演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF318HRIHFB2436

zinc finger protein 318

ZNF318(zinc finger protein 318)是具 Matrin-type 鋅指結構的蛋白質,與 AR 調控的轉錄活性相關;另可能參與精子形成及減數分裂期間的轉錄調控。

Homo sapiens6p21.1UniProt Q5VUA4
OFFICIAL SYMBOL
ZNF318
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q5VUA4
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF318 是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,全長 2,279 個胺基酸,名稱為 zinc finger protein 318。其序列包含兩個 Matrin-type 鋅指,並有多段被註記為無序的區域,顯示蛋白質不同區段具有不同的序列特徵。現有資料將它與 AR 調控的轉錄活性聯繫,也指出它可能在精子形成期間參與轉錄調控。

Official symbol
ZNF318
Gene name
zinc finger protein 318
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13578
UniProt
Q5VUA4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HRIHFB2436ZFP318

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p21.1
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegZNF318pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:43,307,134–43,369,687
Gene span
62,554 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000361428 ★43,336,070–43,369,64710
ENST0000060659943,331,489–43,342,8362
ENST0000097345043,331,490–43,369,6477
ENST0000093086543,336,073–43,369,64710
ENST0000110613643,354,157–43,369,6474
ENST0000110613743,356,891–43,369,6473

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF318 與 AR(androgen receptor)介導的轉錄活性有關,來源將它描述為可作為轉錄共抑制因子,也可作為轉錄共活化因子。這兩種功能方向均見於資料,因此不宜將其角色簡化為只抑制或只促進 AR 的轉錄活性;現有資訊沒有說明兩種作用分別出現的條件或分子機制。

此外,資料指出 ZNF318 可能在精子形成期間作為轉錄調節因子,特別是在減數分裂期間。這項描述屬於可能的功能角色,提示其與生殖細胞發育中的基因轉錄調節相關,但未進一步交代它調控哪些基因、如何影響減數分裂,或其作用對精子形成的具體結果。

因此,來源支持的功能重點是 ZNF318 與 AR 介導的轉錄活性具有共抑制及共活化兩種描述,並可能參與精子形成、尤其減數分裂階段的轉錄調控。可用資料未提供足以釐清作用方向差異或生殖相關調控路徑的細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 43369647 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF318 ENST00000361428 GRCh38 chr6:43369547-43370647 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GATGTGGGCCCCTGGTAATGAAGGACCTCCACCATGACCACAAGTACTTTAGTCAGAAAACAGCTCGAAA
ACGTGTGAAGAGAGTCCACCAAACAGGCTTCGTGTGAGCAACAAGGCTGTTTATCTTACCTGGGTGCAGG
CGGGTTGAGTCCGAAAAAGGAGTCAGCAGAGGGTGGTGGAATTATCATTAGTTCTTATAGGTTTGGGATA
GGTGTACAAAGTACATTCTTAAGGGCGGGGGAGAATATTACAAAGCACCTACTTAAGGGCAAGGGGGAGA
ATATATCCTGTCAGTTAGGGTGGGGCAGGAACAAATCACAATGGTGGAATGTCATCAGTTAAGGCTATTT
TCACTTCTTTTGTGGCTCTTCAGTTGCCTCAGGCCATCTGGATGTATACGTGCAGGTCATAGGGGATATG
ATGGCTTAGCTTGGGCTCAGAGGCCTGACAACGTCTATTTTGGGTTTGATTCTGGCCCACCACCTCCACC
TCGTACTTTCCTATCCTCAATTTCAACCTCTAGAAATTAGGCAAACTGGAAAGTAAACTGATGCGGGTCG
TGTTGCTTCAGCTGGGGACAGGATTTCGGTGGGCGCTCCTGCCGGGGTCCGTAACCTCCCACACAGCTAA
CGTTTACAGGCCCGTTTATATTATCACGAATGGTTTTCAACCATTTCGTGTCCATCCCTAAATTAAGAGG
CTTGAGGGGCGGCACGAAAGAGCGAAGACACCTCCGCACGGTCTCCAAACCCCTAAGTCCAGAGGCCTGG
AGCATCCCCGGAAAACCAGATCCCTCTCCAGAGAAGCCCTTCCTTCCGCTCCGCCCACCCCGCGCGGAGG
CCACAGGGGTCACGTGGCGGCCGCGGGAGGGGGAAGTGGGCGGCTCTGCGGCCGCCATCTTGAGGATTCG
GAGGCGGGGCGTGCAGAGCTCAGGGCGCGCGCTTCGCTTCCCCTCCCCTCGCCCAGCCTCGCGCCGGCGT
CTGTGCTCCTCCCCACTTTTCTTGGTTCCTGCGGCCGCTCCCTGAGTGGAGGAGCGGGGAACCCCGGAGG
CGGGGGGGGGTGTGTCGGACGCGTGCTCGCGCCCTCCAACCGCCAGCCGCG
ZNF318 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF318_1 ↗6:43,369,481負股43,369,471–43,369,530

