演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF317

zinc finger protein 317

ZNF317(zinc finger protein 317)可能具有轉錄因子功能,並可能參與紅系成熟與淋巴細胞增殖。

Homo sapiens19p13.2UniProt Q96PQ6
OFFICIAL SYMBOL
ZNF317
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q96PQ6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF317 是蛋白質編碼基因,產物為 zinc finger protein 317,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其蛋白質具有 KRAB 結構域與多個 C2H2-type zinc finger,呈現此類鋅指蛋白的結構特徵。現有資料將它的角色描述為可能具有轉錄因子功能,並指出它可能與紅系成熟及淋巴細胞增殖有關;這些功能仍以可能性表述。

Official symbol
ZNF317
Gene name
zinc finger protein 317
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13507
UniProt
Q96PQ6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.2
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF317pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:9,140,377–9,163,424
Gene span
23,048 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000247956 ★9,140,397–9,163,4137
ENST000003603859,140,377–9,163,4086
ENST000008918229,140,377–9,163,4137
ENST000008918239,140,377–9,163,3928
ENST000009338729,140,377–9,163,4137
ENST000009338739,140,377–9,163,4088
ENST000009338749,140,377–9,163,4137
ENST000009338759,140,377–9,163,4087
ENST000009491349,140,377–9,163,4138
ENST000009491359,140,377–9,163,4066
ENST000009491369,140,377–9,163,3778
ENST000009923089,140,377–9,163,4046

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF317 可能作為轉錄因子發揮作用。這項描述表示它可能參與轉錄調控,但目前資料沒有進一步說明其辨識的 DNA 序列、調控方向、作用靶點或所參與的分子機制,因此不宜據此推定特定基因會被活化或抑制。

此外,ZNF317 可能在紅系成熟中扮演重要角色。這項關聯指向紅系細胞成熟過程,但來源未指出作用發生的階段、涉及哪些細胞或分子事件,也未提供可判定其影響方向的細節。因此,現有資訊支持的是可能參與此生物學過程,而非已確立的具體調控路徑。

資料亦指出 ZNF317 可能與淋巴細胞增殖有關。這代表其可能涉及淋巴細胞數量增加的過程,但來源沒有交代相關細胞亞群、實驗條件或作用方式,也不能由此推論它會促進或抑制增殖。轉錄因子功能、紅系成熟與淋巴細胞增殖,是目前對 ZNF317 功能的概括性描述;可支持的結論仍限於這些可能角色,尚不足以說明它們之間是否存在因果或共同機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 9140397 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF317 ENST00000247956 GRCh38 chr19:9139397-9140497 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGGAAGCCTTGGTTTCCTAAAGTGTTGAGATTACAGGTGTGAGCCACTGTACCCAGCCTGATTCTGGAA
TTTTGTATATGCAGACTCCTCCTGCTAAAATAATATATATTATATATAATATATATTCCATAATATATAT
AACATACATACATATATTATTTTAGCATATATTATATAATATACGGTAATAATACACATAATACATAATT
ATAATAAATATGATATAATATATATTCCATTGTATAAAACATATAATATATATAACGGAATATTATTCAA
CCTTGAAATAGAAGGAGGTCCTGACATTTATCACAAGATGGGTGGACCTGGAGGACATTACGCTAAGTGA
AATAAGCCAGACACAAAAAGAAAAATATTGCATGACGTCACTTACATGAGGAACTTTTTTTAATCAAGAG
AGACAGCTCAAATACACAGAAATAAAGAATGAGGCAGTTGGGGAAGAAAATGGGAAGATGTGGGTCAAAA
AATACAAAATAGCAGATATGCAGGATGAACACCACACAGGTGATGGTGATTTTACGCCCTTCCCAAGGTG
TCATTCAGAGGCACGTGGTCTCCATCTGACCCTCACTGGTGATATTGATTTGATCACCTGGTCCAGATGT
TGTCCAATTTCTTCGCTGTACAATTTCTATTACTTTTTCTCCATTCCAACATACGAGCAGTTTATAGAGA
GGCATTTAAGGCAATTCAAATATTCTGCTCGTCATGCAAATGTCCCCCAGTTGTGTCATGTAGATGACAA
TTCTTGCCTGATTCAACCTTTACCACTACGATGGCTACAAAATGCTGTGGGTTGTGGTTGAAAATTTGAG
TCTTGAGTAGAAATTGGAGAAATATGCTGGACCGTCAGATTCCACCGGGGCACGGCCGCCATGCCAATCC
AAACTTCAAAACTACAATTCCCAGCATCCTCTCCGCCCCGCTTCCGTATTAGACGCCGCCAATGAAGTCC
CGCGAGAATTGGAAGGCGGCAGTGAAGCGGAAGCCATTACTCTCTGGAGTCGATTGCCCCGAGACACATG
GGCCAAGGAGGGGTCAGCGGCGAATTCTTTCGGCCTGTTGGGGACCCCTCG
ZNF317 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF317_1 ↗19:9,140,397正股9,140,348–9,140,407

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_95LWP · enhancer · 9136489–9136948 · regulatory

