基因總覽
ZNF318 是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,全長 2,279 個胺基酸,名稱為 zinc finger protein 318。其序列包含兩個 Matrin-type 鋅指,並有多段被註記為無序的區域,顯示蛋白質不同區段具有不同的序列特徵。現有資料將它與 AR 調控的轉錄活性聯繫,也指出它可能在精子形成期間參與轉錄調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361428 ★ | 43,336,070–43,369,647 | 10 |
| ENST00000606599 | 43,331,489–43,342,836 | 2 |
| ENST00000973450 | 43,331,490–43,369,647 | 7 |
| ENST00000930865 | 43,336,073–43,369,647 | 10 |
| ENST00001106136 | 43,354,157–43,369,647 | 4 |
| ENST00001106137 | 43,356,891–43,369,647 | 3 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF318 與 AR(androgen receptor)介導的轉錄活性有關,來源將它描述為可作為轉錄共抑制因子,也可作為轉錄共活化因子。這兩種功能方向均見於資料,因此不宜將其角色簡化為只抑制或只促進 AR 的轉錄活性;現有資訊沒有說明兩種作用分別出現的條件或分子機制。
此外,資料指出 ZNF318 可能在精子形成期間作為轉錄調節因子,特別是在減數分裂期間。這項描述屬於可能的功能角色,提示其與生殖細胞發育中的基因轉錄調節相關,但未進一步交代它調控哪些基因、如何影響減數分裂,或其作用對精子形成的具體結果。
因此,來源支持的功能重點是 ZNF318 與 AR 介導的轉錄活性具有共抑制及共活化兩種描述,並可能參與精子形成、尤其減數分裂階段的轉錄調控。可用資料未提供足以釐清作用方向差異或生殖相關調控路徑的細節。
Promoter 與基因調控
>ZNF318 ENST00000361428 GRCh38 chr6:43369547-43370647 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GATGTGGGCCCCTGGTAATGAAGGACCTCCACCATGACCACAAGTACTTTAGTCAGAAAACAGCTCGAAA ACGTGTGAAGAGAGTCCACCAAACAGGCTTCGTGTGAGCAACAAGGCTGTTTATCTTACCTGGGTGCAGG CGGGTTGAGTCCGAAAAAGGAGTCAGCAGAGGGTGGTGGAATTATCATTAGTTCTTATAGGTTTGGGATA GGTGTACAAAGTACATTCTTAAGGGCGGGGGAGAATATTACAAAGCACCTACTTAAGGGCAAGGGGGAGA ATATATCCTGTCAGTTAGGGTGGGGCAGGAACAAATCACAATGGTGGAATGTCATCAGTTAAGGCTATTT TCACTTCTTTTGTGGCTCTTCAGTTGCCTCAGGCCATCTGGATGTATACGTGCAGGTCATAGGGGATATG ATGGCTTAGCTTGGGCTCAGAGGCCTGACAACGTCTATTTTGGGTTTGATTCTGGCCCACCACCTCCACC TCGTACTTTCCTATCCTCAATTTCAACCTCTAGAAATTAGGCAAACTGGAAAGTAAACTGATGCGGGTCG TGTTGCTTCAGCTGGGGACAGGATTTCGGTGGGCGCTCCTGCCGGGGTCCGTAACCTCCCACACAGCTAA CGTTTACAGGCCCGTTTATATTATCACGAATGGTTTTCAACCATTTCGTGTCCATCCCTAAATTAAGAGG CTTGAGGGGCGGCACGAAAGAGCGAAGACACCTCCGCACGGTCTCCAAACCCCTAAGTCCAGAGGCCTGG AGCATCCCCGGAAAACCAGATCCCTCTCCAGAGAAGCCCTTCCTTCCGCTCCGCCCACCCCGCGCGGAGG CCACAGGGGTCACGTGGCGGCCGCGGGAGGGGGAAGTGGGCGGCTCTGCGGCCGCCATCTTGAGGATTCG GAGGCGGGGCGTGCAGAGCTCAGGGCGCGCGCTTCGCTTCCCCTCCCCTCGCCCAGCCTCGCGCCGGCGT CTGTGCTCCTCCCCACTTTTCTTGGTTCCTGCGGCCGCTCCCTGAGTGGAGGAGCGGGGAACCCCGGAGG CGGGGGGGGGTGTGTCGGACGCGTGCTCGCGCCCTCCAACCGCCAGCCGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF318_1 ↗ | 6:43,369,481 | 負股 | 43,369,471–43,369,530 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_9M7QJ · enhancer · 43367492–43367912 · regulatory
ENSR6_9M7R5 · promoter · 43369637–43370036 · regulatory
ENSR6_5D7FHT · CTCF_binding_site · 43369739–43369760 · regulatory
ENSR6_BBLDM · enhancer · 43370037–43370667 · regulatory
· motif · 43365320–43365327 · motif
· motif · 43365355–43365370 · motif
· motif · 43365474–43365481 · motif
· motif · 43365711–43365718 · motif
· motif · 43365820–43365832 · motif
· motif · 43365923–43365935 · motif
· motif · 43366383–43366396 · motif
· motif · 43366383–43366396 · motif
· motif · 43366755–43366767 · motif
· motif · 43367565–43367587 · motif
· motif · 43367565–43367587 · motif
· motif · 43368835–43368848 · motif
· motif · 43368835–43368848 · motif
· motif · 43368847–43368858 · motif
· motif · 43369116–43369129 · motif
· motif · 43369146–43369159 · motif
· motif · 43369230–43369243 · motif
· motif · 43369300–43369313 · motif