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_9M7QJ · enhancer · 43367492–43367912 · regulatory

ENSR6_9M7R5 · promoter · 43369637–43370036 · regulatory

ENSR6_5D7FHT · CTCF_binding_site · 43369739–43369760 · regulatory

ENSR6_BBLDM · enhancer · 43370037–43370667 · regulatory

· motif · 43365320–43365327 · motif

· motif · 43365355–43365370 · motif

· motif · 43365474–43365481 · motif

· motif · 43365711–43365718 · motif

· motif · 43365820–43365832 · motif

· motif · 43365923–43365935 · motif

· motif · 43366383–43366396 · motif

· motif · 43366383–43366396 · motif

· motif · 43366755–43366767 · motif

· motif · 43367565–43367587 · motif

· motif · 43367565–43367587 · motif

· motif · 43368835–43368848 · motif

· motif · 43368835–43368848 · motif

· motif · 43368847–43368858 · motif

· motif · 43369116–43369129 · motif

· motif · 43369146–43369159 · motif

· motif · 43369230–43369243 · motif

· motif · 43369300–43369313 · motif

· motif · 43369431–43369444 · motif

· motif · 43369505–43369518 · motif

· motif · 43369539–43369552 · motif

· motif · 43369546–43369561 · motif

· motif · 43369588–43369601 · motif

· motif · 43369631–43369648 · motif

· motif · 43369730–43369743 · motif

· motif · 43369741–43369757 · motif

· motif · 43369748–43369758 · motif

· motif · 43369781–43369797 · motif

· motif · 43369781–43369797 · motif

· motif · 43369790–43369799 · motif

· motif · 43369790–43369799 · motif

· motif · 43369792–43369804 · motif

· motif · 43369795–43369802 · motif

· motif · 43369801–43369817 · motif

· motif · 43369815–43369828 · motif

· motif · 43370232–43370245 · motif

· motif · 43370566–43370578 · motif

· motif · 43373191–43373203 · motif

· motif · 43373201–43373213 · motif

· motif · 43373203–43373210 · motif

· motif · 43373203–43373218 · motif

· motif · 43373314–43373325 · motif

· motif · 43373332–43373343 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:2279 aa

1 aa2279 aa功能區域鋅指
依 Q5VUA4 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF318 蛋白質長 2,279 個胺基酸,含有兩個 Matrin-type 鋅指:第一個位於第 1,063–1,097 位,第二個位於第 1,136–1,166 位。與 AR 互作的區域註記為第 1–1,092 位;另有多段序列被註記為無序區。

鋅指Matrin-type 11063–1097 aa
鋅指Matrin-type 21136–1166 aa
功能區域Interaction with AR1–1092 aa
功能區域Disordered1–140 aa
功能區域Disordered164–189 aa
功能區域Disordered279–346 aa
功能區域Disordered397–416 aa
功能區域Disordered514–533 aa
功能區域Disordered540–570 aa
功能區域Disordered664–709 aa
功能區域Disordered922–942 aa
功能區域Disordered989–1051 aa
功能區域Disordered1195–1319 aa
功能區域Disordered1428–1463 aa
功能區域Disordered1577–1628 aa
功能區域Disordered1702–1735 aa
功能區域Disordered1753–1775 aa
功能區域Disordered2252–2279 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q5VUA4…

