTGTGCGATCTTGATTCACTTCAACCTCTGCT160CTCCGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTGAGTCTC200ACTCTGTCCTTCAGGCTGTGAGTGCAGTCTCCTGATCTTG240GCTCACTGCAACCTCTGTCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTT280GTGCCTCAGCCTACCAAGTAGCTGAGATACAGGATTGACT320TCTAAAGACTCTTGGTACCTGAGGAAGAAACCCAGAAGAG360GAAGAGGAAAGCAAAGGAGTCGGGGATGGCTCTTTCTCAG400GGTCTACTGACATTCAGGGATGTGGCCATAGAATTCTCTC440AGGAGGAGTGGAAATGCCTGGACCCTGCTCAGAGGACTCT480ATACAGAGACGTGATGCTGGAGAATTATAGGAACCTGGTC520TCCCTGGATATCTCTTCCAAATGCATGATGAATACATTGT560CATCAACAGGGCAAGGCAATACAGAAGTGATCCACACAGG600GACATTGCAGAGACAAGCAAGTTATCACATTGGAGCATTT640TGCTCCCAGGAAATTGAGAAAGACATTCATGACTTTGTGT680TTCAGTGGCAAGAAGATGAAACAAATGACCATGAAGCACC720CATGACAGAAATAAAAAAGTTGACTAGTAGTACAGACCGA760TATGATCAAAGGCATGCTGGAAACAAGCCTATTAAAGGTC800AGCTTGAATCAAGATTTCATTTGCATTTGCGAAGACATAG840GAGAATTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAATGTGAAGAA880TGTGAGAAAGTTTTCAGTTGCAAATCACATCTTGAAATAC920ATAGGATAATTCATACTGGAGAGAAACCATACAAATGTAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。