演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF316MZF-3

zinc finger protein 316

ZNF316(zinc finger protein 316)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族成員,可能參與轉錄調控;其蛋白質含 KRAB domain 與多個 C2H2-type zinc finger。

Homo sapiens7p22.1UniProt A6NFI3
OFFICIAL SYMBOL
ZNF316
CHROMOSOME
7
UNIPROT
A6NFI3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF316 是蛋白質編碼基因,產物為 zinc finger protein 316,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其蛋白質全長 1004 個胺基酸,具有 KRAB domain,並在序列中分布多個 C2H2-type zinc finger,其中一個被註記為退化型;此外也有數段預測為無序區域。這些結構註解勾勒出蛋白質的組成特徵,但來源未提供更詳細的結構或分子作用資料。

Official symbol
ZNF316
Gene name
zinc finger protein 316
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13843
UniProt
A6NFI3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MZF-3ENST00000305834

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77p22.1
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegZNF316pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr7:6,637,298–6,658,279
Gene span
20,982 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000382252 ★6,637,318–6,658,2799
ENST000009498936,637,298–6,658,2799
ENST000009498946,637,298–6,658,2799
ENST000009498956,637,298–6,658,2798
ENST000009498966,637,298–6,658,2798
ENST000009498986,637,298–6,658,2799
ENST000009498996,637,298–6,658,2798
ENST000009499006,637,298–6,658,2799
ENST000011342656,637,298–6,658,2799
ENST000009498976,637,300–6,658,2797
ENST000009499016,637,759–6,658,2797
ENST000009499026,637,759–6,658,2796

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF316 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。這項描述保留了推測性,表示目前資料支持的是可能的功能角色,並未進一步界定它調控哪些基因、以何種方向影響轉錄,或在何種生物學條件下發揮作用。

因此,現有資訊可將 ZNF316 視為可能與轉錄調控相關的蛋白質,但不足以說明其具體分子機制或下游結果。來源沒有交代它是否直接接觸 DNA、是否與其他分子形成複合體,也未指出其作用對特定細胞過程或生物學表型的影響。這些細節不宜由家族名稱或蛋白質結構註解推演補足。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 6637318 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF316 ENST00000382252 GRCh38 chr7:6636318-6637418 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTTTCACCCACCATGTTAGCCAAGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCAAGACCTCCC
AAAGTGCTAGGATTACAGACACCGTGCCTGGCCGAGTCCTCCTCTATCTCTTGCCCAGTCAGGCCTGGGG
TCCCCACAGAAAAGCACCAAGAACAGTGGTGCAGGCGGGCTGGGAGCTGGGGAAGGGGCCCAGGCCACAC
CATTCCAGGCGGAAGACAGACCCTGGACTCCACCAATGCCAGAGCTCATCCTGACACCCCAGCTGCACCT
CTTGGGAGCAGGTGCAGACAGGCTTGTGGGTGGGGGTCTGGGGGTGGCCGCTGAGCTCACCGACCCCTCC
CTGGGTTCCTGGGGTCGCCTGTCACTTCTGCCCCCACACTGGCCATGCCCTCTGCCTGGACATCGCTTCC
CTGCCCGTGACCCCATGTCCCTCCAAGTGCGGGCTCCACAACCCCAGTCTCCTCCTGCACTCAACCGCCA
CAGTCCACCCATAAGACGTTCACCCCGCCCGTCCCTCCTCCCTCCCCACCCACAAGACGTTCACCCCGCG
CGGGCCCGGGGATCTGGTGGAGGCGTGGACACCTGGCCCCCTCCCCACCACAGGGGTCGCCTCCTCCCTC
CACCATCCTGGGGTCCCGGGCAGGCTCCGTGGACTGGCGGAGGGGGCCCAGCGCGGGGCCTGGTCCTCAG
CGGGCGCCCCGATGAACGAGGCCGGGCTGGGGTTCGGGGAAGGCGGTGGTCGCAGCGGCGGGACCTCGGG
GTCACCTCCGAGACCTGGCCAGGGTGTCCAGGAGCGGGGCGAGGTTGTGGGCGCCCCACGAGTGTCGAGG
GCGCTCCCGTCCCCTCCCCGCATGCCCCGTCCTCGCCCCGGCCCGAGGCCCAGCTGGGCAAACCCCCGCA
ACCCGCGCTTCCCCGCTCCGCGCCGCTGCCCCCGCGTGACCGGAAGTTCCTCCCCCCGCGGGCGCGGGCG
GGGCGGGGCCGGCCGGCGGTACTTCCGGTGCCCACGCGCCGCCGTCGCGCAGCTCCCGGGCCGTCACTTT
GTGTAGCGCGGGGTCCGCCGCCGGCCCGCAGGCCCCGGCCCCGGTGTCCGG
ZNF316 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_94M5G · promoter · 6636828–6637328 · regulatory