ENSR19_5462MD · CTCF_binding_site · 9136657–9136678 · regulatory

ENSR19_95LXP · promoter · 9139907–9140407 · regulatory

ENSR19_B3RZF · enhancer · 9140408–9141045 · regulatory

· motif · 9136659–9136675 · motif

· motif · 9136709–9136722 · motif

· motif · 9139776–9139789 · motif

· motif · 9139776–9139789 · motif

· motif · 9139966–9139975 · motif

· motif · 9139966–9139975 · motif

· motif · 9139968–9139984 · motif

· motif · 9139968–9139984 · motif

· motif · 9140211–9140226 · motif

· motif · 9140218–9140226 · motif

· motif · 9140345–9140356 · motif

· motif · 9140372–9140385 · motif

· motif · 9140372–9140385 · motif

· motif · 9140400–9140411 · motif

· motif · 9140454–9140466 · motif

· motif · 9140456–9140463 · motif

· motif · 9140626–9140641 · motif

· motif · 9140632–9140644 · motif

· motif · 9140634–9140641 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:595 aa

1 aa595 aa結構域功能區域鋅指
依 Q96PQ6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 317 長 595 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質含有位於第 57–128 位胺基酸的 KRAB 結構域,以及 13 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 222–580 位胺基酸。第 109–128 位另註記為無序區域。

結構域KRAB57–128 aa
鋅指C2H2-type 1222–244 aa
鋅指C2H2-type 2250–272 aa
鋅指C2H2-type 3278–300 aa
鋅指C2H2-type 4306–328 aa
鋅指C2H2-type 5334–356 aa
鋅指C2H2-type 6362–384 aa
鋅指C2H2-type 7390–412 aa
鋅指C2H2-type 8418–440 aa
鋅指C2H2-type 9446–468 aa
鋅指C2H2-type 10474–496 aa
鋅指C2H2-type 11502–524 aa
鋅指C2H2-type 12530–552 aa
鋅指C2H2-type 13558–580 aa
功能區域Disordered109–128 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96PQ6…

AlphaFold · Q96PQ6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

zinc finger protein 317 定位於細胞核。 現有資料未提供不同條件下的定位變化或異構型間差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 15 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF317ZNF317AENBAHD1CIB3CLK2NKAPD1RBM10RBMY1A1RBMY1JZBTB48ZNF408ZNF524ZNF648ZNF837KRT40KRTAP10-9
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF317 可能具有轉錄因子功能,並可能在紅系成熟與淋巴細胞增殖中扮演重要角色;現有敘述未進一步界定相關機制或作用方向。資料庫紀錄
證據與來源

May function as a transcription factor. May play an important role in erythroid maturation and lymphoid proliferation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF317 的定位為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000247956 · 4,056 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGAAGCGGAAGCCATTACTCTCTGGAGTCGATTGCCCC40
41GAGACACATGGGCCAAGGAGGGGTCAGCGGCGAATTCTTT80
81CGGCCTGTTGGGGACCCCTCGTGTCCCCACGCCAGACTGG120
121ACCTCCCGTATGAACTTCTCTTCGCATCGGCGGCGGCTTC160
161CGTCACCTCCGCTCCCCCGATCCTATTCCCAGTCGTATGC200
201CAGCTTGGAGAGTCACGTGAGAGCAAGAGAGTAGCTTTCT240
241GGTTGTCCTGGTGCCCTGCTCAGGCAAACTGACTGCCATT280
281CTCTGAGGATGGCAGCTCTGTCCCCCACATTTGCCACGTC320
321CACCCAGGATTCCACCTGTCTCCAGGACTCAGAATTTCCT360
361GTTTCTTCAAAAGACCATTCCTGTCCCCAGAATTTGGACC400
401TGTTCGTGTGCAGTGGTCTGGAGCCTCACACACCCAGTGT440
441TGGTTCCCAGGAATCGGTGACTTTCCAAGATGTCGCTGTG480
481GACTTTACCGAGAAGGAGTGGCCCTTGCTGGATTCTTCTC520
521AGAGAAAACTGTACAAAGATGTAATGCTGGAGAACTACAG560
561CAACCTCACTTCACTGGGGTATCAGGTCGGCAAACCCAGC600
601CTCATCTCACACTTGGAGCAGGAGGAGGAGCCGAGGACAG640
641AGGAGAGGGGCGCTCACCAGGGCGCTTGTGCAGATTGGGA680
681GACTCCATCTAAAACCAAGTGGTCACTTCTTATGGAAGAT720
721ATTTTTGGGAAGGAAACGCCCAGTGGTGTGACGATGGAAA760
761GAGCCGGTCTTGGAGAGAAGTCCACTGAATACGCTCACTT800
801GTTCGAAGTCTTTGGCATGGACCCTCATCTCACTCAGCCA840
841ATGGGAAGGCACGCTGGCAAGAGGCCCTATCACCGCCGCG880
881ACTATGGGGTAGCGTTCAAGGGCAGGCCGCACCTCACTCA920
921GCACATGAGCATGTACGACGGGAGAAAAATGCATGAATGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。