演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF320ZFPL

zinc finger protein 320

ZNF320(zinc finger protein 320)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 成員,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19q13.41UniProt A2RRD8
OFFICIAL SYMBOL
ZNF320
CHROMOSOME
19
UNIPROT
A2RRD8
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF320 是蛋白質編碼基因,產物為 zinc finger protein 320,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其蛋白質序列長 509 個胺基酸,具有 N 端 KRAB 區域,並在後段排列多個 C2H2-type zinc finger。這些結構特徵界定了其家族歸屬;目前來源對其生物學角色僅提供可能參與轉錄調控的簡要描述,未進一步說明作用對象或調控方式。

Official symbol
ZNF320
Gene name
zinc finger protein 320
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13842
UniProt
A2RRD8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZFPLDKFZp686G16228

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.41
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF320pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:52,860,851–52,897,720
Gene span
36,870 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000682928 ★52,876,180–52,897,6356
ENST0000067363152,860,851–52,897,6936
ENST0000039178152,876,172–52,890,3753
ENST0000107248552,876,178–52,897,6935
ENST0000059563552,876,180–52,897,6938
ENST0000113436052,876,180–52,897,6936
ENST0000091970152,877,720–52,897,7204
ENST0000095239852,877,730–52,897,7206
ENST0000101947752,877,730–52,897,7206
ENST0000091970252,877,750–52,897,6935
ENST0000091970352,877,916–52,897,7205
ENST0000091970452,878,238–52,897,7205

顯示 12/33 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF320 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述保留了推測性:現有資訊沒有說明其調控的是哪些基因,也未指出它會促進或抑制轉錄,因此不能據此界定具體的調控方向或靶標。

此來源僅將轉錄調控列為可能角色,沒有提供實驗系統、細胞或組織情境,也未描述能確認該功能的分子作用方式。因而目前可支持的結論限於 ZNF320 可能與轉錄調控有關;尚無資料可據以延伸其在特定生物學過程中的作用或功能意義。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 52897635 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF320 ENST00000682928 GRCh38 chr19:52897535-52898635 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGGGAGCTCGGATTTCAAGGCAGTAGATTGCTGACGCTCCCAGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTACAAC
TCAGTGTCTGAGAAGTTTTGTCTGCCGCTAGCCCTGCTACACACTGTTACAATGTCAATGCTTTTTTTAA
AAATCCCTTTTTTTCTTATTGAGGCGGAGGAAGGAGCTCTGGGGTAGAGGGTCTTACTTTGTCGCCCACG
CTGGCCTGGACCTCCGGGCTCAGCGGTCTTGCGGCTCCTGCTTCCTGAGTAGCCGGGACCCCAGACTCGC
CACCTCGCCCACATCCCTGCTGTGTTTAAGCAGGAGGTGGTGACCTCACTCCTCCCTGGCCTGAGGCCTC
CGCTCCGCACCCCAGGCGGTGGCCCTGAGGAAGTCTCTGGAGCTGAGCACAGGGTGGATTCTCCCACCCC
AGTGAATGGAAAATAGAAAGGGAGAGGATTTGCTATTCTGTTCTGTGGGCCGTCAGCAGGAAATTGGAGG
TTTCGCTGAGGCAGAGCTTTGTATTTCGCATTCTAGTTTGCATTCCTTCCCTTGACAACTTCCAGATTTT
GGACATAAATTGCTAAAATTAATTTCAATAGCAAGGAACTTTCCTGGGTCCAATGACCGCCTCACGTTGA
CTTCTCAGGGAGGTACTATTTCAATGACTGCTGAGCTGCTCCAGCCTCACTGGCGGCTTTCGCCTCCAAA
ACCTGGAAAAAAGGCGCAGAGAGCGAGATGGAGGAAAGCTCAGGACCCACCCGCTTCTCGCCCCCGCCGA
CCCCTCATAGCCCAGGACTCTTCTCCCAGCCAGGCCCCTTGTTTCTCAACCCCGCCCCGGCCTTGTTCAG
GCCCCGCCCACCTCTTCGCGTCTCATCCCGGCCTAGTCCAGGCCCCGCCTACCTTCTCGGGGGTCCCGCC
CAGGCCTGGCCTCTGTCCTGCGCTGATTGGCATAGACCCGGAAGCGGATGGCAGGGACTGAAGGTCACAC
CACAGCGCGTGAGTTTCGCTCTGTTTTATGTGTGCTTCCCAGTCCTGTGGTGCTGCTATACCGGGGACGT
TGAGTCCCCACAGACCTGGAAATTGCGGCCCCTCTTTCTCAACCCAGAGCA
ZNF320 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF320_2 ↗19:52,879,897負股52,879,887–52,879,946
ZNF320_1 ↗19:52,897,694負股52,897,684–52,897,743

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BDHFW · promoter · 52896683–52897250 · regulatory