ENSR7_CMR6 · enhancer · 6637329–6638459 · regulatory

ENSR7_B3BKP · enhancer · 6640324–6640844 · regulatory

· motif · 6636348–6636363 · motif

· motif · 6636353–6636365 · motif

· motif · 6636356–6636363 · motif

· motif · 6636356–6636371 · motif

· motif · 6636741–6636753 · motif

· motif · 6636744–6636751 · motif

· motif · 6636744–6636759 · motif

· motif · 6637085–6637092 · motif

· motif · 6637216–6637229 · motif

· motif · 6637220–6637235 · motif

· motif · 6637252–6637265 · motif

· motif · 6637264–6637275 · motif

· motif · 6637264–6637275 · motif

· motif · 6637266–6637275 · motif

· motif · 6637297–6637310 · motif

· motif · 6637311–6637328 · motif

· motif · 6637317–6637326 · motif

· motif · 6637317–6637328 · motif

· motif · 6637324–6637337 · motif

· motif · 6637458–6637471 · motif

· motif · 6637513–6637526 · motif

· motif · 6637519–6637532 · motif

· motif · 6637525–6637538 · motif

· motif · 6637531–6637544 · motif

· motif · 6637583–6637596 · motif

· motif · 6637640–6637653 · motif

· motif · 6637729–6637745 · motif

· motif · 6637756–6637769 · motif

· motif · 6637922–6637934 · motif

· motif · 6638110–6638123 · motif

· motif · 6638112–6638123 · motif

· motif · 6639221–6639232 · motif

· motif · 6640045–6640057 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1004 aa

1 aa1004 aa結構域功能區域鋅指
依 A6NFI3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 316 長 1004 個胺基酸,含有位於第 158–229 位的 KRAB domain,以及多個 C2H2-type zinc finger;其中第 6 個被註記為退化型。蛋白質另有三段預測為無序的區域,分別位於第 1–148、508–574 與 936–976 位。

結構域KRAB158–229 aa
鋅指C2H2-type 1345–367 aa
鋅指C2H2-type 2373–395 aa
鋅指C2H2-type 3401–423 aa
鋅指C2H2-type 4429–451 aa
鋅指C2H2-type 5457–479 aa
鋅指C2H2-type 6; degenerate485–512 aa
鋅指C2H2-type 7691–713 aa
鋅指C2H2-type 8719–741 aa
鋅指C2H2-type 9747–769 aa
鋅指C2H2-type 10775–797 aa
鋅指C2H2-type 11803–825 aa
鋅指C2H2-type 12831–853 aa
鋅指C2H2-type 13859–881 aa
鋅指C2H2-type 14887–909 aa
鋅指C2H2-type 15915–937 aa
功能區域Disordered1–148 aa
功能區域Disordered508–574 aa
功能區域Disordered936–976 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · A6NFI3…

AlphaFold · A6NFI3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF316 的定位註記為細胞核。 來源未提供定位隨條件改變的資訊,也沒有異構型差異或動態定位的描述。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MZF-3ZNF316
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF316 可能參與轉錄調控。此註解僅提出可能的功能關聯,未提供具體調控目標、作用方向、實驗系統或機制細節。推論支持
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF316 的定位註記為細胞核;此資料未說明定位的實驗條件或是否隨情境改變。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000382252 · 7,243 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTTCCGGTGCCCACGCGCCGCCGTCGCGCAGCTCCCGGG40
41CCGTCACTTTGTGTAGCGCGGGGTCCGCCGCCGGCCCGCA80
81GGCCCCGGCCCCGGTGTCCGGCCCGTGGCTCGGCCAGCCC120
121GGCCCGCGCGGTCTCTGCAGGAGGAGGCGGCTCCGGACGC160
161CCCCTGGGGGGCGGGAGGCGCTCGGCCCGTCGCCCCAGGA200
201GCCCGCTTTGTGACCTTGGGGGCCTTATCCGGGCTTTCCC240
241TCATCTGCAGAAGGAGCCCCGGTGGGCTGCTCGGCTGTCT280
281TCTGCTGCCGGCAGGAGCTGGTCCTCCACCTTCTCTGGTC320
321ATCCGTGGGTGGACTTCTTGGGAGAAAGAACTCAGTGTCG360
361TCTTTGGAGGCAGAGACTCTCCACTGCTTCTGGGGAAGAA400
401GCCTGACCTGCCGGCTTCCTGGCACCTGTCTCTCCTCCTA440
441GCCCCGTTGTGCCTTGCAAGTGCCTGCATCCTGTCTGTGC480
481TGAGACCTCTTGGCGTTCCCTGCTGGCCTGGTTCATGTGT520
521GTTGAGGACCAGGCCACGTGGAGGCTCGCTCCCAGGGAGG560
561ATGGCGGCGCTCCACACGACTCCCGACTCCCCAGCTGCCC600
601AGCTGGAGCGGGCAGAGGACGGGTCAGAGTGCGACCCTGA640
641CCAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAAAGGGGGAAGAG680
681GTGCAGGAGGTGGAAGAAGAGGAGGAGGAGATAGTGGTGG720
721AGGAGGAGGAGGAGGGTGTGGCAGAGGTAGTGCAGGATGC760
761GCAGGTGGAGGCGGTGGCCGAGGTGGAGGTGGAGGCGGAC800
801GTGGAGGAGGAGGATGTGAAGGAGGTGCTGGCAGAGGAGG840
841AGTGTCCGGCGTTGGGGACCCAGGAGCGACTTAGCCGTGG880
881TGGTGATGCCAAGTCCCCAGTTCTTCAGGAAAAGGGCCTG920
921CAGGCCTCCCGGGCTCCAGCCACTCCTAGGGATGAGGACC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。