基因總覽
ZNF316 是蛋白質編碼基因,產物為 zinc finger protein 316,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其蛋白質全長 1004 個胺基酸,具有 KRAB domain,並在序列中分布多個 C2H2-type zinc finger,其中一個被註記為退化型;此外也有數段預測為無序區域。這些結構註解勾勒出蛋白質的組成特徵,但來源未提供更詳細的結構或分子作用資料。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000382252 ★ | 6,637,318–6,658,279 | 9 |
| ENST00000949893 | 6,637,298–6,658,279 | 9 |
| ENST00000949894 | 6,637,298–6,658,279 | 9 |
| ENST00000949895 | 6,637,298–6,658,279 | 8 |
| ENST00000949896 | 6,637,298–6,658,279 | 8 |
| ENST00000949898 | 6,637,298–6,658,279 | 9 |
| ENST00000949899 | 6,637,298–6,658,279 | 8 |
| ENST00000949900 | 6,637,298–6,658,279 | 9 |
| ENST00001134265 | 6,637,298–6,658,279 | 9 |
| ENST00000949897 | 6,637,300–6,658,279 | 7 |
| ENST00000949901 | 6,637,759–6,658,279 | 7 |
| ENST00000949902 | 6,637,759–6,658,279 | 6 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF316 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。這項描述保留了推測性,表示目前資料支持的是可能的功能角色,並未進一步界定它調控哪些基因、以何種方向影響轉錄,或在何種生物學條件下發揮作用。
因此,現有資訊可將 ZNF316 視為可能與轉錄調控相關的蛋白質,但不足以說明其具體分子機制或下游結果。來源沒有交代它是否直接接觸 DNA、是否與其他分子形成複合體,也未指出其作用對特定細胞過程或生物學表型的影響。這些細節不宜由家族名稱或蛋白質結構註解推演補足。
Promoter 與基因調控
>ZNF316 ENST00000382252 GRCh38 chr7:6636318-6637418 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTTTCACCCACCATGTTAGCCAAGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCAAGACCTCCC AAAGTGCTAGGATTACAGACACCGTGCCTGGCCGAGTCCTCCTCTATCTCTTGCCCAGTCAGGCCTGGGG TCCCCACAGAAAAGCACCAAGAACAGTGGTGCAGGCGGGCTGGGAGCTGGGGAAGGGGCCCAGGCCACAC CATTCCAGGCGGAAGACAGACCCTGGACTCCACCAATGCCAGAGCTCATCCTGACACCCCAGCTGCACCT CTTGGGAGCAGGTGCAGACAGGCTTGTGGGTGGGGGTCTGGGGGTGGCCGCTGAGCTCACCGACCCCTCC CTGGGTTCCTGGGGTCGCCTGTCACTTCTGCCCCCACACTGGCCATGCCCTCTGCCTGGACATCGCTTCC CTGCCCGTGACCCCATGTCCCTCCAAGTGCGGGCTCCACAACCCCAGTCTCCTCCTGCACTCAACCGCCA CAGTCCACCCATAAGACGTTCACCCCGCCCGTCCCTCCTCCCTCCCCACCCACAAGACGTTCACCCCGCG CGGGCCCGGGGATCTGGTGGAGGCGTGGACACCTGGCCCCCTCCCCACCACAGGGGTCGCCTCCTCCCTC CACCATCCTGGGGTCCCGGGCAGGCTCCGTGGACTGGCGGAGGGGGCCCAGCGCGGGGCCTGGTCCTCAG CGGGCGCCCCGATGAACGAGGCCGGGCTGGGGTTCGGGGAAGGCGGTGGTCGCAGCGGCGGGACCTCGGG GTCACCTCCGAGACCTGGCCAGGGTGTCCAGGAGCGGGGCGAGGTTGTGGGCGCCCCACGAGTGTCGAGG GCGCTCCCGTCCCCTCCCCGCATGCCCCGTCCTCGCCCCGGCCCGAGGCCCAGCTGGGCAAACCCCCGCA ACCCGCGCTTCCCCGCTCCGCGCCGCTGCCCCCGCGTGACCGGAAGTTCCTCCCCCCGCGGGCGCGGGCG GGGCGGGGCCGGCCGGCGGTACTTCCGGTGCCCACGCGCCGCCGTCGCGCAGCTCCCGGGCCGTCACTTT GTGTAGCGCGGGGTCCGCCGCCGGCCCGCAGGCCCCGGCCCCGGTGTCCGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_94M5G · promoter · 6636828–6637328 · regulatory
ENSR7_CMR6 · enhancer · 6637329–6638459 · regulatory
ENSR7_B3BKP · enhancer · 6640324–6640844 · regulatory