ENSR19_9QZTX · enhancer · 52897251–52897549 · regulatory

ENSR19_5GFX72 · CTCF_binding_site · 52897316–52897337 · regulatory

ENSR19_BDHG3 · promoter · 52897550–52898183 · regulatory

· motif · 52896838–52896851 · motif

· motif · 52897318–52897334 · motif

· motif · 52897517–52897528 · motif

· motif · 52897658–52897673 · motif

· motif · 52897680–52897689 · motif

· motif · 52897680–52897691 · motif

· motif · 52897680–52897691 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:509 aa

1 aa509 aa結構域鋅指
依 A2RRD8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 320 長 509 個胺基酸,含有位於第 8–80 位的 KRAB 區域,並具有 12 個 C2H2-type zinc finger 註解,其中第 12 個被標示為 degenerate。此蛋白質屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。

結構域KRAB8–80 aa
鋅指C2H2-type 1161–183 aa
鋅指C2H2-type 2189–211 aa
鋅指C2H2-type 3217–239 aa
鋅指C2H2-type 4245–267 aa
鋅指C2H2-type 5273–295 aa
鋅指C2H2-type 6301–323 aa
鋅指C2H2-type 7329–351 aa
鋅指C2H2-type 8357–379 aa
鋅指C2H2-type 9385–407 aa
鋅指C2H2-type 10413–435 aa
鋅指C2H2-type 11441–463 aa
鋅指C2H2-type 12; degenerate469–491 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · A2RRD8…

AlphaFold · A2RRD8

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF320 的定位資料指向細胞核;來源未提供定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZFPLZNF320KRTAP10-5KRTAP10-7
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

一種 glioblastoma 中曾發現涉及 ZNF320 的染色體異常,為 t(10;19)(q26;q13.3) 易位,並涉及 BRWD2/WDR11。這項資料描述的是染色體異常與疾病形式中的觀察,未證明 ZNF320 異常是疾病的成因。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF320 可能參與轉錄調控,但此描述具有推測性;資料未指出其調控的基因、作用方向或具體分子機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF320 的定位註記為細胞核;此筆資料未提供定位變化的條件或異構型差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯一種 glioblastoma 中發現涉及 ZNF320 的染色體異常,具體為 t(10;19)(q26;q13.3) 易位,並涉及 BRWD2/WDR11。這是疾病中的染色體異常觀察,並未指出其與疾病之間具有因果關係。含實驗來源
證據與來源

A chromosomal aberration involving ZNF320 is found in a form of glioblastoma. Translocation t(10;19)(q26;q13.3) with BRWD2/WDR11

PMID 11536051 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000682928 · 6,331 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1CTGTTTTATGTGTGCTTCCCAGTCCTGTGGTGCTGCTATA40
41CCGGGGACGTTGAGTCCCCACAGACCTGGAAATTGCGGCC80
81CCTCTTTCTCAACCCAGAGCAAATTGAGACGTCCGGGCTG120
121GAGGGCAGTTGTGCGATCTTGATTCACTTCAACCTCTGCT160
161CTCCGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTGAGTCTC200
201ACTCTGTCCTTCAGGCTGTGAGTGCAGTCTCCTGATCTTG240
241GCTCACTGCAACCTCTGTCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTT280
281GTGCCTCAGCCTACCAAGTAGCTGAGATACAGGATTGACT320
321TCTAAAGACTCTTGGTACCTGAGGAAGAAACCCAGAAGAG360
361GAAGAGGAAAGCAAAGGAGTCGGGGATGGCTCTTTCTCAG400
401GGTCTACTGACATTCAGGGATGTGGCCATAGAATTCTCTC440
441AGGAGGAGTGGAAATGCCTGGACCCTGCTCAGAGGACTCT480
481ATACAGAGACGTGATGCTGGAGAATTATAGGAACCTGGTC520
521TCCCTGGATATCTCTTCCAAATGCATGATGAATACATTGT560
561CATCAACAGGGCAAGGCAATACAGAAGTGATCCACACAGG600
601GACATTGCAGAGACAAGCAAGTTATCACATTGGAGCATTT640
641TGCTCCCAGGAAATTGAGAAAGACATTCATGACTTTGTGT680
681TTCAGTGGCAAGAAGATGAAACAAATGACCATGAAGCACC720
721CATGACAGAAATAAAAAAGTTGACTAGTAGTACAGACCGA760
761TATGATCAAAGGCATGCTGGAAACAAGCCTATTAAAGGTC800
801AGCTTGAATCAAGATTTCATTTGCATTTGCGAAGACATAG840
841GAGAATTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAATGTGAAGAA880
881TGTGAGAAAGTTTTCAGTTGCAAATCACATCTTGAAATAC920
921ATAGGATAATTCATACTGGAGAGAAACCATACAAATGTAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。