AlphaFold · Q5VUA4

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF318 的定位資料將其記錄於細胞核;來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HRIHFB2436ZNF318
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZNF318 可形成同源二聚體;isoform 1 與 isoform 2 也可形成異源二聚體。資料另指出這兩種異構型均與 AR 互作,但未說明該互作是否形成特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF318 可作為 AR 介導轉錄活性的共抑制因子;此外,它可能在精子形成期間參與轉錄調控,尤其可能與減數分裂階段有關。推論支持
證據與來源

Acts as a transcriptional corepressor for AR-mediated transactivation function. May act as a transcriptional regulator during spermatogenesis and, in particular, during meiotic division

開啟資料庫紀錄 ↗

功能ZNF318 也可作為 AR 介導轉錄活性的共活化因子;此外,它可能在精子形成期間參與轉錄調控,尤其可能與減數分裂階段有關。推論支持
證據與來源

Acts as a transcriptional coactivator for AR-mediated transactivation function. May act as a transcriptional regulator during spermatogenesis and, in particular, during meiotic division

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZNF318 可形成同源二聚體;isoform 1 與 isoform 2 可形成異源二聚體,且這兩種異構型均與 AR 互作。推論支持
證據與來源

Homodimer. Heterodimer of isoform 1 and isoform 2. Isoform 1 and isoform 2 interact with AR

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF318 的定位記錄為細胞核。含實驗來源
證據與來源

Nucleus

PMID 9853615 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000361428 · 8,210 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTTGGTTCCTGCGGCCGCTCCCTGAGTGGAGGAGCGGGGA40
41ACCCCGGAGGCGGGGGGGGGTGTGTCGGACGCGTGCTCGC80
81GCCCTCCAACCGCCAGCCGCGGGGGCGCGCTCGGCCGGGC120
121CCCCGGGGCGACGCGGGGCCGAGGGGAGGGGGCTGCTCCC160
161GCGGCTGAGGCGGCGCGCAGCGGCCGAGGTGGCGGCGGCT200
201GCAGCTGCGGCGGCGCGCTCCGAGCCTGCGTCTAGGGCGC240
241CCCCGGGTCAGAGCTGTCGCCGTGGCCGCCGCTGCAAGAA280
281CCATGTACCGCAGCAGCGCTCGCTCCTCCGTCTCTTCCCA320
321CCGGCCTAAAGACGACGGCGGGGGCGGCCCGCGCAGCGGC360
361CGCAGCTCTGGCTCCTCCTCAGGCCCGGCTCGCCGCAGCT400
401CACCGCCGCCTCCGCCCTCCGGCTCCTCGTCGCGGACCCC440
441GGCTCGCCGACCCCGCTCGCCCTCAGGGCACCGCGGCCGC480
481CGGGCCTCGCCGTCCCCGCCACGGGGTCGTCGCGTCTCCC520
521CGTCCCCGCCTCGGGCCCGTCGCGGCTCCCCGTCGCCACC560
561GCGGGGCCGACGACTCTTCCCGCCGGGCCCGGCCGGCTTC600
601AGAGGCAGCAGCCGGGGGGAGTCCCGCGCCGACTATGCCC640
641GGGACGGCCGCGGAGACCATCCAGGCGACAGCGGCAGCCG680
681GAGACGCTCTCCTGGTCTGTGTTCTGACTCTTTGGAAAAG720
721AGCTTAAGGATCACTGTTGGCAATGACCACTTCTGTGTTA760
761GCACACCAGAACGGCGACGGCTTAGTGATCGGCTGGGGTC800
801ACCAGTGGATAATCTGGAAGACATGGACAGGGATGACCTG840
841ACTGATGATTCTGTCTTCACTCGAAGCTCCCAGTGCTCTC880
881GGGGTCTTGAGCGATATATTTCCCAGGAGGAAGGGCCTCT920
921CAGTCCCTTCTTGGGACAACTTGATGAGGACTACCGAACA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。