· motif · 6636348–6636363 · motif
· motif · 6636353–6636365 · motif
· motif · 6636356–6636363 · motif
· motif · 6636356–6636371 · motif
· motif · 6636741–6636753 · motif
· motif · 6636744–6636751 · motif
· motif · 6636744–6636759 · motif
· motif · 6637085–6637092 · motif
· motif · 6637216–6637229 · motif
· motif · 6637220–6637235 · motif
· motif · 6637252–6637265 · motif
· motif · 6637264–6637275 · motif
· motif · 6637264–6637275 · motif
· motif · 6637266–6637275 · motif
· motif · 6637297–6637310 · motif
· motif · 6637311–6637328 · motif
· motif · 6637317–6637326 · motif
· motif · 6637317–6637328 · motif
· motif · 6637324–6637337 · motif
· motif · 6637458–6637471 · motif
· motif · 6637513–6637526 · motif
· motif · 6637519–6637532 · motif
· motif · 6637525–6637538 · motif
· motif · 6637531–6637544 · motif
· motif · 6637583–6637596 · motif
· motif · 6637640–6637653 · motif
· motif · 6637729–6637745 · motif
· motif · 6637756–6637769 · motif
· motif · 6637922–6637934 · motif
· motif · 6638110–6638123 · motif
· motif · 6638112–6638123 · motif
· motif · 6639221–6639232 · motif
· motif · 6640045–6640057 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1004 aa
zinc finger protein 316 長 1004 個胺基酸,含有位於第 158–229 位的 KRAB domain,以及多個 C2H2-type zinc finger;其中第 6 個被註記為退化型。蛋白質另有三段預測為無序的區域,分別位於第 1–148、508–574 與 936–976 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF316 的定位註記為細胞核。 來源未提供定位隨條件改變的資訊,也沒有異構型差異或動態定位的描述。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ACTTCCGGTGCCCACGCGCCGCCGTCGCGCAGCTCCCGGG40CCGTCACTTTGTGTAGCGCGGGGTCCGCCGCCGGCCCGCA80GGCCCCGGCCCCGGTGTCCGGCCCGTGGCTCGGCCAGCCC120GGCCCGCGCGGTCTCTGCAGGAGGAGGCGGCTCCGGACGC160CCCCTGGGGGGCGGGAGGCGCTCGGCCCGTCGCCCCAGGA200GCCCGCTTTGTGACCTTGGGGGCCTTATCCGGGCTTTCCC240TCATCTGCAGAAGGAGCCCCGGTGGGCTGCTCGGCTGTCT280TCTGCTGCCGGCAGGAGCTGGTCCTCCACCTTCTCTGGTC320ATCCGTGGGTGGACTTCTTGGGAGAAAGAACTCAGTGTCG360TCTTTGGAGGCAGAGACTCTCCACTGCTTCTGGGGAAGAA400GCCTGACCTGCCGGCTTCCTGGCACCTGTCTCTCCTCCTA440GCCCCGTTGTGCCTTGCAAGTGCCTGCATCCTGTCTGTGC480TGAGACCTCTTGGCGTTCCCTGCTGGCCTGGTTCATGTGT520GTTGAGGACCAGGCCACGTGGAGGCTCGCTCCCAGGGAGG560ATGGCGGCGCTCCACACGACTCCCGACTCCCCAGCTGCCC600AGCTGGAGCGGGCAGAGGACGGGTCAGAGTGCGACCCTGA640CCAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAAAGGGGGAAGAG680GTGCAGGAGGTGGAAGAAGAGGAGGAGGAGATAGTGGTGG720AGGAGGAGGAGGAGGGTGTGGCAGAGGTAGTGCAGGATGC760GCAGGTGGAGGCGGTGGCCGAGGTGGAGGTGGAGGCGGAC800GTGGAGGAGGAGGATGTGAAGGAGGTGCTGGCAGAGGAGG840AGTGTCCGGCGTTGGGGACCCAGGAGCGACTTAGCCGTGG880TGGTGATGCCAAGTCCCCAGTTCTTCAGGAAAAGGGCCTG920CAGGCCTCCCGGGCTCCAGCCACTCCTAGGGATGAGGACC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。