基因總覽
ZNF32(zinc finger protein 32)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列長度為273個胺基酸,具有多個鋅指區域;這些結構特徵構成此蛋白質的主要序列註解。現有資料指出,ZNF32可能參與轉錄調控,但未提供更具體的作用方式或調控對象。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000374433 ★ | 43,643,862–43,648,881 | 3 |
| ENST00000395797 | 43,643,859–43,648,872 | 3 |
| ENST00000858678 | 43,643,859–43,649,367 | 3 |
| ENST00000858679 | 43,643,859–43,648,848 | 2 |
| ENST00000858680 | 43,643,859–43,648,814 | 3 |
| ENST00000858681 | 43,643,859–43,648,872 | 4 |
| ENST00000858682 | 43,643,859–43,648,872 | 4 |
| ENST00000924832 | 43,643,859–43,648,898 | 3 |
| ENST00000924833 | 43,643,859–43,648,898 | 3 |
| ENST00000924834 | 43,643,859–43,648,898 | 4 |
| ENST00000924835 | 43,643,859–43,648,898 | 4 |
| ENST00000924836 | 43,643,859–43,648,827 | 3 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF32可能參與轉錄調控。現有資料僅支持這項概括性功能描述,未進一步說明其調控的基因、作用方向、分子機制或參與的特定生物學過程,因此無法據此判定它如何影響轉錄,也不應將可能性表述為已確立的作用。
Promoter 與基因調控
>ZNF32 ENST00000374433 GRCh38 chr10:43648781-43649881 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TATTACTTACAGACACCTTTGCATATTGAGTGAAATTAAGTTGTTTGATTTAACAAATCTGTGGCTTTGG GGTAGAGAACAAGAACATAGCAAGAGGAAGCATTCTTTATTAGTCCTTCACGAAAGAGGATGGACAGACA CATCTACGGAGAGGGGCTCCAGAGGCAGGGACCCAGAGATACACCCGGCCAGGCAGAACAGCTCCAGGAT GTGGCCCCGATCCTGGAAAAGTGCGTTTAAAAGAGGCTTAAGGCATATCAGACAGCCTGGCCAACATGGT AAAACCTTCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACAGACCTGTAGTCCCAGC TACTTGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGAAGGCGGAGGTTGCAGTGAGGCGACACCGTG CCACTGCACTCAAGCCTGGGAGACAGAGTGAAGGAAAAAAAAAAACAGGCATTATTAGAGAGGCTTTATC TCCTACGTGTTCAAAAGCAACCATGCTCCTCCCAGTATCTCAGGACGACTGGACTGCCTGTGTTCCTGTT GCTCTTCACAGAAGCTCCATGAAAGCGGGCTTCGCTTTTGTTCATGCAGCCAGAGGCTCAACACATGACC TCGAAGCCGCCAAGGCTTTATCAAACGGATTTCTCCCAAAAACTTCGTTTCCTTCCGCGACGCCCTGCAA GAACCCTGTATTCCTGAGTCCCTGGCTCAGCGTCTGCTACCCCGATGCTGTCAATCAGATCCTGCTAATC TGAGCGGCCGTGGCTCCGTCCCGGCTCCGCGTCCGCTGACAGGTCACCGCTGTGAGTCTCCGGATTACCA GTCCAAACGGGACGGCTTGAGGTCCCCGCGCCCTAGGGACCTGCGGGGCCCGAGCGCAGGGCGCGCCAGA GAACTACATTTCCCACAGAGCTCTTGGGAAGCCGGGGCCGCCGAGACCCACGGCCCGGCGGGCGGGCTCG CGGGGAGACTCCTGGGAGTTGTAGTCCATTCCGCCGGCGCCGGCGCTGGCGCTGCTGCGGGCTCGGCGCC GGCCTTTGTCTGCGGGCACGCGCCGCTGCGGTGAGTGAGGCCGCTGGCCGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF32_1 ↗ | 10:43,648,874 | 負股 | 43,648,864–43,648,923 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR10_C6BXF · enhancer · 43647599–43648693 · regulatory
ENSR10_5D9799 · CTCF_binding_site · 43648252–43648273 · regulatory
ENSR10_9MBQT · promoter · 43648694–43648970 · regulatory
ENSR10_BBMTZ · enhancer · 43648971–43649545 · regulatory
ENSR10_839MMN · enhancer · 43653832–43654016 · regulatory
· motif · 43648254–43648270 · motif
· motif · 43648334–43648351 · motif
· motif · 43648654–43648667 · motif
· motif · 43648789–43648806 · motif
· motif · 43648883–43648896 · motif
· motif · 43649001–43649014 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:273 aa
ZNF32長273個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解列有六個 C2H2-type zinc finger,另有一個 CCHC-type zinc finger;這些區域分布於蛋白質中段至末端。
蛋白質三維結構
細胞內定位
現有資料未提供定位隨條件改變的情形,也未指出不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- CARD10Q9BWT7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC125Q86Z20 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INCA1Q0VD86 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-4P60372 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-5P60370 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOTCH2NLAQ7Z3S9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RELL2Q8NC24 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTAGTCCATTCCGCCGGCGCCGGCGCTGGCGCTGCTGCGG40GCTCGGCGCCGGCCTTTGTCTGCGGGCACGCGCCGCTGCG80GTGCTCAGGAACAGCCCATGGAAGAATCATATGAAGAGGT120GGTGACTGAGGTCGTAAGCAGGAGTGGACATGTTTGGATT160TCCAACAGCTACCCTGCTGGACTGTCATGGAAGATATGCC200CAGAATGTAGCGTTCTTCAATGTGATGACTGAAGCCCACC240ACAAATATGACCACTCTGAGGCTACAGGATCCTCAAGCTG280GGATATCCAAAATTCTTTCAGAAGAGAGAAGCTGGAACAA320AAATCCCCAGATTCGAAGACACTACAGGAAGATTCACCTG360GAGTGAGACAAAGGGTCTATGAGTGCCAGGAGTGTGGAAA400ATCCTTCCGGCAAAAAGGTAGTCTAACGTTACATGAGAGA440ATCCACACTGGTCAAAAGCCTTTTGAGTGCACCCACTGTG480GAAAAAGCTTCAGGGCCAAAGGCAATCTTGTTACACATCA520ACGGATACACACGGGAGAGAAGCCTTATCAGTGCAAGGAG560TGTGGGAAAAGCTTCAGTCAACGAGGTAGTCTCGCTGTCC600ACGAGAGACTCCACACTGGACAGAAACCCTACGAGTGTGC640TATTTGTCAGAGAAGCTTCAGGAATCAGAGTAACCTTGCT680GTTCACAGGAGAGTTCACAGTGGTGAGAAGCCCTATAGAT720GTGATCAGTGTGGAAAAGCCTTCAGTCAGAAAGGAAGCTT760AATTGTTCACATCAGAGTCCACACAGGCCTGAAGCCCTAT800GCCTGTACCCAGTGCAGGAAGAGTTTCCACACCAGGGGGA840ATTGTATTCTGCATGGCAAAATCCACACAGGAGAGACACC880CTATCTGTGCGGCCAGTGTGGAAAAAGCTTCACCCAGAGA920GGGAGTCTGGCTGTGCACCAGCGAAGCTGCTCACAGAGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。