· motif · 43369431–43369444 · motif
· motif · 43369505–43369518 · motif
· motif · 43369539–43369552 · motif
· motif · 43369546–43369561 · motif
· motif · 43369588–43369601 · motif
· motif · 43369631–43369648 · motif
· motif · 43369730–43369743 · motif
· motif · 43369741–43369757 · motif
· motif · 43369748–43369758 · motif
· motif · 43369781–43369797 · motif
· motif · 43369781–43369797 · motif
· motif · 43369790–43369799 · motif
· motif · 43369790–43369799 · motif
· motif · 43369792–43369804 · motif
· motif · 43369795–43369802 · motif
· motif · 43369801–43369817 · motif
· motif · 43369815–43369828 · motif
· motif · 43370232–43370245 · motif
· motif · 43370566–43370578 · motif
· motif · 43373191–43373203 · motif
· motif · 43373201–43373213 · motif
· motif · 43373203–43373210 · motif
· motif · 43373203–43373218 · motif
· motif · 43373314–43373325 · motif
· motif · 43373332–43373343 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:2279 aa
ZNF318 蛋白質長 2,279 個胺基酸,含有兩個 Matrin-type 鋅指:第一個位於第 1,063–1,097 位,第二個位於第 1,136–1,166 位。與 AR 互作的區域註記為第 1–1,092 位;另有多段序列被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF318 的定位資料將其記錄於細胞核;來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
ZNF318 可形成同源二聚體;isoform 1 與 isoform 2 也可形成異源二聚體。資料另指出這兩種異構型均與 AR 互作,但未說明該互作是否形成特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF318 可作為 AR 介導轉錄活性的共抑制因子;此外,它可能在精子形成期間參與轉錄調控,尤其可能與減數分裂階段有關。 | 推論支持 | 證據與來源Acts as a transcriptional corepressor for AR-mediated transactivation function. May act as a transcriptional regulator during spermatogenesis and, in particular, during meiotic division |
| 功能 | ZNF318 也可作為 AR 介導轉錄活性的共活化因子;此外,它可能在精子形成期間參與轉錄調控,尤其可能與減數分裂階段有關。 | 推論支持 | 證據與來源Acts as a transcriptional coactivator for AR-mediated transactivation function. May act as a transcriptional regulator during spermatogenesis and, in particular, during meiotic division |
| 交互作用 | ZNF318 可形成同源二聚體;isoform 1 與 isoform 2 可形成異源二聚體,且這兩種異構型均與 AR 互作。 | 推論支持 | 證據與來源Homodimer. Heterodimer of isoform 1 and isoform 2. Isoform 1 and isoform 2 interact with AR |
| 細胞定位 | ZNF318 的定位記錄為細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTGGTTCCTGCGGCCGCTCCCTGAGTGGAGGAGCGGGGA40ACCCCGGAGGCGGGGGGGGGTGTGTCGGACGCGTGCTCGC80GCCCTCCAACCGCCAGCCGCGGGGGCGCGCTCGGCCGGGC120CCCCGGGGCGACGCGGGGCCGAGGGGAGGGGGCTGCTCCC160GCGGCTGAGGCGGCGCGCAGCGGCCGAGGTGGCGGCGGCT200GCAGCTGCGGCGGCGCGCTCCGAGCCTGCGTCTAGGGCGC240CCCCGGGTCAGAGCTGTCGCCGTGGCCGCCGCTGCAAGAA280CCATGTACCGCAGCAGCGCTCGCTCCTCCGTCTCTTCCCA320CCGGCCTAAAGACGACGGCGGGGGCGGCCCGCGCAGCGGC360CGCAGCTCTGGCTCCTCCTCAGGCCCGGCTCGCCGCAGCT400CACCGCCGCCTCCGCCCTCCGGCTCCTCGTCGCGGACCCC440GGCTCGCCGACCCCGCTCGCCCTCAGGGCACCGCGGCCGC480CGGGCCTCGCCGTCCCCGCCACGGGGTCGTCGCGTCTCCC520CGTCCCCGCCTCGGGCCCGTCGCGGCTCCCCGTCGCCACC560GCGGGGCCGACGACTCTTCCCGCCGGGCCCGGCCGGCTTC600AGAGGCAGCAGCCGGGGGGAGTCCCGCGCCGACTATGCCC640GGGACGGCCGCGGAGACCATCCAGGCGACAGCGGCAGCCG680GAGACGCTCTCCTGGTCTGTGTTCTGACTCTTTGGAAAAG720AGCTTAAGGATCACTGTTGGCAATGACCACTTCTGTGTTA760GCACACCAGAACGGCGACGGCTTAGTGATCGGCTGGGGTC800ACCAGTGGATAATCTGGAAGACATGGACAGGGATGACCTG840ACTGATGATTCTGTCTTCACTCGAAGCTCCCAGTGCTCTC880GGGGTCTTGAGCGATATATTTCCCAGGAGGAAGGGCCTCT920CAGTCCCTTCTTGGGACAACTTGATGAGGACTACCGAACA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。